Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP05160
Target Name Nucleobindin-2 (NUCB2)
Gene Name NUCB2
Gene ID 4925
Synonyms
NEFA; Nucleobindin-2; DNA-binding protein NEFA; Epididymis secretory protein Li 109; Gastric cancer antigen Zg4; Prepronesfatin) [Cleaved into: Nesfatin-1]
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MRWRTILLQYCFLLITCLLTALEAVPIDIDKTKVQNIHPVESAKIEPPDTGLYYDEYLKQ
VIDVLETDKHFREKLQKADIEEIKSGRLSKELDLVSHHVRTKLDELKRQEVGRLRMLIKA
KLDSLQDIGMDHQALLKQFDHLNHLNPDKFESTDLDMLIKAATSDLEHYDKTRHEEFKKY
EMMKEHERREYLKTLNEEKRKEEESKFEEMKKKHENHPKVNHPGSKDQLKEVWEETDGLD
PNDFDPKTFFKLHDVNSDGFLDEQELEALFTKELEKVYDPKNEEDDMVEMEEERLRMREH
VMNEVDTNKDRLVTLEEFLKATEKKEFLEPDSWETLDQQQFFTEEELKEYENIIALQENE
LKKKADELQKQKEELQRQHDQLEAQKLEYHQVIQQMEQKKLQQGIPPSGPAGELKFEPHI
Target Bioclass
Other
Family
Nucleobindin family
Subcellular location
Secreted; Golgi apparatus
Function
Calcium-binding protein which may have a role in calcium homeostasis. Acts as a non-receptor guanine nucleotide exchange factor which binds to and activates guanine nucleotide-binding protein (G-protein) alpha subunit GNAI3.; [Nesfatin-1]: Anorexigenic peptide, seems to play an important role in hypothalamic pathways regulating food intake and energy homeostasis, acting in a leptin-independent manner. May also exert hypertensive roles and modulate blood pressure through directly acting on peripheral arterial resistance.
Uniprot ID
P80303
Ensemble ID
ENST00000323688.10
HGNC ID
HGNC:8044

Target Site Mutations in Different Cell Lines

Cell line Mutation details Probe for labeling this protein in this cell
LNCaP clone FGC SNV: p.L8I .
SW756 SNV: p.I420L .

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 14 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
FBPP2
 Probe Info  		24.62  LDD0318  [1]
SAA-alkyne
 Probe Info  		1.12  LDD0252  [2]
TH214
 Probe Info  		Y169(6.11)  LDD0258  [3]
TH216
 Probe Info  		Y169(20.00)  LDD0259  [3]
ONAyne
 Probe Info  		K171(10.00); K69(7.14)  LDD0274  [4]
OPA-S-S-alkyne
 Probe Info  		K84(1.63); K171(2.34); K184(2.65)  LDD3494  [5]
Probe 1
 Probe Info  		Y54(13.68); Y169(20.12); Y389(11.08)  LDD3495  [6]
5E-2FA
 Probe Info  		H132(0.00); H390(0.00); H300(0.00); H379(0.00)  LDD2235  [7]
ATP probe
 Probe Info  		K399(0.00); K400(0.00); K226(0.00); K230(0.00)  LDD0199  [8]
m-APA
 Probe Info  		H300(0.00); H132(0.00); H390(0.00); H253(0.00)  LDD2231  [7]
STPyne
 Probe Info  		N.A.  LDD0009  [9]
1c-yne
 Probe Info  		N.A.  LDD0228  [10]
Acrolein
 Probe Info  		N.A.  LDD0217  [11]
W1
 Probe Info  		E299(0.00); N303(0.00); H300(0.00)  LDD0236  [12]
PAL-AfBPP Probe
Click To Hide/Show 220 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
IMP2070
 Probe Info  		1.75  LDD0280  [13]
C001
 Probe Info  		13.55  LDD1711  [14]
C003
 Probe Info  		13.00  LDD1713  [14]
C004
 Probe Info  		28.64  LDD1714  [14]
C007
 Probe Info  		30.06  LDD1716  [14]
C008
 Probe Info  		7.73  LDD1717  [14]
C010
 Probe Info  		18.00  LDD1719  [14]
C011
 Probe Info  		9.00  LDD1720  [14]
C017
 Probe Info  		11.24  LDD1725  [14]
C018
 Probe Info  		4.96  LDD1726  [14]
C022
 Probe Info  		46.85  LDD1728  [14]
C026
 Probe Info  		13.74  LDD1732  [14]
C027
 Probe Info  		18.00  LDD1733  [14]
C039
 Probe Info  		11.55  LDD1739  [14]
C040
 Probe Info  		39.12  LDD1740  [14]
C041
 Probe Info  		41.64  LDD1741  [14]
C049
 Probe Info  		11.31  LDD1747  [14]
C051
 Probe Info  		6.23  LDD1749  [14]
C052
 Probe Info  		6.82  LDD1750  [14]
C053
 Probe Info  		22.47  LDD1751  [14]
C055
 Probe Info  		36.76  LDD1752  [14]
C056
 Probe Info  		39.67  LDD1753  [14]
C059
 Probe Info  		23.59  LDD1756  [14]
C060
 Probe Info  		12.47  LDD1757  [14]
C063
 Probe Info  		38.32  LDD1760  [14]
C064
 Probe Info  		15.24  LDD1761  [14]
C067
 Probe Info  		11.47  LDD1763  [14]
C070
 Probe Info  		31.56  LDD1766  [14]
C071
 Probe Info  		10.06  LDD1767  [14]
C072
 Probe Info  		12.21  LDD1768  [14]
C075
 Probe Info  		6.23  LDD1770  [14]
C082
 Probe Info  		25.28  LDD1774  [14]
C085
 Probe Info  		19.97  LDD1777  [14]
C087
 Probe Info  		17.88  LDD1779  [14]
C089
 Probe Info  		4.96  LDD1781  [14]
C091
 Probe Info  		25.11  LDD1782  [14]
C092
 Probe Info  		49.87  LDD1783  [14]
C094
 Probe Info  		69.07  LDD1785  [14]
C095
 Probe Info  		13.83  LDD1786  [14]
C100
 Probe Info  		16.45  LDD1789  [14]
C106
 Probe Info  		89.26  LDD1793  [14]
C107
 Probe Info  		41.07  LDD1794  [14]
C108
 Probe Info  		33.13  LDD1795  [14]
C112
 Probe Info  		87.43  LDD1799  [14]
C129
 Probe Info  		7.31  LDD1811  [14]
C130
 Probe Info  		21.86  LDD1812  [14]
C131
 Probe Info  		5.58  LDD1813  [14]
C134
 Probe Info  		70.52  LDD1816  [14]
C135
 Probe Info  		30.06  LDD1817  [14]
C138
 Probe Info  		4.99  LDD1820  [14]
C139
 Probe Info  		23.59  LDD1821  [14]
C140
 Probe Info  		26.54  LDD1822  [14]
C141
 Probe Info  		99.04  LDD1823  [14]
C143
 Probe Info  		58.08  LDD1825  [14]
C145
 Probe Info  		13.45  LDD1827  [14]
C147
 Probe Info  		20.11  LDD1829  [14]
C153
 Probe Info  		99.73  LDD1834  [14]
C156
 Probe Info  		5.90  LDD1836  [14]
C158
 Probe Info  		11.55  LDD1838  [14]
C159
 Probe Info  		21.26  LDD1839  [14]
C160
 Probe Info  		36.50  LDD1840  [14]
C161
 Probe Info  		33.59  LDD1841  [14]
C163
 Probe Info  		17.63  LDD1843  [14]
C165
 Probe Info  		21.41  LDD1845  [14]
C169
 Probe Info  		87.43  LDD1849  [14]
C170
 Probe Info  		13.74  LDD1850  [14]
C173
 Probe Info  		9.99  LDD1853  [14]
C174
 Probe Info  		7.84  LDD1854  [14]
C177
 Probe Info  		11.24  LDD1856  [14]
C178
 Probe Info  		67.65  LDD1857  [14]
C183
 Probe Info  		17.75  LDD1861  [14]
C185
 Probe Info  		13.36  LDD1863  [14]
C186
 Probe Info  		16.80  LDD1864  [14]
C187
 Probe Info  		47.84  LDD1865  [14]
C191
 Probe Info  		47.50  LDD1868  [14]
C193
 Probe Info  		30.91  LDD1869  [14]
C194
 Probe Info  		41.64  LDD1870  [14]
C196
 Probe Info  		17.88  LDD1872  [14]
C197
 Probe Info  		17.39  LDD1873  [14]
C198
 Probe Info  		17.63  LDD1874  [14]
C201
 Probe Info  		99.73  LDD1877  [14]
C204
 Probe Info  		10.85  LDD1879  [14]
C205
 Probe Info  		10.93  LDD1880  [14]
C206
 Probe Info  		99.73  LDD1881  [14]
C210
 Probe Info  		59.30  LDD1884  [14]
C211
 Probe Info  		80.45  LDD1885  [14]
C212
 Probe Info  		6.54  LDD1886  [14]
C213
 Probe Info  		92.41  LDD1887  [14]
C214
 Probe Info  		11.88  LDD1888  [14]
C216
 Probe Info  		5.10  LDD1890  [14]
C217
 Probe Info  		4.92  LDD1891  [14]
C218
 Probe Info  		39.95  LDD1892  [14]
C219
 Probe Info  		14.52  LDD1893  [14]
C220
 Probe Info  		55.72  LDD1894  [14]
C222
 Probe Info  		6.77  LDD1896  [14]
C225
 Probe Info  		20.53  LDD1898  [14]
C226
 Probe Info  		17.63  LDD1899  [14]
C228
 Probe Info  		98.36  LDD1901  [14]
C229
 Probe Info  		11.47  LDD1902  [14]
C231
 Probe Info  		60.97  LDD1904  [14]
C232
 Probe Info  		78.25  LDD1905  [14]
C233
 Probe Info  		30.70  LDD1906  [14]
C234
 Probe Info  		17.03  LDD1907  [14]
C235
 Probe Info  		31.34  LDD1908  [14]
C238
 Probe Info  		33.82  LDD1911  [14]
C239
 Probe Info  		5.35  LDD1912  [14]
C240
 Probe Info  		27.47  LDD1913  [14]
C243
 Probe Info  		67.18  LDD1916  [14]
C244
 Probe Info  		43.41  LDD1917  [14]
C246
 Probe Info  		55.33  LDD1919  [14]
C249
 Probe Info  		34.06  LDD1922  [14]
C252
 Probe Info  		19.56  LDD1925  [14]
C264
 Probe Info  		85.04  LDD1935  [14]
C265
 Probe Info  		43.71  LDD1936  [14]
C269
 Probe Info  		12.04  LDD1939  [14]
C270
 Probe Info  		12.21  LDD1940  [14]
C271
 Probe Info  		6.68  LDD1941  [14]
C273
 Probe Info  		8.11  LDD1943  [14]
C277
 Probe Info  		56.89  LDD1947  [14]
C278
 Probe Info  		68.59  LDD1948  [14]
C280
 Probe Info  		13.27  LDD1950  [14]
C282
 Probe Info  		99.73  LDD1952  [14]
C284
 Probe Info  		75.58  LDD1954  [14]
C285
 Probe Info  		94.35  LDD1955  [14]
C286
 Probe Info  		8.57  LDD1956  [14]
C287
 Probe Info  		37.79  LDD1957  [14]
C288
 Probe Info  		25.99  LDD1958  [14]
C289
 Probe Info  		79.34  LDD1959  [14]
C290
 Probe Info  		18.64  LDD1960  [14]
C293
 Probe Info  		55.33  LDD1963  [14]
C296
 Probe Info  		42.22  LDD1966  [14]
C297
 Probe Info  		4.92  LDD1967  [14]
C299
 Probe Info  		24.59  LDD1968  [14]
C300
 Probe Info  		5.74  LDD1969  [14]
C301
 Probe Info  		6.36  LDD1970  [14]
C302
 Probe Info  		5.17  LDD1971  [14]
C303
 Probe Info  		6.23  LDD1972  [14]
C305
 Probe Info  		34.78  LDD1974  [14]
C307
 Probe Info  		15.35  LDD1975  [14]
C310
 Probe Info  		53.82  LDD1977  [14]
C311
 Probe Info  		9.51  LDD1978  [14]
C313
 Probe Info  		23.92  LDD1980  [14]
C314
 Probe Info  		48.17  LDD1981  [14]
C317
 Probe Info  		11.39  LDD1983  [14]
C320
 Probe Info  		6.41  LDD1986  [14]
C322
 Probe Info  		12.04  LDD1988  [14]
C326
 Probe Info  		60.55  LDD1990  [14]
C327
 Probe Info  		5.39  LDD1991  [14]
C328
 Probe Info  		5.21  LDD1992  [14]
C333
 Probe Info  		5.35  LDD1996  [14]
C338
 Probe Info  		25.99  LDD2001  [14]
C339
 Probe Info  		8.22  LDD2002  [14]
C340
 Probe Info  		7.01  LDD2003  [14]
C342
 Probe Info  		6.77  LDD2004  [14]
C343
 Probe Info  		79.89  LDD2005  [14]
C344
 Probe Info  		5.90  LDD2006  [14]
C346
 Probe Info  		21.86  LDD2007  [14]
C347
 Probe Info  		5.17  LDD2008  [14]
C348
 Probe Info  		22.01  LDD2009  [14]
C349
 Probe Info  		64.89  LDD2010  [14]
C350
 Probe Info  		99.73  LDD2011  [14]
C353
 Probe Info  		16.91  LDD2014  [14]
C354
 Probe Info  		23.10  LDD2015  [14]
C355
 Probe Info  		49.87  LDD2016  [14]
C356
 Probe Info  		49.87  LDD2017  [14]
C357
 Probe Info  		23.10  LDD2018  [14]
C360
 Probe Info  		7.36  LDD2021  [14]
C362
 Probe Info  		98.36  LDD2023  [14]
C363
 Probe Info  		63.12  LDD2024  [14]
C364
 Probe Info  		33.82  LDD2025  [14]
C366
 Probe Info  		34.30  LDD2027  [14]
C367
 Probe Info  		14.62  LDD2028  [14]
C373
 Probe Info  		4.96  LDD2033  [14]
C376
 Probe Info  		41.93  LDD2036  [14]
C378
 Probe Info  		11.79  LDD2037  [14]
C380
 Probe Info  		11.71  LDD2039  [14]
C382
 Probe Info  		18.77  LDD2041  [14]
C383
 Probe Info  		70.52  LDD2042  [14]
C385
 Probe Info  		6.92  LDD2044  [14]
C386
 Probe Info  		36.50  LDD2045  [14]
C387
 Probe Info  		18.77  LDD2046  [14]
C388
 Probe Info  		99.73  LDD2047  [14]
C389
 Probe Info  		6.82  LDD2048  [14]
C390
 Probe Info  		99.73  LDD2049  [14]
C391
 Probe Info  		56.89  LDD2050  [14]
C392
 Probe Info  		8.46  LDD2051  [14]
C393
 Probe Info  		10.20  LDD2052  [14]
C394
 Probe Info  		7.01  LDD2053  [14]
C395
 Probe Info  		6.06  LDD2054  [14]
C396
 Probe Info  		10.85  LDD2055  [14]
C397
 Probe Info  		13.74  LDD2056  [14]
C399
 Probe Info  		37.27  LDD2058  [14]
C400
 Probe Info  		4.92  LDD2059  [14]
C403
 Probe Info  		59.30  LDD2061  [14]
C405
 Probe Info  		18.64  LDD2063  [14]
C407
 Probe Info  		95.67  LDD2064  [14]
C408
 Probe Info  		7.52  LDD2065  [14]
C409
 Probe Info  		12.55  LDD2066  [14]
C413
 Probe Info  		21.11  LDD2069  [14]
C419
 Probe Info  		20.82  LDD2074  [14]
C420
 Probe Info  		14.42  LDD2075  [14]
C422
 Probe Info  		19.16  LDD2077  [14]
C424
 Probe Info  		10.41  LDD2079  [14]
C426
 Probe Info  		20.53  LDD2081  [14]
C428
 Probe Info  		5.21  LDD2083  [14]
C429
 Probe Info  		31.34  LDD2084  [14]
C430
 Probe Info  		11.08  LDD2085  [14]
C431
 Probe Info  		99.73  LDD2086  [14]
C433
 Probe Info  		10.78  LDD2088  [14]
FFF probe11
 Probe Info  		20.00  LDD0471  [15]
FFF probe12
 Probe Info  		13.46  LDD0473  [15]
FFF probe13
 Probe Info  		20.00  LDD0475  [15]
FFF probe14
 Probe Info  		20.00  LDD0477  [15]
FFF probe15
 Probe Info  		20.00  LDD0478  [15]
FFF probe2
 Probe Info  		20.00  LDD0463  [15]
FFF probe3
 Probe Info  		20.00  LDD0464  [15]
FFF probe4
 Probe Info  		20.00  LDD0466  [15]
FFF probe6
 Probe Info  		20.00  LDD0467  [15]
JN0003
 Probe Info  		20.00  LDD0469  [15]
OEA-DA
 Probe Info  		20.00  LDD0046  [16]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0108  Chloroacetamide HeLa H300(0.00); H38(0.00)  LDD0222  [11]
 LDCM0185  Compound 17 HEK-293T 3.75  LDD0512  [15]
 LDCM0191  Compound 21 HEK-293T 10.00  LDD0508  [15]
 LDCM0190  Compound 34 HEK-293T 12.35  LDD0510  [15]
 LDCM0192  Compound 35 HEK-293T 9.52  LDD0509  [15]
 LDCM0193  Compound 36 HEK-293T 12.05  LDD0511  [15]
 LDCM0107  IAA HeLa H300(0.00); H38(0.00)  LDD0221  [11]
 LDCM0109  NEM HeLa H38(0.00); H168(0.00); H97(0.00); H300(0.00)  LDD0223  [11]

The Interaction Atlas With This Target

The Protein(s) Related To This Target

Other
Click To Hide/Show 1 Protein(s) Interacting with This Target
Protein name Family Uniprot ID
Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha (GADD45A) GADD45 family P24522

The Drug(s) Related To This Target

Approved
Click To Hide/Show 3 Drug(s) Interacting with This Target
Drug Name Drug Type External ID
Calcium Phosphate Small molecular drug DB11348
Calcium Phosphate Dihydrate Small molecular drug DB14481
Calcium Citrate . DB11093

References

1 Tranylcypromine specificity for monoamine oxidase is limited by promiscuous protein labelling and lysosomal trapping. RSC Chem Biol. 2020 Aug 12;1(4):209-213. doi: 10.1039/d0cb00048e. eCollection 2020 Oct 1.
Mass spectrometry data entry: PXD018580
2 Chemoproteomics and Phosphoproteomics Profiling Reveals Salvianolic Acid A as a Covalent Inhibitor of mTORC1. J Proteome Res. 2023 Jul 7;22(7):2450-2459. doi: 10.1021/acs.jproteome.3c00188. Epub 2023 Jun 22.
3 Chemoproteomic profiling of kinases in live cells using electrophilic sulfonyl triazole probes. Chem Sci. 2021 Jan 21;12(9):3295-3307. doi: 10.1039/d0sc06623k.
4 A Paal-Knorr agent for chemoproteomic profiling of targets of isoketals in cells. Chem Sci. 2021 Oct 15;12(43):14557-14563. doi: 10.1039/d1sc02230j. eCollection 2021 Nov 10.
Mass spectrometry data entry: PXD028270
5 A chemical proteomics approach for global mapping of functional lysines on cell surface of living cell. Nat Commun. 2024 Apr 8;15(1):2997. doi: 10.1038/s41467-024-47033-w.
Mass spectrometry data entry: PXD042888
6 An Azo Coupling-Based Chemoproteomic Approach to Systematically Profile the Tyrosine Reactivity in the Human Proteome. Anal Chem. 2021 Jul 27;93(29):10334-10342. doi: 10.1021/acs.analchem.1c01935. Epub 2021 Jul 12.
7 Global profiling of functional histidines in live cells using small-molecule photosensitizer and chemical probe relay labelling. Nat Chem. 2024 Jun 4. doi: 10.1038/s41557-024-01545-6. Online ahead of print.
Mass spectrometry data entry: PXD042377
8 Targeted Proteomic Approaches for Proteome-Wide Characterizations of the AMP-Binding Capacities of Kinases. J Proteome Res. 2022 Aug 5;21(8):2063-2070. doi: 10.1021/acs.jproteome.2c00225. Epub 2022 Jul 12.
9 A modification-centric assessment tool for the performance of chemoproteomic probes. Nat Chem Biol. 2022 Aug;18(8):904-912. doi: 10.1038/s41589-022-01074-8. Epub 2022 Jul 21.
Mass spectrometry data entry: PXD027758 , PXD027755 , PXD027760 , PXD027762 , PXD027756 , PXD027591 , PXD007149 , PXD030064 , PXD032392 , PXD027789 , PXD027767 , PXD027764
10 Tunable Amine-Reactive Electrophiles for Selective Profiling of Lysine. Angew Chem Int Ed Engl. 2022 Jan 26;61(5):e202112107. doi: 10.1002/anie.202112107. Epub 2021 Dec 16.
11 ACR-Based Probe for the Quantitative Profiling of Histidine Reactivity in the Human Proteome. J Am Chem Soc. 2023 Mar 8;145(9):5252-5260. doi: 10.1021/jacs.2c12653. Epub 2023 Feb 27.
12 Oxidant-Induced Bioconjugation for Protein Labeling in Live Cells. ACS Chem Biol. 2023 Jan 20;18(1):112-122. doi: 10.1021/acschembio.2c00740. Epub 2022 Dec 21.
13 A Probe for NLRP3 Inflammasome Inhibitor MCC950 Identifies Carbonic Anhydrase 2 as a Novel Target. ACS Chem Biol. 2021 Jun 18;16(6):982-990. doi: 10.1021/acschembio.1c00218. Epub 2021 May 18.
Mass spectrometry data entry: PXD024915 , PXD024913
14 Large-scale chemoproteomics expedites ligand discovery and predicts ligand behavior in cells. Science. 2024 Apr 26;384(6694):eadk5864. doi: 10.1126/science.adk5864. Epub 2024 Apr 26.
Mass spectrometry data entry: PXD041587
15 Ligand and Target Discovery by Fragment-Based Screening in Human Cells. Cell. 2017 Jan 26;168(3):527-541.e29. doi: 10.1016/j.cell.2016.12.029. Epub 2017 Jan 19.
16 Mapping Protein Targets of Bioactive Small Molecules Using Lipid-Based Chemical Proteomics. ACS Chem Biol. 2017 Oct 20;12(10):2671-2681. doi: 10.1021/acschembio.7b00581. Epub 2017 Sep 20.
Mass spectrometry data entry: PXD007570