Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP00832
Target Name NADH dehydrogenase 1 beta subcomplex subunit 3 (NDUFB3)
Gene Name NDUFB3
Gene ID 4709
Synonyms
NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3; Complex I-B12; CI-B12; NADH-ubiquinone oxidoreductase B12 subunit
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MAHEHGHEHGHHKMELPDYRQWKIEGTPLETIQKKLAAKGLRDPWGRNEAWRYMGGFAKS
VSFSDVFFKGFKWGFAAFVVAVGAEYYLESLNKDKKHH
Target Bioclass
Enzyme
Family
Complex I NDUFB3 subunit family
Subcellular location
Mitochondrion inner membrane
Function
Accessory subunit of the mitochondrial membrane respiratory chain NADH dehydrogenase (Complex I), that is believed not to be involved in catalysis. Complex I functions in the transfer of electrons from NADH to the respiratory chain. The immediate electron acceptor for the enzyme is believed to be ubiquinone.
Uniprot ID
O43676
Ensemble ID
ENST00000237889.9
HGNC ID
HGNC:7698
ChEMBL ID
CHEMBL2363065

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 2 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
STPyne
 Probe Info  		K39(2.12)  LDD0277  [1]
ATP probe
 Probe Info  		K34(0.00); K35(0.00)  LDD0199  [2]
PAL-AfBPP Probe
Click To Hide/Show 174 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
C001
 Probe Info  		7.36  LDD1711  [3]
C003
 Probe Info  		23.92  LDD1713  [3]
C004
 Probe Info  		17.39  LDD1714  [3]
C007
 Probe Info  		10.06  LDD1716  [3]
C008
 Probe Info  		11.31  LDD1717  [3]
C010
 Probe Info  		10.06  LDD1719  [3]
C011
 Probe Info  		9.71  LDD1720  [3]
C017
 Probe Info  		10.56  LDD1725  [3]
C022
 Probe Info  		41.36  LDD1728  [3]
C026
 Probe Info  		11.71  LDD1732  [3]
C027
 Probe Info  		5.46  LDD1733  [3]
C039
 Probe Info  		9.85  LDD1739  [3]
C040
 Probe Info  		48.50  LDD1740  [3]
C041
 Probe Info  		23.43  LDD1741  [3]
C044
 Probe Info  		6.36  LDD1743  [3]
C049
 Probe Info  		18.77  LDD1747  [3]
C051
 Probe Info  		5.94  LDD1749  [3]
C052
 Probe Info  		11.00  LDD1750  [3]
C053
 Probe Info  		11.71  LDD1751  [3]
C055
 Probe Info  		77.17  LDD1752  [3]
C056
 Probe Info  		99.73  LDD1753  [3]
C059
 Probe Info  		6.96  LDD1756  [3]
C060
 Probe Info  		7.46  LDD1757  [3]
C063
 Probe Info  		68.12  LDD1760  [3]
C064
 Probe Info  		11.08  LDD1761  [3]
C067
 Probe Info  		6.68  LDD1763  [3]
C070
 Probe Info  		39.12  LDD1766  [3]
C072
 Probe Info  		16.68  LDD1768  [3]
C082
 Probe Info  		17.39  LDD1774  [3]
C085
 Probe Info  		9.85  LDD1777  [3]
C087
 Probe Info  		28.44  LDD1779  [3]
C091
 Probe Info  		54.19  LDD1782  [3]
C092
 Probe Info  		70.52  LDD1783  [3]
C094
 Probe Info  		52.35  LDD1785  [3]
C095
 Probe Info  		13.09  LDD1786  [3]
C099
 Probe Info  		4.92  LDD1788  [3]
C100
 Probe Info  		10.20  LDD1789  [3]
C106
 Probe Info  		67.18  LDD1793  [3]
C107
 Probe Info  		17.39  LDD1794  [3]
C108
 Probe Info  		32.90  LDD1795  [3]
C112
 Probe Info  		99.73  LDD1799  [3]
C129
 Probe Info  		5.78  LDD1811  [3]
C130
 Probe Info  		13.45  LDD1812  [3]
C134
 Probe Info  		75.06  LDD1816  [3]
C135
 Probe Info  		35.51  LDD1817  [3]
C139
 Probe Info  		22.94  LDD1821  [3]
C140
 Probe Info  		15.89  LDD1822  [3]
C141
 Probe Info  		38.05  LDD1823  [3]
C143
 Probe Info  		99.73  LDD1825  [3]
C145
 Probe Info  		9.85  LDD1827  [3]
C147
 Probe Info  		12.82  LDD1829  [3]
C153
 Probe Info  		93.05  LDD1834  [3]
C158
 Probe Info  		9.99  LDD1838  [3]
C159
 Probe Info  		39.12  LDD1839  [3]
C160
 Probe Info  		25.46  LDD1840  [3]
C161
 Probe Info  		58.08  LDD1841  [3]
C163
 Probe Info  		10.78  LDD1843  [3]
C165
 Probe Info  		16.00  LDD1845  [3]
C166
 Probe Info  		8.63  LDD1846  [3]
C169
 Probe Info  		91.14  LDD1849  [3]
C170
 Probe Info  		8.94  LDD1850  [3]
C173
 Probe Info  		7.57  LDD1853  [3]
C174
 Probe Info  		5.82  LDD1854  [3]
C177
 Probe Info  		17.15  LDD1856  [3]
C178
 Probe Info  		91.77  LDD1857  [3]
C183
 Probe Info  		7.52  LDD1861  [3]
C186
 Probe Info  		36.00  LDD1864  [3]
C194
 Probe Info  		28.64  LDD1870  [3]
C196
 Probe Info  		23.75  LDD1872  [3]
C197
 Probe Info  		7.06  LDD1873  [3]
C198
 Probe Info  		38.85  LDD1874  [3]
C201
 Probe Info  		99.73  LDD1877  [3]
C204
 Probe Info  		9.25  LDD1879  [3]
C205
 Probe Info  		9.13  LDD1880  [3]
C206
 Probe Info  		99.73  LDD1881  [3]
C207
 Probe Info  		46.21  LDD1882  [3]
C210
 Probe Info  		99.73  LDD1884  [3]
C211
 Probe Info  		48.50  LDD1885  [3]
C212
 Probe Info  		5.43  LDD1886  [3]
C213
 Probe Info  		54.57  LDD1887  [3]
C214
 Probe Info  		10.13  LDD1888  [3]
C218
 Probe Info  		36.00  LDD1892  [3]
C219
 Probe Info  		8.82  LDD1893  [3]
C220
 Probe Info  		50.21  LDD1894  [3]
C225
 Probe Info  		17.75  LDD1898  [3]
C226
 Probe Info  		18.00  LDD1899  [3]
C228
 Probe Info  		99.73  LDD1901  [3]
C229
 Probe Info  		17.03  LDD1902  [3]
C231
 Probe Info  		70.52  LDD1904  [3]
C232
 Probe Info  		96.34  LDD1905  [3]
C233
 Probe Info  		26.35  LDD1906  [3]
C234
 Probe Info  		16.80  LDD1907  [3]
C235
 Probe Info  		77.17  LDD1908  [3]
C238
 Probe Info  		32.22  LDD1911  [3]
C240
 Probe Info  		13.74  LDD1913  [3]
C243
 Probe Info  		48.17  LDD1916  [3]
C244
 Probe Info  		41.64  LDD1917  [3]
C246
 Probe Info  		54.57  LDD1919  [3]
C249
 Probe Info  		36.25  LDD1922  [3]
C264
 Probe Info  		31.78  LDD1935  [3]
C265
 Probe Info  		21.56  LDD1936  [3]
C269
 Probe Info  		6.11  LDD1939  [3]
C270
 Probe Info  		9.51  LDD1940  [3]
C271
 Probe Info  		5.17  LDD1941  [3]
C273
 Probe Info  		11.16  LDD1943  [3]
C277
 Probe Info  		37.27  LDD1947  [3]
C278
 Probe Info  		97.01  LDD1948  [3]
C280
 Probe Info  		13.93  LDD1950  [3]
C282
 Probe Info  		41.07  LDD1952  [3]
C284
 Probe Info  		51.98  LDD1954  [3]
C285
 Probe Info  		99.73  LDD1955  [3]
C286
 Probe Info  		18.51  LDD1956  [3]
C287
 Probe Info  		88.03  LDD1957  [3]
C288
 Probe Info  		47.18  LDD1958  [3]
C289
 Probe Info  		99.73  LDD1959  [3]
C290
 Probe Info  		21.26  LDD1960  [3]
C293
 Probe Info  		37.01  LDD1963  [3]
C296
 Probe Info  		41.07  LDD1966  [3]
C299
 Probe Info  		18.13  LDD1968  [3]
C304
 Probe Info  		6.68  LDD1973  [3]
C305
 Probe Info  		34.30  LDD1974  [3]
C307
 Probe Info  		8.11  LDD1975  [3]
C310
 Probe Info  		20.97  LDD1977  [3]
C313
 Probe Info  		32.00  LDD1980  [3]
C314
 Probe Info  		47.18  LDD1981  [3]
C317
 Probe Info  		8.57  LDD1983  [3]
C322
 Probe Info  		13.27  LDD1988  [3]
C326
 Probe Info  		22.16  LDD1990  [3]
C333
 Probe Info  		5.21  LDD1996  [3]
C338
 Probe Info  		20.39  LDD2001  [3]
C339
 Probe Info  		18.64  LDD2002  [3]
C343
 Probe Info  		37.01  LDD2005  [3]
C348
 Probe Info  		61.39  LDD2009  [3]
C349
 Probe Info  		76.11  LDD2010  [3]
C350
 Probe Info  		99.73  LDD2011  [3]
C353
 Probe Info  		17.75  LDD2014  [3]
C354
 Probe Info  		15.14  LDD2015  [3]
C355
 Probe Info  		88.65  LDD2016  [3]
C356
 Probe Info  		32.90  LDD2017  [3]
C357
 Probe Info  		14.12  LDD2018  [3]
C361
 Probe Info  		18.90  LDD2022  [3]
C362
 Probe Info  		99.73  LDD2023  [3]
C363
 Probe Info  		46.53  LDD2024  [3]
C364
 Probe Info  		53.08  LDD2025  [3]
C366
 Probe Info  		17.51  LDD2027  [3]
C367
 Probe Info  		11.79  LDD2028  [3]
C373
 Probe Info  		8.75  LDD2033  [3]
C376
 Probe Info  		18.51  LDD2036  [3]
C378
 Probe Info  		8.63  LDD2037  [3]
C380
 Probe Info  		5.54  LDD2039  [3]
C382
 Probe Info  		27.47  LDD2041  [3]
C383
 Probe Info  		38.59  LDD2042  [3]
C386
 Probe Info  		14.93  LDD2045  [3]
C388
 Probe Info  		99.73  LDD2047  [3]
C397
 Probe Info  		13.36  LDD2056  [3]
C399
 Probe Info  		20.11  LDD2058  [3]
C403
 Probe Info  		50.56  LDD2061  [3]
C407
 Probe Info  		58.89  LDD2064  [3]
C409
 Probe Info  		7.01  LDD2066  [3]
C413
 Probe Info  		59.30  LDD2069  [3]
C414
 Probe Info  		5.21  LDD2070  [3]
C419
 Probe Info  		27.67  LDD2074  [3]
C420
 Probe Info  		34.06  LDD2075  [3]
C423
 Probe Info  		31.56  LDD2078  [3]
C424
 Probe Info  		41.64  LDD2079  [3]
C426
 Probe Info  		74.03  LDD2081  [3]
C428
 Probe Info  		6.28  LDD2083  [3]
C429
 Probe Info  		39.40  LDD2084  [3]
C430
 Probe Info  		7.21  LDD2085  [3]
C431
 Probe Info  		79.89  LDD2086  [3]
C433
 Probe Info  		7.89  LDD2088  [3]
FFF probe11
 Probe Info  		20.00  LDD0471  [4]
FFF probe14
 Probe Info  		20.00  LDD0477  [4]
FFF probe2
 Probe Info  		20.00  LDD0463  [4]

The Interaction Atlas With This Target

The Drug(s) Related To This Target

Approved
Click To Hide/Show 1 Drug(s) Interacting with This Target
Drug Name Drug Type External ID
Nadh Small molecular drug DB00157

References

1 A Paal-Knorr agent for chemoproteomic profiling of targets of isoketals in cells. Chem Sci. 2021 Oct 15;12(43):14557-14563. doi: 10.1039/d1sc02230j. eCollection 2021 Nov 10.
Mass spectrometry data entry: PXD028270
2 Targeted Proteomic Approaches for Proteome-Wide Characterizations of the AMP-Binding Capacities of Kinases. J Proteome Res. 2022 Aug 5;21(8):2063-2070. doi: 10.1021/acs.jproteome.2c00225. Epub 2022 Jul 12.
3 Large-scale chemoproteomics expedites ligand discovery and predicts ligand behavior in cells. Science. 2024 Apr 26;384(6694):eadk5864. doi: 10.1126/science.adk5864. Epub 2024 Apr 26.
Mass spectrometry data entry: PXD041587
4 Ligand and Target Discovery by Fragment-Based Screening in Human Cells. Cell. 2017 Jan 26;168(3):527-541.e29. doi: 10.1016/j.cell.2016.12.029. Epub 2017 Jan 19.