Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP16813
Target Name Tetraspanin-3 (TSPAN3)
Gene Name TSPAN3
Gene ID 10099
Synonyms
TM4SF8; Tetraspanin-3; Tspan-3; Tetraspanin TM4-A; Transmembrane 4 superfamily member 8
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MAVRQWVIALALAALLVVDREVPVAAGKLPFSRMPICEHMVESPTCSQMSNLVCGTDGLT
YTNECQLCLARIKTKQDIQIMKDGKC
Target Bioclass
Transporter and channel
Family
Tetraspanin (TM4SF) family
Subcellular location
Membrane
Function Regulates the proliferation and migration of oligodendrocytes, a process essential for normal myelination and repair.
Uniprot ID
O60637
Ensemble ID
ENST00000267970.9
HGNC ID
HGNC:17752

Target Site Mutations in Different Cell Lines

Cell line Mutation details Probe for labeling this protein in this cell
OVK18 Deletion: p.S79VfsTer22 .

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 8 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
FBPP2
 Probe Info  		9.86  LDD0318  [1]
TH211
 Probe Info  		Y140(6.92)  LDD0257  [2]
STPyne
 Probe Info  		K121(1.93)  LDD0277  [3]
OPA-S-S-alkyne
 Probe Info  		K110(4.07)  LDD3494  [4]
BTD
 Probe Info  		C4(1.71)  LDD2108  [5]
IA-alkyne
 Probe Info  		C618(0.00); C533(0.00)  LDD0161  [6]
WYneN
 Probe Info  		N.A.  LDD0021  [7]
IPM
 Probe Info  		N.A.  LDD0005  [7]
PAL-AfBPP Probe
Click To Hide/Show 140 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
C004
 Probe Info  		8.00  LDD1714  [8]
C007
 Probe Info  		9.38  LDD1716  [8]
C008
 Probe Info  		5.46  LDD1717  [8]
C010
 Probe Info  		9.06  LDD1719  [8]
C011
 Probe Info  		6.45  LDD1720  [8]
C022
 Probe Info  		52.35  LDD1728  [8]
C026
 Probe Info  		15.35  LDD1732  [8]
C040
 Probe Info  		23.75  LDD1740  [8]
C041
 Probe Info  		14.93  LDD1741  [8]
C055
 Probe Info  		25.46  LDD1752  [8]
C056
 Probe Info  		41.36  LDD1753  [8]
C063
 Probe Info  		36.00  LDD1760  [8]
C064
 Probe Info  		9.92  LDD1761  [8]
C067
 Probe Info  		8.57  LDD1763  [8]
C070
 Probe Info  		30.27  LDD1766  [8]
C071
 Probe Info  		8.40  LDD1767  [8]
C072
 Probe Info  		17.03  LDD1768  [8]
C082
 Probe Info  		8.63  LDD1774  [8]
C085
 Probe Info  		5.54  LDD1777  [8]
C087
 Probe Info  		9.92  LDD1779  [8]
C089
 Probe Info  		7.31  LDD1781  [8]
C091
 Probe Info  		54.95  LDD1782  [8]
C092
 Probe Info  		91.14  LDD1783  [8]
C093
 Probe Info  		5.90  LDD1784  [8]
C094
 Probe Info  		88.03  LDD1785  [8]
C100
 Probe Info  		9.32  LDD1789  [8]
C106
 Probe Info  		42.52  LDD1793  [8]
C107
 Probe Info  		17.03  LDD1794  [8]
C108
 Probe Info  		13.93  LDD1795  [8]
C112
 Probe Info  		32.22  LDD1799  [8]
C115
 Probe Info  		5.24  LDD1802  [8]
C129
 Probe Info  		8.06  LDD1811  [8]
C134
 Probe Info  		50.21  LDD1816  [8]
C135
 Probe Info  		17.51  LDD1817  [8]
C139
 Probe Info  		10.41  LDD1821  [8]
C140
 Probe Info  		9.19  LDD1822  [8]
C141
 Probe Info  		31.78  LDD1823  [8]
C143
 Probe Info  		74.54  LDD1825  [8]
C145
 Probe Info  		8.17  LDD1827  [8]
C147
 Probe Info  		19.56  LDD1829  [8]
C149
 Probe Info  		5.13  LDD1830  [8]
C153
 Probe Info  		32.67  LDD1834  [8]
C156
 Probe Info  		5.70  LDD1836  [8]
C159
 Probe Info  		31.12  LDD1839  [8]
C160
 Probe Info  		29.24  LDD1840  [8]
C161
 Probe Info  		64.00  LDD1841  [8]
C163
 Probe Info  		23.43  LDD1843  [8]
C164
 Probe Info  		9.00  LDD1844  [8]
C165
 Probe Info  		19.03  LDD1845  [8]
C166
 Probe Info  		7.46  LDD1846  [8]
C169
 Probe Info  		30.06  LDD1849  [8]
C170
 Probe Info  		24.08  LDD1850  [8]
C171
 Probe Info  		7.67  LDD1851  [8]
C176
 Probe Info  		5.21  LDD1855  [8]
C177
 Probe Info  		24.42  LDD1856  [8]
C178
 Probe Info  		97.01  LDD1857  [8]
C183
 Probe Info  		11.88  LDD1861  [8]
C184
 Probe Info  		7.21  LDD1862  [8]
C186
 Probe Info  		52.35  LDD1864  [8]
C187
 Probe Info  		54.57  LDD1865  [8]
C193
 Probe Info  		7.41  LDD1869  [8]
C194
 Probe Info  		23.10  LDD1870  [8]
C197
 Probe Info  		15.14  LDD1873  [8]
C198
 Probe Info  		25.99  LDD1874  [8]
C201
 Probe Info  		99.73  LDD1877  [8]
C206
 Probe Info  		65.34  LDD1881  [8]
C208
 Probe Info  		14.72  LDD1883  [8]
C211
 Probe Info  		17.75  LDD1885  [8]
C212
 Probe Info  		5.43  LDD1886  [8]
C213
 Probe Info  		26.91  LDD1887  [8]
C218
 Probe Info  		19.56  LDD1892  [8]
C219
 Probe Info  		29.24  LDD1893  [8]
C220
 Probe Info  		64.89  LDD1894  [8]
C221
 Probe Info  		11.39  LDD1895  [8]
C222
 Probe Info  		5.28  LDD1896  [8]
C223
 Probe Info  		23.75  LDD1897  [8]
C225
 Probe Info  		24.76  LDD1898  [8]
C226
 Probe Info  		18.00  LDD1899  [8]
C228
 Probe Info  		77.17  LDD1901  [8]
C229
 Probe Info  		58.89  LDD1902  [8]
C231
 Probe Info  		99.73  LDD1904  [8]
C232
 Probe Info  		99.73  LDD1905  [8]
C233
 Probe Info  		68.59  LDD1906  [8]
C234
 Probe Info  		23.59  LDD1907  [8]
C235
 Probe Info  		99.73  LDD1908  [8]
C240
 Probe Info  		8.22  LDD1913  [8]
C243
 Probe Info  		37.79  LDD1916  [8]
C245
 Probe Info  		8.11  LDD1918  [8]
C246
 Probe Info  		57.68  LDD1919  [8]
C249
 Probe Info  		43.41  LDD1922  [8]
C258
 Probe Info  		6.77  LDD1931  [8]
C264
 Probe Info  		77.71  LDD1935  [8]
C265
 Probe Info  		37.53  LDD1936  [8]
C270
 Probe Info  		14.72  LDD1940  [8]
C273
 Probe Info  		13.83  LDD1943  [8]
C277
 Probe Info  		22.78  LDD1947  [8]
C278
 Probe Info  		74.54  LDD1948  [8]
C280
 Probe Info  		17.27  LDD1950  [8]
C281
 Probe Info  		12.38  LDD1951  [8]
C282
 Probe Info  		47.50  LDD1952  [8]
C284
 Probe Info  		49.87  LDD1954  [8]
C285
 Probe Info  		33.59  LDD1955  [8]
C286
 Probe Info  		6.92  LDD1956  [8]
C287
 Probe Info  		50.91  LDD1957  [8]
C288
 Probe Info  		27.86  LDD1958  [8]
C289
 Probe Info  		74.54  LDD1959  [8]
C290
 Probe Info  		5.06  LDD1960  [8]
C299
 Probe Info  		8.69  LDD1968  [8]
C305
 Probe Info  		21.41  LDD1974  [8]
C307
 Probe Info  		9.32  LDD1975  [8]
C310
 Probe Info  		46.21  LDD1977  [8]
C314
 Probe Info  		57.68  LDD1981  [8]
C322
 Probe Info  		10.85  LDD1988  [8]
C326
 Probe Info  		28.64  LDD1990  [8]
C343
 Probe Info  		22.94  LDD2005  [8]
C348
 Probe Info  		30.27  LDD2009  [8]
C349
 Probe Info  		43.11  LDD2010  [8]
C350
 Probe Info  		99.73  LDD2011  [8]
C353
 Probe Info  		9.58  LDD2014  [8]
C354
 Probe Info  		8.63  LDD2015  [8]
C355
 Probe Info  		73.01  LDD2016  [8]
C356
 Probe Info  		22.32  LDD2017  [8]
C357
 Probe Info  		12.55  LDD2018  [8]
C362
 Probe Info  		99.73  LDD2023  [8]
C363
 Probe Info  		70.52  LDD2024  [8]
C364
 Probe Info  		80.45  LDD2025  [8]
C376
 Probe Info  		27.86  LDD2036  [8]
C378
 Probe Info  		14.72  LDD2037  [8]
C380
 Probe Info  		11.79  LDD2039  [8]
C382
 Probe Info  		18.64  LDD2041  [8]
C383
 Probe Info  		17.51  LDD2042  [8]
C386
 Probe Info  		11.63  LDD2045  [8]
C388
 Probe Info  		99.73  LDD2047  [8]
C390
 Probe Info  		99.73  LDD2049  [8]
C396
 Probe Info  		4.92  LDD2055  [8]
C399
 Probe Info  		11.16  LDD2058  [8]
C403
 Probe Info  		24.25  LDD2061  [8]
C413
 Probe Info  		49.52  LDD2069  [8]
C419
 Probe Info  		24.25  LDD2074  [8]
C420
 Probe Info  		23.10  LDD2075  [8]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0023  KB03 MDA-MB-231 C4(23.69)  LDD1701  [5]
 LDCM0515  Nucleophilic fragment 20b MDA-MB-231 C4(1.71)  LDD2108  [5]
 LDCM0521  Nucleophilic fragment 23b MDA-MB-231 C4(1.78)  LDD2114  [5]

References

1 Tranylcypromine specificity for monoamine oxidase is limited by promiscuous protein labelling and lysosomal trapping. RSC Chem Biol. 2020 Aug 12;1(4):209-213. doi: 10.1039/d0cb00048e. eCollection 2020 Oct 1.
Mass spectrometry data entry: PXD018580
2 Chemoproteomic profiling of kinases in live cells using electrophilic sulfonyl triazole probes. Chem Sci. 2021 Jan 21;12(9):3295-3307. doi: 10.1039/d0sc06623k.
3 A Paal-Knorr agent for chemoproteomic profiling of targets of isoketals in cells. Chem Sci. 2021 Oct 15;12(43):14557-14563. doi: 10.1039/d1sc02230j. eCollection 2021 Nov 10.
Mass spectrometry data entry: PXD028270
4 A chemical proteomics approach for global mapping of functional lysines on cell surface of living cell. Nat Commun. 2024 Apr 8;15(1):2997. doi: 10.1038/s41467-024-47033-w.
Mass spectrometry data entry: PXD042888
5 Nucleophilic covalent ligand discovery for the cysteine redoxome. Nat Chem Biol. 2023 Nov;19(11):1309-1319. doi: 10.1038/s41589-023-01330-5. Epub 2023 May 29.
Mass spectrometry data entry: PXD039908 , PXD029761
6 SP3-FAIMS Chemoproteomics for High-Coverage Profiling of the Human Cysteinome*. Chembiochem. 2021 May 14;22(10):1841-1851. doi: 10.1002/cbic.202000870. Epub 2021 Feb 18.
Mass spectrometry data entry: PXD023056 , PXD023059 , PXD023058 , PXD023057 , PXD023060
7 A modification-centric assessment tool for the performance of chemoproteomic probes. Nat Chem Biol. 2022 Aug;18(8):904-912. doi: 10.1038/s41589-022-01074-8. Epub 2022 Jul 21.
Mass spectrometry data entry: PXD027758 , PXD027755 , PXD027760 , PXD027762 , PXD027756 , PXD027591 , PXD007149 , PXD030064 , PXD032392 , PXD027789 , PXD027767 , PXD027764
8 Large-scale chemoproteomics expedites ligand discovery and predicts ligand behavior in cells. Science. 2024 Apr 26;384(6694):eadk5864. doi: 10.1126/science.adk5864. Epub 2024 Apr 26.
Mass spectrometry data entry: PXD041587