Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP06097
Target Name Reticulocalbin-2 (RCN2)
Gene Name RCN2
Gene ID 5955
Synonyms
ERC55; Reticulocalbin-2; Calcium-binding protein ERC-55; E6-binding protein; E6BP
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MRLGPRTAALGLLLLCAAAAGAGKAEELHYPLGERRSDYDREALLGVQEDVDEYVKLGHE
EQQKRLQAIIKKIDLDSDGFLTESELSSWIQMSFKHYAMQEAKQQFVEYDKNSDDTVTWD
EYNIQMYDRVIDFDENTALDDAEEESFRKLHLKDKKRFEKANQDSGPGLSLEEFIAFEHP
EEVDYMTEFVIQEALEEHDKNGDGFVSLEEFLGDYRWDPTANEDPEWILVEKDRFVNDYD
KDNDGRLDPQELLPWVVPNNQGIAQEEALHLIDEMDLNGDKKLSEEEILENPDLFLTSEA
TDYGRQLHDDYFYHDEL
Target Bioclass
Other
Family
CREC family
Subcellular location
Endoplasmic reticulum lumen
Function Not known. Binds calcium.
Uniprot ID
Q14257
Ensemble ID
ENST00000320963.9
HGNC ID
HGNC:9935

Target Site Mutations in Different Cell Lines

Cell line Mutation details Probe for labeling this protein in this cell
HCC15 SNV: p.G166C .
MFE319 SNV: p.S87G .
RH41 Deletion: p.E210del .
WM1552C SNV: p.D240Y .

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 16 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
FBPP2
 Probe Info  		21.44  LDD0318  [1]
TH211
 Probe Info  		Y109(20.00); Y39(14.73); Y122(12.81); Y97(12.60)  LDD0257  [2]
TH216
 Probe Info  		Y97(20.00)  LDD0259  [2]
STPyne
 Probe Info  		K153(3.34); K155(1.56); K56(0.80); K71(4.47)  LDD0277  [3]
ONAyne
 Probe Info  		N.A.  LDD0273  [3]
Probe 1
 Probe Info  		Y30(10.71); Y54(31.46); Y109(54.81); Y122(13.15)  LDD3495  [4]
HHS-475
 Probe Info  		Y30(1.07)  LDD0264  [5]
HHS-465
 Probe Info  		Y54(7.07)  LDD2237  [6]
5E-2FA
 Probe Info  		H29(0.00); H59(0.00)  LDD2235  [7]
ATP probe
 Probe Info  		N.A.  LDD0199  [8]
m-APA
 Probe Info  		N.A.  LDD2231  [7]
NHS
 Probe Info  		K241(0.00); K64(0.00)  LDD0010  [9]
1c-yne
 Probe Info  		N.A.  LDD0228  [10]
1d-yne
 Probe Info  		N.A.  LDD0357  [10]
Acrolein
 Probe Info  		N.A.  LDD0217  [11]
Crotonaldehyde
 Probe Info  		N.A.  LDD0219  [11]
PAL-AfBPP Probe
Click To Hide/Show 146 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
C001
 Probe Info  		4.99  LDD1711  [12]
C004
 Probe Info  		7.84  LDD1714  [12]
C017
 Probe Info  		15.14  LDD1725  [12]
C022
 Probe Info  		10.41  LDD1728  [12]
C039
 Probe Info  		5.39  LDD1739  [12]
C040
 Probe Info  		29.24  LDD1740  [12]
C041
 Probe Info  		9.06  LDD1741  [12]
C052
 Probe Info  		5.35  LDD1750  [12]
C053
 Probe Info  		8.11  LDD1751  [12]
C055
 Probe Info  		13.27  LDD1752  [12]
C056
 Probe Info  		17.27  LDD1753  [12]
C063
 Probe Info  		22.32  LDD1760  [12]
C070
 Probe Info  		12.47  LDD1766  [12]
C082
 Probe Info  		6.15  LDD1774  [12]
C087
 Probe Info  		21.26  LDD1779  [12]
C091
 Probe Info  		15.14  LDD1782  [12]
C092
 Probe Info  		25.11  LDD1783  [12]
C095
 Probe Info  		6.63  LDD1786  [12]
C100
 Probe Info  		5.66  LDD1789  [12]
C102
 Probe Info  		5.86  LDD1790  [12]
C106
 Probe Info  		50.91  LDD1793  [12]
C107
 Probe Info  		7.94  LDD1794  [12]
C108
 Probe Info  		20.68  LDD1795  [12]
C112
 Probe Info  		40.79  LDD1799  [12]
C131
 Probe Info  		9.65  LDD1813  [12]
C134
 Probe Info  		28.84  LDD1816  [12]
C138
 Probe Info  		6.45  LDD1820  [12]
C139
 Probe Info  		13.83  LDD1821  [12]
C140
 Probe Info  		8.57  LDD1822  [12]
C143
 Probe Info  		13.27  LDD1825  [12]
C145
 Probe Info  		11.79  LDD1827  [12]
C147
 Probe Info  		7.84  LDD1829  [12]
C153
 Probe Info  		18.64  LDD1834  [12]
C156
 Probe Info  		5.31  LDD1836  [12]
C158
 Probe Info  		9.45  LDD1838  [12]
C159
 Probe Info  		9.19  LDD1839  [12]
C160
 Probe Info  		9.38  LDD1840  [12]
C161
 Probe Info  		21.56  LDD1841  [12]
C165
 Probe Info  		22.63  LDD1845  [12]
C166
 Probe Info  		8.17  LDD1846  [12]
C170
 Probe Info  		11.71  LDD1850  [12]
C177
 Probe Info  		9.13  LDD1856  [12]
C178
 Probe Info  		24.76  LDD1857  [12]
C183
 Probe Info  		5.43  LDD1861  [12]
C186
 Probe Info  		10.93  LDD1864  [12]
C187
 Probe Info  		20.97  LDD1865  [12]
C191
 Probe Info  		15.45  LDD1868  [12]
C194
 Probe Info  		11.96  LDD1870  [12]
C196
 Probe Info  		12.13  LDD1872  [12]
C197
 Probe Info  		5.54  LDD1873  [12]
C198
 Probe Info  		12.82  LDD1874  [12]
C201
 Probe Info  		56.10  LDD1877  [12]
C206
 Probe Info  		25.46  LDD1881  [12]
C210
 Probe Info  		41.64  LDD1884  [12]
C216
 Probe Info  		5.10  LDD1890  [12]
C218
 Probe Info  		29.86  LDD1892  [12]
C219
 Probe Info  		5.78  LDD1893  [12]
C220
 Probe Info  		28.25  LDD1894  [12]
C223
 Probe Info  		4.92  LDD1897  [12]
C225
 Probe Info  		4.96  LDD1898  [12]
C226
 Probe Info  		6.06  LDD1899  [12]
C228
 Probe Info  		29.86  LDD1901  [12]
C229
 Probe Info  		7.16  LDD1902  [12]
C231
 Probe Info  		16.91  LDD1904  [12]
C232
 Probe Info  		79.34  LDD1905  [12]
C233
 Probe Info  		12.38  LDD1906  [12]
C234
 Probe Info  		5.90  LDD1907  [12]
C235
 Probe Info  		22.32  LDD1908  [12]
C238
 Probe Info  		11.00  LDD1911  [12]
C243
 Probe Info  		11.79  LDD1916  [12]
C244
 Probe Info  		24.76  LDD1917  [12]
C246
 Probe Info  		18.90  LDD1919  [12]
C249
 Probe Info  		26.72  LDD1922  [12]
C264
 Probe Info  		16.34  LDD1935  [12]
C265
 Probe Info  		15.35  LDD1936  [12]
C269
 Probe Info  		7.62  LDD1939  [12]
C270
 Probe Info  		8.88  LDD1940  [12]
C277
 Probe Info  		11.71  LDD1947  [12]
C282
 Probe Info  		15.78  LDD1952  [12]
C284
 Probe Info  		32.22  LDD1954  [12]
C285
 Probe Info  		24.08  LDD1955  [12]
C288
 Probe Info  		8.06  LDD1958  [12]
C289
 Probe Info  		42.52  LDD1959  [12]
C290
 Probe Info  		5.78  LDD1960  [12]
C293
 Probe Info  		25.46  LDD1963  [12]
C296
 Probe Info  		19.97  LDD1966  [12]
C302
 Probe Info  		8.75  LDD1971  [12]
C305
 Probe Info  		20.97  LDD1974  [12]
C310
 Probe Info  		24.76  LDD1977  [12]
C313
 Probe Info  		21.41  LDD1980  [12]
C314
 Probe Info  		19.84  LDD1981  [12]
C317
 Probe Info  		8.94  LDD1983  [12]
C322
 Probe Info  		8.51  LDD1988  [12]
C326
 Probe Info  		11.08  LDD1990  [12]
C338
 Probe Info  		40.79  LDD2001  [12]
C339
 Probe Info  		5.98  LDD2002  [12]
C343
 Probe Info  		12.13  LDD2005  [12]
C346
 Probe Info  		14.62  LDD2007  [12]
C347
 Probe Info  		6.73  LDD2008  [12]
C348
 Probe Info  		31.56  LDD2009  [12]
C349
 Probe Info  		20.11  LDD2010  [12]
C350
 Probe Info  		70.52  LDD2011  [12]
C351
 Probe Info  		6.02  LDD2012  [12]
C353
 Probe Info  		14.72  LDD2014  [12]
C354
 Probe Info  		15.24  LDD2015  [12]
C355
 Probe Info  		35.51  LDD2016  [12]
C356
 Probe Info  		10.56  LDD2017  [12]
C361
 Probe Info  		32.00  LDD2022  [12]
C362
 Probe Info  		27.10  LDD2023  [12]
C363
 Probe Info  		18.51  LDD2024  [12]
C364
 Probe Info  		17.75  LDD2025  [12]
C376
 Probe Info  		6.77  LDD2036  [12]
C380
 Probe Info  		5.86  LDD2039  [12]
C382
 Probe Info  		18.25  LDD2041  [12]
C383
 Probe Info  		18.90  LDD2042  [12]
C386
 Probe Info  		7.16  LDD2045  [12]
C388
 Probe Info  		65.80  LDD2047  [12]
C389
 Probe Info  		6.54  LDD2048  [12]
C390
 Probe Info  		61.39  LDD2049  [12]
C391
 Probe Info  		52.35  LDD2050  [12]
C397
 Probe Info  		10.56  LDD2056  [12]
C399
 Probe Info  		7.36  LDD2058  [12]
C403
 Probe Info  		34.30  LDD2061  [12]
C407
 Probe Info  		17.51  LDD2064  [12]
C413
 Probe Info  		20.53  LDD2069  [12]
C420
 Probe Info  		22.63  LDD2075  [12]
C424
 Probe Info  		9.38  LDD2079  [12]
C429
 Probe Info  		29.24  LDD2084  [12]
C430
 Probe Info  		7.84  LDD2085  [12]
C431
 Probe Info  		39.40  LDD2086  [12]
C433
 Probe Info  		14.42  LDD2088  [12]
FFF probe11
 Probe Info  		14.22  LDD0471  [13]
FFF probe12
 Probe Info  		15.50  LDD0473  [13]
FFF probe13
 Probe Info  		20.00  LDD0475  [13]
FFF probe14
 Probe Info  		16.29  LDD0477  [13]
FFF probe15
 Probe Info  		5.29  LDD0478  [13]
FFF probe2
 Probe Info  		20.00  LDD0463  [13]
FFF probe3
 Probe Info  		20.00  LDD0464  [13]
FFF probe4
 Probe Info  		11.19  LDD0466  [13]
FFF probe6
 Probe Info  		15.84  LDD0467  [13]
FFF probe7
 Probe Info  		5.89  LDD0483  [13]
FFF probe9
 Probe Info  		20.00  LDD0470  [13]
JN0003
 Probe Info  		20.00  LDD0469  [13]
BD-F
 Probe Info  		N.A.  LDD0024  [14]
LD-F
 Probe Info  		E290(0.00); E299(0.00); E285(0.00)  LDD0015  [14]
OEA-DA
 Probe Info  		18.57  LDD0046  [15]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0108  Chloroacetamide HeLa H96(0.00); H59(0.00)  LDD0222  [11]
 LDCM0116  HHS-0101 DM93 Y30(1.07)  LDD0264  [5]
 LDCM0117  HHS-0201 DM93 Y30(0.60)  LDD0265  [5]
 LDCM0118  HHS-0301 DM93 Y30(0.76)  LDD0266  [5]
 LDCM0119  HHS-0401 DM93 Y30(0.94)  LDD0267  [5]
 LDCM0120  HHS-0701 DM93 Y30(0.76)  LDD0268  [5]
 LDCM0107  IAA HeLa H96(0.00); H59(0.00)  LDD0221  [11]
 LDCM0109  NEM HeLa H59(0.00); H308(0.00); H96(0.00); H29(0.00)  LDD0223  [11]

The Interaction Atlas With This Target

The Protein(s) Related To This Target

Enzyme
Click To Hide/Show 1 Protein(s) Interacting with This Target
Protein name Family Uniprot ID
E3 ubiquitin-protein ligase CHIP (STUB1) . Q9UNE7
Other
Click To Hide/Show 2 Protein(s) Interacting with This Target
Protein name Family Uniprot ID
Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 1 (GABARAPL1) ATG8 family Q9H0R8
Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2 (GABARAPL2) ATG8 family P60520

References

1 Tranylcypromine specificity for monoamine oxidase is limited by promiscuous protein labelling and lysosomal trapping. RSC Chem Biol. 2020 Aug 12;1(4):209-213. doi: 10.1039/d0cb00048e. eCollection 2020 Oct 1.
Mass spectrometry data entry: PXD018580
2 Chemoproteomic profiling of kinases in live cells using electrophilic sulfonyl triazole probes. Chem Sci. 2021 Jan 21;12(9):3295-3307. doi: 10.1039/d0sc06623k.
3 A Paal-Knorr agent for chemoproteomic profiling of targets of isoketals in cells. Chem Sci. 2021 Oct 15;12(43):14557-14563. doi: 10.1039/d1sc02230j. eCollection 2021 Nov 10.
Mass spectrometry data entry: PXD028270
4 An Azo Coupling-Based Chemoproteomic Approach to Systematically Profile the Tyrosine Reactivity in the Human Proteome. Anal Chem. 2021 Jul 27;93(29):10334-10342. doi: 10.1021/acs.analchem.1c01935. Epub 2021 Jul 12.
5 Discovery of a Cell-Active SuTEx Ligand of Prostaglandin Reductase 2. Chembiochem. 2021 Jun 15;22(12):2134-2139. doi: 10.1002/cbic.202000879. Epub 2021 Apr 29.
6 Global targeting of functional tyrosines using sulfur-triazole exchange chemistry. Nat Chem Biol. 2020 Feb;16(2):150-159. doi: 10.1038/s41589-019-0404-5. Epub 2019 Nov 25.
7 Global profiling of functional histidines in live cells using small-molecule photosensitizer and chemical probe relay labelling. Nat Chem. 2024 Jun 4. doi: 10.1038/s41557-024-01545-6. Online ahead of print.
Mass spectrometry data entry: PXD042377
8 Targeted Proteomic Approaches for Proteome-Wide Characterizations of the AMP-Binding Capacities of Kinases. J Proteome Res. 2022 Aug 5;21(8):2063-2070. doi: 10.1021/acs.jproteome.2c00225. Epub 2022 Jul 12.
9 A modification-centric assessment tool for the performance of chemoproteomic probes. Nat Chem Biol. 2022 Aug;18(8):904-912. doi: 10.1038/s41589-022-01074-8. Epub 2022 Jul 21.
Mass spectrometry data entry: PXD027758 , PXD027755 , PXD027760 , PXD027762 , PXD027756 , PXD027591 , PXD007149 , PXD030064 , PXD032392 , PXD027789 , PXD027767 , PXD027764
10 Tunable Amine-Reactive Electrophiles for Selective Profiling of Lysine. Angew Chem Int Ed Engl. 2022 Jan 26;61(5):e202112107. doi: 10.1002/anie.202112107. Epub 2021 Dec 16.
11 ACR-Based Probe for the Quantitative Profiling of Histidine Reactivity in the Human Proteome. J Am Chem Soc. 2023 Mar 8;145(9):5252-5260. doi: 10.1021/jacs.2c12653. Epub 2023 Feb 27.
12 Large-scale chemoproteomics expedites ligand discovery and predicts ligand behavior in cells. Science. 2024 Apr 26;384(6694):eadk5864. doi: 10.1126/science.adk5864. Epub 2024 Apr 26.
Mass spectrometry data entry: PXD041587
13 Ligand and Target Discovery by Fragment-Based Screening in Human Cells. Cell. 2017 Jan 26;168(3):527-541.e29. doi: 10.1016/j.cell.2016.12.029. Epub 2017 Jan 19.
14 Evaluation of fully-functionalized diazirine tags for chemical proteomic applications. Chem Sci. 2021 May 7;12(22):7839-7847. doi: 10.1039/d1sc01360b.
Mass spectrometry data entry: PXD025652
15 Mapping Protein Targets of Bioactive Small Molecules Using Lipid-Based Chemical Proteomics. ACS Chem Biol. 2017 Oct 20;12(10):2671-2681. doi: 10.1021/acschembio.7b00581. Epub 2017 Sep 20.
Mass spectrometry data entry: PXD007570