Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP18373
Target Name Thioredoxin-related transmembrane protein 4 (TMX4)
Gene Name TMX4
Gene ID 56255
Synonyms
KIAA1162; TXNDC13; Thioredoxin-related transmembrane protein 4; Thioredoxin domain-containing protein 13
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MNQENPPPYPGPGPTAPYPPYPPQPMGPGPMGGPYPPPQGYPYQGYPQYGWQGGPQEPPK
TTVYVVEDQRRDELGPSTCLTACWTALCCCCLWDMLT
Target Bioclass
Other
Subcellular location
Nucleus inner membrane
Uniprot ID
Q9H1E5
Ensemble ID
ENST00000246024.7
HGNC ID
HGNC:25237

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 7 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
IA-alkyne
 Probe Info  		C326(0.99)  LDD0304  [1]
m-APA
 Probe Info  		12.64  LDD0403  [2]
HPAP
 Probe Info  		5.18  LDD0062  [3]
Alkyne-RA190
 Probe Info  		6.32  LDD0299  [1]
DBIA
 Probe Info  		C326(1.04)  LDD1492  [4]
NAIA_4
 Probe Info  		N.A.  LDD2226  [5]
NAIA_5
 Probe Info  		N.A.  LDD2224  [5]
PAL-AfBPP Probe
Click To Hide/Show 126 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
C004
 Probe Info  		7.06  LDD1714  [6]
C017
 Probe Info  		6.06  LDD1725  [6]
C022
 Probe Info  		17.39  LDD1728  [6]
C026
 Probe Info  		6.06  LDD1732  [6]
C027
 Probe Info  		5.86  LDD1733  [6]
C039
 Probe Info  		4.96  LDD1739  [6]
C040
 Probe Info  		34.06  LDD1740  [6]
C041
 Probe Info  		6.41  LDD1741  [6]
C049
 Probe Info  		7.52  LDD1747  [6]
C055
 Probe Info  		18.77  LDD1752  [6]
C056
 Probe Info  		35.51  LDD1753  [6]
C063
 Probe Info  		19.16  LDD1760  [6]
C070
 Probe Info  		17.15  LDD1766  [6]
C072
 Probe Info  		12.64  LDD1768  [6]
C082
 Probe Info  		7.67  LDD1774  [6]
C087
 Probe Info  		8.34  LDD1779  [6]
C091
 Probe Info  		36.76  LDD1782  [6]
C092
 Probe Info  		61.82  LDD1783  [6]
C094
 Probe Info  		53.08  LDD1785  [6]
C095
 Probe Info  		7.73  LDD1786  [6]
C106
 Probe Info  		45.25  LDD1793  [6]
C107
 Probe Info  		10.63  LDD1794  [6]
C108
 Probe Info  		14.12  LDD1795  [6]
C112
 Probe Info  		44.94  LDD1799  [6]
C129
 Probe Info  		5.46  LDD1811  [6]
C130
 Probe Info  		7.73  LDD1812  [6]
C134
 Probe Info  		43.71  LDD1816  [6]
C135
 Probe Info  		14.12  LDD1817  [6]
C139
 Probe Info  		11.08  LDD1821  [6]
C141
 Probe Info  		16.68  LDD1823  [6]
C143
 Probe Info  		27.47  LDD1825  [6]
C153
 Probe Info  		32.67  LDD1834  [6]
C159
 Probe Info  		9.32  LDD1839  [6]
C160
 Probe Info  		9.58  LDD1840  [6]
C161
 Probe Info  		12.13  LDD1841  [6]
C163
 Probe Info  		16.34  LDD1843  [6]
C165
 Probe Info  		26.91  LDD1845  [6]
C166
 Probe Info  		15.03  LDD1846  [6]
C169
 Probe Info  		60.13  LDD1849  [6]
C170
 Probe Info  		7.62  LDD1850  [6]
C177
 Probe Info  		7.52  LDD1856  [6]
C178
 Probe Info  		23.59  LDD1857  [6]
C183
 Probe Info  		5.54  LDD1861  [6]
C186
 Probe Info  		11.88  LDD1864  [6]
C187
 Probe Info  		22.32  LDD1865  [6]
C194
 Probe Info  		10.34  LDD1870  [6]
C196
 Probe Info  		16.45  LDD1872  [6]
C198
 Probe Info  		14.22  LDD1874  [6]
C210
 Probe Info  		99.73  LDD1884  [6]
C211
 Probe Info  		14.03  LDD1885  [6]
C213
 Probe Info  		25.63  LDD1887  [6]
C214
 Probe Info  		6.11  LDD1888  [6]
C218
 Probe Info  		35.26  LDD1892  [6]
C219
 Probe Info  		11.55  LDD1893  [6]
C220
 Probe Info  		28.05  LDD1894  [6]
C225
 Probe Info  		5.39  LDD1898  [6]
C226
 Probe Info  		6.19  LDD1899  [6]
C228
 Probe Info  		28.25  LDD1901  [6]
C229
 Probe Info  		7.67  LDD1902  [6]
C231
 Probe Info  		47.18  LDD1904  [6]
C232
 Probe Info  		56.89  LDD1905  [6]
C233
 Probe Info  		17.15  LDD1906  [6]
C234
 Probe Info  		5.86  LDD1907  [6]
C235
 Probe Info  		43.41  LDD1908  [6]
C238
 Probe Info  		21.26  LDD1911  [6]
C240
 Probe Info  		12.64  LDD1913  [6]
C243
 Probe Info  		26.35  LDD1916  [6]
C244
 Probe Info  		18.90  LDD1917  [6]
C246
 Probe Info  		52.71  LDD1919  [6]
C249
 Probe Info  		15.35  LDD1922  [6]
C252
 Probe Info  		25.63  LDD1925  [6]
C264
 Probe Info  		32.67  LDD1935  [6]
C265
 Probe Info  		25.11  LDD1936  [6]
C270
 Probe Info  		11.24  LDD1940  [6]
C277
 Probe Info  		10.48  LDD1947  [6]
C278
 Probe Info  		94.35  LDD1948  [6]
C282
 Probe Info  		32.22  LDD1952  [6]
C284
 Probe Info  		26.54  LDD1954  [6]
C285
 Probe Info  		57.68  LDD1955  [6]
C287
 Probe Info  		25.81  LDD1957  [6]
C288
 Probe Info  		10.85  LDD1958  [6]
C289
 Probe Info  		99.73  LDD1959  [6]
C290
 Probe Info  		5.86  LDD1960  [6]
C293
 Probe Info  		58.08  LDD1963  [6]
C296
 Probe Info  		30.06  LDD1966  [6]
C299
 Probe Info  		12.73  LDD1968  [6]
C305
 Probe Info  		14.93  LDD1974  [6]
C310
 Probe Info  		21.56  LDD1977  [6]
C314
 Probe Info  		15.89  LDD1981  [6]
C338
 Probe Info  		11.47  LDD2001  [6]
C339
 Probe Info  		7.84  LDD2002  [6]
C343
 Probe Info  		18.25  LDD2005  [6]
C348
 Probe Info  		18.77  LDD2009  [6]
C349
 Probe Info  		58.89  LDD2010  [6]
C350
 Probe Info  		94.35  LDD2011  [6]
C353
 Probe Info  		8.57  LDD2014  [6]
C355
 Probe Info  		55.72  LDD2016  [6]
C356
 Probe Info  		17.63  LDD2017  [6]
C357
 Probe Info  		7.89  LDD2018  [6]
C362
 Probe Info  		99.73  LDD2023  [6]
C363
 Probe Info  		25.63  LDD2024  [6]
C364
 Probe Info  		36.25  LDD2025  [6]
C366
 Probe Info  		15.35  LDD2027  [6]
C367
 Probe Info  		7.21  LDD2028  [6]
C373
 Probe Info  		5.90  LDD2033  [6]
C376
 Probe Info  		8.28  LDD2036  [6]
C380
 Probe Info  		4.99  LDD2039  [6]
C382
 Probe Info  		17.39  LDD2041  [6]
C383
 Probe Info  		12.38  LDD2042  [6]
C388
 Probe Info  		71.01  LDD2047  [6]
C390
 Probe Info  		41.64  LDD2049  [6]
C399
 Probe Info  		12.38  LDD2058  [6]
C403
 Probe Info  		38.32  LDD2061  [6]
C407
 Probe Info  		49.87  LDD2064  [6]
C413
 Probe Info  		17.75  LDD2069  [6]
C420
 Probe Info  		12.21  LDD2075  [6]
C424
 Probe Info  		17.88  LDD2079  [6]
C426
 Probe Info  		22.94  LDD2081  [6]
C429
 Probe Info  		24.25  LDD2084  [6]
C431
 Probe Info  		29.24  LDD2086  [6]
FFF probe11
 Probe Info  		20.00  LDD0471  [7]
FFF probe14
 Probe Info  		20.00  LDD0477  [7]
FFF probe2
 Probe Info  		20.00  LDD0463  [7]
FFF probe3
 Probe Info  		20.00  LDD0464  [7]
VE-P
 Probe Info  		N.A.  LDD0396  [8]
OEA-DA
 Probe Info  		5.13  LDD0046  [9]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0156  Aniline NCI-H1299 12.64  LDD0403  [2]
 LDCM0022  KB02 HEK-293T C326(1.04)  LDD1492  [4]
 LDCM0023  KB03 HEK-293T C326(1.13)  LDD1497  [4]
 LDCM0024  KB05 HEK-293T C326(1.05)  LDD1502  [4]
 LDCM0014  Panhematin HEK-293T 5.18  LDD0062  [3]
 LDCM0131  RA190 MM1.R 6.32  LDD0299  [1]

References

1 Physical and Functional Analysis of the Putative Rpn13 Inhibitor RA190. Cell Chem Biol. 2020 Nov 19;27(11):1371-1382.e6. doi: 10.1016/j.chembiol.2020.08.007. Epub 2020 Aug 27.
2 Quantitative and Site-Specific Chemoproteomic Profiling of Targets of Acrolein. Chem Res Toxicol. 2019 Mar 18;32(3):467-473. doi: 10.1021/acs.chemrestox.8b00343. Epub 2019 Jan 15.
3 A Chemical Proteomic Map of Heme-Protein Interactions. J Am Chem Soc. 2022 Aug 24;144(33):15013-15019. doi: 10.1021/jacs.2c06104. Epub 2022 Aug 12.
Mass spectrometry data entry: PXD034651
4 Accelerating multiplexed profiling of protein-ligand interactions: High-throughput plate-based reactive cysteine profiling with minimal input. Cell Chem Biol. 2024 Mar 21;31(3):565-576.e4. doi: 10.1016/j.chembiol.2023.11.015. Epub 2023 Dec 19.
Mass spectrometry data entry: PXD044402
5 N-Acryloylindole-alkyne (NAIA) enables imaging and profiling new ligandable cysteines and oxidized thiols by chemoproteomics. Nat Commun. 2023 Jun 15;14(1):3564. doi: 10.1038/s41467-023-39268-w.
Mass spectrometry data entry: PXD041264
6 Large-scale chemoproteomics expedites ligand discovery and predicts ligand behavior in cells. Science. 2024 Apr 26;384(6694):eadk5864. doi: 10.1126/science.adk5864. Epub 2024 Apr 26.
Mass spectrometry data entry: PXD041587
7 Ligand and Target Discovery by Fragment-Based Screening in Human Cells. Cell. 2017 Jan 26;168(3):527-541.e29. doi: 10.1016/j.cell.2016.12.029. Epub 2017 Jan 19.
8 Pharmacological Targeting of Vacuolar H(+)-ATPase via Subunit V1G Combats Multidrug-Resistant Cancer. Cell Chem Biol. 2020 Nov 19;27(11):1359-1370.e8. doi: 10.1016/j.chembiol.2020.06.011. Epub 2020 Jul 9.
9 Mapping Protein Targets of Bioactive Small Molecules Using Lipid-Based Chemical Proteomics. ACS Chem Biol. 2017 Oct 20;12(10):2671-2681. doi: 10.1021/acschembio.7b00581. Epub 2017 Sep 20.
Mass spectrometry data entry: PXD007570