Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP13620
Target Name Lysosomal thioesterase PPT2 (PPT2)
Gene Name PPT2
Gene ID 9374
Synonyms
Lysosomal thioesterase PPT2; PPT-2; EC 3.1.2.-; S-thioesterase G14
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MEFTASPKPQLSSRANAFSIAALMSSGGSKEKEATENTIKPLEQFVEKSSCAQPLGELTS
LDAHGEFGGGSGSSPSSSSLCTEPLIPTTPIIPSEEMAKIACSLETKELWDKFHELGTEM
IITKSGRRMFPTIRVSFSGVDPEAKYIVLMDIVPVDNKRYRYAYHRSSWLVAGKADPPLP
ARLYVHPDSPFTGEQLLKQMVSFEKVKLTNNELDQHGHIILNSMHKYQPRVHIIKKKDHT
ASLLNLKSEEFRTFIFPETVFTAVTAYQNQLITKLKIDSNPFAKGFRDSSRLTDIERESV
ESLIQKHSYARSPIRTYGGEEDVLGDESQTTPNRGSAFTTSDNLSLSSWVSSSSSFPGFQ
HPQSLTALGTSTASIATPIPHPIQGSLPPYSRLGMPLTPSAIASSMQGSGPTFPSFHMPR
YHHYFQQGPYAAIQGLRHSSAVMTPFV
Target Bioclass
Enzyme
Family
Palmitoyl-protein thioesterase family
Subcellular location
Lysosome
Function
Removes thioester-linked fatty acyl groups from various substrates including S-palmitoyl-CoA. Has the highest S-thioesterase activity for the acyl groups palmitic and myristic acid followed by other short- and long-chain acyl substrates. However, because of structural constraints, is unable to remove palmitate from peptides or proteins.
Uniprot ID
Q9UMR5
Ensemble ID
ENST00000324816.11
HGNC ID
HGNC:9326
ChEMBL ID
CHEMBL2189137

Target Site Mutations in Different Cell Lines

Cell line Mutation details Probe for labeling this protein in this cell
BT549 SNV: p.Y36Ter .
NCIH716 SNV: p.K212E .
OVCAR4 SNV: p.M157R .
SHP77 SNV: p.F241L .
SKMEL28 SNV: p.Y36Ter .
TCCSUP SNV: p.S261C .
THP1 SNV: p.K265E .

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 4 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
HDSF-alk
 Probe Info  		3.57  LDD0197  [1]
FBPP2
 Probe Info  		26.02  LDD0318  [2]
DBIA
 Probe Info  		C296(1.14)  LDD1509  [3]
IA-alkyne
 Probe Info  		N.A.  LDD0165  [4]
PAL-AfBPP Probe
Click To Hide/Show 118 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
C017
 Probe Info  		9.13  LDD1725  [5]
C022
 Probe Info  		10.41  LDD1728  [5]
C036
 Probe Info  		7.46  LDD1736  [5]
C039
 Probe Info  		10.85  LDD1739  [5]
C040
 Probe Info  		14.52  LDD1740  [5]
C041
 Probe Info  		18.00  LDD1741  [5]
C045
 Probe Info  		15.89  LDD1744  [5]
C053
 Probe Info  		8.40  LDD1751  [5]
C063
 Probe Info  		15.67  LDD1760  [5]
C067
 Probe Info  		4.96  LDD1763  [5]
C070
 Probe Info  		20.11  LDD1766  [5]
C071
 Probe Info  		13.36  LDD1767  [5]
C072
 Probe Info  		7.52  LDD1768  [5]
C073
 Probe Info  		11.88  LDD1769  [5]
C082
 Probe Info  		8.75  LDD1774  [5]
C085
 Probe Info  		7.21  LDD1777  [5]
C087
 Probe Info  		31.34  LDD1779  [5]
C106
 Probe Info  		76.64  LDD1793  [5]
C107
 Probe Info  		15.03  LDD1794  [5]
C108
 Probe Info  		26.72  LDD1795  [5]
C112
 Probe Info  		27.10  LDD1799  [5]
C115
 Probe Info  		12.64  LDD1802  [5]
C134
 Probe Info  		22.78  LDD1816  [5]
C139
 Probe Info  		12.13  LDD1821  [5]
C140
 Probe Info  		12.13  LDD1822  [5]
C141
 Probe Info  		18.90  LDD1823  [5]
C143
 Probe Info  		14.03  LDD1825  [5]
C145
 Probe Info  		13.83  LDD1827  [5]
C147
 Probe Info  		9.92  LDD1829  [5]
C149
 Probe Info  		12.04  LDD1830  [5]
C153
 Probe Info  		31.56  LDD1834  [5]
C158
 Probe Info  		9.13  LDD1838  [5]
C159
 Probe Info  		13.83  LDD1839  [5]
C160
 Probe Info  		11.47  LDD1840  [5]
C161
 Probe Info  		32.45  LDD1841  [5]
C163
 Probe Info  		8.57  LDD1843  [5]
C164
 Probe Info  		13.45  LDD1844  [5]
C165
 Probe Info  		23.59  LDD1845  [5]
C170
 Probe Info  		68.59  LDD1850  [5]
C171
 Probe Info  		18.38  LDD1851  [5]
C177
 Probe Info  		26.17  LDD1856  [5]
C178
 Probe Info  		65.80  LDD1857  [5]
C182
 Probe Info  		11.16  LDD1860  [5]
C187
 Probe Info  		23.43  LDD1865  [5]
C197
 Probe Info  		5.78  LDD1873  [5]
C208
 Probe Info  		23.26  LDD1883  [5]
C211
 Probe Info  		21.86  LDD1885  [5]
C212
 Probe Info  		5.78  LDD1886  [5]
C213
 Probe Info  		25.46  LDD1887  [5]
C218
 Probe Info  		12.38  LDD1892  [5]
C219
 Probe Info  		6.96  LDD1893  [5]
C220
 Probe Info  		36.76  LDD1894  [5]
C221
 Probe Info  		16.56  LDD1895  [5]
C223
 Probe Info  		13.74  LDD1897  [5]
C225
 Probe Info  		7.31  LDD1898  [5]
C226
 Probe Info  		6.32  LDD1899  [5]
C228
 Probe Info  		20.25  LDD1901  [5]
C229
 Probe Info  		9.58  LDD1902  [5]
C231
 Probe Info  		20.11  LDD1904  [5]
C232
 Probe Info  		99.73  LDD1905  [5]
C233
 Probe Info  		11.88  LDD1906  [5]
C235
 Probe Info  		26.54  LDD1908  [5]
C237
 Probe Info  		12.55  LDD1910  [5]
C239
 Probe Info  		5.98  LDD1912  [5]
C240
 Probe Info  		8.28  LDD1913  [5]
C243
 Probe Info  		11.63  LDD1916  [5]
C246
 Probe Info  		15.03  LDD1919  [5]
C249
 Probe Info  		26.54  LDD1922  [5]
C264
 Probe Info  		24.42  LDD1935  [5]
C265
 Probe Info  		24.59  LDD1936  [5]
C270
 Probe Info  		9.25  LDD1940  [5]
C277
 Probe Info  		12.38  LDD1947  [5]
C280
 Probe Info  		10.78  LDD1950  [5]
C281
 Probe Info  		10.63  LDD1951  [5]
C282
 Probe Info  		14.12  LDD1952  [5]
C284
 Probe Info  		30.91  LDD1954  [5]
C286
 Probe Info  		6.68  LDD1956  [5]
C287
 Probe Info  		16.34  LDD1957  [5]
C288
 Probe Info  		15.35  LDD1958  [5]
C289
 Probe Info  		29.86  LDD1959  [5]
C290
 Probe Info  		4.99  LDD1960  [5]
C293
 Probe Info  		35.51  LDD1963  [5]
C296
 Probe Info  		24.93  LDD1966  [5]
C299
 Probe Info  		19.43  LDD1968  [5]
C302
 Probe Info  		9.06  LDD1971  [5]
C303
 Probe Info  		6.45  LDD1972  [5]
C305
 Probe Info  		19.29  LDD1974  [5]
C310
 Probe Info  		40.50  LDD1977  [5]
C314
 Probe Info  		28.84  LDD1981  [5]
C326
 Probe Info  		23.26  LDD1990  [5]
C343
 Probe Info  		18.64  LDD2005  [5]
C346
 Probe Info  		36.76  LDD2007  [5]
C355
 Probe Info  		91.14  LDD2016  [5]
C356
 Probe Info  		22.32  LDD2017  [5]
C357
 Probe Info  		8.75  LDD2018  [5]
C361
 Probe Info  		20.11  LDD2022  [5]
C362
 Probe Info  		72.00  LDD2023  [5]
C363
 Probe Info  		34.78  LDD2024  [5]
C364
 Probe Info  		30.91  LDD2025  [5]
C369
 Probe Info  		5.31  LDD2030  [5]
C383
 Probe Info  		33.59  LDD2042  [5]
C386
 Probe Info  		12.55  LDD2045  [5]
C387
 Probe Info  		5.35  LDD2046  [5]
C388
 Probe Info  		41.64  LDD2047  [5]
C390
 Probe Info  		55.72  LDD2049  [5]
C399
 Probe Info  		13.93  LDD2058  [5]
C403
 Probe Info  		32.67  LDD2061  [5]
C413
 Probe Info  		29.65  LDD2069  [5]
C425
 Probe Info  		20.39  LDD2080  [5]
C428
 Probe Info  		5.17  LDD2083  [5]
C429
 Probe Info  		35.51  LDD2084  [5]
C431
 Probe Info  		53.82  LDD2086  [5]
C433
 Probe Info  		6.50  LDD2088  [5]
FFF probe11
 Probe Info  		20.00  LDD0471  [6]
FFF probe12
 Probe Info  		20.00  LDD0473  [6]
FFF probe14
 Probe Info  		20.00  LDD0477  [6]
FFF probe15
 Probe Info  		16.70  LDD0478  [6]
FFF probe9
 Probe Info  		20.00  LDD0470  [6]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0226  AC11 HEK-293T C296(1.14)  LDD1509  [3]
 LDCM0270  AC15 HEK-293T C296(1.04)  LDD1513  [3]
 LDCM0278  AC19 HEK-293T C296(1.16)  LDD1517  [3]
 LDCM0283  AC23 HEK-293T C296(0.92)  LDD1522  [3]
 LDCM0287  AC27 HEK-293T C296(0.91)  LDD1526  [3]
 LDCM0290  AC3 HEK-293T C296(0.86)  LDD1529  [3]
 LDCM0292  AC31 HEK-293T C296(0.91)  LDD1531  [3]
 LDCM0296  AC35 HEK-293T C296(1.11)  LDD1535  [3]
 LDCM0300  AC39 HEK-293T C296(1.02)  LDD1539  [3]
 LDCM0305  AC43 HEK-293T C296(1.06)  LDD1544  [3]
 LDCM0309  AC47 HEK-293T C296(1.00)  LDD1548  [3]
 LDCM0314  AC51 HEK-293T C296(1.11)  LDD1553  [3]
 LDCM0318  AC55 HEK-293T C296(0.86)  LDD1557  [3]
 LDCM0322  AC59 HEK-293T C296(0.91)  LDD1561  [3]
 LDCM0327  AC63 HEK-293T C296(0.98)  LDD1566  [3]
 LDCM0334  AC7 HEK-293T C296(0.96)  LDD1568  [3]
 LDCM0379  CL11 HEK-293T C296(0.92)  LDD1583  [3]
 LDCM0406  CL19 HEK-293T C296(1.25)  LDD1610  [3]
 LDCM0411  CL23 HEK-293T C296(0.97)  LDD1615  [3]
 LDCM0420  CL31 HEK-293T C296(1.02)  LDD1624  [3]
 LDCM0424  CL35 HEK-293T C296(1.06)  LDD1628  [3]
 LDCM0433  CL43 HEK-293T C296(1.05)  LDD1637  [3]
 LDCM0437  CL47 HEK-293T C296(0.99)  LDD1641  [3]
 LDCM0446  CL55 HEK-293T C296(1.00)  LDD1649  [3]
 LDCM0450  CL59 HEK-293T C296(0.91)  LDD1653  [3]
 LDCM0459  CL67 HEK-293T C296(0.93)  LDD1662  [3]
 LDCM0462  CL7 HEK-293T C296(1.03)  LDD1665  [3]
 LDCM0464  CL71 HEK-293T C296(1.05)  LDD1667  [3]
 LDCM0472  CL79 HEK-293T C296(0.86)  LDD1675  [3]
 LDCM0477  CL83 HEK-293T C296(1.21)  LDD1680  [3]
 LDCM0486  CL91 HEK-293T C296(0.80)  LDD1689  [3]
 LDCM0490  CL95 HEK-293T C296(0.95)  LDD1693  [3]

References

1 Fatty Acyl Sulfonyl Fluoride as an Activity-Based Probe for Profiling Fatty Acid-Associated Proteins in Living Cells. Chembiochem. 2022 Feb 16;23(4):e202100628. doi: 10.1002/cbic.202100628. Epub 2021 Dec 30.
2 Tranylcypromine specificity for monoamine oxidase is limited by promiscuous protein labelling and lysosomal trapping. RSC Chem Biol. 2020 Aug 12;1(4):209-213. doi: 10.1039/d0cb00048e. eCollection 2020 Oct 1.
Mass spectrometry data entry: PXD018580
3 Accelerating multiplexed profiling of protein-ligand interactions: High-throughput plate-based reactive cysteine profiling with minimal input. Cell Chem Biol. 2024 Mar 21;31(3):565-576.e4. doi: 10.1016/j.chembiol.2023.11.015. Epub 2023 Dec 19.
Mass spectrometry data entry: PXD044402
4 SP3-FAIMS Chemoproteomics for High-Coverage Profiling of the Human Cysteinome*. Chembiochem. 2021 May 14;22(10):1841-1851. doi: 10.1002/cbic.202000870. Epub 2021 Feb 18.
Mass spectrometry data entry: PXD023056 , PXD023059 , PXD023058 , PXD023057 , PXD023060
5 Large-scale chemoproteomics expedites ligand discovery and predicts ligand behavior in cells. Science. 2024 Apr 26;384(6694):eadk5864. doi: 10.1126/science.adk5864. Epub 2024 Apr 26.
Mass spectrometry data entry: PXD041587
6 Ligand and Target Discovery by Fragment-Based Screening in Human Cells. Cell. 2017 Jan 26;168(3):527-541.e29. doi: 10.1016/j.cell.2016.12.029. Epub 2017 Jan 19.