Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP15623
Target Name Neuferricin (CYB5D2)
Gene Name CYB5D2
Gene ID 124936
Synonyms
Neuferricin; Cytochrome b5 domain-containing protein 2
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MCGDCVEKEYPNRGNTCLENGSFLLNFTGCAVCSKRDFMLITNKSLKEEDGEEIVTYDHL
CKNCHHVIARHEYTFSIMDEFQEYTMLCLLCGKAEDTISILPDDPRQMTLLF
Target Bioclass
Other
Family
Cytochrome b5 family, MAPR subfamily
Subcellular location
Secreted
Function Heme-binding protein which promotes neuronal but not astrocyte differentiation.
Uniprot ID
Q8WUJ1
Ensemble ID
ENST00000301391.8
HGNC ID
HGNC:28471

Target Site Mutations in Different Cell Lines

Cell line Mutation details Probe for labeling this protein in this cell
COLO800 SNV: p.V15L .
NCIH1993 SNV: p.V20G .
SW1116 SNV: p.V15L .

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 1 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
DBIA
 Probe Info  		C17(1.54)  LDD2469  [1]
PAL-AfBPP Probe
Click To Hide/Show 132 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
C001
 Probe Info  		5.21  LDD1711  [2]
C004
 Probe Info  		8.00  LDD1714  [2]
C006
 Probe Info  		5.43  LDD1715  [2]
C007
 Probe Info  		6.19  LDD1716  [2]
C012
 Probe Info  		5.50  LDD1721  [2]
C017
 Probe Info  		19.16  LDD1725  [2]
C027
 Probe Info  		8.51  LDD1733  [2]
C036
 Probe Info  		5.82  LDD1736  [2]
C039
 Probe Info  		7.73  LDD1739  [2]
C040
 Probe Info  		12.64  LDD1740  [2]
C041
 Probe Info  		7.73  LDD1741  [2]
C056
 Probe Info  		16.45  LDD1753  [2]
C057
 Probe Info  		7.73  LDD1754  [2]
C058
 Probe Info  		5.06  LDD1755  [2]
C059
 Probe Info  		11.71  LDD1756  [2]
C060
 Probe Info  		8.82  LDD1757  [2]
C062
 Probe Info  		6.59  LDD1759  [2]
C063
 Probe Info  		16.80  LDD1760  [2]
C067
 Probe Info  		7.57  LDD1763  [2]
C070
 Probe Info  		16.91  LDD1766  [2]
C089
 Probe Info  		10.27  LDD1781  [2]
C091
 Probe Info  		13.45  LDD1782  [2]
C093
 Probe Info  		5.35  LDD1784  [2]
C102
 Probe Info  		14.32  LDD1790  [2]
C103
 Probe Info  		7.11  LDD1791  [2]
C106
 Probe Info  		16.22  LDD1793  [2]
C107
 Probe Info  		7.57  LDD1794  [2]
C109
 Probe Info  		9.38  LDD1796  [2]
C112
 Probe Info  		19.97  LDD1799  [2]
C114
 Probe Info  		14.12  LDD1801  [2]
C131
 Probe Info  		24.25  LDD1813  [2]
C132
 Probe Info  		6.41  LDD1814  [2]
C136
 Probe Info  		13.45  LDD1818  [2]
C138
 Probe Info  		22.47  LDD1820  [2]
C140
 Probe Info  		7.84  LDD1822  [2]
C142
 Probe Info  		7.52  LDD1824  [2]
C145
 Probe Info  		9.32  LDD1827  [2]
C157
 Probe Info  		7.21  LDD1837  [2]
C158
 Probe Info  		19.43  LDD1838  [2]
C160
 Probe Info  		7.46  LDD1840  [2]
C161
 Probe Info  		11.88  LDD1841  [2]
C166
 Probe Info  		10.06  LDD1846  [2]
C170
 Probe Info  		8.11  LDD1850  [2]
C173
 Probe Info  		7.41  LDD1853  [2]
C174
 Probe Info  		13.64  LDD1854  [2]
C176
 Probe Info  		47.18  LDD1855  [2]
C177
 Probe Info  		29.45  LDD1856  [2]
C178
 Probe Info  		16.34  LDD1857  [2]
C179
 Probe Info  		24.25  LDD1858  [2]
C180
 Probe Info  		6.87  LDD1859  [2]
C191
 Probe Info  		11.79  LDD1868  [2]
C195
 Probe Info  		5.31  LDD1871  [2]
C198
 Probe Info  		10.20  LDD1874  [2]
C199
 Probe Info  		10.20  LDD1875  [2]
C200
 Probe Info  		5.58  LDD1876  [2]
C212
 Probe Info  		14.32  LDD1886  [2]
C214
 Probe Info  		5.94  LDD1888  [2]
C215
 Probe Info  		13.18  LDD1889  [2]
C216
 Probe Info  		11.16  LDD1890  [2]
C218
 Probe Info  		13.55  LDD1892  [2]
C220
 Probe Info  		11.88  LDD1894  [2]
C222
 Probe Info  		6.68  LDD1896  [2]
C227
 Probe Info  		6.68  LDD1900  [2]
C228
 Probe Info  		15.56  LDD1901  [2]
C236
 Probe Info  		6.28  LDD1909  [2]
C237
 Probe Info  		7.78  LDD1910  [2]
C239
 Probe Info  		18.13  LDD1912  [2]
C240
 Probe Info  		9.45  LDD1913  [2]
C241
 Probe Info  		9.25  LDD1914  [2]
C242
 Probe Info  		7.06  LDD1915  [2]
C244
 Probe Info  		16.11  LDD1917  [2]
C250
 Probe Info  		15.35  LDD1923  [2]
C252
 Probe Info  		12.55  LDD1925  [2]
C254
 Probe Info  		6.59  LDD1927  [2]
C256
 Probe Info  		11.63  LDD1929  [2]
C258
 Probe Info  		8.75  LDD1931  [2]
C266
 Probe Info  		14.42  LDD1937  [2]
C268
 Probe Info  		11.08  LDD1938  [2]
C269
 Probe Info  		16.56  LDD1939  [2]
C272
 Probe Info  		5.98  LDD1942  [2]
C274
 Probe Info  		5.46  LDD1944  [2]
C275
 Probe Info  		5.35  LDD1945  [2]
C277
 Probe Info  		8.22  LDD1947  [2]
C279
 Probe Info  		16.45  LDD1949  [2]
C286
 Probe Info  		5.17  LDD1956  [2]
C290
 Probe Info  		4.92  LDD1960  [2]
C302
 Probe Info  		10.34  LDD1971  [2]
C303
 Probe Info  		9.38  LDD1972  [2]
C305
 Probe Info  		13.00  LDD1974  [2]
C313
 Probe Info  		13.36  LDD1980  [2]
C317
 Probe Info  		11.39  LDD1983  [2]
C320
 Probe Info  		14.32  LDD1986  [2]
C322
 Probe Info  		8.88  LDD1988  [2]
C331
 Probe Info  		12.04  LDD1994  [2]
C333
 Probe Info  		7.01  LDD1996  [2]
C335
 Probe Info  		6.11  LDD1998  [2]
C338
 Probe Info  		31.34  LDD2001  [2]
C339
 Probe Info  		5.03  LDD2002  [2]
C340
 Probe Info  		9.65  LDD2003  [2]
C343
 Probe Info  		16.11  LDD2005  [2]
C346
 Probe Info  		21.26  LDD2007  [2]
C347
 Probe Info  		26.54  LDD2008  [2]
C348
 Probe Info  		12.91  LDD2009  [2]
C353
 Probe Info  		6.96  LDD2014  [2]
C354
 Probe Info  		28.44  LDD2015  [2]
C355
 Probe Info  		27.67  LDD2016  [2]
C356
 Probe Info  		16.00  LDD2017  [2]
C358
 Probe Info  		5.03  LDD2019  [2]
C359
 Probe Info  		8.63  LDD2020  [2]
C361
 Probe Info  		36.50  LDD2022  [2]
C364
 Probe Info  		15.14  LDD2025  [2]
C366
 Probe Info  		7.78  LDD2027  [2]
C367
 Probe Info  		6.87  LDD2028  [2]
C378
 Probe Info  		5.86  LDD2037  [2]
C381
 Probe Info  		5.78  LDD2040  [2]
C382
 Probe Info  		11.24  LDD2041  [2]
C383
 Probe Info  		12.38  LDD2042  [2]
C384
 Probe Info  		5.74  LDD2043  [2]
C385
 Probe Info  		4.92  LDD2044  [2]
C386
 Probe Info  		8.94  LDD2045  [2]
C387
 Probe Info  		8.00  LDD2046  [2]
C389
 Probe Info  		15.45  LDD2048  [2]
C420
 Probe Info  		19.84  LDD2075  [2]
C424
 Probe Info  		10.48  LDD2079  [2]
C426
 Probe Info  		13.00  LDD2081  [2]
C429
 Probe Info  		32.45  LDD2084  [2]
C430
 Probe Info  		40.22  LDD2085  [2]
C431
 Probe Info  		30.06  LDD2086  [2]
C432
 Probe Info  		15.56  LDD2087  [2]
C433
 Probe Info  		42.52  LDD2088  [2]
FFF probe12
 Probe Info  		20.00  LDD0473  [3]
FFF probe14
 Probe Info  		20.00  LDD0477  [3]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0022  KB02 MGG123 C17(1.54)  LDD2469  [1]
 LDCM0023  KB03 MGG123 C17(2.05)  LDD2886  [1]
 LDCM0024  KB05 MGG123 C17(1.73)  LDD3303  [1]

The Interaction Atlas With This Target

The Protein(s) Related To This Target

Other
Click To Hide/Show 1 Protein(s) Interacting with This Target
Protein name Family Uniprot ID
Transmembrane protein 11, mitochondrial (TMEM11) TMEM11 family P17152

References

1 DrugMap: A quantitative pan-cancer analysis of cysteine ligandability. Cell. 2024 May 9;187(10):2536-2556.e30. doi: 10.1016/j.cell.2024.03.027. Epub 2024 Apr 22.
Mass spectrometry data entry: PXD047840
2 Large-scale chemoproteomics expedites ligand discovery and predicts ligand behavior in cells. Science. 2024 Apr 26;384(6694):eadk5864. doi: 10.1126/science.adk5864. Epub 2024 Apr 26.
Mass spectrometry data entry: PXD041587
3 Ligand and Target Discovery by Fragment-Based Screening in Human Cells. Cell. 2017 Jan 26;168(3):527-541.e29. doi: 10.1016/j.cell.2016.12.029. Epub 2017 Jan 19.