Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP09395
Target Name Signal peptide peptidase-like 2A (SPPL2A)
Gene Name SPPL2A
Gene ID 84888
Synonyms
IMP3; PSL2; Signal peptide peptidase-like 2A; SPP-like 2A; SPPL2a; EC 3.4.23.-; Intramembrane protease 3; IMP-3; Presenilin-like protein 2
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MGPQRRLSPAGAALLWGFLLQLTAAQEAILHASGNGTTKDYCMLYNPYWTALPSTLENAT
SISLMNLTSTPLCNLSDIPPVGIKSKAVVVPWGSCHFLEKARIAQKGGAEAMLVVNNSVL
FPPSGNRSEFPDVKILIAFISYKDFRDMNQTLGDNITVKMYSPSWPNFDYTMVVIFVIAV
FTVALGGYWSGLVELENLKAVTTEDREMRKKKEEYLTFSPLTVVIFVVICCVMMVLLYFF
YKWLVYVMIAIFCIASAMSLYNCLAALIHKIPYGQCTIACRGKNMEVRLIFLSGLCIAVA
VVWAVFRNEDRWAWILQDILGIAFCLNLIKTLKLPNFKSCVILLGLLLLYDVFFVFITPF
ITKNGESIMVELAAGPFGNNEKLPVVIRVPKLIYFSVMSVCLMPVSILGFGDIIVPGLLI
AYCRRFDVQTGSSYIYYVSSTVAYAIGMILTFVVLVLMKKGQPALLYLVPCTLITASVVA
WRRKEMKKFWKGNSYQMMDHLDCATNEENPVISGEQIVQQ
Target Bioclass
Enzyme
Family
Peptidase A22B family
Subcellular location
Late endosome membrane
Function
Intramembrane-cleaving aspartic protease (I-CLiP) that cleaves type II membrane signal peptides in the hydrophobic plane of the membrane. Functions in FASLG, ITM2B and TNF processing. Catalyzes the intramembrane cleavage of the anchored fragment of shed TNF-alpha (TNF), which promotes the release of the intracellular domain (ICD) for signaling to the nucleus. Also responsible for the intramembrane cleavage of Fas antigen ligand FASLG, which promotes the release of the intracellular FasL domain (FasL ICD). Essential for degradation of the invariant chain CD74 that plays a central role in the function of antigen-presenting cells in the immune system. Plays a role in the regulation of innate and adaptive immunity. Catalyzes the intramembrane cleavage of the simian foamy virus envelope glycoprotein gp130 independently of prior ectodomain shedding by furin or furin-like proprotein convertase (PC)-mediated cleavage proteolysis.
Uniprot ID
Q8TCT8
Ensemble ID
ENST00000261854.10
HGNC ID
HGNC:30227
ChEMBL ID
CHEMBL4105833

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 5 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
DBIA
 Probe Info  		C503(1.40)  LDD3332  [1]
4-Iodoacetamidophenylacetylene
 Probe Info  		N.A.  LDD0038  [2]
IA-alkyne
 Probe Info  		N.A.  LDD0036  [2]
Lodoacetamide azide
 Probe Info  		N.A.  LDD0037  [2]
NAIA_5
 Probe Info  		N.A.  LDD2223  [3]
PAL-AfBPP Probe
Click To Hide/Show 52 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
C040
 Probe Info  		7.73  LDD1740  [4]
C041
 Probe Info  		8.06  LDD1741  [4]
C070
 Probe Info  		10.48  LDD1766  [4]
C072
 Probe Info  		7.41  LDD1768  [4]
C106
 Probe Info  		24.93  LDD1793  [4]
C107
 Probe Info  		9.78  LDD1794  [4]
C108
 Probe Info  		13.36  LDD1795  [4]
C112
 Probe Info  		22.32  LDD1799  [4]
C130
 Probe Info  		6.87  LDD1812  [4]
C134
 Probe Info  		20.82  LDD1816  [4]
C135
 Probe Info  		9.71  LDD1817  [4]
C140
 Probe Info  		9.32  LDD1822  [4]
C149
 Probe Info  		6.45  LDD1830  [4]
C153
 Probe Info  		17.39  LDD1834  [4]
C159
 Probe Info  		17.15  LDD1839  [4]
C160
 Probe Info  		13.45  LDD1840  [4]
C161
 Probe Info  		19.97  LDD1841  [4]
C163
 Probe Info  		6.11  LDD1843  [4]
C164
 Probe Info  		5.98  LDD1844  [4]
C183
 Probe Info  		10.78  LDD1861  [4]
C184
 Probe Info  		8.06  LDD1862  [4]
C185
 Probe Info  		7.57  LDD1863  [4]
C186
 Probe Info  		35.75  LDD1864  [4]
C194
 Probe Info  		11.96  LDD1870  [4]
C197
 Probe Info  		13.55  LDD1873  [4]
C198
 Probe Info  		13.83  LDD1874  [4]
C201
 Probe Info  		34.54  LDD1877  [4]
C206
 Probe Info  		19.56  LDD1881  [4]
C222
 Probe Info  		6.63  LDD1896  [4]
C223
 Probe Info  		20.97  LDD1897  [4]
C225
 Probe Info  		12.04  LDD1898  [4]
C226
 Probe Info  		18.13  LDD1899  [4]
C228
 Probe Info  		25.28  LDD1901  [4]
C249
 Probe Info  		12.38  LDD1922  [4]
C277
 Probe Info  		8.82  LDD1947  [4]
C280
 Probe Info  		9.78  LDD1950  [4]
C282
 Probe Info  		15.24  LDD1952  [4]
C293
 Probe Info  		21.71  LDD1963  [4]
C296
 Probe Info  		16.34  LDD1966  [4]
C302
 Probe Info  		5.62  LDD1971  [4]
C310
 Probe Info  		17.75  LDD1977  [4]
C314
 Probe Info  		13.45  LDD1981  [4]
C322
 Probe Info  		6.28  LDD1988  [4]
C326
 Probe Info  		10.13  LDD1990  [4]
C342
 Probe Info  		5.39  LDD2004  [4]
C343
 Probe Info  		18.38  LDD2005  [4]
C346
 Probe Info  		17.27  LDD2007  [4]
C355
 Probe Info  		22.47  LDD2016  [4]
C356
 Probe Info  		10.70  LDD2017  [4]
C376
 Probe Info  		7.89  LDD2036  [4]
C380
 Probe Info  		6.82  LDD2039  [4]
C420
 Probe Info  		15.14  LDD2075  [4]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0214  AC1 HEK-293T C503(1.12)  LDD1507  [5]
 LDCM0215  AC10 HEK-293T C503(1.02)  LDD1508  [5]
 LDCM0226  AC11 HEK-293T C503(1.27)  LDD1509  [5]
 LDCM0237  AC12 HEK-293T C503(0.99)  LDD1510  [5]
 LDCM0259  AC14 HEK-293T C503(1.03)  LDD1512  [5]
 LDCM0270  AC15 HEK-293T C503(0.90)  LDD1513  [5]
 LDCM0276  AC17 HEK-293T C503(1.30)  LDD1515  [5]
 LDCM0277  AC18 HEK-293T C503(0.94)  LDD1516  [5]
 LDCM0278  AC19 HEK-293T C503(1.00)  LDD1517  [5]
 LDCM0279  AC2 HEK-293T C503(1.83)  LDD1518  [5]
 LDCM0280  AC20 HEK-293T C503(1.20)  LDD1519  [5]
 LDCM0281  AC21 HEK-293T C503(1.13)  LDD1520  [5]
 LDCM0282  AC22 HEK-293T C503(1.04)  LDD1521  [5]
 LDCM0283  AC23 HEK-293T C503(1.20)  LDD1522  [5]
 LDCM0284  AC24 HEK-293T C503(0.94)  LDD1523  [5]
 LDCM0285  AC25 HEK-293T C503(1.57)  LDD1524  [5]
 LDCM0286  AC26 HEK-293T C503(1.05)  LDD1525  [5]
 LDCM0287  AC27 HEK-293T C503(1.05)  LDD1526  [5]
 LDCM0288  AC28 HEK-293T C503(1.01)  LDD1527  [5]
 LDCM0289  AC29 HEK-293T C503(1.01)  LDD1528  [5]
 LDCM0290  AC3 HEK-293T C503(1.10)  LDD1529  [5]
 LDCM0291  AC30 HEK-293T C503(0.92)  LDD1530  [5]
 LDCM0292  AC31 HEK-293T C503(0.85)  LDD1531  [5]
 LDCM0293  AC32 HEK-293T C503(0.99)  LDD1532  [5]
 LDCM0294  AC33 HEK-293T C503(1.08)  LDD1533  [5]
 LDCM0295  AC34 HEK-293T C503(1.41)  LDD1534  [5]
 LDCM0296  AC35 HEK-293T C503(1.30)  LDD1535  [5]
 LDCM0297  AC36 HEK-293T C503(1.06)  LDD1536  [5]
 LDCM0298  AC37 HEK-293T C503(1.08)  LDD1537  [5]
 LDCM0299  AC38 HEK-293T C503(0.92)  LDD1538  [5]
 LDCM0300  AC39 HEK-293T C503(1.12)  LDD1539  [5]
 LDCM0301  AC4 HEK-293T C503(1.06)  LDD1540  [5]
 LDCM0302  AC40 HEK-293T C503(1.00)  LDD1541  [5]
 LDCM0303  AC41 HEK-293T C503(0.93)  LDD1542  [5]
 LDCM0304  AC42 HEK-293T C503(1.30)  LDD1543  [5]
 LDCM0305  AC43 HEK-293T C503(1.04)  LDD1544  [5]
 LDCM0306  AC44 HEK-293T C503(1.22)  LDD1545  [5]
 LDCM0307  AC45 HEK-293T C503(1.10)  LDD1546  [5]
 LDCM0308  AC46 HEK-293T C503(1.03)  LDD1547  [5]
 LDCM0309  AC47 HEK-293T C503(1.06)  LDD1548  [5]
 LDCM0310  AC48 HEK-293T C503(0.93)  LDD1549  [5]
 LDCM0311  AC49 HEK-293T C503(0.98)  LDD1550  [5]
 LDCM0312  AC5 HEK-293T C503(1.05)  LDD1551  [5]
 LDCM0313  AC50 HEK-293T C503(0.98)  LDD1552  [5]
 LDCM0314  AC51 HEK-293T C503(1.04)  LDD1553  [5]
 LDCM0315  AC52 HEK-293T C503(1.01)  LDD1554  [5]
 LDCM0316  AC53 HEK-293T C503(1.10)  LDD1555  [5]
 LDCM0317  AC54 HEK-293T C503(1.05)  LDD1556  [5]
 LDCM0318  AC55 HEK-293T C503(1.02)  LDD1557  [5]
 LDCM0319  AC56 HEK-293T C503(0.99)  LDD1558  [5]
 LDCM0320  AC57 HEK-293T C503(1.03)  LDD1559  [5]
 LDCM0321  AC58 HEK-293T C503(1.32)  LDD1560  [5]
 LDCM0322  AC59 HEK-293T C503(1.06)  LDD1561  [5]
 LDCM0323  AC6 HEK-293T C503(0.99)  LDD1562  [5]
 LDCM0324  AC60 HEK-293T C503(1.07)  LDD1563  [5]
 LDCM0325  AC61 HEK-293T C503(1.14)  LDD1564  [5]
 LDCM0326  AC62 HEK-293T C503(1.06)  LDD1565  [5]
 LDCM0327  AC63 HEK-293T C503(0.83)  LDD1566  [5]
 LDCM0328  AC64 HEK-293T C503(0.99)  LDD1567  [5]
 LDCM0334  AC7 HEK-293T C503(0.64)  LDD1568  [5]
 LDCM0345  AC8 HEK-293T C503(0.90)  LDD1569  [5]
 LDCM0248  AKOS034007472 HEK-293T C503(1.06)  LDD1511  [5]
 LDCM0356  AKOS034007680 HEK-293T C503(1.59)  LDD1570  [5]
 LDCM0275  AKOS034007705 HEK-293T C503(0.86)  LDD1514  [5]
 LDCM0367  CL1 HEK-293T C503(1.07)  LDD1571  [5]
 LDCM0368  CL10 HEK-293T C503(1.10)  LDD1572  [5]
 LDCM0370  CL101 HEK-293T C503(1.11)  LDD1574  [5]
 LDCM0371  CL102 HEK-293T C503(1.35)  LDD1575  [5]
 LDCM0374  CL105 HEK-293T C503(1.10)  LDD1578  [5]
 LDCM0375  CL106 HEK-293T C503(1.37)  LDD1579  [5]
 LDCM0378  CL109 HEK-293T C503(0.99)  LDD1582  [5]
 LDCM0379  CL11 HEK-293T C503(0.82)  LDD1583  [5]
 LDCM0380  CL110 HEK-293T C503(1.02)  LDD1584  [5]
 LDCM0383  CL113 HEK-293T C503(0.92)  LDD1587  [5]
 LDCM0384  CL114 HEK-293T C503(1.10)  LDD1588  [5]
 LDCM0387  CL117 HEK-293T C503(1.33)  LDD1591  [5]
 LDCM0388  CL118 HEK-293T C503(1.44)  LDD1592  [5]
 LDCM0390  CL12 HEK-293T C503(1.05)  LDD1594  [5]
 LDCM0392  CL121 HEK-293T C503(0.94)  LDD1596  [5]
 LDCM0393  CL122 HEK-293T C503(1.00)  LDD1597  [5]
 LDCM0396  CL125 HEK-293T C503(0.99)  LDD1600  [5]
 LDCM0397  CL126 HEK-293T C503(1.01)  LDD1601  [5]
 LDCM0400  CL13 HEK-293T C503(1.12)  LDD1604  [5]
 LDCM0401  CL14 HEK-293T C503(1.99)  LDD1605  [5]
 LDCM0404  CL17 HEK-293T C503(1.26)  LDD1608  [5]
 LDCM0405  CL18 HEK-293T C503(1.40)  LDD1609  [5]
 LDCM0406  CL19 HEK-293T C503(1.27)  LDD1610  [5]
 LDCM0407  CL2 HEK-293T C503(1.85)  LDD1611  [5]
 LDCM0408  CL20 HEK-293T C503(0.83)  LDD1612  [5]
 LDCM0409  CL21 HEK-293T C503(1.05)  LDD1613  [5]
 LDCM0410  CL22 HEK-293T C503(1.09)  LDD1614  [5]
 LDCM0411  CL23 HEK-293T C503(0.87)  LDD1615  [5]
 LDCM0412  CL24 HEK-293T C503(1.05)  LDD1616  [5]
 LDCM0413  CL25 HEK-293T C503(1.21)  LDD1617  [5]
 LDCM0414  CL26 HEK-293T C503(1.14)  LDD1618  [5]
 LDCM0417  CL29 HEK-293T C503(1.42)  LDD1621  [5]
 LDCM0419  CL30 HEK-293T C503(1.28)  LDD1623  [5]
 LDCM0420  CL31 HEK-293T C503(0.94)  LDD1624  [5]
 LDCM0421  CL32 HEK-293T C503(0.72)  LDD1625  [5]
 LDCM0422  CL33 HEK-293T C503(1.15)  LDD1626  [5]
 LDCM0423  CL34 HEK-293T C503(1.08)  LDD1627  [5]
 LDCM0424  CL35 HEK-293T C503(0.95)  LDD1628  [5]
 LDCM0425  CL36 HEK-293T C503(1.02)  LDD1629  [5]
 LDCM0426  CL37 HEK-293T C503(1.20)  LDD1630  [5]
 LDCM0431  CL41 HEK-293T C503(1.21)  LDD1635  [5]
 LDCM0432  CL42 HEK-293T C503(1.04)  LDD1636  [5]
 LDCM0433  CL43 HEK-293T C503(0.90)  LDD1637  [5]
 LDCM0434  CL44 HEK-293T C503(0.82)  LDD1638  [5]
 LDCM0435  CL45 HEK-293T C503(1.18)  LDD1639  [5]
 LDCM0436  CL46 HEK-293T C503(1.12)  LDD1640  [5]
 LDCM0437  CL47 HEK-293T C503(0.91)  LDD1641  [5]
 LDCM0438  CL48 HEK-293T C503(1.05)  LDD1642  [5]
 LDCM0439  CL49 HEK-293T C503(1.01)  LDD1643  [5]
 LDCM0440  CL5 HEK-293T C503(1.55)  LDD1644  [5]
 LDCM0441  CL50 HEK-293T C503(1.20)  LDD1645  [5]
 LDCM0444  CL53 HEK-293T C503(1.40)  LDD1647  [5]
 LDCM0445  CL54 HEK-293T C503(0.93)  LDD1648  [5]
 LDCM0446  CL55 HEK-293T C503(0.99)  LDD1649  [5]
 LDCM0447  CL56 HEK-293T C503(0.93)  LDD1650  [5]
 LDCM0448  CL57 HEK-293T C503(0.95)  LDD1651  [5]
 LDCM0449  CL58 HEK-293T C503(1.00)  LDD1652  [5]
 LDCM0450  CL59 HEK-293T C503(0.83)  LDD1653  [5]
 LDCM0451  CL6 HEK-293T C503(2.01)  LDD1654  [5]
 LDCM0452  CL60 HEK-293T C503(1.13)  LDD1655  [5]
 LDCM0453  CL61 HEK-293T C503(0.91)  LDD1656  [5]
 LDCM0454  CL62 HEK-293T C503(1.38)  LDD1657  [5]
 LDCM0457  CL65 HEK-293T C503(0.91)  LDD1660  [5]
 LDCM0458  CL66 HEK-293T C503(1.03)  LDD1661  [5]
 LDCM0459  CL67 HEK-293T C503(1.08)  LDD1662  [5]
 LDCM0460  CL68 HEK-293T C503(1.05)  LDD1663  [5]
 LDCM0461  CL69 HEK-293T C503(1.21)  LDD1664  [5]
 LDCM0462  CL7 HEK-293T C503(1.33)  LDD1665  [5]
 LDCM0463  CL70 HEK-293T C503(1.15)  LDD1666  [5]
 LDCM0464  CL71 HEK-293T C503(0.81)  LDD1667  [5]
 LDCM0465  CL72 HEK-293T C503(1.05)  LDD1668  [5]
 LDCM0466  CL73 HEK-293T C503(0.94)  LDD1669  [5]
 LDCM0467  CL74 HEK-293T C503(0.86)  LDD1670  [5]
 LDCM0470  CL77 HEK-293T C503(0.85)  LDD1673  [5]
 LDCM0471  CL78 HEK-293T C503(1.22)  LDD1674  [5]
 LDCM0472  CL79 HEK-293T C503(1.51)  LDD1675  [5]
 LDCM0473  CL8 HEK-293T C503(0.78)  LDD1676  [5]
 LDCM0474  CL80 HEK-293T C503(0.92)  LDD1677  [5]
 LDCM0475  CL81 HEK-293T C503(1.39)  LDD1678  [5]
 LDCM0476  CL82 HEK-293T C503(0.95)  LDD1679  [5]
 LDCM0477  CL83 HEK-293T C503(0.88)  LDD1680  [5]
 LDCM0478  CL84 HEK-293T C503(0.99)  LDD1681  [5]
 LDCM0479  CL85 HEK-293T C503(0.99)  LDD1682  [5]
 LDCM0480  CL86 HEK-293T C503(0.96)  LDD1683  [5]
 LDCM0483  CL89 HEK-293T C503(1.25)  LDD1686  [5]
 LDCM0484  CL9 HEK-293T C503(0.99)  LDD1687  [5]
 LDCM0485  CL90 HEK-293T C503(0.98)  LDD1688  [5]
 LDCM0486  CL91 HEK-293T C503(1.23)  LDD1689  [5]
 LDCM0487  CL92 HEK-293T C503(0.88)  LDD1690  [5]
 LDCM0488  CL93 HEK-293T C503(1.02)  LDD1691  [5]
 LDCM0489  CL94 HEK-293T C503(1.02)  LDD1692  [5]
 LDCM0490  CL95 HEK-293T C503(0.86)  LDD1693  [5]
 LDCM0491  CL96 HEK-293T C503(1.00)  LDD1694  [5]
 LDCM0492  CL97 HEK-293T C503(0.90)  LDD1695  [5]
 LDCM0493  CL98 HEK-293T C503(1.38)  LDD1696  [5]
 LDCM0427  Fragment51 HEK-293T C503(0.96)  LDD1631  [5]
 LDCM0022  KB02 HEK-293T C503(0.99)  LDD1492  [5]
 LDCM0023  KB03 HEK-293T C503(1.16)  LDD1497  [5]
 LDCM0024  KB05 MKN45 C503(1.40)  LDD3332  [1]

The Interaction Atlas With This Target

The Protein(s) Related To This Target

Transporter and channel
Click To Hide/Show 1 Protein(s) Interacting with This Target
Protein name Family Uniprot ID
Wolframin (WFS1) . O76024
Other
Click To Hide/Show 1 Protein(s) Interacting with This Target
Protein name Family Uniprot ID
Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha (SGTA) SGT family O43765

References

1 DrugMap: A quantitative pan-cancer analysis of cysteine ligandability. Cell. 2024 May 9;187(10):2536-2556.e30. doi: 10.1016/j.cell.2024.03.027. Epub 2024 Apr 22.
Mass spectrometry data entry: PXD047840
2 Enhancing Cysteine Chemoproteomic Coverage through Systematic Assessment of Click Chemistry Product Fragmentation. Anal Chem. 2022 Mar 8;94(9):3800-3810. doi: 10.1021/acs.analchem.1c04402. Epub 2022 Feb 23.
Mass spectrometry data entry: PXD028853
3 N-Acryloylindole-alkyne (NAIA) enables imaging and profiling new ligandable cysteines and oxidized thiols by chemoproteomics. Nat Commun. 2023 Jun 15;14(1):3564. doi: 10.1038/s41467-023-39268-w.
Mass spectrometry data entry: PXD041264
4 Large-scale chemoproteomics expedites ligand discovery and predicts ligand behavior in cells. Science. 2024 Apr 26;384(6694):eadk5864. doi: 10.1126/science.adk5864. Epub 2024 Apr 26.
Mass spectrometry data entry: PXD041587
5 Accelerating multiplexed profiling of protein-ligand interactions: High-throughput plate-based reactive cysteine profiling with minimal input. Cell Chem Biol. 2024 Mar 21;31(3):565-576.e4. doi: 10.1016/j.chembiol.2023.11.015. Epub 2023 Dec 19.
Mass spectrometry data entry: PXD044402