Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP17713
Target Name Tetratricopeptide repeat protein 39C (TTC39C)
Gene Name TTC39C
Gene ID 125488
Synonyms
C18orf17; Tetratricopeptide repeat protein 39C; TPR repeat protein 39C
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MTRWARVSTTYNKRPLPATSWEDMKKGSFEGTSQNLPKRKQLEANRLSLKNDAPQAKHKK
NKKKKEYLNEDVNGFMEYLRQNSQMVHNGQIIATDSEEVREEIAVALKKDSRREGRRLKR
QAAKKNAMVCFHCRKPGHGIADCPAALENQDMGTGICYRCGSTEHEITKCKAKVDPALGE
FPFAKCFVCGEMGHLSRSCPDNPKGLYADGGGCKLCGSVEHLKKDCPESQNSERMVTVGR
WAKGMSADYEEILDVPKPQKPKTKIPKVVNF
Target Bioclass
Other
Family
TTC39 family
Uniprot ID
Q8N584
Ensemble ID
ENST00000304621.10
HGNC ID
HGNC:26595

Target Site Mutations in Different Cell Lines

Cell line Mutation details Probe for labeling this protein in this cell
COLO320 SNV: p.C362G .
COLO800 SNV: p.D374N .
HCT116 SNV: p.L257P .
HUCCT1 SNV: p.E434G .
ICC3 SNV: p.C463R .
MDAMB453 SNV: p.E452K .
NCIH2172 SNV: p.E426Q .
SKMEL28 SNV: p.S146L .

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 9 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
DBIA
 Probe Info  		C87(3.02)  LDD3331  [1]
BTD
 Probe Info  		C517(3.00)  LDD2147  [2]
4-Iodoacetamidophenylacetylene
 Probe Info  		C172(0.00); C97(0.00); C475(0.00); C497(0.00)  LDD0038  [3]
IA-alkyne
 Probe Info  		C463(0.00); C517(0.00); C497(0.00); C329(0.00)  LDD0036  [3]
Lodoacetamide azide
 Probe Info  		C517(0.00); C97(0.00); C329(0.00); C475(0.00)  LDD0037  [3]
IPM
 Probe Info  		N.A.  LDD0147  [4]
TFBX
 Probe Info  		C87(0.00); C497(0.00); C517(0.00)  LDD0148  [4]
Acrolein
 Probe Info  		N.A.  LDD0217  [5]
AOyne
 Probe Info  		14.80  LDD0443  [6]
PAL-AfBPP Probe
Click To Hide/Show 4 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
C158
 Probe Info  		11.47  LDD1838  [7]
C159
 Probe Info  		7.73  LDD1839  [7]
C160
 Probe Info  		8.57  LDD1840  [7]
C161
 Probe Info  		11.96  LDD1841  [7]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0214  AC1 HEK-293T C87(1.03); C172(0.94)  LDD1507  [8]
 LDCM0215  AC10 HEK-293T C87(1.06); C172(0.90); C497(1.58)  LDD1508  [8]
 LDCM0216  AC100 PaTu 8988t C529(1.13); C534(1.13)  LDD1095  [9]
 LDCM0217  AC101 PaTu 8988t C529(1.19); C534(1.19)  LDD1096  [9]
 LDCM0218  AC102 PaTu 8988t C529(1.17); C534(1.17)  LDD1097  [9]
 LDCM0219  AC103 PaTu 8988t C529(0.92); C534(0.92)  LDD1098  [9]
 LDCM0220  AC104 PaTu 8988t C529(1.02); C534(1.02)  LDD1099  [9]
 LDCM0221  AC105 PaTu 8988t C529(1.07); C534(1.07)  LDD1100  [9]
 LDCM0222  AC106 PaTu 8988t C529(0.79); C534(0.79)  LDD1101  [9]
 LDCM0223  AC107 PaTu 8988t C529(1.41); C534(1.41)  LDD1102  [9]
 LDCM0224  AC108 PaTu 8988t C529(0.85); C534(0.85)  LDD1103  [9]
 LDCM0225  AC109 PaTu 8988t C529(0.91); C534(0.91)  LDD1104  [9]
 LDCM0226  AC11 HEK-293T C87(0.98); C172(0.97)  LDD1509  [8]
 LDCM0227  AC110 PaTu 8988t C529(1.13); C534(1.13)  LDD1106  [9]
 LDCM0228  AC111 PaTu 8988t C529(0.85); C534(0.85)  LDD1107  [9]
 LDCM0229  AC112 PaTu 8988t C529(0.99); C534(0.99)  LDD1108  [9]
 LDCM0230  AC113 PaTu 8988t C529(1.38); C534(1.38)  LDD1109  [9]
 LDCM0231  AC114 PaTu 8988t C529(0.80); C534(0.80)  LDD1110  [9]
 LDCM0232  AC115 PaTu 8988t C529(1.20); C534(1.20)  LDD1111  [9]
 LDCM0233  AC116 PaTu 8988t C529(0.99); C534(0.99)  LDD1112  [9]
 LDCM0234  AC117 PaTu 8988t C529(1.22); C534(1.22)  LDD1113  [9]
 LDCM0235  AC118 PaTu 8988t C529(1.00); C534(1.00)  LDD1114  [9]
 LDCM0236  AC119 PaTu 8988t C529(1.32); C534(1.32)  LDD1115  [9]
 LDCM0237  AC12 HEK-293T C87(1.01)  LDD1510  [8]
 LDCM0238  AC120 PaTu 8988t C529(1.83); C534(1.83)  LDD1117  [9]
 LDCM0239  AC121 PaTu 8988t C529(1.26); C534(1.26)  LDD1118  [9]
 LDCM0240  AC122 PaTu 8988t C529(1.33); C534(1.33)  LDD1119  [9]
 LDCM0241  AC123 PaTu 8988t C529(1.81); C534(1.81)  LDD1120  [9]
 LDCM0242  AC124 PaTu 8988t C529(2.14); C534(2.14)  LDD1121  [9]
 LDCM0243  AC125 PaTu 8988t C529(1.48); C534(1.48)  LDD1122  [9]
 LDCM0244  AC126 PaTu 8988t C529(1.24); C534(1.24)  LDD1123  [9]
 LDCM0245  AC127 PaTu 8988t C529(1.03); C534(1.03)  LDD1124  [9]
 LDCM0246  AC128 PaTu 8988t C529(0.58); C534(0.58)  LDD1125  [9]
 LDCM0247  AC129 PaTu 8988t C529(0.53); C534(0.53)  LDD1126  [9]
 LDCM0249  AC130 PaTu 8988t C529(0.60); C534(0.60)  LDD1128  [9]
 LDCM0250  AC131 PaTu 8988t C529(1.08); C534(1.08)  LDD1129  [9]
 LDCM0251  AC132 PaTu 8988t C529(1.03); C534(1.03)  LDD1130  [9]
 LDCM0252  AC133 PaTu 8988t C529(0.73); C534(0.73)  LDD1131  [9]
 LDCM0253  AC134 PaTu 8988t C529(0.59); C534(0.59)  LDD1132  [9]
 LDCM0254  AC135 PaTu 8988t C529(0.57); C534(0.57)  LDD1133  [9]
 LDCM0255  AC136 PaTu 8988t C529(0.38); C534(0.38)  LDD1134  [9]
 LDCM0256  AC137 PaTu 8988t C529(0.69); C534(0.69)  LDD1135  [9]
 LDCM0257  AC138 PaTu 8988t C529(0.56); C534(0.56)  LDD1136  [9]
 LDCM0258  AC139 PaTu 8988t C529(0.60); C534(0.60)  LDD1137  [9]
 LDCM0259  AC14 HEK-293T C87(0.99); C172(0.87); C463(1.02)  LDD1512  [8]
 LDCM0260  AC140 PaTu 8988t C529(0.48); C534(0.48)  LDD1139  [9]
 LDCM0261  AC141 PaTu 8988t C529(0.63); C534(0.63)  LDD1140  [9]
 LDCM0262  AC142 PaTu 8988t C529(0.51); C534(0.51)  LDD1141  [9]
 LDCM0263  AC143 PaTu 8988t C529(0.74); C534(0.74)  LDD1142  [9]
 LDCM0264  AC144 PaTu 8988t C529(0.64); C534(0.64)  LDD1143  [9]
 LDCM0265  AC145 PaTu 8988t C529(0.89); C534(0.89)  LDD1144  [9]
 LDCM0266  AC146 PaTu 8988t C529(0.26); C534(0.26)  LDD1145  [9]
 LDCM0267  AC147 PaTu 8988t C529(0.69); C534(0.69)  LDD1146  [9]
 LDCM0268  AC148 PaTu 8988t C529(0.59); C534(0.59)  LDD1147  [9]
 LDCM0269  AC149 PaTu 8988t C529(0.43); C534(0.43)  LDD1148  [9]
 LDCM0270  AC15 HEK-293T C87(0.97)  LDD1513  [8]
 LDCM0271  AC150 PaTu 8988t C529(0.77); C534(0.77)  LDD1150  [9]
 LDCM0272  AC151 PaTu 8988t C529(0.75); C534(0.75)  LDD1151  [9]
 LDCM0273  AC152 PaTu 8988t C529(0.64); C534(0.64)  LDD1152  [9]
 LDCM0274  AC153 PaTu 8988t C529(0.82); C534(0.82)  LDD1153  [9]
 LDCM0621  AC154 PaTu 8988t C529(0.55); C534(0.55)  LDD2166  [9]
 LDCM0622  AC155 PaTu 8988t C529(0.50); C534(0.50)  LDD2167  [9]
 LDCM0623  AC156 PaTu 8988t C529(0.32); C534(0.32)  LDD2168  [9]
 LDCM0624  AC157 PaTu 8988t C529(0.60); C534(0.60)  LDD2169  [9]
 LDCM0276  AC17 HEK-293T C87(1.02); C172(0.86)  LDD1515  [8]
 LDCM0277  AC18 HEK-293T C87(1.05); C172(0.93); C497(1.15)  LDD1516  [8]
 LDCM0278  AC19 HEK-293T C87(0.98); C172(0.78)  LDD1517  [8]
 LDCM0279  AC2 HEK-293T C87(1.03); C172(0.77); C497(1.74)  LDD1518  [8]
 LDCM0280  AC20 HEK-293T C87(1.00)  LDD1519  [8]
 LDCM0281  AC21 HEK-293T C172(1.03); C497(0.74)  LDD1520  [8]
 LDCM0282  AC22 HEK-293T C87(1.08); C172(0.93); C463(1.00)  LDD1521  [8]
 LDCM0283  AC23 HEK-293T C87(0.97)  LDD1522  [8]
 LDCM0284  AC24 HEK-293T C87(1.02); C172(0.85)  LDD1523  [8]
 LDCM0285  AC25 PaTu 8988t C172(1.09); C529(0.85); C534(0.85)  LDD1164  [9]
 LDCM0286  AC26 PaTu 8988t C172(0.75); C529(0.50); C534(0.50)  LDD1165  [9]
 LDCM0287  AC27 PaTu 8988t C172(0.78); C529(0.50); C534(0.50)  LDD1166  [9]
 LDCM0288  AC28 PaTu 8988t C172(0.72); C529(0.45); C534(0.45)  LDD1167  [9]
 LDCM0289  AC29 PaTu 8988t C172(0.79); C529(0.45); C534(0.45)  LDD1168  [9]
 LDCM0290  AC3 HEK-293T C87(1.06); C172(1.01)  LDD1529  [8]
 LDCM0291  AC30 PaTu 8988t C172(1.07); C529(1.14); C534(1.14)  LDD1170  [9]
 LDCM0292  AC31 PaTu 8988t C172(1.08); C529(0.95); C534(0.95)  LDD1171  [9]
 LDCM0293  AC32 PaTu 8988t C172(1.14); C529(0.80); C534(0.80)  LDD1172  [9]
 LDCM0294  AC33 PaTu 8988t C172(0.77); C529(0.54); C534(0.54)  LDD1173  [9]
 LDCM0295  AC34 PaTu 8988t C172(0.98); C529(0.96); C534(0.96)  LDD1174  [9]
 LDCM0296  AC35 PaTu 8988t C529(0.34); C534(0.34)  LDD1175  [9]
 LDCM0297  AC36 PaTu 8988t C529(0.29); C534(0.29)  LDD1176  [9]
 LDCM0298  AC37 PaTu 8988t C529(0.69); C534(0.69)  LDD1177  [9]
 LDCM0299  AC38 PaTu 8988t C529(0.34); C534(0.34)  LDD1178  [9]
 LDCM0300  AC39 PaTu 8988t C529(0.29); C534(0.29)  LDD1179  [9]
 LDCM0301  AC4 HEK-293T C87(1.03)  LDD1540  [8]
 LDCM0302  AC40 PaTu 8988t C529(0.33); C534(0.33)  LDD1181  [9]
 LDCM0303  AC41 PaTu 8988t C529(0.73); C534(0.73)  LDD1182  [9]
 LDCM0304  AC42 PaTu 8988t C529(0.60); C534(0.60)  LDD1183  [9]
 LDCM0305  AC43 PaTu 8988t C529(0.78); C534(0.78)  LDD1184  [9]
 LDCM0306  AC44 PaTu 8988t C529(0.77); C534(0.77)  LDD1185  [9]
 LDCM0307  AC45 PaTu 8988t C529(0.66); C534(0.66)  LDD1186  [9]
 LDCM0308  AC46 PaTu 8988t C529(1.16); C534(1.16)  LDD1187  [9]
 LDCM0309  AC47 PaTu 8988t C529(0.90); C534(0.90)  LDD1188  [9]
 LDCM0310  AC48 PaTu 8988t C529(1.03); C534(1.03)  LDD1189  [9]
 LDCM0311  AC49 PaTu 8988t C529(1.14); C534(1.14)  LDD1190  [9]
 LDCM0312  AC5 HEK-293T C172(0.93); C497(0.81)  LDD1551  [8]
 LDCM0313  AC50 PaTu 8988t C529(0.95); C534(0.95)  LDD1192  [9]
 LDCM0314  AC51 PaTu 8988t C529(1.00); C534(1.00)  LDD1193  [9]
 LDCM0315  AC52 PaTu 8988t C529(1.10); C534(1.10)  LDD1194  [9]
 LDCM0316  AC53 PaTu 8988t C529(0.80); C534(0.80)  LDD1195  [9]
 LDCM0317  AC54 PaTu 8988t C529(1.10); C534(1.10)  LDD1196  [9]
 LDCM0318  AC55 PaTu 8988t C529(1.07); C534(1.07)  LDD1197  [9]
 LDCM0319  AC56 PaTu 8988t C529(0.93); C534(0.93)  LDD1198  [9]
 LDCM0320  AC57 HEK-293T C87(1.04); C172(0.96)  LDD1559  [8]
 LDCM0321  AC58 HEK-293T C87(1.01); C172(0.99); C497(0.90)  LDD1560  [8]
 LDCM0322  AC59 HEK-293T C87(1.10); C172(1.01)  LDD1561  [8]
 LDCM0323  AC6 HEK-293T C87(1.00); C172(0.99); C463(0.94)  LDD1562  [8]
 LDCM0324  AC60 HEK-293T C87(1.02)  LDD1563  [8]
 LDCM0325  AC61 HEK-293T C172(0.91); C497(0.87)  LDD1564  [8]
 LDCM0326  AC62 HEK-293T C87(1.03); C172(0.94); C463(1.09)  LDD1565  [8]
 LDCM0327  AC63 HEK-293T C87(1.11)  LDD1566  [8]
 LDCM0328  AC64 HEK-293T C87(1.04); C172(0.86)  LDD1567  [8]
 LDCM0332  AC68 PaTu 8988t C172(1.10)  LDD1211  [9]
 LDCM0333  AC69 PaTu 8988t C172(0.95)  LDD1212  [9]
 LDCM0334  AC7 HEK-293T C87(0.96)  LDD1568  [8]
 LDCM0335  AC70 PaTu 8988t C172(1.01)  LDD1214  [9]
 LDCM0336  AC71 PaTu 8988t C172(0.75)  LDD1215  [9]
 LDCM0337  AC72 PaTu 8988t C172(1.20)  LDD1216  [9]
 LDCM0338  AC73 PaTu 8988t C172(1.26)  LDD1217  [9]
 LDCM0339  AC74 PaTu 8988t C172(1.11)  LDD1218  [9]
 LDCM0340  AC75 PaTu 8988t C172(0.91)  LDD1219  [9]
 LDCM0341  AC76 PaTu 8988t C172(1.16)  LDD1220  [9]
 LDCM0342  AC77 PaTu 8988t C172(0.71)  LDD1221  [9]
 LDCM0343  AC78 PaTu 8988t C172(1.26)  LDD1222  [9]
 LDCM0344  AC79 PaTu 8988t C172(0.86)  LDD1223  [9]
 LDCM0345  AC8 HEK-293T C87(1.07); C172(1.00)  LDD1569  [8]
 LDCM0346  AC80 PaTu 8988t C172(1.30)  LDD1225  [9]
 LDCM0347  AC81 PaTu 8988t C172(1.14)  LDD1226  [9]
 LDCM0348  AC82 PaTu 8988t C172(1.15)  LDD1227  [9]
 LDCM0349  AC83 PaTu 8988t C172(1.09)  LDD1228  [9]
 LDCM0350  AC84 PaTu 8988t C172(1.10)  LDD1229  [9]
 LDCM0351  AC85 PaTu 8988t C172(1.02)  LDD1230  [9]
 LDCM0352  AC86 PaTu 8988t C172(1.11)  LDD1231  [9]
 LDCM0353  AC87 PaTu 8988t C172(1.12)  LDD1232  [9]
 LDCM0354  AC88 PaTu 8988t C172(1.05)  LDD1233  [9]
 LDCM0355  AC89 PaTu 8988t C172(1.11)  LDD1234  [9]
 LDCM0357  AC90 PaTu 8988t C172(1.11)  LDD1236  [9]
 LDCM0358  AC91 PaTu 8988t C172(1.02)  LDD1237  [9]
 LDCM0359  AC92 PaTu 8988t C172(1.06)  LDD1238  [9]
 LDCM0360  AC93 PaTu 8988t C172(1.24)  LDD1239  [9]
 LDCM0361  AC94 PaTu 8988t C172(1.00)  LDD1240  [9]
 LDCM0362  AC95 PaTu 8988t C172(1.03)  LDD1241  [9]
 LDCM0363  AC96 PaTu 8988t C172(1.21)  LDD1242  [9]
 LDCM0364  AC97 PaTu 8988t C172(1.11)  LDD1243  [9]
 LDCM0365  AC98 PaTu 8988t C529(0.89); C534(0.89)  LDD1244  [9]
 LDCM0366  AC99 PaTu 8988t C529(1.19); C534(1.19)  LDD1245  [9]
 LDCM0248  AKOS034007472 HEK-293T C172(0.97); C497(0.74)  LDD1511  [8]
 LDCM0356  AKOS034007680 HEK-293T C87(1.06); C172(0.95)  LDD1570  [8]
 LDCM0275  AKOS034007705 HEK-293T C87(1.03); C172(1.03)  LDD1514  [8]
 LDCM0108  Chloroacetamide HeLa C475(0.00); C517(0.00)  LDD0222  [5]
 LDCM0367  CL1 PaTu 8988t C529(0.67); C534(0.67)  LDD1246  [9]
 LDCM0368  CL10 PaTu 8988t C529(0.82); C534(0.82)  LDD1247  [9]
 LDCM0369  CL100 HEK-293T C87(1.09); C172(0.95)  LDD1573  [8]
 LDCM0370  CL101 HEK-293T C87(0.95); C172(0.88)  LDD1574  [8]
 LDCM0371  CL102 HEK-293T C87(1.01); C172(0.85)  LDD1575  [8]
 LDCM0372  CL103 HEK-293T C172(1.25); C463(1.11)  LDD1576  [8]
 LDCM0373  CL104 HEK-293T C87(1.05); C172(0.77)  LDD1577  [8]
 LDCM0374  CL105 HEK-293T C87(1.03); C172(0.97)  LDD1578  [8]
 LDCM0375  CL106 HEK-293T C87(0.96); C172(0.94)  LDD1579  [8]
 LDCM0376  CL107 HEK-293T C172(1.21); C463(1.06)  LDD1580  [8]
 LDCM0377  CL108 HEK-293T C87(0.98); C172(0.86)  LDD1581  [8]
 LDCM0378  CL109 HEK-293T C87(0.87); C172(0.88)  LDD1582  [8]
 LDCM0379  CL11 PaTu 8988t C529(0.75); C534(0.75)  LDD1258  [9]
 LDCM0380  CL110 HEK-293T C87(0.94); C172(0.81)  LDD1584  [8]
 LDCM0381  CL111 HEK-293T C172(1.05); C463(0.95)  LDD1585  [8]
 LDCM0382  CL112 PaTu 8988t C172(1.02); C529(0.93); C534(0.93)  LDD1261  [9]
 LDCM0383  CL113 PaTu 8988t C172(1.08); C529(0.75); C534(0.75)  LDD1262  [9]
 LDCM0384  CL114 PaTu 8988t C172(0.77); C529(0.60); C534(0.60)  LDD1263  [9]
 LDCM0385  CL115 PaTu 8988t C172(0.93); C529(0.93); C534(0.93)  LDD1264  [9]
 LDCM0386  CL116 PaTu 8988t C172(0.63); C529(0.43); C534(0.43)  LDD1265  [9]
 LDCM0387  CL117 PaTu 8988t C529(1.03); C534(1.03)  LDD1266  [9]
 LDCM0388  CL118 PaTu 8988t C529(0.95); C534(0.95)  LDD1267  [9]
 LDCM0389  CL119 PaTu 8988t C529(0.72); C534(0.72)  LDD1268  [9]
 LDCM0390  CL12 PaTu 8988t C529(0.82); C534(0.82)  LDD1269  [9]
 LDCM0391  CL120 PaTu 8988t C529(0.54); C534(0.54)  LDD1270  [9]
 LDCM0392  CL121 PaTu 8988t C529(1.06); C534(1.06)  LDD1271  [9]
 LDCM0393  CL122 PaTu 8988t C529(1.60); C534(1.60)  LDD1272  [9]
 LDCM0394  CL123 PaTu 8988t C529(0.94); C534(0.94)  LDD1273  [9]
 LDCM0395  CL124 PaTu 8988t C529(0.99); C534(0.99)  LDD1274  [9]
 LDCM0396  CL125 HEK-293T C87(0.93); C172(0.95)  LDD1600  [8]
 LDCM0397  CL126 HEK-293T C87(0.95); C172(0.85)  LDD1601  [8]
 LDCM0398  CL127 HEK-293T C172(1.03); C463(1.12)  LDD1602  [8]
 LDCM0399  CL128 HEK-293T C87(0.90); C172(0.86)  LDD1603  [8]
 LDCM0400  CL13 PaTu 8988t C529(0.72); C534(0.72)  LDD1279  [9]
 LDCM0401  CL14 PaTu 8988t C529(1.37); C534(1.37)  LDD1280  [9]
 LDCM0402  CL15 PaTu 8988t C529(0.99); C534(0.99)  LDD1281  [9]
 LDCM0403  CL16 PaTu 8988t C529(0.51); C534(0.51)  LDD1282  [9]
 LDCM0404  CL17 PaTu 8988t C529(0.65); C534(0.65)  LDD1283  [9]
 LDCM0405  CL18 PaTu 8988t C529(0.70); C534(0.70)  LDD1284  [9]
 LDCM0406  CL19 PaTu 8988t C529(0.82); C534(0.82)  LDD1285  [9]
 LDCM0407  CL2 PaTu 8988t C529(0.95); C534(0.95)  LDD1286  [9]
 LDCM0408  CL20 PaTu 8988t C529(0.53); C534(0.53)  LDD1287  [9]
 LDCM0409  CL21 PaTu 8988t C529(0.57); C534(0.57)  LDD1288  [9]
 LDCM0410  CL22 PaTu 8988t C529(0.64); C534(0.64)  LDD1289  [9]
 LDCM0411  CL23 PaTu 8988t C529(0.38); C534(0.38)  LDD1290  [9]
 LDCM0412  CL24 PaTu 8988t C529(0.41); C534(0.41)  LDD1291  [9]
 LDCM0413  CL25 PaTu 8988t C529(0.29); C534(0.29)  LDD1292  [9]
 LDCM0414  CL26 PaTu 8988t C529(0.50); C534(0.50)  LDD1293  [9]
 LDCM0415  CL27 PaTu 8988t C529(0.51); C534(0.51)  LDD1294  [9]
 LDCM0416  CL28 PaTu 8988t C529(0.34); C534(0.34)  LDD1295  [9]
 LDCM0417  CL29 PaTu 8988t C529(0.61); C534(0.61)  LDD1296  [9]
 LDCM0418  CL3 PaTu 8988t C529(0.41); C534(0.41)  LDD1297  [9]
 LDCM0419  CL30 PaTu 8988t C529(0.42); C534(0.42)  LDD1298  [9]
 LDCM0420  CL31 PaTu 8988t C172(1.05); C529(0.53); C534(0.53)  LDD1299  [9]
 LDCM0421  CL32 PaTu 8988t C172(0.88); C529(0.37); C534(0.37)  LDD1300  [9]
 LDCM0422  CL33 PaTu 8988t C172(0.74); C529(0.48); C534(0.48)  LDD1301  [9]
 LDCM0423  CL34 PaTu 8988t C172(0.70); C529(0.28); C534(0.28)  LDD1302  [9]
 LDCM0424  CL35 PaTu 8988t C529(0.45); C534(0.45); C172(0.71)  LDD1303  [9]
 LDCM0425  CL36 PaTu 8988t C172(0.61); C529(0.27); C534(0.27)  LDD1304  [9]
 LDCM0426  CL37 PaTu 8988t C172(0.73); C529(0.27); C534(0.27)  LDD1305  [9]
 LDCM0428  CL39 PaTu 8988t C172(0.68); C529(0.30); C534(0.30)  LDD1307  [9]
 LDCM0429  CL4 PaTu 8988t C529(0.52); C534(0.52)  LDD1308  [9]
 LDCM0430  CL40 PaTu 8988t C172(0.68); C529(0.73); C534(0.73)  LDD1309  [9]
 LDCM0431  CL41 PaTu 8988t C172(0.68); C529(0.31); C534(0.31)  LDD1310  [9]
 LDCM0432  CL42 PaTu 8988t C172(0.71); C529(0.43); C534(0.43)  LDD1311  [9]
 LDCM0433  CL43 PaTu 8988t C172(0.87); C529(0.35); C534(0.35)  LDD1312  [9]
 LDCM0434  CL44 PaTu 8988t C172(0.76); C529(0.34); C534(0.34)  LDD1313  [9]
 LDCM0435  CL45 PaTu 8988t C172(0.63); C529(0.35); C534(0.35)  LDD1314  [9]
 LDCM0436  CL46 HEK-293T C87(1.03); C172(0.99); C463(1.08)  LDD1640  [8]
 LDCM0437  CL47 HEK-293T C87(1.12)  LDD1641  [8]
 LDCM0438  CL48 HEK-293T C87(1.07); C172(1.05)  LDD1642  [8]
 LDCM0439  CL49 HEK-293T C87(1.06); C172(1.04)  LDD1643  [8]
 LDCM0440  CL5 PaTu 8988t C529(0.77); C534(0.77)  LDD1319  [9]
 LDCM0441  CL50 HEK-293T C87(1.04); C172(0.91)  LDD1645  [8]
 LDCM0443  CL52 HEK-293T C87(1.00); C172(0.92)  LDD1646  [8]
 LDCM0444  CL53 HEK-293T C87(0.99); C172(0.95)  LDD1647  [8]
 LDCM0445  CL54 HEK-293T C87(1.00); C172(0.68); C497(1.32)  LDD1648  [8]
 LDCM0446  CL55 HEK-293T C87(1.11); C172(1.34)  LDD1649  [8]
 LDCM0447  CL56 HEK-293T C87(1.05)  LDD1650  [8]
 LDCM0448  CL57 HEK-293T C172(0.83); C497(0.65)  LDD1651  [8]
 LDCM0449  CL58 HEK-293T C87(1.00); C172(1.04); C463(1.15)  LDD1652  [8]
 LDCM0450  CL59 HEK-293T C87(1.20)  LDD1653  [8]
 LDCM0451  CL6 PaTu 8988t C529(0.76); C534(0.76)  LDD1330  [9]
 LDCM0452  CL60 HEK-293T C87(1.06); C172(1.11)  LDD1655  [8]
 LDCM0453  CL61 PaTu 8988t C529(0.53); C534(0.53)  LDD1332  [9]
 LDCM0454  CL62 PaTu 8988t C529(0.56); C534(0.56)  LDD1333  [9]
 LDCM0455  CL63 PaTu 8988t C529(0.77); C534(0.77)  LDD1334  [9]
 LDCM0456  CL64 PaTu 8988t C529(1.06); C534(1.06)  LDD1335  [9]
 LDCM0457  CL65 PaTu 8988t C529(1.07); C534(1.07)  LDD1336  [9]
 LDCM0458  CL66 PaTu 8988t C529(0.98); C534(0.98)  LDD1337  [9]
 LDCM0459  CL67 PaTu 8988t C529(0.95); C534(0.95)  LDD1338  [9]
 LDCM0460  CL68 PaTu 8988t C529(0.64); C534(0.64)  LDD1339  [9]
 LDCM0461  CL69 PaTu 8988t C529(0.73); C534(0.73)  LDD1340  [9]
 LDCM0462  CL7 PaTu 8988t C529(0.75); C534(0.75)  LDD1341  [9]
 LDCM0463  CL70 PaTu 8988t C529(0.84); C534(0.84)  LDD1342  [9]
 LDCM0464  CL71 PaTu 8988t C529(0.76); C534(0.76)  LDD1343  [9]
 LDCM0465  CL72 PaTu 8988t C529(0.96); C534(0.96)  LDD1344  [9]
 LDCM0466  CL73 PaTu 8988t C529(0.94); C534(0.94)  LDD1345  [9]
 LDCM0467  CL74 PaTu 8988t C529(0.45); C534(0.45)  LDD1346  [9]
 LDCM0469  CL76 PaTu 8988t C529(0.72); C534(0.72)  LDD1348  [9]
 LDCM0470  CL77 PaTu 8988t C529(1.03); C534(1.03)  LDD1349  [9]
 LDCM0471  CL78 PaTu 8988t C529(0.83); C534(0.83)  LDD1350  [9]
 LDCM0472  CL79 PaTu 8988t C529(1.05); C534(1.05)  LDD1351  [9]
 LDCM0473  CL8 PaTu 8988t C529(0.54); C534(0.54)  LDD1352  [9]
 LDCM0474  CL80 PaTu 8988t C529(0.56); C534(0.56)  LDD1353  [9]
 LDCM0475  CL81 PaTu 8988t C529(0.94); C534(0.94)  LDD1354  [9]
 LDCM0476  CL82 PaTu 8988t C529(0.61); C534(0.61)  LDD1355  [9]
 LDCM0477  CL83 PaTu 8988t C529(0.59); C534(0.59)  LDD1356  [9]
 LDCM0478  CL84 PaTu 8988t C529(0.99); C534(0.99)  LDD1357  [9]
 LDCM0479  CL85 PaTu 8988t C529(1.11); C534(1.11)  LDD1358  [9]
 LDCM0480  CL86 PaTu 8988t C529(0.83); C534(0.83)  LDD1359  [9]
 LDCM0481  CL87 PaTu 8988t C529(0.84); C534(0.84)  LDD1360  [9]
 LDCM0482  CL88 PaTu 8988t C529(0.74); C534(0.74)  LDD1361  [9]
 LDCM0483  CL89 PaTu 8988t C529(1.04); C534(1.04)  LDD1362  [9]
 LDCM0484  CL9 PaTu 8988t C529(0.96); C534(0.96)  LDD1363  [9]
 LDCM0485  CL90 PaTu 8988t C529(0.99); C534(0.99)  LDD1364  [9]
 LDCM0486  CL91 HEK-293T C87(1.05); C172(1.10)  LDD1689  [8]
 LDCM0487  CL92 HEK-293T C87(1.01)  LDD1690  [8]
 LDCM0488  CL93 HEK-293T C172(1.05); C497(0.63)  LDD1691  [8]
 LDCM0489  CL94 HEK-293T C87(1.07); C172(0.97); C463(1.18)  LDD1692  [8]
 LDCM0490  CL95 HEK-293T C87(0.95)  LDD1693  [8]
 LDCM0491  CL96 HEK-293T C87(0.98); C172(0.99)  LDD1694  [8]
 LDCM0492  CL97 HEK-293T C87(0.99); C172(0.83)  LDD1695  [8]
 LDCM0493  CL98 HEK-293T C87(0.99); C172(0.95)  LDD1696  [8]
 LDCM0494  CL99 HEK-293T C172(0.97); C463(1.24)  LDD1697  [8]
 LDCM0495  E2913 HEK-293T C172(1.26); C463(1.30)  LDD1698  [8]
 LDCM0625  F8 Ramos C517(1.32); C497(1.31); C463(0.96); C172(0.74)  LDD2187  [10]
 LDCM0572  Fragment10 Ramos C517(0.72); C497(0.62); C463(0.50); C475(1.09)  LDD2189  [10]
 LDCM0573  Fragment11 Ramos C517(0.20); C497(2.76); C172(1.43); C475(0.85)  LDD2190  [10]
 LDCM0574  Fragment12 Ramos C517(0.68); C497(0.87); C463(0.64); C475(0.72)  LDD2191  [10]
 LDCM0575  Fragment13 Ramos C517(1.10); C497(1.13); C463(1.07); C475(1.07)  LDD2192  [10]
 LDCM0576  Fragment14 Ramos C517(1.03); C497(1.09); C463(0.85); C172(1.00)  LDD2193  [10]
 LDCM0579  Fragment20 Ramos C517(0.66); C497(1.04); C463(0.75); C475(0.88)  LDD2194  [10]
 LDCM0580  Fragment21 Ramos C517(0.83); C497(0.88); C463(0.73); C172(0.41)  LDD2195  [10]
 LDCM0582  Fragment23 Ramos C517(1.08); C497(1.20); C463(0.66); C172(0.50)  LDD2196  [10]
 LDCM0578  Fragment27 Ramos C517(1.09); C497(1.01); C463(0.86); C172(0.33)  LDD2197  [10]
 LDCM0586  Fragment28 Ramos C517(0.64); C497(0.75); C463(0.88); C172(0.71)  LDD2198  [10]
 LDCM0588  Fragment30 Ramos C517(1.07); C497(1.23); C463(0.90); C475(1.13)  LDD2199  [10]
 LDCM0589  Fragment31 Ramos C517(1.12); C497(1.18); C463(1.02); C475(1.08)  LDD2200  [10]
 LDCM0590  Fragment32 Ramos C517(0.65); C497(0.60); C463(0.50); C475(0.75)  LDD2201  [10]
 LDCM0468  Fragment33 PaTu 8988t C529(0.98); C534(0.98)  LDD1347  [9]
 LDCM0596  Fragment38 Ramos C517(1.54); C497(0.93); C463(0.69); C475(1.39)  LDD2203  [10]
 LDCM0566  Fragment4 Ramos C517(1.08); C497(0.80); C463(0.80); C475(1.04)  LDD2184  [10]
 LDCM0427  Fragment51 PaTu 8988t C172(0.59); C529(0.38); C534(0.38)  LDD1306  [9]
 LDCM0610  Fragment52 Ramos C517(1.03); C497(1.71); C463(0.92); C475(0.83)  LDD2204  [10]
 LDCM0614  Fragment56 Ramos C517(1.46); C497(1.11); C463(1.07)  LDD2205  [10]
 LDCM0569  Fragment7 Ramos C517(0.68); C497(0.62); C463(0.55); C172(0.68)  LDD2186  [10]
 LDCM0571  Fragment9 Ramos C517(1.11); C497(0.81); C463(1.02)  LDD2188  [10]
 LDCM0022  KB02 HEK-293T C87(0.96); C172(0.93)  LDD1492  [8]
 LDCM0023  KB03 HEK-293T C87(0.96); C172(1.00)  LDD1497  [8]
 LDCM0024  KB05 MKN-1 C87(3.02)  LDD3331  [1]
 LDCM0553  Nucleophilic fragment 6b MDA-MB-231 C517(3.00)  LDD2147  [2]

References

1 DrugMap: A quantitative pan-cancer analysis of cysteine ligandability. Cell. 2024 May 9;187(10):2536-2556.e30. doi: 10.1016/j.cell.2024.03.027. Epub 2024 Apr 22.
Mass spectrometry data entry: PXD047840
2 Nucleophilic covalent ligand discovery for the cysteine redoxome. Nat Chem Biol. 2023 Nov;19(11):1309-1319. doi: 10.1038/s41589-023-01330-5. Epub 2023 May 29.
Mass spectrometry data entry: PXD039908 , PXD029761
3 Enhancing Cysteine Chemoproteomic Coverage through Systematic Assessment of Click Chemistry Product Fragmentation. Anal Chem. 2022 Mar 8;94(9):3800-3810. doi: 10.1021/acs.analchem.1c04402. Epub 2022 Feb 23.
Mass spectrometry data entry: PXD028853
4 Chemoproteomic Profiling by Cysteine Fluoroalkylation Reveals Myrocin G as an Inhibitor of the Nonhomologous End Joining DNA Repair Pathway. J Am Chem Soc. 2021 Dec 8;143(48):20332-20342. doi: 10.1021/jacs.1c09724. Epub 2021 Nov 24.
Mass spectrometry data entry: PXD029255
5 ACR-Based Probe for the Quantitative Profiling of Histidine Reactivity in the Human Proteome. J Am Chem Soc. 2023 Mar 8;145(9):5252-5260. doi: 10.1021/jacs.2c12653. Epub 2023 Feb 27.
6 Chemoproteomic profiling of targets of lipid-derived electrophiles by bioorthogonal aminooxy probe. Redox Biol. 2017 Aug;12:712-718. doi: 10.1016/j.redox.2017.04.001. Epub 2017 Apr 5.
7 Large-scale chemoproteomics expedites ligand discovery and predicts ligand behavior in cells. Science. 2024 Apr 26;384(6694):eadk5864. doi: 10.1126/science.adk5864. Epub 2024 Apr 26.
Mass spectrometry data entry: PXD041587
8 Accelerating multiplexed profiling of protein-ligand interactions: High-throughput plate-based reactive cysteine profiling with minimal input. Cell Chem Biol. 2024 Mar 21;31(3):565-576.e4. doi: 10.1016/j.chembiol.2023.11.015. Epub 2023 Dec 19.
Mass spectrometry data entry: PXD044402
9 Reimagining high-throughput profiling of reactive cysteines for cell-based screening of large electrophile libraries. Nat Biotechnol. 2021 May;39(5):630-641. doi: 10.1038/s41587-020-00778-3. Epub 2021 Jan 4.
10 Site-specific quantitative cysteine profiling with data-independent acquisition-based mass spectrometry. Methods Enzymol. 2023;679:295-322. doi: 10.1016/bs.mie.2022.07.037. Epub 2022 Sep 7.
Mass spectrometry data entry: PXD027578