Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP11931
Target Name SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1 (SMARCAD1)
Gene Name SMARCAD1
Gene ID 56916
Synonyms
KIAA1122; SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1; EC 3.6.4.12; ATP-dependent helicase 1; hHEL1
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MMSDEKNLGVSQKLVSPSRSTSSCSSKQGSRQDSWEVVEGLRGEMNYTQEPPVQKGFLLK
KRKWPLKGWHKRFFYLDKGILKYAKSQTDIEREKLHGCIDVGLSVMSVKKSSKCIDLDTE
EHIYHLKVKSEEVFDEWVSKLRHHRMYRQNEIAMFPHEVNHFFSGSTITDSSSGVFDSIS
SRKRSSISKQNLFQTGSNVSFSCGGETRVPLWLQSSEDMEKCSKDLAHCHAYLVEMSQLL
QSMDVLHRTYSAPAINAIQGGSFESPKKEKRSHRRWRSRAIGKDAKGTLQVPKPFSGPVR
LHSSNPNLSTLDFGEEKNYSDGSETSSEFSKMQEDLCHIAHKVYFTLRSAFNIMSAEREK
LKQLMEQDASSSPSAQVIGLKNALSSALAQNTDLKERLRRIHAESLLLDSPAVAKSGDNL
AEENSRDENRALVHQLSNESRLSITDSLSEFFDAQEVLLSPSSSENEISDDDSYVSDISD
NLSLDNLSNDLDNERQTLGPVLDSGREAKSRRRTCLPAPCPSSSNISLWNILRNNIGKDL
SKVAMPVELNEPLNTLQRLCEELEYSELLDKAAQIPSPLERMVYVAAFAISAYASSYYRA
GSKPFNPVLGETYECIREDKGFQFFSEQVSHHPPISACHAESRNFVFWQDVRWKNKFWGK
SMEIVPIGTTHVTLPVFGDHFEWNKVTSCIHNILSGQRWIEHYGEIVIKNLHDDSCYCKV
NFIKAKYWSTNAHEIEGTVFDRSGKAVHRLFGKWHESIYCGGGSSSACVWRANPMPKGYE
QYYSFTQFALELNEMDPSSKSLLPPTDTRFRPDQRFLEEGNLEEAEIQKQRIEQLQRERR
RVLEENHVEHQPRFFRKSDDDSWVSNGTYLELRKDLGFSKLDHPVLW
Target Bioclass
Enzyme
Family
SNF2/RAD54 helicase family
Subcellular location
Nucleus
Function
DNA helicase that possesses intrinsic ATP-dependent nucleosome-remodeling activity and is both required for DNA repair and heterochromatin organization. Promotes DNA end resection of double-strand breaks (DSBs) following DNA damage: probably acts by weakening histone DNA interactions in nucleosomes flanking DSBs. Required for the restoration of heterochromatin organization after replication. Acts at replication sites to facilitate the maintenance of heterochromatin by directing H3 and H4 histones deacetylation, H3 'Lys-9' trimethylation (H3K9me3) and restoration of silencing.
Uniprot ID
Q9H4L7
Ensemble ID
ENST00000354268.9
HGNC ID
HGNC:18398

Target Site Mutations in Different Cell Lines

Cell line Mutation details Probe for labeling this protein in this cell
AGS SNV: p.L566V DBIA    Probe Info 
CCK81 SNV: p.D821G .
COLO678 SNV: p.A709T .
COLO829 SNV: p.V888D DBIA    Probe Info 
MOLT4 Insertion: p.E48GfsTer3 IA-alkyne    Probe Info 
OVKATE Deletion: p.N108KfsTer13 DBIA    Probe Info 
TC71 SNV: p.T1003K DBIA    Probe Info 

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 22 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
m-APA
 Probe Info  		15.00  LDD0402  [1]
TH216
 Probe Info  		Y703(10.23)  LDD0259  [2]
STPyne
 Probe Info  		K716(7.52)  LDD0277  [3]
Probe 1
 Probe Info  		Y703(23.30)  LDD3495  [4]
BTD
 Probe Info  		C741(0.93)  LDD2109  [5]
AHL-Pu-1
 Probe Info  		C951(3.67); C772(2.47)  LDD0168  [6]
DBIA
 Probe Info  		C951(10.12); C772(12.54)  LDD0209  [7]
4-Iodoacetamidophenylacetylene
 Probe Info  		C462(0.00); C568(0.00); C741(0.00); C407(0.00)  LDD0038  [8]
IA-alkyne
 Probe Info  		C462(0.00); C568(0.00); C741(0.00); C407(0.00)  LDD0036  [8]
Lodoacetamide azide
 Probe Info  		C568(0.00); C741(0.00); C407(0.00); C772(0.00)  LDD0037  [8]
NAIA_4
 Probe Info  		C407(0.00); C951(0.00)  LDD2226  [9]
WYneN
 Probe Info  		N.A.  LDD0021  [10]
Compound 10
 Probe Info  		N.A.  LDD2216  [11]
Compound 11
 Probe Info  		N.A.  LDD2213  [11]
IPM
 Probe Info  		C407(0.00); C772(0.00); C861(0.00)  LDD0005  [10]
TFBX
 Probe Info  		C462(0.00); C861(0.00)  LDD0148  [12]
VSF
 Probe Info  		N.A.  LDD0007  [10]
Phosphinate-6
 Probe Info  		N.A.  LDD0018  [13]
Acrolein
 Probe Info  		N.A.  LDD0217  [14]
W1
 Probe Info  		C568(0.00); C861(0.00)  LDD0236  [15]
AOyne
 Probe Info  		15.00  LDD0443  [16]
NAIA_5
 Probe Info  		N.A.  LDD2223  [9]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0025  4SU-RNA HEK-293T C951(3.67); C772(2.47)  LDD0168  [6]
 LDCM0026  4SU-RNA+native RNA HEK-293T C951(2.55); C861(2.11); C772(2.15)  LDD0169  [6]
 LDCM0214  AC1 HEK-293T C462(1.09); C741(1.03); C772(1.09); C106(0.90)  LDD1507  [17]
 LDCM0215  AC10 HEK-293T C462(1.01); C741(1.11); C772(1.06); C106(1.07)  LDD1508  [17]
 LDCM0226  AC11 HEK-293T C462(1.11); C741(1.00); C772(1.07); C106(0.73)  LDD1509  [17]
 LDCM0237  AC12 HEK-293T C462(1.03); C741(0.96); C772(1.10); C106(1.09)  LDD1510  [17]
 LDCM0259  AC14 HEK-293T C462(1.06); C741(1.08); C772(1.09); C106(1.05)  LDD1512  [17]
 LDCM0270  AC15 HEK-293T C462(1.09); C741(1.01); C772(1.01); C568(0.91)  LDD1513  [17]
 LDCM0276  AC17 HEK-293T C462(1.03); C741(1.16); C772(1.14); C106(1.06)  LDD1515  [17]
 LDCM0277  AC18 HEK-293T C462(0.98); C741(1.02); C772(1.04); C106(1.02)  LDD1516  [17]
 LDCM0278  AC19 HEK-293T C462(1.15); C741(1.16); C772(1.14); C106(1.01)  LDD1517  [17]
 LDCM0279  AC2 HEK-293T C462(0.97); C741(1.02); C772(0.90); C106(1.19)  LDD1518  [17]
 LDCM0280  AC20 HEK-293T C462(1.08); C741(0.96); C772(1.06); C106(0.92)  LDD1519  [17]
 LDCM0281  AC21 HEK-293T C462(1.02); C741(1.00); C772(0.99); C106(1.21)  LDD1520  [17]
 LDCM0282  AC22 HEK-293T C462(1.03); C741(1.03); C772(0.98); C106(1.00)  LDD1521  [17]
 LDCM0283  AC23 HEK-293T C462(1.04); C741(1.00); C772(1.03); C568(0.99)  LDD1522  [17]
 LDCM0284  AC24 HEK-293T C462(0.98); C741(0.93); C772(0.93); C106(1.02)  LDD1523  [17]
 LDCM0285  AC25 HEK-293T C462(1.05); C741(1.09); C772(1.11); C106(0.97)  LDD1524  [17]
 LDCM0286  AC26 HEK-293T C462(1.03); C741(1.05); C772(0.98); C106(1.09)  LDD1525  [17]
 LDCM0287  AC27 HEK-293T C462(1.05); C741(1.10); C772(1.02); C106(1.05)  LDD1526  [17]
 LDCM0288  AC28 HEK-293T C462(1.02); C741(0.97); C772(1.05); C106(1.17)  LDD1527  [17]
 LDCM0289  AC29 HEK-293T C462(1.02); C741(0.98); C772(1.09); C106(1.27)  LDD1528  [17]
 LDCM0290  AC3 HEK-293T C462(0.99); C741(1.00); C772(1.06); C106(1.15)  LDD1529  [17]
 LDCM0291  AC30 HEK-293T C462(1.07); C741(1.05); C772(0.99); C106(0.95)  LDD1530  [17]
 LDCM0292  AC31 HEK-293T C462(1.02); C741(0.96); C772(0.98); C568(0.87)  LDD1531  [17]
 LDCM0293  AC32 HEK-293T C462(1.04); C741(0.91); C772(0.96); C106(1.26)  LDD1532  [17]
 LDCM0294  AC33 HEK-293T C462(1.12); C741(1.08); C772(1.08); C106(1.04)  LDD1533  [17]
 LDCM0295  AC34 HEK-293T C462(1.02); C741(1.10); C772(1.04); C106(1.15)  LDD1534  [17]
 LDCM0296  AC35 HEK-293T C462(1.01); C741(0.99); C772(0.99); C106(1.20)  LDD1535  [17]
 LDCM0297  AC36 HEK-293T C462(1.08); C741(0.95); C772(1.06); C106(1.50)  LDD1536  [17]
 LDCM0298  AC37 HEK-293T C462(1.06); C741(0.93); C772(0.99); C106(0.87)  LDD1537  [17]
 LDCM0299  AC38 HEK-293T C462(1.08); C741(1.03); C772(1.04); C106(0.99)  LDD1538  [17]
 LDCM0300  AC39 HEK-293T C462(1.14); C741(1.03); C772(1.06); C568(0.89)  LDD1539  [17]
 LDCM0301  AC4 HEK-293T C462(1.04); C741(0.97); C772(1.00); C106(1.20)  LDD1540  [17]
 LDCM0302  AC40 HEK-293T C462(1.09); C741(0.98); C772(1.03); C106(1.11)  LDD1541  [17]
 LDCM0303  AC41 HEK-293T C462(1.12); C741(1.02); C772(1.11); C106(0.96)  LDD1542  [17]
 LDCM0304  AC42 HEK-293T C462(1.09); C741(1.01); C772(1.06); C106(1.20)  LDD1543  [17]
 LDCM0305  AC43 HEK-293T C462(1.05); C741(1.03); C772(1.13); C106(1.04)  LDD1544  [17]
 LDCM0306  AC44 HEK-293T C462(1.10); C741(0.93); C772(1.06); C106(1.12)  LDD1545  [17]
 LDCM0307  AC45 HEK-293T C462(1.07); C741(0.94); C772(1.05); C106(0.86)  LDD1546  [17]
 LDCM0308  AC46 HEK-293T C462(1.09); C741(1.03); C772(1.05); C106(1.09)  LDD1547  [17]
 LDCM0309  AC47 HEK-293T C462(1.07); C741(1.02); C772(1.05); C568(0.88)  LDD1548  [17]
 LDCM0310  AC48 HEK-293T C462(1.16); C741(0.94); C772(1.12); C106(1.66)  LDD1549  [17]
 LDCM0311  AC49 HEK-293T C462(1.16); C741(1.03); C772(1.13); C106(0.99)  LDD1550  [17]
 LDCM0312  AC5 HEK-293T C462(1.05); C741(0.98); C772(1.02); C106(1.16)  LDD1551  [17]
 LDCM0313  AC50 HEK-293T C462(1.08); C741(1.05); C772(1.01); C106(1.07)  LDD1552  [17]
 LDCM0314  AC51 HEK-293T C462(1.09); C741(1.01); C772(1.09); C106(1.05)  LDD1553  [17]
 LDCM0315  AC52 HEK-293T C462(1.08); C741(0.95); C772(1.06); C106(1.12)  LDD1554  [17]
 LDCM0316  AC53 HEK-293T C462(1.05); C741(1.00); C772(1.09); C106(1.09)  LDD1555  [17]
 LDCM0317  AC54 HEK-293T C462(1.11); C741(1.01); C772(1.08); C106(0.88)  LDD1556  [17]
 LDCM0318  AC55 HEK-293T C462(1.14); C741(0.92); C772(1.02); C568(0.94)  LDD1557  [17]
 LDCM0319  AC56 HEK-293T C462(1.11); C741(0.94); C772(1.04); C106(1.20)  LDD1558  [17]
 LDCM0320  AC57 HEK-293T C462(1.05); C741(1.07); C772(1.11); C106(1.02)  LDD1559  [17]
 LDCM0321  AC58 HEK-293T C462(1.04); C741(1.07); C772(0.98); C106(1.09)  LDD1560  [17]
 LDCM0322  AC59 HEK-293T C462(1.06); C741(0.96); C772(1.07); C106(0.97)  LDD1561  [17]
 LDCM0323  AC6 HEK-293T C462(1.01); C741(1.01); C772(0.99); C106(1.05)  LDD1562  [17]
 LDCM0324  AC60 HEK-293T C462(0.98); C741(0.97); C772(1.01); C106(1.06)  LDD1563  [17]
 LDCM0325  AC61 HEK-293T C462(1.06); C741(0.98); C772(1.06); C106(1.10)  LDD1564  [17]
 LDCM0326  AC62 HEK-293T C462(1.07); C741(1.01); C772(1.08); C106(0.94)  LDD1565  [17]
 LDCM0327  AC63 HEK-293T C462(1.04); C741(0.98); C772(1.00); C568(0.91)  LDD1566  [17]
 LDCM0328  AC64 HEK-293T C462(1.08); C741(0.93); C772(1.04); C106(1.36)  LDD1567  [17]
 LDCM0334  AC7 HEK-293T C462(1.05); C741(1.03); C772(0.96); C568(0.92)  LDD1568  [17]
 LDCM0345  AC8 HEK-293T C462(1.08); C741(0.97); C772(1.02); C106(1.15)  LDD1569  [17]
 LDCM0248  AKOS034007472 HEK-293T C462(1.07); C741(0.99); C772(1.02); C106(1.04)  LDD1511  [17]
 LDCM0356  AKOS034007680 HEK-293T C462(1.08); C741(1.03); C772(1.08); C106(1.08)  LDD1570  [17]
 LDCM0275  AKOS034007705 HEK-293T C462(1.09); C741(0.97); C772(1.05); C106(1.35)  LDD1514  [17]
 LDCM0108  Chloroacetamide HeLa C861(0.00); C568(0.00)  LDD0222  [14]
 LDCM0367  CL1 HEK-293T C462(1.01); C741(1.10); C772(1.20); C106(1.00)  LDD1571  [17]
 LDCM0368  CL10 HEK-293T C462(1.28); C741(1.64); C772(1.80); C106(0.87)  LDD1572  [17]
 LDCM0369  CL100 HEK-293T C462(1.13); C741(0.98); C772(1.16); C568(1.00)  LDD1573  [17]
 LDCM0370  CL101 HEK-293T C462(1.10); C741(1.02); C772(1.04); C106(1.35)  LDD1574  [17]
 LDCM0371  CL102 HEK-293T C741(1.11); C772(1.21); C106(0.89); C568(1.09)  LDD1575  [17]
 LDCM0372  CL103 HEK-293T C462(1.06); C741(1.10); C772(1.10); C568(0.98)  LDD1576  [17]
 LDCM0373  CL104 HEK-293T C462(1.18); C741(0.94); C772(1.20); C568(0.93)  LDD1577  [17]
 LDCM0374  CL105 HEK-293T C462(1.06); C741(1.02); C772(1.11); C106(1.25)  LDD1578  [17]
 LDCM0375  CL106 HEK-293T C741(1.04); C772(1.13); C106(0.95); C568(1.06)  LDD1579  [17]
 LDCM0376  CL107 HEK-293T C462(1.10); C741(1.04); C772(1.04); C568(0.92)  LDD1580  [17]
 LDCM0377  CL108 HEK-293T C462(1.09); C741(0.97); C772(1.05); C568(0.92)  LDD1581  [17]
 LDCM0378  CL109 HEK-293T C462(1.03); C741(0.99); C772(1.22); C106(1.06)  LDD1582  [17]
 LDCM0379  CL11 HEK-293T C462(1.10); C741(1.21); C772(1.18); C568(1.25)  LDD1583  [17]
 LDCM0380  CL110 HEK-293T C741(1.16); C772(1.72); C106(1.02); C568(1.15)  LDD1584  [17]
 LDCM0381  CL111 HEK-293T C462(1.00); C741(1.04); C772(1.16); C568(1.00)  LDD1585  [17]
 LDCM0382  CL112 HEK-293T C462(1.12); C741(1.04); C772(1.24); C568(0.91)  LDD1586  [17]
 LDCM0383  CL113 HEK-293T C462(1.05); C741(0.99); C772(1.07); C106(1.37)  LDD1587  [17]
 LDCM0384  CL114 HEK-293T C741(1.15); C772(1.42); C106(1.15); C568(1.01)  LDD1588  [17]
 LDCM0385  CL115 HEK-293T C462(1.04); C741(1.00); C772(1.02); C568(0.88)  LDD1589  [17]
 LDCM0386  CL116 HEK-293T C462(1.12); C741(0.93); C772(1.11); C568(0.91)  LDD1590  [17]
 LDCM0387  CL117 HEK-293T C462(1.10); C741(0.94); C772(1.11); C106(0.95)  LDD1591  [17]
 LDCM0388  CL118 HEK-293T C741(1.01); C772(1.13); C106(1.02); C568(0.90)  LDD1592  [17]
 LDCM0389  CL119 HEK-293T C462(1.09); C741(1.05); C772(1.04); C568(0.87)  LDD1593  [17]
 LDCM0390  CL12 HEK-293T C462(1.10); C741(1.05); C772(1.01); C106(1.83)  LDD1594  [17]
 LDCM0391  CL120 HEK-293T C462(1.13); C741(0.99); C772(1.11); C568(0.91)  LDD1595  [17]
 LDCM0392  CL121 HEK-293T C462(1.09); C741(0.98); C772(1.09); C106(1.25)  LDD1596  [17]
 LDCM0393  CL122 HEK-293T C741(1.04); C772(1.25); C106(0.99); C568(0.98)  LDD1597  [17]
 LDCM0394  CL123 HEK-293T C462(1.15); C741(1.10); C772(1.74); C568(1.11)  LDD1598  [17]
 LDCM0395  CL124 HEK-293T C462(1.22); C741(1.00); C772(1.49); C568(0.94)  LDD1599  [17]
 LDCM0396  CL125 HEK-293T C462(1.10); C741(0.98); C772(1.02); C106(1.17)  LDD1600  [17]
 LDCM0397  CL126 HEK-293T C741(1.02); C772(1.02); C106(1.08); C568(1.04)  LDD1601  [17]
 LDCM0398  CL127 HEK-293T C462(0.99); C741(0.96); C772(1.07); C568(0.91)  LDD1602  [17]
 LDCM0399  CL128 HEK-293T C462(1.01); C741(0.93); C772(1.04); C568(0.94)  LDD1603  [17]
 LDCM0400  CL13 HEK-293T C462(1.04); C741(1.01); C772(1.27); C106(1.10)  LDD1604  [17]
 LDCM0401  CL14 HEK-293T C741(1.07); C772(1.15); C106(0.96); C568(0.97)  LDD1605  [17]
 LDCM0402  CL15 HEK-293T C462(1.09); C741(1.19); C772(1.64); C568(1.13)  LDD1606  [17]
 LDCM0403  CL16 HEK-293T C462(1.07); C741(0.98); C772(0.98); C568(0.91)  LDD1607  [17]
 LDCM0404  CL17 HEK-293T C462(1.12); C741(1.42); C772(1.52); C106(0.96)  LDD1608  [17]
 LDCM0405  CL18 HEK-293T C462(1.04); C741(1.07); C772(1.04); C106(1.14)  LDD1609  [17]
 LDCM0406  CL19 HEK-293T C462(1.18); C741(1.13); C772(1.25); C106(1.00)  LDD1610  [17]
 LDCM0407  CL2 HEK-293T C741(1.11); C772(1.16); C106(0.97); C568(0.98)  LDD1611  [17]
 LDCM0408  CL20 HEK-293T C462(1.11); C741(0.93); C772(1.15); C106(1.20)  LDD1612  [17]
 LDCM0409  CL21 HEK-293T C462(1.15); C741(1.16); C772(1.54); C106(1.01)  LDD1613  [17]
 LDCM0410  CL22 HEK-293T C462(1.21); C741(1.07); C772(1.06); C106(0.97)  LDD1614  [17]
 LDCM0411  CL23 HEK-293T C462(1.15); C741(1.05); C772(1.02); C568(1.07)  LDD1615  [17]
 LDCM0412  CL24 HEK-293T C462(1.18); C741(0.99); C772(0.99); C106(1.37)  LDD1616  [17]
 LDCM0413  CL25 HEK-293T C462(1.12); C741(1.06); C772(1.29); C106(0.93)  LDD1617  [17]
 LDCM0414  CL26 HEK-293T C741(1.00); C772(1.07); C106(1.08); C568(0.96)  LDD1618  [17]
 LDCM0415  CL27 HEK-293T C462(1.05); C741(1.04); C772(1.01); C568(0.95)  LDD1619  [17]
 LDCM0416  CL28 HEK-293T C462(1.14); C741(1.02); C772(1.21); C568(0.91)  LDD1620  [17]
 LDCM0417  CL29 HEK-293T C462(1.11); C741(1.04); C772(1.11); C106(0.95)  LDD1621  [17]
 LDCM0418  CL3 HEK-293T C462(1.01); C741(1.04); C772(1.03); C568(1.11)  LDD1622  [17]
 LDCM0419  CL30 HEK-293T C462(1.10); C741(1.05); C772(0.96); C106(1.02)  LDD1623  [17]
 LDCM0420  CL31 HEK-293T C462(1.14); C741(1.16); C772(1.20); C106(1.00)  LDD1624  [17]
 LDCM0421  CL32 HEK-293T C462(1.20); C741(1.01); C772(1.14); C106(1.09)  LDD1625  [17]
 LDCM0422  CL33 HEK-293T C462(1.24); C741(1.48); C772(2.04); C106(0.84)  LDD1626  [17]
 LDCM0423  CL34 HEK-293T C462(1.20); C741(1.13); C772(1.15); C106(1.09)  LDD1627  [17]
 LDCM0424  CL35 HEK-293T C462(1.18); C741(1.11); C772(1.01); C568(1.11)  LDD1628  [17]
 LDCM0425  CL36 HEK-293T C462(1.12); C741(0.99); C772(1.04); C106(1.30)  LDD1629  [17]
 LDCM0426  CL37 HEK-293T C462(0.99); C741(0.98); C772(1.20); C106(1.16)  LDD1630  [17]
 LDCM0428  CL39 HEK-293T C462(0.93); C741(1.06); C772(1.13); C568(0.95)  LDD1632  [17]
 LDCM0429  CL4 HEK-293T C462(1.04); C741(0.98); C772(1.16); C568(1.11)  LDD1633  [17]
 LDCM0430  CL40 HEK-293T C462(1.09); C741(1.01); C772(1.05); C568(0.90)  LDD1634  [17]
 LDCM0431  CL41 HEK-293T C462(1.05); C741(1.20); C772(1.31); C106(1.00)  LDD1635  [17]
 LDCM0432  CL42 HEK-293T C462(1.04); C741(0.98); C772(1.00); C106(1.07)  LDD1636  [17]
 LDCM0433  CL43 HEK-293T C462(1.09); C741(1.09); C772(1.25); C106(1.01)  LDD1637  [17]
 LDCM0434  CL44 HEK-293T C462(1.04); C741(1.01); C772(1.14); C106(1.13)  LDD1638  [17]
 LDCM0435  CL45 HEK-293T C462(1.11); C741(1.15); C772(1.29); C106(0.77)  LDD1639  [17]
 LDCM0436  CL46 HEK-293T C462(1.10); C741(1.17); C772(1.06); C106(1.07)  LDD1640  [17]
 LDCM0437  CL47 HEK-293T C462(1.10); C741(1.15); C772(0.88); C568(1.00)  LDD1641  [17]
 LDCM0438  CL48 HEK-293T C462(1.06); C741(0.95); C772(0.99); C106(1.39)  LDD1642  [17]
 LDCM0439  CL49 HEK-293T C462(1.10); C741(0.96); C772(1.05); C106(0.95)  LDD1643  [17]
 LDCM0440  CL5 HEK-293T C462(1.09); C741(1.11); C772(1.09); C106(1.05)  LDD1644  [17]
 LDCM0441  CL50 HEK-293T C741(1.07); C772(1.35); C106(1.06); C568(1.00)  LDD1645  [17]
 LDCM0443  CL52 HEK-293T C462(1.12); C741(1.04); C772(1.10); C568(0.87)  LDD1646  [17]
 LDCM0444  CL53 HEK-293T C462(1.23); C741(1.21); C772(1.48); C106(0.98)  LDD1647  [17]
 LDCM0445  CL54 HEK-293T C462(1.12); C741(1.18); C772(2.06); C106(1.12)  LDD1648  [17]
 LDCM0446  CL55 HEK-293T C462(1.11); C741(1.08); C772(1.21); C106(0.86)  LDD1649  [17]
 LDCM0447  CL56 HEK-293T C462(1.11); C741(0.98); C772(1.12); C106(1.08)  LDD1650  [17]
 LDCM0448  CL57 HEK-293T C462(1.20); C741(1.15); C772(1.42); C106(1.22)  LDD1651  [17]
 LDCM0449  CL58 HEK-293T C462(1.17); C741(1.14); C772(1.19); C106(0.92)  LDD1652  [17]
 LDCM0450  CL59 HEK-293T C462(1.20); C741(1.10); C772(1.02); C568(1.01)  LDD1653  [17]
 LDCM0451  CL6 HEK-293T C462(1.06); C741(1.17); C772(1.53); C106(1.11)  LDD1654  [17]
 LDCM0452  CL60 HEK-293T C462(1.10); C741(1.06); C772(1.01); C106(1.19)  LDD1655  [17]
 LDCM0453  CL61 HEK-293T C462(1.03); C741(0.95); C772(0.97); C106(0.84)  LDD1656  [17]
 LDCM0454  CL62 HEK-293T C741(0.99); C772(1.14); C106(0.99); C568(0.93)  LDD1657  [17]
 LDCM0455  CL63 HEK-293T C462(1.04); C741(1.06); C772(1.05); C568(0.84)  LDD1658  [17]
 LDCM0456  CL64 HEK-293T C462(1.17); C741(1.09); C772(1.48); C568(1.16)  LDD1659  [17]
 LDCM0457  CL65 HEK-293T C462(1.11); C741(1.03); C772(1.12); C106(0.90)  LDD1660  [17]
 LDCM0458  CL66 HEK-293T C462(1.07); C741(1.07); C772(1.18); C106(0.98)  LDD1661  [17]
 LDCM0459  CL67 HEK-293T C462(1.11); C741(1.02); C772(1.22); C106(1.32)  LDD1662  [17]
 LDCM0460  CL68 HEK-293T C462(1.14); C741(0.97); C772(1.18); C106(1.25)  LDD1663  [17]
 LDCM0461  CL69 HEK-293T C462(1.17); C741(1.03); C772(1.20); C106(0.93)  LDD1664  [17]
 LDCM0462  CL7 HEK-293T C462(1.04); C741(1.10); C772(1.23); C106(0.95)  LDD1665  [17]
 LDCM0463  CL70 HEK-293T C462(1.22); C741(1.11); C772(1.02); C106(1.13)  LDD1666  [17]
 LDCM0464  CL71 HEK-293T C462(1.16); C741(1.05); C772(1.06); C568(1.00)  LDD1667  [17]
 LDCM0465  CL72 HEK-293T C462(1.11); C741(1.05); C772(0.98); C106(1.04)  LDD1668  [17]
 LDCM0466  CL73 HEK-293T C462(1.05); C741(1.01); C772(1.17); C106(0.98)  LDD1669  [17]
 LDCM0467  CL74 HEK-293T C741(1.01); C772(1.07); C106(0.99); C568(0.90)  LDD1670  [17]
 LDCM0469  CL76 HEK-293T C462(1.14); C741(0.99); C772(1.04); C568(0.93)  LDD1672  [17]
 LDCM0470  CL77 HEK-293T C462(1.19); C741(1.18); C772(1.45); C106(1.05)  LDD1673  [17]
 LDCM0471  CL78 HEK-293T C462(1.09); C741(1.05); C772(1.02); C106(1.00)  LDD1674  [17]
 LDCM0472  CL79 HEK-293T C462(1.16); C741(1.05); C772(1.18); C106(1.11)  LDD1675  [17]
 LDCM0473  CL8 HEK-293T C462(1.22); C741(1.48); C772(3.34); C106(0.87)  LDD1676  [17]
 LDCM0474  CL80 HEK-293T C462(1.13); C741(0.93); C772(1.05); C106(1.22)  LDD1677  [17]
 LDCM0475  CL81 HEK-293T C462(1.23); C741(1.00); C772(1.10); C106(1.03)  LDD1678  [17]
 LDCM0476  CL82 HEK-293T C462(1.15); C741(1.04); C772(1.02); C106(1.04)  LDD1679  [17]
 LDCM0477  CL83 HEK-293T C462(1.14); C741(1.06); C772(1.03); C568(1.07)  LDD1680  [17]
 LDCM0478  CL84 HEK-293T C462(1.17); C741(1.06); C772(1.27); C106(1.43)  LDD1681  [17]
 LDCM0479  CL85 HEK-293T C462(1.07); C741(0.93); C772(1.04); C106(1.06)  LDD1682  [17]
 LDCM0480  CL86 HEK-293T C741(0.95); C772(0.86); C106(1.24); C568(0.98)  LDD1683  [17]
 LDCM0481  CL87 HEK-293T C462(1.04); C741(0.96); C772(1.06); C568(0.95)  LDD1684  [17]
 LDCM0482  CL88 HEK-293T C462(1.14); C741(0.90); C772(1.04); C568(0.95)  LDD1685  [17]
 LDCM0483  CL89 HEK-293T C462(1.11); C741(1.03); C772(1.13); C106(0.99)  LDD1686  [17]
 LDCM0484  CL9 HEK-293T C462(1.17); C741(1.00); C772(1.06); C106(1.03)  LDD1687  [17]
 LDCM0485  CL90 HEK-293T C462(1.26); C741(1.95); C772(2.97); C106(1.06)  LDD1688  [17]
 LDCM0486  CL91 HEK-293T C462(1.07); C741(1.01); C772(1.12); C106(0.90)  LDD1689  [17]
 LDCM0487  CL92 HEK-293T C462(1.11); C741(1.03); C772(1.35); C106(0.88)  LDD1690  [17]
 LDCM0488  CL93 HEK-293T C462(1.20); C741(1.13); C772(1.24); C106(0.76)  LDD1691  [17]
 LDCM0489  CL94 HEK-293T C462(1.16); C741(1.08); C772(1.07); C106(1.09)  LDD1692  [17]
 LDCM0490  CL95 HEK-293T C462(1.19); C741(1.34); C772(1.67); C568(1.26)  LDD1693  [17]
 LDCM0491  CL96 HEK-293T C462(1.09); C741(1.11); C772(1.31); C106(1.67)  LDD1694  [17]
 LDCM0492  CL97 HEK-293T C462(1.04); C741(1.01); C772(1.37); C106(1.40)  LDD1695  [17]
 LDCM0493  CL98 HEK-293T C741(1.03); C772(1.13); C106(1.01); C568(1.05)  LDD1696  [17]
 LDCM0494  CL99 HEK-293T C462(0.93); C741(0.96); C772(1.07); C568(0.88)  LDD1697  [17]
 LDCM0495  E2913 HEK-293T C462(1.03); C741(1.09); C772(1.00); C568(0.89)  LDD1698  [17]
 LDCM0213  Electrophilic fragment 2 MDA-MB-231 C861(1.06)  LDD1702  [5]
 LDCM0625  F8 Ramos C861(1.04); C568(0.71); C575(0.88); C772(1.38)  LDD2187  [18]
 LDCM0572  Fragment10 Ramos C772(1.60)  LDD1390  [19]
 LDCM0573  Fragment11 Ramos C861(0.12); C568(2.38); C575(15.91); C445(0.40)  LDD2190  [18]
 LDCM0574  Fragment12 MDA-MB-231 C772(1.21)  LDD1393  [19]
 LDCM0575  Fragment13 MDA-MB-231 C772(1.54)  LDD1395  [19]
 LDCM0576  Fragment14 MDA-MB-231 C772(1.06)  LDD1397  [19]
 LDCM0579  Fragment20 MDA-MB-231 C772(20.00)  LDD1402  [19]
 LDCM0580  Fragment21 Ramos C772(1.74)  LDD1405  [19]
 LDCM0582  Fragment23 Ramos C772(2.07)  LDD1409  [19]
 LDCM0578  Fragment27 MDA-MB-231 C772(0.77)  LDD1401  [19]
 LDCM0586  Fragment28 Ramos C861(1.03); C568(0.78); C575(1.10); C772(0.82)  LDD2198  [18]
 LDCM0588  Fragment30 Ramos C861(0.86); C568(0.91); C575(1.19); C772(1.72)  LDD2199  [18]
 LDCM0589  Fragment31 MDA-MB-231 C772(3.04)  LDD1421  [19]
 LDCM0590  Fragment32 Ramos C861(0.71); C575(1.21); C445(0.86)  LDD2201  [18]
 LDCM0468  Fragment33 HEK-293T C462(1.10); C741(1.03); C772(1.05); C568(0.95)  LDD1671  [17]
 LDCM0595  Fragment37 Ramos C772(0.77)  LDD1432  [19]
 LDCM0596  Fragment38 Ramos C861(0.64); C568(0.57); C575(0.82); C772(0.65)  LDD2203  [18]
 LDCM0566  Fragment4 Ramos C772(20.00)  LDD1379  [19]
 LDCM0598  Fragment40 Ramos C772(1.12)  LDD1437  [19]
 LDCM0427  Fragment51 HEK-293T C741(1.04); C772(1.13); C106(1.31); C568(0.90)  LDD1631  [17]
 LDCM0610  Fragment52 Ramos C861(0.98); C575(1.92); C772(0.97); C445(0.90)  LDD2204  [18]
 LDCM0614  Fragment56 Ramos C861(0.81); C568(0.73); C575(1.35); C772(0.64)  LDD2205  [18]
 LDCM0569  Fragment7 MDA-MB-231 C772(0.90)  LDD1383  [19]
 LDCM0571  Fragment9 Ramos C861(0.75); C575(3.18)  LDD2188  [18]
 LDCM0022  KB02 MDA-MB-231 C772(20.00)  LDD1374  [19]
 LDCM0023  KB03 Jurkat C951(10.12); C772(12.54)  LDD0209  [7]
 LDCM0024  KB05 COLO792 C863(2.13)  LDD3310  [20]
 LDCM0516  Nucleophilic fragment 21a MDA-MB-231 C741(0.93)  LDD2109  [5]
 LDCM0530  Nucleophilic fragment 28a MDA-MB-231 C462(0.90)  LDD2123  [5]
 LDCM0532  Nucleophilic fragment 29a MDA-MB-231 C462(0.86)  LDD2125  [5]
 LDCM0534  Nucleophilic fragment 30a MDA-MB-231 C462(1.02)  LDD2127  [5]
 LDCM0536  Nucleophilic fragment 31 MDA-MB-231 C462(1.48)  LDD2129  [5]
 LDCM0546  Nucleophilic fragment 40 MDA-MB-231 C462(0.72)  LDD2140  [5]
 LDCM0550  Nucleophilic fragment 5a MDA-MB-231 C462(1.63)  LDD2144  [5]
 LDCM0552  Nucleophilic fragment 6a MDA-MB-231 C462(0.86)  LDD2146  [5]

References

1 Quantitative and Site-Specific Chemoproteomic Profiling of Targets of Acrolein. Chem Res Toxicol. 2019 Mar 18;32(3):467-473. doi: 10.1021/acs.chemrestox.8b00343. Epub 2019 Jan 15.
2 Chemoproteomic profiling of kinases in live cells using electrophilic sulfonyl triazole probes. Chem Sci. 2021 Jan 21;12(9):3295-3307. doi: 10.1039/d0sc06623k.
3 A Paal-Knorr agent for chemoproteomic profiling of targets of isoketals in cells. Chem Sci. 2021 Oct 15;12(43):14557-14563. doi: 10.1039/d1sc02230j. eCollection 2021 Nov 10.
Mass spectrometry data entry: PXD028270
4 An Azo Coupling-Based Chemoproteomic Approach to Systematically Profile the Tyrosine Reactivity in the Human Proteome. Anal Chem. 2021 Jul 27;93(29):10334-10342. doi: 10.1021/acs.analchem.1c01935. Epub 2021 Jul 12.
5 Nucleophilic covalent ligand discovery for the cysteine redoxome. Nat Chem Biol. 2023 Nov;19(11):1309-1319. doi: 10.1038/s41589-023-01330-5. Epub 2023 May 29.
Mass spectrometry data entry: PXD039908 , PXD029761
6 Chemoproteomic capture of RNA binding activity in living cells. Nat Commun. 2023 Oct 7;14(1):6282. doi: 10.1038/s41467-023-41844-z.
Mass spectrometry data entry: PXD044625
7 Covalent Inhibition by a Natural Product-Inspired Latent Electrophile. J Am Chem Soc. 2023 May 24;145(20):11097-11109. doi: 10.1021/jacs.3c00598. Epub 2023 May 15.
8 Enhancing Cysteine Chemoproteomic Coverage through Systematic Assessment of Click Chemistry Product Fragmentation. Anal Chem. 2022 Mar 8;94(9):3800-3810. doi: 10.1021/acs.analchem.1c04402. Epub 2022 Feb 23.
Mass spectrometry data entry: PXD028853
9 N-Acryloylindole-alkyne (NAIA) enables imaging and profiling new ligandable cysteines and oxidized thiols by chemoproteomics. Nat Commun. 2023 Jun 15;14(1):3564. doi: 10.1038/s41467-023-39268-w.
Mass spectrometry data entry: PXD041264
10 A modification-centric assessment tool for the performance of chemoproteomic probes. Nat Chem Biol. 2022 Aug;18(8):904-912. doi: 10.1038/s41589-022-01074-8. Epub 2022 Jul 21.
Mass spectrometry data entry: PXD027758 , PXD027755 , PXD027760 , PXD027762 , PXD027756 , PXD027591 , PXD007149 , PXD030064 , PXD032392 , PXD027789 , PXD027767 , PXD027764
11 Multiplexed CuAAC Suzuki-Miyaura Labeling for Tandem Activity-Based Chemoproteomic Profiling. Anal Chem. 2021 Feb 2;93(4):2610-2618. doi: 10.1021/acs.analchem.0c04726. Epub 2021 Jan 20.
Mass spectrometry data entry: PXD022279
12 Chemoproteomic Profiling by Cysteine Fluoroalkylation Reveals Myrocin G as an Inhibitor of the Nonhomologous End Joining DNA Repair Pathway. J Am Chem Soc. 2021 Dec 8;143(48):20332-20342. doi: 10.1021/jacs.1c09724. Epub 2021 Nov 24.
Mass spectrometry data entry: PXD029255
13 DFT-Guided Discovery of Ethynyl-Triazolyl-Phosphinates as Modular Electrophiles for Chemoselective Cysteine Bioconjugation and Profiling. Angew Chem Int Ed Engl. 2022 Oct 10;61(41):e202205348. doi: 10.1002/anie.202205348. Epub 2022 Aug 22.
Mass spectrometry data entry: PXD033004
14 ACR-Based Probe for the Quantitative Profiling of Histidine Reactivity in the Human Proteome. J Am Chem Soc. 2023 Mar 8;145(9):5252-5260. doi: 10.1021/jacs.2c12653. Epub 2023 Feb 27.
15 Oxidant-Induced Bioconjugation for Protein Labeling in Live Cells. ACS Chem Biol. 2023 Jan 20;18(1):112-122. doi: 10.1021/acschembio.2c00740. Epub 2022 Dec 21.
16 Chemoproteomic profiling of targets of lipid-derived electrophiles by bioorthogonal aminooxy probe. Redox Biol. 2017 Aug;12:712-718. doi: 10.1016/j.redox.2017.04.001. Epub 2017 Apr 5.
17 Accelerating multiplexed profiling of protein-ligand interactions: High-throughput plate-based reactive cysteine profiling with minimal input. Cell Chem Biol. 2024 Mar 21;31(3):565-576.e4. doi: 10.1016/j.chembiol.2023.11.015. Epub 2023 Dec 19.
Mass spectrometry data entry: PXD044402
18 Site-specific quantitative cysteine profiling with data-independent acquisition-based mass spectrometry. Methods Enzymol. 2023;679:295-322. doi: 10.1016/bs.mie.2022.07.037. Epub 2022 Sep 7.
Mass spectrometry data entry: PXD027578
19 Proteome-wide covalent ligand discovery in native biological systems. Nature. 2016 Jun 23;534(7608):570-4. doi: 10.1038/nature18002. Epub 2016 Jun 15.
20 DrugMap: A quantitative pan-cancer analysis of cysteine ligandability. Cell. 2024 May 9;187(10):2536-2556.e30. doi: 10.1016/j.cell.2024.03.027. Epub 2024 Apr 22.
Mass spectrometry data entry: PXD047840