General Information of Target

Target ID LDTP08642
Target Name Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3B (GSPT2)
Gene Name GSPT2
Gene ID 23708
Synonyms
ERF3B; Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3B; Eukaryotic peptide chain release factor subunit 3b; eRF3b; EC 3.6.5.-; G1 to S phase transition protein 2 homolog
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MDSGSSSSDSAPDCWDQVDMESPGSAPSGDGVSSAVAEAQREPLSSAFSRKLNVNAKPFV
PNVHAAEFVPSFLRGPTQPPTLPAGSGSNDETCTGAGYPQGKRMGRGAPVEPSREEPLVS
LEGSNSAVTMELSEPVVENGEVEMALEESWEHSKEVSEAEPGGGSSGDSGPPEESGQEMM
EEKEEIRKSKSVIVPSGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMFLTGMVDKRTLEKYER
EAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETERKHFTILDAPGHKSFVPNMIG
GASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLINKMDDPTVNWSI
ERYEECKEKLVPFLKKVGFSPKKDIHFMPCSGLTGANIKEQSDFCPWYTGLPFIPYLDNL
PNFNRSIDGPIRLPIVDKYKDMGTVVLGKLESGSIFKGQQLVMMPNKHNVEVLGILSDDT
ETDFVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPSNLCHSGRTFDVQIVIIEHKSIICPGYN
AVLHIHTCIEEVEITALISLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQVCIARLRTAGTICLETFKDF
PQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
Target Bioclass
Enzyme
Family
TRAFAC class translation factor GTPase superfamily, Classic translation factor GTPase family, ERF3 subfamily
Subcellular location
Cytoplasm
Function
GTPase component of the eRF1-eRF3-GTP ternary complex, a ternary complex that mediates translation termination in response to the termination codons UAA, UAG and UGA. GSPT2/ERF3B mediates ETF1/ERF1 delivery to stop codons: The eRF1-eRF3-GTP complex binds to a stop codon in the ribosomal A-site. GTP hydrolysis by GSPT2/ERF3B induces a conformational change that leads to its dissociation, permitting ETF1/ERF1 to accommodate fully in the A-site. Component of the transient SURF complex which recruits UPF1 to stalled ribosomes in the context of nonsense-mediated decay (NMD) of mRNAs containing premature stop codons.
Uniprot ID
Q8IYD1
Ensemble ID
ENST00000340438.6
HGNC ID
HGNC:4622
ChEMBL ID
CHEMBL4105974

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 17 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
m-APA
 Probe Info 
15.00  LDD0402  [1]
STPyne
 Probe Info 
K376(4.95)  LDD0277  [2]
DBIA
 Probe Info 
C591(2.03)  LDD3310  [3]
AHL-Pu-1
 Probe Info 
C582(2.15); C366(2.09)  LDD0169  [4]
5E-2FA
 Probe Info 
N.A.  LDD2235  [5]
4-Iodoacetamidophenylacetylene
 Probe Info 
C405(0.00); C516(0.00)  LDD0038  [6]
IA-alkyne
 Probe Info 
N.A.  LDD0036  [6]
Lodoacetamide azide
 Probe Info 
N.A.  LDD0037  [6]
1d-yne
 Probe Info 
N.A.  LDD0356  [7]
IPM
 Probe Info 
C390(0.00); C93(0.00); C593(0.00); C582(0.00)  LDD2156  [8]
1c-yne
 Probe Info 
N.A.  LDD0228  [7]
Acrolein
 Probe Info 
C390(0.00); H282(0.00); C582(0.00); H332(0.00)  LDD0217  [9]
Crotonaldehyde
 Probe Info 
N.A.  LDD0219  [9]
Methacrolein
 Probe Info 
C593(0.00); C582(0.00); C366(0.00); C390(0.00)  LDD0218  [9]
W1
 Probe Info 
E67(0.00); N62(0.00); H64(0.00)  LDD0236  [10]
NAIA_5
 Probe Info 
N.A.  LDD2223  [11]
HHS-465
 Probe Info 
K337(0.00); K619(0.00)  LDD2240  [12]
PAL-AfBPP Probe
Click To Hide/Show 2 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
FFF probe13
 Probe Info 
12.60  LDD0475  [13]
VE-P
 Probe Info 
N.A.  LDD0396  [14]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0026  4SU-RNA+native RNA HEK-293T C582(2.15); C366(2.09)  LDD0169  [4]
 LDCM0214  AC1 PaTu 8988t C405(0.42); C510(0.16); C516(0.16)  LDD1093  [15]
 LDCM0215  AC10 PaTu 8988t C93(1.03); C405(0.69); C510(0.54); C516(0.54)  LDD1094  [15]
 LDCM0216  AC100 PaTu 8988t C93(1.14); C405(0.87); C510(0.68); C516(0.68)  LDD1095  [15]
 LDCM0217  AC101 PaTu 8988t C93(1.02); C405(1.12); C510(0.80); C516(0.80)  LDD1096  [15]
 LDCM0218  AC102 PaTu 8988t C93(0.94); C405(1.01); C510(0.45); C516(0.45)  LDD1097  [15]
 LDCM0219  AC103 PaTu 8988t C93(1.23); C405(0.81); C510(0.78); C516(0.78)  LDD1098  [15]
 LDCM0220  AC104 PaTu 8988t C93(1.05); C405(1.20); C510(0.82); C516(0.82)  LDD1099  [15]
 LDCM0221  AC105 PaTu 8988t C93(1.02); C405(1.01); C510(0.66); C516(0.66)  LDD1100  [15]
 LDCM0222  AC106 PaTu 8988t C93(1.10); C405(0.91); C510(0.62); C516(0.62)  LDD1101  [15]
 LDCM0223  AC107 PaTu 8988t C93(1.10); C405(1.05); C510(0.93); C516(0.93)  LDD1102  [15]
 LDCM0224  AC108 PaTu 8988t C93(1.03); C405(0.89); C510(0.70); C516(0.70)  LDD1103  [15]
 LDCM0225  AC109 PaTu 8988t C93(1.20); C405(0.88); C510(0.49); C516(0.49)  LDD1104  [15]
 LDCM0226  AC11 PaTu 8988t C93(1.15); C405(0.65); C510(0.52); C516(0.52)  LDD1105  [15]
 LDCM0227  AC110 PaTu 8988t C93(1.15); C405(0.85); C510(0.61); C516(0.61)  LDD1106  [15]
 LDCM0228  AC111 PaTu 8988t C93(1.46); C405(0.90); C510(0.44); C516(0.44)  LDD1107  [15]
 LDCM0229  AC112 PaTu 8988t C93(1.03); C405(0.89); C510(0.89); C516(0.89)  LDD1108  [15]
 LDCM0230  AC113 PaTu 8988t C93(0.92); C405(1.29); C510(1.26); C516(1.26)  LDD1109  [15]
 LDCM0231  AC114 PaTu 8988t C93(0.87); C405(1.19); C510(1.64); C516(1.64)  LDD1110  [15]
 LDCM0232  AC115 PaTu 8988t C93(0.87); C405(0.82); C510(1.19); C516(1.19)  LDD1111  [15]
 LDCM0233  AC116 PaTu 8988t C93(0.73); C405(1.25); C510(1.08); C516(1.08)  LDD1112  [15]
 LDCM0234  AC117 PaTu 8988t C93(0.79); C405(1.07); C510(0.98); C516(0.98)  LDD1113  [15]
 LDCM0235  AC118 PaTu 8988t C93(1.11); C405(1.05); C510(1.07); C516(1.07)  LDD1114  [15]
 LDCM0236  AC119 PaTu 8988t C93(0.84); C405(1.04); C510(1.06); C516(1.06)  LDD1115  [15]
 LDCM0237  AC12 PaTu 8988t C93(1.02); C405(0.50); C510(0.50); C516(0.50)  LDD1116  [15]
 LDCM0238  AC120 PaTu 8988t C93(0.81); C405(1.26); C510(1.13); C516(1.13)  LDD1117  [15]
 LDCM0239  AC121 PaTu 8988t C93(0.84); C405(1.14); C510(1.60); C516(1.60)  LDD1118  [15]
 LDCM0240  AC122 PaTu 8988t C93(0.76); C405(1.35); C510(1.14); C516(1.14)  LDD1119  [15]
 LDCM0241  AC123 PaTu 8988t C93(0.69); C405(1.29); C510(1.01); C516(1.01)  LDD1120  [15]
 LDCM0242  AC124 PaTu 8988t C93(0.77); C405(1.52); C510(1.13); C516(1.13)  LDD1121  [15]
 LDCM0243  AC125 PaTu 8988t C93(1.19); C405(1.01); C510(0.65); C516(0.65)  LDD1122  [15]
 LDCM0244  AC126 PaTu 8988t C93(0.87); C405(1.27); C510(0.91); C516(0.91)  LDD1123  [15]
 LDCM0245  AC127 PaTu 8988t C93(0.80); C405(1.19); C510(1.37); C516(1.37)  LDD1124  [15]
 LDCM0246  AC128 PaTu 8988t C510(0.77); C516(0.77)  LDD1125  [15]
 LDCM0247  AC129 PaTu 8988t C510(0.66); C516(0.66)  LDD1126  [15]
 LDCM0249  AC130 PaTu 8988t C510(0.87); C516(0.87)  LDD1128  [15]
 LDCM0250  AC131 PaTu 8988t C510(1.08); C516(1.08)  LDD1129  [15]
 LDCM0251  AC132 PaTu 8988t C510(0.86); C516(0.86)  LDD1130  [15]
 LDCM0252  AC133 PaTu 8988t C510(0.99); C516(0.99)  LDD1131  [15]
 LDCM0253  AC134 PaTu 8988t C510(0.79); C516(0.79)  LDD1132  [15]
 LDCM0254  AC135 PaTu 8988t C510(0.78); C516(0.78)  LDD1133  [15]
 LDCM0255  AC136 PaTu 8988t C510(0.74); C516(0.74)  LDD1134  [15]
 LDCM0256  AC137 PaTu 8988t C510(0.67); C516(0.67)  LDD1135  [15]
 LDCM0257  AC138 PaTu 8988t C510(0.58); C516(0.58)  LDD1136  [15]
 LDCM0258  AC139 PaTu 8988t C510(1.01); C516(1.01)  LDD1137  [15]
 LDCM0259  AC14 PaTu 8988t C93(0.96); C405(0.90); C510(0.74); C516(0.74)  LDD1138  [15]
 LDCM0260  AC140 PaTu 8988t C510(0.48); C516(0.48)  LDD1139  [15]
 LDCM0261  AC141 PaTu 8988t C510(0.70); C516(0.70)  LDD1140  [15]
 LDCM0262  AC142 PaTu 8988t C510(0.69); C516(0.69)  LDD1141  [15]
 LDCM0263  AC143 PaTu 8988t C93(1.24); C405(1.00); C510(0.91); C516(0.91)  LDD1142  [15]
 LDCM0264  AC144 PaTu 8988t C93(1.28); C405(1.16); C510(0.86); C516(0.86)  LDD1143  [15]
 LDCM0265  AC145 PaTu 8988t C93(1.12); C405(1.11); C510(0.90); C516(0.90)  LDD1144  [15]
 LDCM0266  AC146 PaTu 8988t C93(1.58); C405(1.40); C510(0.71); C516(0.71)  LDD1145  [15]
 LDCM0267  AC147 PaTu 8988t C93(1.25); C405(1.22); C510(0.89); C516(0.89)  LDD1146  [15]
 LDCM0268  AC148 PaTu 8988t C93(1.51); C405(0.89); C510(0.58); C516(0.58)  LDD1147  [15]
 LDCM0269  AC149 PaTu 8988t C93(1.79); C405(1.04); C510(0.62); C516(0.62)  LDD1148  [15]
 LDCM0270  AC15 PaTu 8988t C93(0.95); C405(0.71); C510(0.57); C516(0.57)  LDD1149  [15]
 LDCM0271  AC150 PaTu 8988t C93(1.71); C405(1.33); C510(0.75); C516(0.75)  LDD1150  [15]
 LDCM0272  AC151 PaTu 8988t C93(1.81); C405(1.05); C510(0.49); C516(0.49)  LDD1151  [15]
 LDCM0273  AC152 PaTu 8988t C93(2.83); C405(1.07); C510(0.68); C516(0.68)  LDD1152  [15]
 LDCM0274  AC153 PaTu 8988t C93(3.59); C405(1.10); C510(0.62); C516(0.62)  LDD1153  [15]
 LDCM0621  AC154 PaTu 8988t C93(3.70); C405(0.99); C510(0.59); C516(0.59)  LDD2166  [15]
 LDCM0622  AC155 PaTu 8988t C93(3.25); C405(1.10); C510(0.64); C516(0.64)  LDD2167  [15]
 LDCM0623  AC156 PaTu 8988t C93(4.63); C405(0.93); C510(0.68); C516(0.68)  LDD2168  [15]
 LDCM0624  AC157 PaTu 8988t C93(2.51); C405(1.07); C510(0.85); C516(0.85)  LDD2169  [15]
 LDCM0276  AC17 PaTu 8988t C93(1.02)  LDD1155  [15]
 LDCM0277  AC18 PaTu 8988t C93(1.56)  LDD1156  [15]
 LDCM0278  AC19 PaTu 8988t C93(1.38)  LDD1157  [15]
 LDCM0279  AC2 PaTu 8988t C405(0.57); C510(0.27); C516(0.27)  LDD1158  [15]
 LDCM0280  AC20 PaTu 8988t C93(1.42)  LDD1159  [15]
 LDCM0281  AC21 PaTu 8988t C93(1.69)  LDD1160  [15]
 LDCM0282  AC22 PaTu 8988t C93(1.55)  LDD1161  [15]
 LDCM0283  AC23 PaTu 8988t C93(1.47)  LDD1162  [15]
 LDCM0284  AC24 PaTu 8988t C93(1.83)  LDD1163  [15]
 LDCM0285  AC25 PaTu 8988t C93(1.29); C405(1.05); C510(0.93); C516(0.93)  LDD1164  [15]
 LDCM0286  AC26 PaTu 8988t C93(1.26); C405(0.89); C510(0.71); C516(0.71)  LDD1165  [15]
 LDCM0287  AC27 PaTu 8988t C93(1.60); C405(0.83); C510(0.52); C516(0.52)  LDD1166  [15]
 LDCM0288  AC28 PaTu 8988t C93(1.91); C405(0.86); C510(0.43); C516(0.43)  LDD1167  [15]
 LDCM0289  AC29 PaTu 8988t C93(1.29); C405(0.94); C510(0.83); C516(0.83)  LDD1168  [15]
 LDCM0290  AC3 PaTu 8988t C405(0.72); C510(0.18); C516(0.18)  LDD1169  [15]
 LDCM0291  AC30 PaTu 8988t C93(1.16); C405(0.95); C510(0.99); C516(0.99)  LDD1170  [15]
 LDCM0292  AC31 PaTu 8988t C93(1.25); C405(1.04); C510(0.94); C516(0.94)  LDD1171  [15]
 LDCM0293  AC32 PaTu 8988t C93(1.92); C405(0.84); C510(0.84); C516(0.84)  LDD1172  [15]
 LDCM0294  AC33 PaTu 8988t C93(1.69); C405(0.72); C510(0.52); C516(0.52)  LDD1173  [15]
 LDCM0295  AC34 PaTu 8988t C93(1.25); C405(0.79); C510(1.05); C516(1.05)  LDD1174  [15]
 LDCM0296  AC35 PaTu 8988t C93(0.90); C405(0.69); C510(0.68); C516(0.68)  LDD1175  [15]
 LDCM0297  AC36 PaTu 8988t C93(1.15); C405(0.59); C510(0.59); C516(0.59)  LDD1176  [15]
 LDCM0298  AC37 PaTu 8988t C93(1.19); C405(0.56); C510(0.59); C516(0.59)  LDD1177  [15]
 LDCM0299  AC38 PaTu 8988t C93(1.15); C405(0.54); C510(0.58); C516(0.58)  LDD1178  [15]
 LDCM0300  AC39 PaTu 8988t C93(1.21); C405(0.53); C510(0.55); C516(0.55)  LDD1179  [15]
 LDCM0301  AC4 PaTu 8988t C405(0.67); C510(0.24); C516(0.24)  LDD1180  [15]
 LDCM0302  AC40 PaTu 8988t C93(1.27); C405(0.47); C510(0.49); C516(0.49)  LDD1181  [15]
 LDCM0303  AC41 PaTu 8988t C93(1.42); C405(0.54); C510(0.76); C516(0.76)  LDD1182  [15]
 LDCM0304  AC42 PaTu 8988t C93(1.66); C405(0.59); C510(0.57); C516(0.57)  LDD1183  [15]
 LDCM0305  AC43 PaTu 8988t C93(1.28); C405(0.58); C510(0.67); C516(0.67)  LDD1184  [15]
 LDCM0306  AC44 PaTu 8988t C93(2.24); C405(0.37); C510(0.54); C516(0.54)  LDD1185  [15]
 LDCM0307  AC45 PaTu 8988t C93(1.88); C405(0.52); C510(0.55); C516(0.55)  LDD1186  [15]
 LDCM0308  AC46 PaTu 8988t C405(0.79); C510(1.15); C516(1.15)  LDD1187  [15]
 LDCM0309  AC47 PaTu 8988t C405(0.74); C510(1.05); C516(1.05)  LDD1188  [15]
 LDCM0310  AC48 PaTu 8988t C405(0.76); C510(0.75); C516(0.75)  LDD1189  [15]
 LDCM0311  AC49 PaTu 8988t C405(0.62); C510(0.71); C516(0.71)  LDD1190  [15]
 LDCM0312  AC5 PaTu 8988t C405(0.49); C510(0.19); C516(0.19)  LDD1191  [15]
 LDCM0313  AC50 PaTu 8988t C405(0.61); C510(0.54); C516(0.54)  LDD1192  [15]
 LDCM0314  AC51 PaTu 8988t C405(2.57); C510(0.60); C516(0.60)  LDD1193  [15]
 LDCM0315  AC52 PaTu 8988t C405(0.74); C510(0.89); C516(0.89)  LDD1194  [15]
 LDCM0316  AC53 PaTu 8988t C405(0.61); C510(0.72); C516(0.72)  LDD1195  [15]
 LDCM0317  AC54 PaTu 8988t C405(0.58); C510(0.56); C516(0.56)  LDD1196  [15]
 LDCM0318  AC55 PaTu 8988t C405(0.68); C510(0.83); C516(0.83)  LDD1197  [15]
 LDCM0319  AC56 PaTu 8988t C405(0.90); C510(0.69); C516(0.69)  LDD1198  [15]
 LDCM0320  AC57 PaTu 8988t C510(0.86); C516(0.86)  LDD1199  [15]
 LDCM0321  AC58 PaTu 8988t C510(1.29); C516(1.29)  LDD1200  [15]
 LDCM0322  AC59 PaTu 8988t C510(0.99); C516(0.99)  LDD1201  [15]
 LDCM0323  AC6 PaTu 8988t C93(1.16); C405(0.64); C510(0.61); C516(0.61)  LDD1202  [15]
 LDCM0324  AC60 PaTu 8988t C510(0.84); C516(0.84)  LDD1203  [15]
 LDCM0325  AC61 PaTu 8988t C510(1.25); C516(1.25)  LDD1204  [15]
 LDCM0326  AC62 PaTu 8988t C510(1.18); C516(1.18)  LDD1205  [15]
 LDCM0327  AC63 PaTu 8988t C510(1.28); C516(1.28)  LDD1206  [15]
 LDCM0328  AC64 PaTu 8988t C510(0.84); C516(0.84)  LDD1207  [15]
 LDCM0329  AC65 PaTu 8988t C510(1.21); C516(1.21)  LDD1208  [15]
 LDCM0330  AC66 PaTu 8988t C510(1.18); C516(1.18)  LDD1209  [15]
 LDCM0331  AC67 PaTu 8988t C510(1.18); C516(1.18)  LDD1210  [15]
 LDCM0332  AC68 PaTu 8988t C93(0.76); C405(1.15); C510(1.25); C516(1.25)  LDD1211  [15]
 LDCM0333  AC69 PaTu 8988t C93(0.99); C405(0.96); C510(1.19); C516(1.19)  LDD1212  [15]
 LDCM0334  AC7 PaTu 8988t C93(0.95); C405(0.76); C510(0.86); C516(0.86)  LDD1213  [15]
 LDCM0335  AC70 PaTu 8988t C93(0.85); C405(0.95); C510(1.60); C516(1.60)  LDD1214  [15]
 LDCM0336  AC71 PaTu 8988t C93(0.82); C405(1.18); C510(1.73); C516(1.73)  LDD1215  [15]
 LDCM0337  AC72 PaTu 8988t C93(0.71); C405(1.22); C510(1.34); C516(1.34)  LDD1216  [15]
 LDCM0338  AC73 PaTu 8988t C93(0.73); C405(1.22); C510(1.43); C516(1.43)  LDD1217  [15]
 LDCM0339  AC74 PaTu 8988t C93(0.81); C405(0.97); C510(1.62); C516(1.62)  LDD1218  [15]
 LDCM0340  AC75 PaTu 8988t C93(0.92); C405(0.78); C510(1.10); C516(1.10)  LDD1219  [15]
 LDCM0341  AC76 PaTu 8988t C93(0.92); C405(1.09); C510(1.37); C516(1.37)  LDD1220  [15]
 LDCM0342  AC77 PaTu 8988t C93(0.96); C405(1.02); C510(1.62); C516(1.62)  LDD1221  [15]
 LDCM0343  AC78 PaTu 8988t C93(0.90); C405(1.15); C510(1.62); C516(1.62)  LDD1222  [15]
 LDCM0344  AC79 PaTu 8988t C93(1.00); C405(1.00); C510(1.59); C516(1.59)  LDD1223  [15]
 LDCM0345  AC8 PaTu 8988t C93(0.88); C405(0.90); C510(0.74); C516(0.74)  LDD1224  [15]
 LDCM0346  AC80 PaTu 8988t C93(0.86); C405(1.15); C510(1.82); C516(1.82)  LDD1225  [15]
 LDCM0347  AC81 PaTu 8988t C93(0.80); C405(1.10); C510(1.29); C516(1.29)  LDD1226  [15]
 LDCM0348  AC82 PaTu 8988t C93(0.76); C405(1.03); C510(2.19); C516(2.19)  LDD1227  [15]
 LDCM0349  AC83 PaTu 8988t C93(0.83); C405(1.58); C510(1.40); C516(1.40)  LDD1228  [15]
 LDCM0350  AC84 PaTu 8988t C93(0.86); C405(1.66); C510(1.30); C516(1.30)  LDD1229  [15]
 LDCM0351  AC85 PaTu 8988t C93(0.82); C405(1.85); C510(1.25); C516(1.25)  LDD1230  [15]
 LDCM0352  AC86 PaTu 8988t C93(0.81); C405(1.50); C510(1.19); C516(1.19)  LDD1231  [15]
 LDCM0353  AC87 PaTu 8988t C93(0.91); C405(2.30); C510(1.47); C516(1.47)  LDD1232  [15]
 LDCM0354  AC88 PaTu 8988t C93(0.94); C405(1.97); C510(1.52); C516(1.52)  LDD1233  [15]
 LDCM0355  AC89 PaTu 8988t C93(0.80); C405(1.85); C510(1.32); C516(1.32)  LDD1234  [15]
 LDCM0357  AC90 PaTu 8988t C93(0.81); C405(2.08); C510(1.68); C516(1.68)  LDD1236  [15]
 LDCM0358  AC91 PaTu 8988t C93(0.88); C405(2.41); C510(1.35); C516(1.35)  LDD1237  [15]
 LDCM0359  AC92 PaTu 8988t C93(0.79); C405(1.43); C510(1.08); C516(1.08)  LDD1238  [15]
 LDCM0360  AC93 PaTu 8988t C93(0.74); C405(2.34); C510(1.40); C516(1.40)  LDD1239  [15]
 LDCM0361  AC94 PaTu 8988t C93(0.73); C405(1.81); C510(1.31); C516(1.31)  LDD1240  [15]
 LDCM0362  AC95 PaTu 8988t C93(0.98); C405(1.72); C510(1.19); C516(1.19)  LDD1241  [15]
 LDCM0363  AC96 PaTu 8988t C93(0.70); C405(2.40); C510(1.73); C516(1.73)  LDD1242  [15]
 LDCM0364  AC97 PaTu 8988t C93(0.77); C405(2.34); C510(1.21); C516(1.21)  LDD1243  [15]
 LDCM0365  AC98 PaTu 8988t C93(1.40); C405(1.07); C510(0.57); C516(0.57)  LDD1244  [15]
 LDCM0366  AC99 PaTu 8988t C93(0.96); C405(1.28); C510(0.86); C516(0.86)  LDD1245  [15]
 LDCM0248  AKOS034007472 PaTu 8988t C93(0.96); C405(0.72); C510(0.52); C516(0.52)  LDD1127  [15]
 LDCM0356  AKOS034007680 PaTu 8988t C93(1.19); C405(0.72); C510(0.48); C516(0.48)  LDD1235  [15]
 LDCM0275  AKOS034007705 PaTu 8988t C93(1.08); C405(0.68); C510(0.47); C516(0.47)  LDD1154  [15]
 LDCM0156  Aniline NCI-H1299 N.A.  LDD0405  [1]
 LDCM0108  Chloroacetamide HeLa C593(0.00); C390(0.00); C582(0.00); H291(0.00)  LDD0222  [9]
 LDCM0367  CL1 PaTu 8988t C510(0.51); C516(0.51)  LDD1246  [15]
 LDCM0368  CL10 PaTu 8988t C510(0.40); C516(0.40)  LDD1247  [15]
 LDCM0369  CL100 PaTu 8988t C405(0.66); C510(0.20); C516(0.20)  LDD1248  [15]
 LDCM0370  CL101 PaTu 8988t C93(1.21); C405(0.82); C510(0.72); C516(0.72)  LDD1249  [15]
 LDCM0371  CL102 PaTu 8988t C93(1.02); C405(0.73); C510(0.60); C516(0.60)  LDD1250  [15]
 LDCM0372  CL103 PaTu 8988t C93(1.12); C405(0.72); C510(0.45); C516(0.45)  LDD1251  [15]
 LDCM0373  CL104 PaTu 8988t C93(1.09); C405(0.87); C510(0.68); C516(0.68)  LDD1252  [15]
 LDCM0374  CL105 PaTu 8988t C93(1.28)  LDD1253  [15]
 LDCM0375  CL106 PaTu 8988t C93(1.35)  LDD1254  [15]
 LDCM0376  CL107 PaTu 8988t C93(1.13)  LDD1255  [15]
 LDCM0377  CL108 PaTu 8988t C93(1.34)  LDD1256  [15]
 LDCM0378  CL109 PaTu 8988t C93(1.49)  LDD1257  [15]
 LDCM0379  CL11 PaTu 8988t C510(0.65); C516(0.65)  LDD1258  [15]
 LDCM0380  CL110 PaTu 8988t C93(1.45)  LDD1259  [15]
 LDCM0381  CL111 PaTu 8988t C93(1.63)  LDD1260  [15]
 LDCM0382  CL112 PaTu 8988t C93(1.20); C405(0.91); C510(0.89); C516(0.89)  LDD1261  [15]
 LDCM0383  CL113 PaTu 8988t C93(1.50); C405(0.98); C510(0.90); C516(0.90)  LDD1262  [15]
 LDCM0384  CL114 PaTu 8988t C93(1.51); C405(1.00); C510(0.68); C516(0.68)  LDD1263  [15]
 LDCM0385  CL115 PaTu 8988t C93(1.49); C405(1.08); C510(1.25); C516(1.25)  LDD1264  [15]
 LDCM0386  CL116 PaTu 8988t C93(1.83); C405(0.78); C510(0.46); C516(0.46)  LDD1265  [15]
 LDCM0387  CL117 PaTu 8988t C93(0.98); C405(0.67); C510(0.79); C516(0.79)  LDD1266  [15]
 LDCM0388  CL118 PaTu 8988t C93(1.74); C405(0.55); C510(0.79); C516(0.79)  LDD1267  [15]
 LDCM0389  CL119 PaTu 8988t C93(1.26); C405(0.47); C510(0.61); C516(0.61)  LDD1268  [15]
 LDCM0390  CL12 PaTu 8988t C510(0.56); C516(0.56)  LDD1269  [15]
 LDCM0391  CL120 PaTu 8988t C93(1.01); C405(0.52); C510(0.69); C516(0.69)  LDD1270  [15]
 LDCM0392  CL121 PaTu 8988t C405(0.80); C510(0.97); C516(0.97)  LDD1271  [15]
 LDCM0393  CL122 PaTu 8988t C405(1.36); C510(0.74); C516(0.74)  LDD1272  [15]
 LDCM0394  CL123 PaTu 8988t C405(0.58); C510(0.64); C516(0.64)  LDD1273  [15]
 LDCM0395  CL124 PaTu 8988t C405(0.71); C510(0.76); C516(0.76)  LDD1274  [15]
 LDCM0396  CL125 PaTu 8988t C510(1.35); C516(1.35)  LDD1275  [15]
 LDCM0397  CL126 PaTu 8988t C510(1.11); C516(1.11)  LDD1276  [15]
 LDCM0398  CL127 PaTu 8988t C510(1.08); C516(1.08)  LDD1277  [15]
 LDCM0399  CL128 PaTu 8988t C510(1.11); C516(1.11)  LDD1278  [15]
 LDCM0400  CL13 PaTu 8988t C510(0.27); C516(0.27)  LDD1279  [15]
 LDCM0401  CL14 PaTu 8988t C510(0.32); C516(0.32)  LDD1280  [15]
 LDCM0402  CL15 PaTu 8988t C510(0.60); C516(0.60)  LDD1281  [15]
 LDCM0403  CL16 PaTu 8988t C93(1.26); C510(0.67); C516(0.67)  LDD1282  [15]
 LDCM0404  CL17 PaTu 8988t C93(1.13); C510(0.55); C516(0.55)  LDD1283  [15]
 LDCM0405  CL18 PaTu 8988t C93(1.18); C510(0.50); C516(0.50)  LDD1284  [15]
 LDCM0406  CL19 PaTu 8988t C93(1.26); C510(0.49); C516(0.49)  LDD1285  [15]
 LDCM0407  CL2 PaTu 8988t C510(0.53); C516(0.53)  LDD1286  [15]
 LDCM0408  CL20 PaTu 8988t C93(1.54); C510(0.39); C516(0.39)  LDD1287  [15]
 LDCM0409  CL21 PaTu 8988t C93(1.87); C510(0.49); C516(0.49)  LDD1288  [15]
 LDCM0410  CL22 PaTu 8988t C93(1.60); C510(0.40); C516(0.40)  LDD1289  [15]
 LDCM0411  CL23 PaTu 8988t C93(1.54); C510(0.43); C516(0.43)  LDD1290  [15]
 LDCM0412  CL24 PaTu 8988t C93(1.22); C510(0.66); C516(0.66)  LDD1291  [15]
 LDCM0413  CL25 PaTu 8988t C93(1.37); C510(0.62); C516(0.62)  LDD1292  [15]
 LDCM0414  CL26 PaTu 8988t C93(1.39); C510(0.40); C516(0.40)  LDD1293  [15]
 LDCM0415  CL27 PaTu 8988t C93(1.10); C510(0.65); C516(0.65)  LDD1294  [15]
 LDCM0416  CL28 PaTu 8988t C93(1.87); C510(0.39); C516(0.39)  LDD1295  [15]
 LDCM0417  CL29 PaTu 8988t C93(1.89); C510(0.36); C516(0.36)  LDD1296  [15]
 LDCM0418  CL3 PaTu 8988t C510(0.38); C516(0.38)  LDD1297  [15]
 LDCM0419  CL30 PaTu 8988t C93(1.49); C510(0.44); C516(0.44)  LDD1298  [15]
 LDCM0420  CL31 PaTu 8988t C405(1.69)  LDD1299  [15]
 LDCM0421  CL32 PaTu 8988t C405(1.22)  LDD1300  [15]
 LDCM0422  CL33 PaTu 8988t C405(1.21)  LDD1301  [15]
 LDCM0423  CL34 PaTu 8988t C405(1.86)  LDD1302  [15]
 LDCM0424  CL35 PaTu 8988t C405(1.23)  LDD1303  [15]
 LDCM0425  CL36 PaTu 8988t C405(0.36)  LDD1304  [15]
 LDCM0426  CL37 PaTu 8988t C405(0.96)  LDD1305  [15]
 LDCM0428  CL39 PaTu 8988t C405(0.93)  LDD1307  [15]
 LDCM0429  CL4 PaTu 8988t C510(0.40); C516(0.40)  LDD1308  [15]
 LDCM0430  CL40 PaTu 8988t C405(1.70)  LDD1309  [15]
 LDCM0431  CL41 PaTu 8988t C405(0.90)  LDD1310  [15]
 LDCM0432  CL42 PaTu 8988t C405(0.92)  LDD1311  [15]
 LDCM0433  CL43 PaTu 8988t C405(1.21)  LDD1312  [15]
 LDCM0434  CL44 PaTu 8988t C405(1.47)  LDD1313  [15]
 LDCM0435  CL45 PaTu 8988t C405(1.27)  LDD1314  [15]
 LDCM0436  CL46 PaTu 8988t C93(1.24); C510(1.05); C516(1.05)  LDD1315  [15]
 LDCM0437  CL47 PaTu 8988t C93(1.10); C510(0.98); C516(0.98)  LDD1316  [15]
 LDCM0438  CL48 PaTu 8988t C93(1.24); C510(0.89); C516(0.89)  LDD1317  [15]
 LDCM0439  CL49 PaTu 8988t C93(1.45); C510(1.20); C516(1.20)  LDD1318  [15]
 LDCM0440  CL5 PaTu 8988t C510(0.31); C516(0.31)  LDD1319  [15]
 LDCM0441  CL50 PaTu 8988t C93(1.11); C510(1.00); C516(1.00)  LDD1320  [15]
 LDCM0442  CL51 PaTu 8988t C93(1.29); C510(0.98); C516(0.98)  LDD1321  [15]
 LDCM0443  CL52 PaTu 8988t C93(1.26); C510(0.86); C516(0.86)  LDD1322  [15]
 LDCM0444  CL53 PaTu 8988t C93(1.37); C510(0.78); C516(0.78)  LDD1323  [15]
 LDCM0445  CL54 PaTu 8988t C93(1.31); C510(0.60); C516(0.60)  LDD1324  [15]
 LDCM0446  CL55 PaTu 8988t C93(1.34); C510(0.60); C516(0.60)  LDD1325  [15]
 LDCM0447  CL56 PaTu 8988t C93(1.35); C510(0.37); C516(0.37)  LDD1326  [15]
 LDCM0448  CL57 PaTu 8988t C93(1.81); C510(0.32); C516(0.32)  LDD1327  [15]
 LDCM0449  CL58 PaTu 8988t C93(1.25); C510(0.71); C516(0.71)  LDD1328  [15]
 LDCM0450  CL59 PaTu 8988t C93(1.34); C510(0.37); C516(0.37)  LDD1329  [15]
 LDCM0451  CL6 PaTu 8988t C510(0.46); C516(0.46)  LDD1330  [15]
 LDCM0452  CL60 PaTu 8988t C93(1.27); C510(0.44); C516(0.44)  LDD1331  [15]
 LDCM0453  CL61 PaTu 8988t C405(1.08); C510(1.06); C516(1.06)  LDD1332  [15]
 LDCM0454  CL62 PaTu 8988t C405(0.73); C510(0.57); C516(0.57)  LDD1333  [15]
 LDCM0455  CL63 PaTu 8988t C405(0.75); C510(0.64); C516(0.64)  LDD1334  [15]
 LDCM0456  CL64 PaTu 8988t C405(0.75); C510(0.60); C516(0.60)  LDD1335  [15]
 LDCM0457  CL65 PaTu 8988t C405(0.94); C510(0.70); C516(0.70)  LDD1336  [15]
 LDCM0458  CL66 PaTu 8988t C405(0.79); C510(0.56); C516(0.56)  LDD1337  [15]
 LDCM0459  CL67 PaTu 8988t C405(0.70); C510(0.62); C516(0.62)  LDD1338  [15]
 LDCM0460  CL68 PaTu 8988t C405(0.73); C510(0.52); C516(0.52)  LDD1339  [15]
 LDCM0461  CL69 PaTu 8988t C405(0.57); C510(0.43); C516(0.43)  LDD1340  [15]
 LDCM0462  CL7 PaTu 8988t C510(0.38); C516(0.38)  LDD1341  [15]
 LDCM0463  CL70 PaTu 8988t C405(0.68); C510(0.60); C516(0.60)  LDD1342  [15]
 LDCM0464  CL71 PaTu 8988t C405(0.76); C510(0.72); C516(0.72)  LDD1343  [15]
 LDCM0465  CL72 PaTu 8988t C405(0.79); C510(0.68); C516(0.68)  LDD1344  [15]
 LDCM0466  CL73 PaTu 8988t C405(0.57); C510(0.31); C516(0.31)  LDD1345  [15]
 LDCM0467  CL74 PaTu 8988t C405(0.83); C510(0.72); C516(0.72)  LDD1346  [15]
 LDCM0469  CL76 PaTu 8988t C510(0.74); C516(0.74)  LDD1348  [15]
 LDCM0470  CL77 PaTu 8988t C510(0.73); C516(0.73)  LDD1349  [15]
 LDCM0471  CL78 PaTu 8988t C510(0.58); C516(0.58)  LDD1350  [15]
 LDCM0472  CL79 PaTu 8988t C510(0.64); C516(0.64)  LDD1351  [15]
 LDCM0473  CL8 PaTu 8988t C510(0.35); C516(0.35)  LDD1352  [15]
 LDCM0474  CL80 PaTu 8988t C510(0.58); C516(0.58)  LDD1353  [15]
 LDCM0475  CL81 PaTu 8988t C510(0.61); C516(0.61)  LDD1354  [15]
 LDCM0476  CL82 PaTu 8988t C510(0.62); C516(0.62)  LDD1355  [15]
 LDCM0477  CL83 PaTu 8988t C510(0.52); C516(0.52)  LDD1356  [15]
 LDCM0478  CL84 PaTu 8988t C510(0.63); C516(0.63)  LDD1357  [15]
 LDCM0479  CL85 PaTu 8988t C510(0.75); C516(0.75)  LDD1358  [15]
 LDCM0480  CL86 PaTu 8988t C510(0.53); C516(0.53)  LDD1359  [15]
 LDCM0481  CL87 PaTu 8988t C510(0.46); C516(0.46)  LDD1360  [15]
 LDCM0482  CL88 PaTu 8988t C510(0.50); C516(0.50)  LDD1361  [15]
 LDCM0483  CL89 PaTu 8988t C510(0.66); C516(0.66)  LDD1362  [15]
 LDCM0484  CL9 PaTu 8988t C510(0.34); C516(0.34)  LDD1363  [15]
 LDCM0485  CL90 PaTu 8988t C510(0.51); C516(0.51)  LDD1364  [15]
 LDCM0486  CL91 PaTu 8988t C405(0.67); C510(0.26); C516(0.26)  LDD1365  [15]
 LDCM0487  CL92 PaTu 8988t C405(0.51); C510(0.27); C516(0.27)  LDD1366  [15]
 LDCM0488  CL93 PaTu 8988t C405(0.58); C510(0.23); C516(0.23)  LDD1367  [15]
 LDCM0489  CL94 PaTu 8988t C405(0.56); C510(0.28); C516(0.28)  LDD1368  [15]
 LDCM0490  CL95 PaTu 8988t C405(0.37); C510(0.21); C516(0.21)  LDD1369  [15]
 LDCM0491  CL96 PaTu 8988t C405(0.45); C510(0.25); C516(0.25)  LDD1370  [15]
 LDCM0492  CL97 PaTu 8988t C405(0.58); C510(0.26); C516(0.26)  LDD1371  [15]
 LDCM0493  CL98 PaTu 8988t C405(0.41); C510(0.18); C516(0.18)  LDD1372  [15]
 LDCM0494  CL99 PaTu 8988t C405(0.53); C510(0.27); C516(0.27)  LDD1373  [15]
 LDCM0468  Fragment33 PaTu 8988t C405(0.62); C510(0.47); C516(0.47)  LDD1347  [15]
 LDCM0427  Fragment51 PaTu 8988t C405(1.17)  LDD1306  [15]
 LDCM0107  IAA HeLa H64(0.00); C390(0.00); H291(0.00); C593(0.00)  LDD0221  [9]
 LDCM0022  KB02 22RV1 C591(1.87); C602(1.51)  LDD2243  [3]
 LDCM0023  KB03 22RV1 C591(2.78); C602(2.03)  LDD2660  [3]
 LDCM0024  KB05 COLO792 C591(2.03)  LDD3310  [3]
 LDCM0109  NEM HeLa H64(0.00); H282(0.00); H332(0.00); H343(0.00)  LDD0223  [9]
 LDCM0131  RA190 MM1.R C93(1.12)  LDD0304  [16]

The Interaction Atlas With This Target

The Protein(s) Related To This Target

Enzyme
Click To Hide/Show 1 Protein(s) Interacting with This Target
Protein name Family Uniprot ID
Regulator of nonsense transcripts 1 (UPF1) DNA2/NAM7 helicase family Q92900
Other
Click To Hide/Show 2 Protein(s) Interacting with This Target
Protein name Family Uniprot ID
Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ETF1) Eukaryotic release factor 1 family P62495
Polyadenylate-binding protein 1 (PABPC1) Polyadenylate-binding protein type-1 family P11940

References

1 Quantitative and Site-Specific Chemoproteomic Profiling of Targets of Acrolein. Chem Res Toxicol. 2019 Mar 18;32(3):467-473. doi: 10.1021/acs.chemrestox.8b00343. Epub 2019 Jan 15.
2 A Paal-Knorr agent for chemoproteomic profiling of targets of isoketals in cells. Chem Sci. 2021 Oct 15;12(43):14557-14563. doi: 10.1039/d1sc02230j. eCollection 2021 Nov 10.
Mass spectrometry data entry: PXD028270
3 DrugMap: A quantitative pan-cancer analysis of cysteine ligandability. Cell. 2024 May 9;187(10):2536-2556.e30. doi: 10.1016/j.cell.2024.03.027. Epub 2024 Apr 22.
Mass spectrometry data entry: PXD047840
4 Chemoproteomic capture of RNA binding activity in living cells. Nat Commun. 2023 Oct 7;14(1):6282. doi: 10.1038/s41467-023-41844-z.
Mass spectrometry data entry: PXD044625
5 Global profiling of functional histidines in live cells using small-molecule photosensitizer and chemical probe relay labelling. Nat Chem. 2024 Jun 4. doi: 10.1038/s41557-024-01545-6. Online ahead of print.
Mass spectrometry data entry: PXD042377
6 Enhancing Cysteine Chemoproteomic Coverage through Systematic Assessment of Click Chemistry Product Fragmentation. Anal Chem. 2022 Mar 8;94(9):3800-3810. doi: 10.1021/acs.analchem.1c04402. Epub 2022 Feb 23.
Mass spectrometry data entry: PXD028853
7 Tunable Amine-Reactive Electrophiles for Selective Profiling of Lysine. Angew Chem Int Ed Engl. 2022 Jan 26;61(5):e202112107. doi: 10.1002/anie.202112107. Epub 2021 Dec 16.
8 Benchmarking Cleavable Biotin Tags for Peptide-Centric Chemoproteomics. J Proteome Res. 2022 May 6;21(5):1349-1358. doi: 10.1021/acs.jproteome.2c00174. Epub 2022 Apr 25.
Mass spectrometry data entry: PXD031019
9 ACR-Based Probe for the Quantitative Profiling of Histidine Reactivity in the Human Proteome. J Am Chem Soc. 2023 Mar 8;145(9):5252-5260. doi: 10.1021/jacs.2c12653. Epub 2023 Feb 27.
10 Oxidant-Induced Bioconjugation for Protein Labeling in Live Cells. ACS Chem Biol. 2023 Jan 20;18(1):112-122. doi: 10.1021/acschembio.2c00740. Epub 2022 Dec 21.
11 N-Acryloylindole-alkyne (NAIA) enables imaging and profiling new ligandable cysteines and oxidized thiols by chemoproteomics. Nat Commun. 2023 Jun 15;14(1):3564. doi: 10.1038/s41467-023-39268-w.
Mass spectrometry data entry: PXD041264
12 Global profiling identifies a stress-responsive tyrosine site on EDC3 regulating biomolecular condensate formation. Cell Chem Biol. 2022 Dec 15;29(12):1709-1720.e7. doi: 10.1016/j.chembiol.2022.11.008. Epub 2022 Dec 6.
Mass spectrometry data entry: PXD038010
13 Ligand and Target Discovery by Fragment-Based Screening in Human Cells. Cell. 2017 Jan 26;168(3):527-541.e29. doi: 10.1016/j.cell.2016.12.029. Epub 2017 Jan 19.
14 Pharmacological Targeting of Vacuolar H(+)-ATPase via Subunit V1G Combats Multidrug-Resistant Cancer. Cell Chem Biol. 2020 Nov 19;27(11):1359-1370.e8. doi: 10.1016/j.chembiol.2020.06.011. Epub 2020 Jul 9.
15 Reimagining high-throughput profiling of reactive cysteines for cell-based screening of large electrophile libraries. Nat Biotechnol. 2021 May;39(5):630-641. doi: 10.1038/s41587-020-00778-3. Epub 2021 Jan 4.
16 Physical and Functional Analysis of the Putative Rpn13 Inhibitor RA190. Cell Chem Biol. 2020 Nov 19;27(11):1371-1382.e6. doi: 10.1016/j.chembiol.2020.08.007. Epub 2020 Aug 27.