General Information of Target

Target ID LDTP00686
Target Name mRNA cap guanine-N7 methyltransferase (RNMT)
Gene Name RNMT
Gene ID 8731
Synonyms
KIAA0398; mRNA cap guanine-N7 methyltransferase; EC 2.1.1.56; RG7MT1; mRNA; guanine-N(7))-methyltransferase; mRNA cap methyltransferase; hCMT1; hMet; hcm1p
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MANSAKAEEYEKMSLEQAKASVNSETESSFNINENTTASGTGLSEKTSVCRQVDIARKRK
EFEDDLVKESSSCGKDTPSKKRKLDPEIVPEEKDCGDAEGNSKKRKRETEDVPKDKSSTG
DGTQNKRKIALEDVPEKQKNLEEGHSSTVAAHYNELQEVGLEKRSQSRIFYLRNFNNWMK
SVLIGEFLEKVRQKKKRDITVLDLGCGKGGDLLKWKKGRINKLVCTDIADVSVKQCQQRY
EDMKNRRDSEYIFSAEFITADSSKELLIDKFRDPQMCFDICSCQFVCHYSFESYEQADMM
LRNACERLSPGGYFIGTTPNSFELIRRLEASETESFGNEIYTVKFQKKGDYPLFGCKYDF
NLEGVVDVPEFLVYFPLLNEMAKKYNMKLVYKKTFLEFYEEKIKNNENKMLLKRMQALEP
YPANESSKLVSEKVDDYEHAAKYMKNSQVRLPLGTLSKSEWEATSIYLVFAFEKQQ
Target Type
Literature-reported
Target Bioclass
Enzyme
Family
Class I-like SAM-binding methyltransferase superfamily, mRNA cap 0 methyltransferase family
Subcellular location
Nucleus
Function
Catalytic subunit of the mRNA-capping methyltransferase RNMT:RAMAC complex that methylates the N7 position of the added guanosine to the 5'-cap structure of mRNAs . Binds RNA containing 5'-terminal GpppC.
TTD ID
T77174
Uniprot ID
O43148
DrugMap ID
TTG45HY
Ensemble ID
ENST00000262173.7
HGNC ID
HGNC:10075
ChEMBL ID
CHEMBL4295662

Target Site Mutations in Different Cell Lines

Cell line Mutation details Probe for labeling this protein in this cell
HT115 SNV: p.K60Q; p.N338K DBIA    Probe Info 
SISO SNV: p.R307K DBIA    Probe Info 

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 22 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
m-APA
 Probe Info 
15.00  LDD0402  [1]
STPyne
 Probe Info 
K190(10.00); K208(1.28)  LDD0277  [2]
Probe 1
 Probe Info 
Y10(37.12); Y351(10.59)  LDD3495  [3]
DBIA
 Probe Info 
C225(1.79)  LDD3312  [4]
BTD
 Probe Info 
C95(1.28)  LDD2091  [5]
AHL-Pu-1
 Probe Info 
C73(4.48); C95(4.84)  LDD0168  [6]
ATP probe
 Probe Info 
K208(0.00); K214(0.00); K190(0.00)  LDD0199  [7]
4-Iodoacetamidophenylacetylene
 Probe Info 
C206(0.00); C73(0.00); C356(0.00); C225(0.00)  LDD0038  [8]
IA-alkyne
 Probe Info 
N.A.  LDD0032  [9]
Lodoacetamide azide
 Probe Info 
C206(0.00); C356(0.00); C225(0.00); C95(0.00)  LDD0037  [8]
IPM
 Probe Info 
C95(0.00); C73(0.00)  LDD0025  [10]
NAIA_4
 Probe Info 
N.A.  LDD2226  [11]
Compound 10
 Probe Info 
N.A.  LDD2216  [12]
Compound 11
 Probe Info 
N.A.  LDD2213  [12]
TFBX
 Probe Info 
N.A.  LDD0148  [10]
VSF
 Probe Info 
N.A.  LDD0007  [13]
Phosphinate-6
 Probe Info 
C95(0.00); C50(0.00); C73(0.00)  LDD0018  [14]
Acrolein
 Probe Info 
C206(0.00); C225(0.00)  LDD0217  [15]
Methacrolein
 Probe Info 
N.A.  LDD0218  [15]
AOyne
 Probe Info 
14.50  LDD0443  [16]
NAIA_5
 Probe Info 
C206(0.00); C225(0.00); C236(0.00)  LDD2223  [11]
HHS-482
 Probe Info 
Y153(0.76)  LDD2239  [17]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0548  1-(4-(Benzo[d][1,3]dioxol-5-ylmethyl)piperazin-1-yl)-2-nitroethan-1-one MDA-MB-231 C73(1.08); C95(0.73)  LDD2142  [5]
 LDCM0519  1-(6-methoxy-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-2-nitroethan-1-one MDA-MB-231 C73(0.99)  LDD2112  [5]
 LDCM0524  2-Cyano-N-(2-morpholin-4-yl-ethyl)-acetamide MDA-MB-231 C73(1.08)  LDD2117  [5]
 LDCM0025  4SU-RNA HEK-293T C73(4.48); C95(4.84)  LDD0168  [6]
 LDCM0026  4SU-RNA+native RNA HEK-293T C73(18.07); C95(2.17)  LDD0169  [6]
 LDCM0214  AC1 HEK-293T C73(1.03); C95(0.92); C356(1.10); C225(0.86)  LDD1507  [18]
 LDCM0215  AC10 HEK-293T C73(1.07); C95(0.96); C356(1.00); C225(0.86)  LDD1508  [18]
 LDCM0226  AC11 HEK-293T C73(1.01); C95(1.06); C356(1.06); C225(0.95)  LDD1509  [18]
 LDCM0237  AC12 HEK-293T C73(0.95); C95(0.96); C356(1.01); C225(0.89)  LDD1510  [18]
 LDCM0259  AC14 HEK-293T C73(0.96); C95(0.90); C356(1.02); C225(1.05)  LDD1512  [18]
 LDCM0270  AC15 HEK-293T C73(0.98); C95(0.98); C356(0.95); C225(1.14)  LDD1513  [18]
 LDCM0276  AC17 HEK-293T C73(1.02); C95(1.00); C356(0.91); C225(0.99)  LDD1515  [18]
 LDCM0277  AC18 HEK-293T C73(1.06); C95(0.93); C356(0.97); C225(1.04)  LDD1516  [18]
 LDCM0278  AC19 HEK-293T C73(1.66); C95(1.53); C356(0.94); C225(0.99)  LDD1517  [18]
 LDCM0279  AC2 HEK-293T C73(1.03); C95(1.02); C356(1.03); C225(1.06)  LDD1518  [18]
 LDCM0280  AC20 HEK-293T C73(0.97); C95(0.99); C356(0.97); C225(0.81)  LDD1519  [18]
 LDCM0281  AC21 HEK-293T C73(1.00); C95(1.00); C356(1.02); C225(1.15)  LDD1520  [18]
 LDCM0282  AC22 HEK-293T C73(0.98); C95(1.05); C356(1.03); C225(1.01)  LDD1521  [18]
 LDCM0283  AC23 HEK-293T C73(0.94); C95(0.84); C356(0.95); C225(0.95)  LDD1522  [18]
 LDCM0284  AC24 HEK-293T C73(0.96); C95(1.02); C225(1.07)  LDD1523  [18]
 LDCM0285  AC25 HEK-293T C73(1.06); C95(1.11); C356(1.05); C225(0.97)  LDD1524  [18]
 LDCM0286  AC26 HEK-293T C73(1.02); C95(1.01); C356(0.96); C225(1.01)  LDD1525  [18]
 LDCM0287  AC27 HEK-293T C73(1.07); C95(1.28); C356(0.99); C225(1.12)  LDD1526  [18]
 LDCM0288  AC28 HEK-293T C73(1.02); C95(1.04); C356(1.03); C225(1.04)  LDD1527  [18]
 LDCM0289  AC29 HEK-293T C73(1.04); C95(0.91); C356(1.05); C225(1.24)  LDD1528  [18]
 LDCM0290  AC3 HEK-293T C73(1.00); C95(0.96); C356(1.02); C225(0.98)  LDD1529  [18]
 LDCM0291  AC30 HEK-293T C73(1.04); C95(1.02); C356(1.05); C225(1.17)  LDD1530  [18]
 LDCM0292  AC31 HEK-293T C73(1.02); C95(0.96); C356(1.03); C225(1.33)  LDD1531  [18]
 LDCM0293  AC32 HEK-293T C73(1.01); C95(1.04); C225(1.07)  LDD1532  [18]
 LDCM0294  AC33 HEK-293T C73(0.98); C95(0.89); C356(0.98); C225(0.91)  LDD1533  [18]
 LDCM0295  AC34 HEK-293T C73(1.08); C95(0.88); C356(0.97); C225(0.91)  LDD1534  [18]
 LDCM0296  AC35 HEK-293T C73(0.99); C95(0.97); C356(1.09); C225(1.13)  LDD1535  [18]
 LDCM0297  AC36 HEK-293T C73(0.88); C95(0.90); C356(0.98); C225(0.97)  LDD1536  [18]
 LDCM0298  AC37 HEK-293T C73(0.86); C95(0.91); C356(1.26); C225(1.09)  LDD1537  [18]
 LDCM0299  AC38 HEK-293T C73(0.90); C95(0.86); C356(1.09); C225(1.06)  LDD1538  [18]
 LDCM0300  AC39 HEK-293T C73(0.92); C95(0.85); C356(0.96); C225(1.26)  LDD1539  [18]
 LDCM0301  AC4 HEK-293T C73(0.96); C95(0.93); C356(1.01); C225(0.99)  LDD1540  [18]
 LDCM0302  AC40 HEK-293T C73(0.96); C95(0.79); C225(0.94)  LDD1541  [18]
 LDCM0303  AC41 HEK-293T C73(0.96); C95(0.92); C356(1.15); C225(0.98)  LDD1542  [18]
 LDCM0304  AC42 HEK-293T C73(1.10); C95(0.95); C356(0.90); C225(0.97)  LDD1543  [18]
 LDCM0305  AC43 HEK-293T C73(1.02); C95(1.01); C356(1.08); C225(0.98)  LDD1544  [18]
 LDCM0306  AC44 HEK-293T C73(0.96); C95(0.98); C356(0.96); C225(0.89)  LDD1545  [18]
 LDCM0307  AC45 HEK-293T C73(0.98); C95(0.91); C356(1.14); C225(0.98)  LDD1546  [18]
 LDCM0308  AC46 HEK-293T C73(0.95); C95(0.95); C356(0.97); C225(1.12)  LDD1547  [18]
 LDCM0309  AC47 HEK-293T C73(0.91); C95(0.96); C356(0.97); C225(0.99)  LDD1548  [18]
 LDCM0310  AC48 HEK-293T C73(0.94); C95(0.78); C225(0.99)  LDD1549  [18]
 LDCM0311  AC49 HEK-293T C73(0.96); C95(0.90); C356(0.98); C225(0.93)  LDD1550  [18]
 LDCM0312  AC5 HEK-293T C73(0.98); C95(0.94); C356(1.14); C225(1.02)  LDD1551  [18]
 LDCM0313  AC50 HEK-293T C73(1.04); C95(0.90); C356(0.92); C225(1.03)  LDD1552  [18]
 LDCM0314  AC51 HEK-293T C73(0.96); C95(0.99); C356(1.02); C225(0.98)  LDD1553  [18]
 LDCM0315  AC52 HEK-293T C73(0.96); C95(0.93); C356(0.96); C225(0.91)  LDD1554  [18]
 LDCM0316  AC53 HEK-293T C73(0.90); C95(0.89); C356(1.12); C225(0.99)  LDD1555  [18]
 LDCM0317  AC54 HEK-293T C73(0.94); C95(0.92); C356(1.06); C225(1.03)  LDD1556  [18]
 LDCM0318  AC55 HEK-293T C73(0.92); C95(0.91); C356(0.97); C225(1.04)  LDD1557  [18]
 LDCM0319  AC56 HEK-293T C73(0.96); C95(0.87); C225(0.96)  LDD1558  [18]
 LDCM0320  AC57 HEK-293T C73(1.00); C95(0.88); C356(0.97); C225(0.91)  LDD1559  [18]
 LDCM0321  AC58 HEK-293T C73(0.99); C95(1.00); C356(0.94); C225(1.05)  LDD1560  [18]
 LDCM0322  AC59 HEK-293T C73(0.96); C95(0.90); C356(1.10); C225(1.12)  LDD1561  [18]
 LDCM0323  AC6 HEK-293T C73(1.00); C95(1.14); C356(1.02); C225(0.98)  LDD1562  [18]
 LDCM0324  AC60 HEK-293T C73(0.99); C95(0.91); C356(0.96); C225(0.94)  LDD1563  [18]
 LDCM0325  AC61 HEK-293T C73(0.98); C95(0.96); C356(1.08); C225(1.06)  LDD1564  [18]
 LDCM0326  AC62 HEK-293T C73(0.95); C95(1.06); C356(0.98); C225(1.03)  LDD1565  [18]
 LDCM0327  AC63 HEK-293T C73(0.95); C95(1.06); C356(1.02); C225(1.18)  LDD1566  [18]
 LDCM0328  AC64 HEK-293T C73(0.94); C95(0.95); C225(1.01)  LDD1567  [18]
 LDCM0334  AC7 HEK-293T C73(0.93); C95(1.14); C356(1.01); C225(1.19)  LDD1568  [18]
 LDCM0345  AC8 HEK-293T C73(1.03); C95(1.02); C225(0.92)  LDD1569  [18]
 LDCM0520  AKOS000195272 MDA-MB-231 C73(0.94)  LDD2113  [5]
 LDCM0248  AKOS034007472 HEK-293T C73(0.95); C95(0.91); C356(1.24); C225(1.09)  LDD1511  [18]
 LDCM0356  AKOS034007680 HEK-293T C73(1.05); C95(1.11); C356(1.06); C225(0.91)  LDD1570  [18]
 LDCM0275  AKOS034007705 HEK-293T C73(1.00); C95(0.91); C225(0.95)  LDD1514  [18]
 LDCM0156  Aniline NCI-H1299 12.24  LDD0403  [1]
 LDCM0498  BS-3668 MDA-MB-231 C95(1.28)  LDD2091  [5]
 LDCM0108  Chloroacetamide HeLa N.A.  LDD0222  [15]
 LDCM0632  CL-Sc Hep-G2 C73(1.34)  LDD2227  [11]
 LDCM0367  CL1 HEK-293T C73(0.91); C95(0.99); C356(1.01); C225(0.89)  LDD1571  [18]
 LDCM0368  CL10 HEK-293T C73(0.82); C95(0.37); C356(0.90); C225(0.83)  LDD1572  [18]
 LDCM0369  CL100 HEK-293T C73(1.00); C95(0.88); C356(1.06); C225(1.05)  LDD1573  [18]
 LDCM0370  CL101 HEK-293T C73(1.02); C95(1.08); C356(0.99); C225(0.67)  LDD1574  [18]
 LDCM0371  CL102 HEK-293T C73(0.97); C95(1.01); C356(1.09); C225(0.90)  LDD1575  [18]
 LDCM0372  CL103 HEK-293T C73(1.00); C95(1.22); C356(0.96); C225(1.09)  LDD1576  [18]
 LDCM0373  CL104 HEK-293T C73(0.99); C95(1.05); C356(1.02); C225(1.15)  LDD1577  [18]
 LDCM0374  CL105 HEK-293T C73(1.05); C95(0.96); C356(1.00); C225(0.81)  LDD1578  [18]
 LDCM0375  CL106 HEK-293T C73(0.95); C95(1.16); C356(0.95); C225(1.06)  LDD1579  [18]
 LDCM0376  CL107 HEK-293T C73(0.98); C95(0.86); C356(0.97); C225(1.08)  LDD1580  [18]
 LDCM0377  CL108 HEK-293T C73(1.01); C95(0.98); C356(1.04); C225(1.10)  LDD1581  [18]
 LDCM0378  CL109 HEK-293T C73(0.96); C95(0.94); C356(0.96); C225(0.88)  LDD1582  [18]
 LDCM0379  CL11 HEK-293T C73(0.88); C95(0.38); C356(0.96); C225(1.17)  LDD1583  [18]
 LDCM0380  CL110 HEK-293T C73(0.95); C95(1.17); C356(1.01); C225(0.88)  LDD1584  [18]
 LDCM0381  CL111 HEK-293T C73(0.99); C95(0.93); C356(0.96); C225(1.05)  LDD1585  [18]
 LDCM0382  CL112 HEK-293T C73(1.06); C95(0.94); C356(1.07); C225(1.09)  LDD1586  [18]
 LDCM0383  CL113 HEK-293T C73(1.00); C95(1.03); C356(1.17); C225(0.84)  LDD1587  [18]
 LDCM0384  CL114 HEK-293T C73(0.97); C95(1.11); C356(1.07); C225(0.86)  LDD1588  [18]
 LDCM0385  CL115 HEK-293T C73(0.93); C95(0.94); C356(1.03); C225(1.15)  LDD1589  [18]
 LDCM0386  CL116 HEK-293T C73(0.96); C95(0.94); C356(1.07); C225(1.09)  LDD1590  [18]
 LDCM0387  CL117 HEK-293T C73(1.02); C95(1.01); C356(1.06); C225(1.00)  LDD1591  [18]
 LDCM0388  CL118 HEK-293T C73(1.08); C95(1.14); C356(1.12); C225(1.03)  LDD1592  [18]
 LDCM0389  CL119 HEK-293T C73(0.95); C95(0.93); C356(1.08); C225(1.00)  LDD1593  [18]
 LDCM0390  CL12 HEK-293T C73(0.93); C95(0.93); C225(0.94)  LDD1594  [18]
 LDCM0391  CL120 HEK-293T C73(0.97); C95(0.98); C356(1.02); C225(1.08)  LDD1595  [18]
 LDCM0392  CL121 HEK-293T C73(0.99); C95(0.99); C356(0.92); C225(0.81)  LDD1596  [18]
 LDCM0393  CL122 HEK-293T C73(0.92); C95(0.93); C356(1.06); C225(1.00)  LDD1597  [18]
 LDCM0394  CL123 HEK-293T C73(0.84); C95(0.83); C356(1.03); C225(0.87)  LDD1598  [18]
 LDCM0395  CL124 HEK-293T C73(0.96); C95(0.89); C356(0.90); C225(1.00)  LDD1599  [18]
 LDCM0396  CL125 HEK-293T C73(0.96); C95(0.88); C356(1.12); C225(0.89)  LDD1600  [18]
 LDCM0397  CL126 HEK-293T C73(0.95); C95(1.03); C356(1.11); C225(0.96)  LDD1601  [18]
 LDCM0398  CL127 HEK-293T C73(0.96); C95(0.84); C356(1.13); C225(1.08)  LDD1602  [18]
 LDCM0399  CL128 HEK-293T C73(0.93); C95(0.94); C356(1.02); C225(1.02)  LDD1603  [18]
 LDCM0400  CL13 HEK-293T C73(1.15); C95(0.95); C356(0.91); C225(0.91)  LDD1604  [18]
 LDCM0401  CL14 HEK-293T C73(0.88); C95(1.09); C356(1.07); C225(0.73)  LDD1605  [18]
 LDCM0402  CL15 HEK-293T C73(0.96); C95(0.99); C356(0.88); C225(0.95)  LDD1606  [18]
 LDCM0403  CL16 HEK-293T C73(0.99); C95(0.93); C356(1.00); C225(0.81)  LDD1607  [18]
 LDCM0404  CL17 HEK-293T C73(0.96); C95(0.97); C356(0.88); C225(0.82)  LDD1608  [18]
 LDCM0405  CL18 HEK-293T C73(1.01); C95(0.98); C356(0.84); C225(0.71)  LDD1609  [18]
 LDCM0406  CL19 HEK-293T C73(0.99); C95(0.90); C356(0.98); C225(0.97)  LDD1610  [18]
 LDCM0407  CL2 HEK-293T C73(0.88); C95(1.25); C356(1.06); C225(1.01)  LDD1611  [18]
 LDCM0408  CL20 HEK-293T C73(0.95); C95(0.97); C356(0.87); C225(0.89)  LDD1612  [18]
 LDCM0409  CL21 HEK-293T C73(0.90); C95(0.92); C356(0.99); C225(0.77)  LDD1613  [18]
 LDCM0410  CL22 HEK-293T C73(0.91); C95(0.40); C356(1.03); C225(0.88)  LDD1614  [18]
 LDCM0411  CL23 HEK-293T C73(0.92); C95(0.35); C356(1.01); C225(0.89)  LDD1615  [18]
 LDCM0412  CL24 HEK-293T C73(0.91); C95(0.89); C225(0.70)  LDD1616  [18]
 LDCM0413  CL25 HEK-293T C73(0.91); C95(0.93); C356(1.04); C225(0.84)  LDD1617  [18]
 LDCM0414  CL26 HEK-293T C73(0.95); C95(0.94); C356(0.96); C225(1.13)  LDD1618  [18]
 LDCM0415  CL27 HEK-293T C73(0.96); C95(0.93); C356(0.97); C225(1.20)  LDD1619  [18]
 LDCM0416  CL28 HEK-293T C73(1.00); C95(0.93); C356(1.02); C225(0.99)  LDD1620  [18]
 LDCM0417  CL29 HEK-293T C73(1.01); C95(0.96); C356(1.10); C225(1.09)  LDD1621  [18]
 LDCM0418  CL3 HEK-293T C73(0.94); C95(0.87); C356(1.05); C225(1.05)  LDD1622  [18]
 LDCM0419  CL30 HEK-293T C73(1.02); C95(1.05); C356(0.93); C225(1.11)  LDD1623  [18]
 LDCM0420  CL31 HEK-293T C73(1.03); C95(1.11); C356(0.98); C225(1.01)  LDD1624  [18]
 LDCM0421  CL32 HEK-293T C73(0.97); C95(1.04); C356(1.05); C225(1.18)  LDD1625  [18]
 LDCM0422  CL33 HEK-293T C73(0.93); C95(0.93); C356(1.07); C225(1.00)  LDD1626  [18]
 LDCM0423  CL34 HEK-293T C73(0.98); C95(0.42); C356(0.97); C225(1.03)  LDD1627  [18]
 LDCM0424  CL35 HEK-293T C73(0.99); C95(0.37); C356(1.09); C225(1.15)  LDD1628  [18]
 LDCM0425  CL36 HEK-293T C73(0.97); C95(0.96); C225(0.96)  LDD1629  [18]
 LDCM0426  CL37 HEK-293T C73(0.93); C95(0.93); C356(1.10); C225(1.14)  LDD1630  [18]
 LDCM0428  CL39 HEK-293T C73(0.93); C95(1.09); C356(0.98); C225(0.96)  LDD1632  [18]
 LDCM0429  CL4 HEK-293T C73(0.91); C95(0.95); C356(0.93); C225(1.08)  LDD1633  [18]
 LDCM0430  CL40 HEK-293T C73(0.99); C95(1.07); C356(1.03); C225(1.06)  LDD1634  [18]
 LDCM0431  CL41 HEK-293T C73(0.97); C95(1.00); C356(0.93); C225(0.96)  LDD1635  [18]
 LDCM0432  CL42 HEK-293T C73(1.04); C95(1.07); C356(1.11); C225(1.01)  LDD1636  [18]
 LDCM0433  CL43 HEK-293T C73(1.01); C95(1.17); C356(1.09); C225(1.07)  LDD1637  [18]
 LDCM0434  CL44 HEK-293T C73(1.01); C95(1.01); C356(1.04); C225(0.92)  LDD1638  [18]
 LDCM0435  CL45 HEK-293T C73(1.03); C95(0.95); C356(1.03); C225(0.88)  LDD1639  [18]
 LDCM0436  CL46 HEK-293T C73(0.97); C95(0.42); C356(1.01); C225(1.09)  LDD1640  [18]
 LDCM0437  CL47 HEK-293T C73(1.00); C95(0.38); C356(0.97); C225(1.10)  LDD1641  [18]
 LDCM0438  CL48 HEK-293T C73(0.97); C95(1.23); C225(0.98)  LDD1642  [18]
 LDCM0439  CL49 HEK-293T C73(0.90); C95(0.87); C356(1.19); C225(1.07)  LDD1643  [18]
 LDCM0440  CL5 HEK-293T C73(0.90); C95(0.86); C356(1.08); C225(0.93)  LDD1644  [18]
 LDCM0441  CL50 HEK-293T C73(0.91); C95(1.09); C356(1.04); C225(1.01)  LDD1645  [18]
 LDCM0443  CL52 HEK-293T C73(0.98); C95(0.90); C356(0.99); C225(1.18)  LDD1646  [18]
 LDCM0444  CL53 HEK-293T C73(0.93); C95(0.88); C356(1.01); C225(0.90)  LDD1647  [18]
 LDCM0445  CL54 HEK-293T C73(0.99); C95(0.93); C356(0.88); C225(0.92)  LDD1648  [18]
 LDCM0446  CL55 HEK-293T C73(1.02); C95(0.94); C356(0.98); C225(1.07)  LDD1649  [18]
 LDCM0447  CL56 HEK-293T C73(0.94); C95(0.90); C356(0.94); C225(1.08)  LDD1650  [18]
 LDCM0448  CL57 HEK-293T C73(1.04); C95(1.03); C356(1.08); C225(0.89)  LDD1651  [18]
 LDCM0449  CL58 HEK-293T C73(0.91); C95(0.40); C356(1.03); C225(0.97)  LDD1652  [18]
 LDCM0450  CL59 HEK-293T C73(0.90); C95(0.39); C356(0.96); C225(1.29)  LDD1653  [18]
 LDCM0451  CL6 HEK-293T C73(0.99); C95(1.14); C356(0.92); C225(0.86)  LDD1654  [18]
 LDCM0452  CL60 HEK-293T C73(0.98); C95(0.80); C225(0.93)  LDD1655  [18]
 LDCM0453  CL61 HEK-293T C73(0.90); C95(0.93); C356(1.10); C225(0.88)  LDD1656  [18]
 LDCM0454  CL62 HEK-293T C73(0.96); C95(0.97); C356(1.06); C225(0.95)  LDD1657  [18]
 LDCM0455  CL63 HEK-293T C73(0.93); C95(0.95); C356(1.00); C225(1.18)  LDD1658  [18]
 LDCM0456  CL64 HEK-293T C73(0.89); C95(0.89); C356(1.02); C225(1.09)  LDD1659  [18]
 LDCM0457  CL65 HEK-293T C73(0.95); C95(0.87); C356(0.91); C225(0.84)  LDD1660  [18]
 LDCM0458  CL66 HEK-293T C73(1.03); C95(0.84); C356(0.86); C225(1.06)  LDD1661  [18]
 LDCM0459  CL67 HEK-293T C73(0.98); C95(1.03); C356(1.07); C225(1.03)  LDD1662  [18]
 LDCM0460  CL68 HEK-293T C73(0.90); C95(0.90); C356(1.04); C225(0.99)  LDD1663  [18]
 LDCM0461  CL69 HEK-293T C73(0.91); C95(0.87); C356(1.04); C225(1.13)  LDD1664  [18]
 LDCM0462  CL7 HEK-293T C73(0.95); C95(0.99); C356(1.01); C225(1.02)  LDD1665  [18]
 LDCM0463  CL70 HEK-293T C73(0.97); C95(0.46); C356(0.99); C225(0.98)  LDD1666  [18]
 LDCM0464  CL71 HEK-293T C73(0.97); C95(0.41); C356(0.97); C225(1.09)  LDD1667  [18]
 LDCM0465  CL72 HEK-293T C73(1.01); C95(1.01); C225(1.13)  LDD1668  [18]
 LDCM0466  CL73 HEK-293T C73(0.95); C95(0.99); C356(1.14); C225(0.96)  LDD1669  [18]
 LDCM0467  CL74 HEK-293T C73(0.95); C95(0.96); C356(1.04); C225(1.18)  LDD1670  [18]
 LDCM0469  CL76 HEK-293T C73(0.96); C95(0.84); C356(1.01); C225(1.32)  LDD1672  [18]
 LDCM0470  CL77 HEK-293T C73(0.92); C95(0.86); C356(1.04); C225(1.00)  LDD1673  [18]
 LDCM0471  CL78 HEK-293T C73(1.01); C95(0.95); C356(0.97); C225(1.18)  LDD1674  [18]
 LDCM0472  CL79 HEK-293T C73(0.98); C95(1.03); C356(1.12); C225(1.08)  LDD1675  [18]
 LDCM0473  CL8 HEK-293T C73(0.85); C95(0.78); C356(0.84); C225(0.51)  LDD1676  [18]
 LDCM0474  CL80 HEK-293T C73(0.96); C95(1.02); C356(1.06); C225(1.23)  LDD1677  [18]
 LDCM0475  CL81 HEK-293T C73(0.92); C95(0.96); C356(1.00); C225(1.05)  LDD1678  [18]
 LDCM0476  CL82 HEK-293T C73(0.94); C95(0.54); C356(1.11); C225(0.99)  LDD1679  [18]
 LDCM0477  CL83 HEK-293T C73(0.92); C95(0.52); C356(0.91); C225(1.12)  LDD1680  [18]
 LDCM0478  CL84 HEK-293T C73(0.92); C95(0.91); C225(0.95)  LDD1681  [18]
 LDCM0479  CL85 HEK-293T C73(0.92); C95(0.90); C356(1.12); C225(0.90)  LDD1682  [18]
 LDCM0480  CL86 HEK-293T C73(0.92); C95(0.96); C356(1.09); C225(0.91)  LDD1683  [18]
 LDCM0481  CL87 HEK-293T C73(0.92); C95(0.85); C356(1.16); C225(1.16)  LDD1684  [18]
 LDCM0482  CL88 HEK-293T C73(0.97); C95(0.91); C356(1.09); C225(0.96)  LDD1685  [18]
 LDCM0483  CL89 HEK-293T C73(0.96); C95(0.85); C356(1.12); C225(1.05)  LDD1686  [18]
 LDCM0484  CL9 HEK-293T C73(0.88); C95(0.97); C356(1.05); C225(1.08)  LDD1687  [18]
 LDCM0485  CL90 HEK-293T C73(0.95); C95(0.87); C356(0.95); C225(0.76)  LDD1688  [18]
 LDCM0486  CL91 HEK-293T C73(0.98); C95(0.92); C356(1.09); C225(1.07)  LDD1689  [18]
 LDCM0487  CL92 HEK-293T C73(0.92); C95(0.86); C356(0.95); C225(0.73)  LDD1690  [18]
 LDCM0488  CL93 HEK-293T C73(0.89); C95(0.98); C356(1.10); C225(0.98)  LDD1691  [18]
 LDCM0489  CL94 HEK-293T C73(0.92); C95(0.62); C356(1.04); C225(0.93)  LDD1692  [18]
 LDCM0490  CL95 HEK-293T C73(0.96); C95(0.64); C356(1.03); C225(0.81)  LDD1693  [18]
 LDCM0491  CL96 HEK-293T C73(0.95); C95(0.80); C225(0.76)  LDD1694  [18]
 LDCM0492  CL97 HEK-293T C73(1.01); C95(1.03); C356(1.01); C225(0.76)  LDD1695  [18]
 LDCM0493  CL98 HEK-293T C73(0.99); C95(1.11); C356(1.13); C225(0.98)  LDD1696  [18]
 LDCM0494  CL99 HEK-293T C73(0.97); C95(0.93); C356(0.96); C225(0.92)  LDD1697  [18]
 LDCM0495  E2913 HEK-293T C73(0.89); C95(0.92); C356(0.95); C225(1.02)  LDD1698  [18]
 LDCM0625  F8 Ramos C73(1.59)  LDD2187  [19]
 LDCM0572  Fragment10 Ramos C73(0.38); C95(1.17)  LDD2189  [19]
 LDCM0574  Fragment12 Ramos C73(0.32); C95(0.73)  LDD2191  [19]
 LDCM0575  Fragment13 Ramos C73(1.14); C95(0.72)  LDD2192  [19]
 LDCM0576  Fragment14 Ramos C73(0.59)  LDD2193  [19]
 LDCM0579  Fragment20 Ramos C73(0.42); C95(0.68)  LDD2194  [19]
 LDCM0580  Fragment21 Ramos C73(0.60); C95(0.90)  LDD2195  [19]
 LDCM0582  Fragment23 Ramos C95(1.31)  LDD2196  [19]
 LDCM0578  Fragment27 Ramos C73(0.99)  LDD2197  [19]
 LDCM0586  Fragment28 Ramos C73(0.58)  LDD2198  [19]
 LDCM0588  Fragment30 Ramos C73(0.59); C95(1.42)  LDD2199  [19]
 LDCM0589  Fragment31 Ramos C95(1.14)  LDD2200  [19]
 LDCM0590  Fragment32 Ramos C95(1.28)  LDD2201  [19]
 LDCM0468  Fragment33 HEK-293T C73(0.92); C95(0.78); C356(1.08); C225(1.02)  LDD1671  [18]
 LDCM0596  Fragment38 Ramos C73(0.81); C95(2.82)  LDD2203  [19]
 LDCM0566  Fragment4 Ramos C73(0.89)  LDD2184  [19]
 LDCM0427  Fragment51 HEK-293T C73(0.98); C95(1.10); C356(1.07); C225(0.98)  LDD1631  [18]
 LDCM0610  Fragment52 Ramos C95(0.88)  LDD2204  [19]
 LDCM0614  Fragment56 Ramos C95(1.50)  LDD2205  [19]
 LDCM0571  Fragment9 Ramos C73(0.38); C95(1.01)  LDD2188  [19]
 LDCM0107  IAA HeLa N.A.  LDD0221  [15]
 LDCM0022  KB02 HEK-293T C73(1.01); C95(0.98); C356(0.96)  LDD1492  [18]
 LDCM0023  KB03 HEK-293T C73(1.03); C95(0.97); C356(1.01)  LDD1497  [18]
 LDCM0024  KB05 HMCB C225(1.79)  LDD3312  [4]
 LDCM0499  Nucleophilic fragment 12b MDA-MB-231 C73(1.03)  LDD2092  [5]
 LDCM0506  Nucleophilic fragment 16a MDA-MB-231 C73(0.75)  LDD2099  [5]
 LDCM0507  Nucleophilic fragment 16b MDA-MB-231 C73(1.11); C95(0.91)  LDD2100  [5]
 LDCM0511  Nucleophilic fragment 18b MDA-MB-231 C95(1.24)  LDD2104  [5]
 LDCM0513  Nucleophilic fragment 19b MDA-MB-231 C95(0.63)  LDD2106  [5]
 LDCM0514  Nucleophilic fragment 20a MDA-MB-231 C73(0.94)  LDD2107  [5]
 LDCM0515  Nucleophilic fragment 20b MDA-MB-231 C73(0.66)  LDD2108  [5]
 LDCM0516  Nucleophilic fragment 21a MDA-MB-231 C73(0.62)  LDD2109  [5]
 LDCM0521  Nucleophilic fragment 23b MDA-MB-231 C95(0.64)  LDD2114  [5]
 LDCM0522  Nucleophilic fragment 24a MDA-MB-231 C73(1.35)  LDD2115  [5]
 LDCM0526  Nucleophilic fragment 26a MDA-MB-231 C356(1.01)  LDD2119  [5]
 LDCM0530  Nucleophilic fragment 28a MDA-MB-231 C73(0.54); C356(1.04)  LDD2123  [5]
 LDCM0532  Nucleophilic fragment 29a MDA-MB-231 C73(0.85)  LDD2125  [5]
 LDCM0534  Nucleophilic fragment 30a MDA-MB-231 C73(0.93)  LDD2127  [5]
 LDCM0540  Nucleophilic fragment 35 MDA-MB-231 C73(0.54)  LDD2133  [5]
 LDCM0541  Nucleophilic fragment 36 MDA-MB-231 C73(0.51)  LDD2134  [5]
 LDCM0542  Nucleophilic fragment 37 MDA-MB-231 C73(0.39)  LDD2135  [5]
 LDCM0543  Nucleophilic fragment 38 MDA-MB-231 C73(1.01); C95(0.92); C356(0.84)  LDD2136  [5]
 LDCM0544  Nucleophilic fragment 39 MDA-MB-231 C73(0.86)  LDD2137  [5]
 LDCM0546  Nucleophilic fragment 40 MDA-MB-231 C73(0.80)  LDD2140  [5]
 LDCM0547  Nucleophilic fragment 41 MDA-MB-231 C73(0.89); C95(0.89)  LDD2141  [5]
 LDCM0550  Nucleophilic fragment 5a MDA-MB-231 C73(1.62); C356(1.27)  LDD2144  [5]
 LDCM0551  Nucleophilic fragment 5b MDA-MB-231 C73(2.82); C95(2.51)  LDD2145  [5]
 LDCM0552  Nucleophilic fragment 6a MDA-MB-231 C73(0.67); C356(1.01)  LDD2146  [5]
 LDCM0556  Nucleophilic fragment 8a MDA-MB-231 C73(0.25); C225(0.97)  LDD2150  [5]

The Interaction Atlas With This Target

The Protein(s) Related To This Target

Enzyme
Click To Hide/Show 1 Protein(s) Interacting with This Target
Protein name Family Uniprot ID
Germ cell-less protein-like 1 (GMCL1) . Q96IK5
Transporter and channel
Click To Hide/Show 2 Protein(s) Interacting with This Target
Protein name Family Uniprot ID
Importin subunit alpha-1 (KPNA2) Importin alpha family P52292
Importin subunit alpha-7 (KPNA6) Importin alpha family O60684
Other
Click To Hide/Show 2 Protein(s) Interacting with This Target
Protein name Family Uniprot ID
RNA guanine-N7 methyltransferase activating subunit (RAMAC) RAM family Q9BTL3
Pleckstrin homology domain-containing family A member 3 (PLEKHA3) . Q9HB20

References

1 Quantitative and Site-Specific Chemoproteomic Profiling of Targets of Acrolein. Chem Res Toxicol. 2019 Mar 18;32(3):467-473. doi: 10.1021/acs.chemrestox.8b00343. Epub 2019 Jan 15.
2 A Paal-Knorr agent for chemoproteomic profiling of targets of isoketals in cells. Chem Sci. 2021 Oct 15;12(43):14557-14563. doi: 10.1039/d1sc02230j. eCollection 2021 Nov 10.
Mass spectrometry data entry: PXD028270
3 An Azo Coupling-Based Chemoproteomic Approach to Systematically Profile the Tyrosine Reactivity in the Human Proteome. Anal Chem. 2021 Jul 27;93(29):10334-10342. doi: 10.1021/acs.analchem.1c01935. Epub 2021 Jul 12.
4 DrugMap: A quantitative pan-cancer analysis of cysteine ligandability. Cell. 2024 May 9;187(10):2536-2556.e30. doi: 10.1016/j.cell.2024.03.027. Epub 2024 Apr 22.
Mass spectrometry data entry: PXD047840
5 Nucleophilic covalent ligand discovery for the cysteine redoxome. Nat Chem Biol. 2023 Nov;19(11):1309-1319. doi: 10.1038/s41589-023-01330-5. Epub 2023 May 29.
Mass spectrometry data entry: PXD039908 , PXD029761
6 Chemoproteomic capture of RNA binding activity in living cells. Nat Commun. 2023 Oct 7;14(1):6282. doi: 10.1038/s41467-023-41844-z.
Mass spectrometry data entry: PXD044625
7 Targeted Proteomic Approaches for Proteome-Wide Characterizations of the AMP-Binding Capacities of Kinases. J Proteome Res. 2022 Aug 5;21(8):2063-2070. doi: 10.1021/acs.jproteome.2c00225. Epub 2022 Jul 12.
8 Enhancing Cysteine Chemoproteomic Coverage through Systematic Assessment of Click Chemistry Product Fragmentation. Anal Chem. 2022 Mar 8;94(9):3800-3810. doi: 10.1021/acs.analchem.1c04402. Epub 2022 Feb 23.
Mass spectrometry data entry: PXD028853
9 SP3-FAIMS Chemoproteomics for High-Coverage Profiling of the Human Cysteinome*. Chembiochem. 2021 May 14;22(10):1841-1851. doi: 10.1002/cbic.202000870. Epub 2021 Feb 18.
Mass spectrometry data entry: PXD023056 , PXD023059 , PXD023058 , PXD023057 , PXD023060
10 Chemoproteomic Profiling by Cysteine Fluoroalkylation Reveals Myrocin G as an Inhibitor of the Nonhomologous End Joining DNA Repair Pathway. J Am Chem Soc. 2021 Dec 8;143(48):20332-20342. doi: 10.1021/jacs.1c09724. Epub 2021 Nov 24.
Mass spectrometry data entry: PXD029255
11 N-Acryloylindole-alkyne (NAIA) enables imaging and profiling new ligandable cysteines and oxidized thiols by chemoproteomics. Nat Commun. 2023 Jun 15;14(1):3564. doi: 10.1038/s41467-023-39268-w.
Mass spectrometry data entry: PXD041264
12 Multiplexed CuAAC Suzuki-Miyaura Labeling for Tandem Activity-Based Chemoproteomic Profiling. Anal Chem. 2021 Feb 2;93(4):2610-2618. doi: 10.1021/acs.analchem.0c04726. Epub 2021 Jan 20.
Mass spectrometry data entry: PXD022279
13 A modification-centric assessment tool for the performance of chemoproteomic probes. Nat Chem Biol. 2022 Aug;18(8):904-912. doi: 10.1038/s41589-022-01074-8. Epub 2022 Jul 21.
Mass spectrometry data entry: PXD027758 , PXD027755 , PXD027760 , PXD027762 , PXD027756 , PXD027591 , PXD007149 , PXD030064 , PXD032392 , PXD027789 , PXD027767 , PXD027764
14 DFT-Guided Discovery of Ethynyl-Triazolyl-Phosphinates as Modular Electrophiles for Chemoselective Cysteine Bioconjugation and Profiling. Angew Chem Int Ed Engl. 2022 Oct 10;61(41):e202205348. doi: 10.1002/anie.202205348. Epub 2022 Aug 22.
Mass spectrometry data entry: PXD033004
15 ACR-Based Probe for the Quantitative Profiling of Histidine Reactivity in the Human Proteome. J Am Chem Soc. 2023 Mar 8;145(9):5252-5260. doi: 10.1021/jacs.2c12653. Epub 2023 Feb 27.
16 Chemoproteomic profiling of targets of lipid-derived electrophiles by bioorthogonal aminooxy probe. Redox Biol. 2017 Aug;12:712-718. doi: 10.1016/j.redox.2017.04.001. Epub 2017 Apr 5.
17 Global targeting of functional tyrosines using sulfur-triazole exchange chemistry. Nat Chem Biol. 2020 Feb;16(2):150-159. doi: 10.1038/s41589-019-0404-5. Epub 2019 Nov 25.
18 Accelerating multiplexed profiling of protein-ligand interactions: High-throughput plate-based reactive cysteine profiling with minimal input. Cell Chem Biol. 2024 Mar 21;31(3):565-576.e4. doi: 10.1016/j.chembiol.2023.11.015. Epub 2023 Dec 19.
Mass spectrometry data entry: PXD044402
19 Site-specific quantitative cysteine profiling with data-independent acquisition-based mass spectrometry. Methods Enzymol. 2023;679:295-322. doi: 10.1016/bs.mie.2022.07.037. Epub 2022 Sep 7.
Mass spectrometry data entry: PXD027578