Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP01422
Target Name Serine/threonine-protein kinase D3 (PRKD3)
Gene Name PRKD3
Gene ID 23683
Synonyms
EPK2; PRKCN; Serine/threonine-protein kinase D3; EC 2.7.11.13; Protein kinase C nu type; Protein kinase EPK2; nPKC-nu
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MSANNSPPSAQKSVLPTAIPAVLPAASPCSSPKTGLSARLSNGSFSAPSLTNSRGSVHTV
SFLLQIGLTRESVTIEAQELSLSAVKDLVCSIVYQKFPECGFFGMYDKILLFRHDMNSEN
ILQLITSADEIHEGDLVEVVLSALATVEDFQIRPHTLYVHSYKAPTFCDYCGEMLWGLVR
QGLKCEGCGLNYHKRCAFKIPNNCSGVRKRRLSNVSLPGPGLSVPRPLQPEYVALPSEES
HVHQEPSKRIPSWSGRPIWMEKMVMCRVKVPHTFAVHSYTRPTICQYCKRLLKGLFRQGM
QCKDCKFNCHKRCASKVPRDCLGEVTFNGEPSSLGTDTDIPMDIDNNDINSDSSRGLDDT
EEPSPPEDKMFFLDPSDLDVERDEEAVKTISPSTSNNIPLMRVVQSIKHTKRKSSTMVKE
GWMVHYTSRDNLRKRHYWRLDSKCLTLFQNESGSKYYKEIPLSEILRISSPRDFTNISQG
SNPHCFEIITDTMVYFVGENNGDSSHNPVLAATGVGLDVAQSWEKAIRQALMPVTPQASV
CTSPGQGKDHKDLSTSISVSNCQIQENVDISTVYQIFADEVLGSGQFGIVYGGKHRKTGR
DVAIKVIDKMRFPTKQESQLRNEVAILQNLHHPGIVNLECMFETPERVFVVMEKLHGDML
EMILSSEKSRLPERITKFMVTQILVALRNLHFKNIVHCDLKPENVLLASAEPFPQVKLCD
FGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLRSKGYNRSLDMWSVGVIIYVSLSGTFPFNEDE
DINDQIQNAAFMYPPNPWREISGEAIDLINNLLQVKMRKRYSVDKSLSHPWLQDYQTWLD
LREFETRIGERYITHESDDARWEIHAYTHNLVYPKHFIMAPNPDDMEEDP
Target Bioclass
Enzyme
Family
Protein kinase superfamily, CAMK Ser/Thr protein kinase family, PKD subfamily
Subcellular location
Cytoplasm
Function Converts transient diacylglycerol (DAG) signals into prolonged physiological effects, downstream of PKC. Involved in resistance to oxidative stress.
Uniprot ID
O94806
Ensemble ID
ENST00000234179.8
HGNC ID
HGNC:9408
ChEMBL ID
CHEMBL2595

Target Site Mutations in Different Cell Lines

Cell line Mutation details Probe for labeling this protein in this cell
22RV1 SNV: p.G67D .
A3KAW SNV: p.N350H .
HCT15 SNV: p.R355W .
IPC298 SNV: p.M641I DBIA    Probe Info 
JHH1 SNV: p.S822N .
KMS27 SNV: p.L445P DBIA    Probe Info 
MFE319 Deletion: p.G356VfsTer45 .
SUPT1 SNV: p.V403I .
YSCCC SNV: p.G177E .

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 9 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
STPyne
 Probe Info  		K458(3.85)  LDD0277  [1]
AHL-Pu-1
 Probe Info  		C541(4.33)  LDD0169  [2]
IA-alkyne
 Probe Info  		C29(1.12)  LDD2182  [3]
DBIA
 Probe Info  		C100(1.03)  LDD0078  [4]
NAIA_4
 Probe Info  		N.A.  LDD2226  [5]
NAIA_5
 Probe Info  		N.A.  LDD2225  [5]
IPM
 Probe Info  		C29(0.00); C541(0.00)  LDD2156  [6]
VSF
 Probe Info  		N.A.  LDD0007  [7]
AOyne
 Probe Info  		8.20  LDD0443  [8]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0026  4SU-RNA+native RNA HEK-293T C541(4.33)  LDD0169  [2]
 LDCM0214  AC1 HEK-293T C90(0.96); C100(1.06); C29(1.20); C698(1.11)  LDD1507  [9]
 LDCM0215  AC10 HEK-293T C100(1.25); C29(1.05); C698(1.04); C640(0.94)  LDD1508  [9]
 LDCM0226  AC11 HEK-293T C100(1.00); C29(1.04); C698(1.01); C640(1.05)  LDD1509  [9]
 LDCM0237  AC12 HEK-293T C100(1.06); C29(0.96); C698(1.14); C640(1.06)  LDD1510  [9]
 LDCM0259  AC14 HEK-293T C100(0.96); C29(1.03); C698(1.07); C640(1.33)  LDD1512  [9]
 LDCM0263  AC143 PaTu 8988t C100(1.20)  LDD1142  [4]
 LDCM0264  AC144 PaTu 8988t C100(0.97)  LDD1143  [4]
 LDCM0265  AC145 PaTu 8988t C100(1.07)  LDD1144  [4]
 LDCM0266  AC146 PaTu 8988t C100(1.73)  LDD1145  [4]
 LDCM0267  AC147 PaTu 8988t C100(1.04)  LDD1146  [4]
 LDCM0268  AC148 PaTu 8988t C100(1.23)  LDD1147  [4]
 LDCM0269  AC149 PaTu 8988t C100(1.41)  LDD1148  [4]
 LDCM0270  AC15 HEK-293T C100(1.14); C29(1.05); C698(1.00); C640(1.09)  LDD1513  [9]
 LDCM0271  AC150 PaTu 8988t C100(0.99)  LDD1150  [4]
 LDCM0272  AC151 PaTu 8988t C100(1.15)  LDD1151  [4]
 LDCM0273  AC152 PaTu 8988t C100(1.20)  LDD1152  [4]
 LDCM0274  AC153 PaTu 8988t C100(1.22)  LDD1153  [4]
 LDCM0621  AC154 PaTu 8988t C100(1.11)  LDD2166  [4]
 LDCM0622  AC155 PaTu 8988t C100(1.03)  LDD2167  [4]
 LDCM0623  AC156 PaTu 8988t C100(1.15)  LDD2168  [4]
 LDCM0624  AC157 PaTu 8988t C100(1.11)  LDD2169  [4]
 LDCM0276  AC17 PaTu 8988t C100(0.71)  LDD1155  [4]
 LDCM0277  AC18 PaTu 8988t C100(0.95)  LDD1156  [4]
 LDCM0278  AC19 PaTu 8988t C100(1.10)  LDD1157  [4]
 LDCM0279  AC2 HEK-293T C100(1.08); C29(1.00); C698(1.06); C640(1.05)  LDD1518  [9]
 LDCM0280  AC20 PaTu 8988t C100(0.79)  LDD1159  [4]
 LDCM0281  AC21 PaTu 8988t C100(0.77)  LDD1160  [4]
 LDCM0282  AC22 PaTu 8988t C100(0.98)  LDD1161  [4]
 LDCM0283  AC23 PaTu 8988t C100(0.99)  LDD1162  [4]
 LDCM0284  AC24 PaTu 8988t C100(1.01)  LDD1163  [4]
 LDCM0285  AC25 HEK-293T C90(0.97); C100(1.04); C29(1.08); C698(1.20)  LDD1524  [9]
 LDCM0286  AC26 HEK-293T C100(1.20); C29(1.07); C698(0.94); C640(0.98)  LDD1525  [9]
 LDCM0287  AC27 HEK-293T C100(0.99); C29(1.07); C698(1.02); C640(1.07)  LDD1526  [9]
 LDCM0288  AC28 HEK-293T C100(1.05); C29(1.00); C698(1.20); C640(1.25)  LDD1527  [9]
 LDCM0289  AC29 HEK-293T C90(0.93); C100(1.04); C29(1.04); C698(0.97)  LDD1528  [9]
 LDCM0290  AC3 HEK-293T C100(0.97); C29(0.99); C698(0.95); C640(1.00)  LDD1529  [9]
 LDCM0291  AC30 HEK-293T C100(0.93); C29(0.98); C698(1.11); C640(0.83)  LDD1530  [9]
 LDCM0292  AC31 HEK-293T C100(1.08); C29(0.96); C698(0.99); C640(1.08)  LDD1531  [9]
 LDCM0293  AC32 HEK-293T C100(1.10); C29(1.06); C640(1.09)  LDD1532  [9]
 LDCM0294  AC33 HEK-293T C90(0.99); C100(0.97); C29(1.09); C698(1.05)  LDD1533  [9]
 LDCM0295  AC34 HEK-293T C100(1.22); C29(1.09); C698(1.11); C640(1.11)  LDD1534  [9]
 LDCM0296  AC35 HEK-293T C100(0.97); C29(0.98); C698(1.08); C640(1.18)  LDD1535  [9]
 LDCM0297  AC36 HEK-293T C100(1.03); C29(1.03); C698(1.13); C640(1.08)  LDD1536  [9]
 LDCM0298  AC37 HEK-293T C90(1.05); C100(1.02); C29(1.02); C698(1.02)  LDD1537  [9]
 LDCM0299  AC38 HEK-293T C100(0.98); C29(1.02); C698(1.22); C640(1.08)  LDD1538  [9]
 LDCM0300  AC39 HEK-293T C100(0.94); C29(1.03); C698(0.98); C640(1.04)  LDD1539  [9]
 LDCM0301  AC4 HEK-293T C100(1.03); C29(0.96); C698(1.13); C640(1.11)  LDD1540  [9]
 LDCM0302  AC40 HEK-293T C100(1.12); C29(1.08); C640(1.09)  LDD1541  [9]
 LDCM0303  AC41 HEK-293T C90(0.99); C100(1.02); C29(1.07); C698(1.21)  LDD1542  [9]
 LDCM0304  AC42 HEK-293T C100(1.11); C29(1.08); C698(1.09); C640(1.13)  LDD1543  [9]
 LDCM0305  AC43 HEK-293T C100(1.00); C29(1.03); C698(1.04); C640(1.14)  LDD1544  [9]
 LDCM0306  AC44 HEK-293T C100(1.05); C29(0.97); C698(1.35); C640(1.10)  LDD1545  [9]
 LDCM0307  AC45 HEK-293T C90(1.06); C100(1.05); C29(1.08); C698(0.99)  LDD1546  [9]
 LDCM0308  AC46 HEK-293T C100(1.00); C29(1.08); C698(1.03); C640(0.94)  LDD1547  [9]
 LDCM0309  AC47 HEK-293T C100(0.94); C29(1.10); C698(1.03); C640(1.11)  LDD1548  [9]
 LDCM0310  AC48 HEK-293T C100(1.06); C29(1.10); C640(1.12)  LDD1549  [9]
 LDCM0311  AC49 HEK-293T C90(0.98); C100(0.98); C29(1.01); C698(1.02)  LDD1550  [9]
 LDCM0312  AC5 HEK-293T C90(1.03); C100(1.05); C29(1.00); C698(1.10)  LDD1551  [9]
 LDCM0313  AC50 HEK-293T C100(1.21); C29(1.07); C698(0.98); C640(0.86)  LDD1552  [9]
 LDCM0314  AC51 HEK-293T C100(0.98); C29(0.97); C698(1.07); C640(1.03)  LDD1553  [9]
 LDCM0315  AC52 HEK-293T C100(1.14); C29(1.01); C698(1.14); C640(1.13)  LDD1554  [9]
 LDCM0316  AC53 HEK-293T C90(1.05); C100(1.05); C29(1.03); C698(1.10)  LDD1555  [9]
 LDCM0317  AC54 HEK-293T C100(1.02); C29(0.96); C698(1.07); C640(1.01)  LDD1556  [9]
 LDCM0318  AC55 HEK-293T C100(1.23); C29(1.00); C698(1.06); C640(1.03)  LDD1557  [9]
 LDCM0319  AC56 HEK-293T C100(1.21); C29(0.92); C640(1.04)  LDD1558  [9]
 LDCM0320  AC57 PaTu 8988t C100(1.36)  LDD1199  [4]
 LDCM0321  AC58 PaTu 8988t C100(1.24)  LDD1200  [4]
 LDCM0322  AC59 PaTu 8988t C100(1.30)  LDD1201  [4]
 LDCM0323  AC6 HEK-293T C100(1.03); C29(0.99); C698(1.17); C640(0.90)  LDD1562  [9]
 LDCM0324  AC60 PaTu 8988t C100(1.47)  LDD1203  [4]
 LDCM0325  AC61 PaTu 8988t C100(1.03)  LDD1204  [4]
 LDCM0326  AC62 PaTu 8988t C100(1.17)  LDD1205  [4]
 LDCM0327  AC63 PaTu 8988t C100(1.15)  LDD1206  [4]
 LDCM0328  AC64 PaTu 8988t C100(1.23)  LDD1207  [4]
 LDCM0329  AC65 PaTu 8988t C100(0.98)  LDD1208  [4]
 LDCM0330  AC66 PaTu 8988t C100(1.17)  LDD1209  [4]
 LDCM0331  AC67 PaTu 8988t C100(1.02)  LDD1210  [4]
 LDCM0332  AC68 PaTu 8988t C100(0.96)  LDD1211  [4]
 LDCM0333  AC69 PaTu 8988t C100(1.11)  LDD1212  [4]
 LDCM0334  AC7 HEK-293T C100(1.05); C29(0.99); C698(1.13); C640(1.02)  LDD1568  [9]
 LDCM0335  AC70 PaTu 8988t C100(1.20)  LDD1214  [4]
 LDCM0336  AC71 PaTu 8988t C100(1.15)  LDD1215  [4]
 LDCM0337  AC72 PaTu 8988t C100(1.14)  LDD1216  [4]
 LDCM0338  AC73 PaTu 8988t C100(1.10)  LDD1217  [4]
 LDCM0339  AC74 PaTu 8988t C100(1.24)  LDD1218  [4]
 LDCM0340  AC75 PaTu 8988t C100(1.23)  LDD1219  [4]
 LDCM0341  AC76 PaTu 8988t C100(1.04)  LDD1220  [4]
 LDCM0342  AC77 PaTu 8988t C100(1.24)  LDD1221  [4]
 LDCM0343  AC78 PaTu 8988t C100(1.18)  LDD1222  [4]
 LDCM0344  AC79 PaTu 8988t C100(1.17)  LDD1223  [4]
 LDCM0345  AC8 HEK-293T C100(1.02); C29(0.98); C640(0.93)  LDD1569  [9]
 LDCM0346  AC80 PaTu 8988t C100(1.28)  LDD1225  [4]
 LDCM0347  AC81 PaTu 8988t C100(1.31)  LDD1226  [4]
 LDCM0348  AC82 PaTu 8988t C100(1.29)  LDD1227  [4]
 LDCM0248  AKOS034007472 HEK-293T C90(1.11); C100(1.13); C29(0.95); C698(1.13)  LDD1511  [9]
 LDCM0356  AKOS034007680 HEK-293T C90(1.00); C100(0.98); C29(1.04); C698(1.17)  LDD1570  [9]
 LDCM0275  AKOS034007705 HEK-293T C100(1.07); C29(0.95); C640(1.04)  LDD1514  [9]
 LDCM0020  ARS-1620 HCC44 C100(1.03)  LDD0078  [4]
 LDCM0367  CL1 HEK-293T C90(0.98); C100(0.88); C29(0.99); C698(0.95)  LDD1571  [9]
 LDCM0368  CL10 HEK-293T C100(0.98); C29(0.93); C698(1.11); C640(0.87)  LDD1572  [9]
 LDCM0369  CL100 HEK-293T C90(1.03); C100(1.07); C29(1.01); C698(0.99)  LDD1573  [9]
 LDCM0370  CL101 HEK-293T C90(1.04); C100(1.05); C29(1.12); C698(1.12)  LDD1574  [9]
 LDCM0371  CL102 HEK-293T C90(1.05); C100(1.13); C29(0.99); C698(1.06)  LDD1575  [9]
 LDCM0372  CL103 HEK-293T C100(0.93); C29(1.03); C698(1.01); C640(1.07)  LDD1576  [9]
 LDCM0373  CL104 HEK-293T C90(1.02); C100(1.14); C29(1.08); C698(0.97)  LDD1577  [9]
 LDCM0374  CL105 PaTu 8988t C100(1.44)  LDD1253  [4]
 LDCM0375  CL106 PaTu 8988t C100(0.85)  LDD1254  [4]
 LDCM0376  CL107 PaTu 8988t C100(0.79)  LDD1255  [4]
 LDCM0377  CL108 PaTu 8988t C100(0.71)  LDD1256  [4]
 LDCM0378  CL109 PaTu 8988t C100(0.93)  LDD1257  [4]
 LDCM0379  CL11 HEK-293T C100(1.14); C29(1.08); C698(1.08); C640(1.03)  LDD1583  [9]
 LDCM0380  CL110 PaTu 8988t C100(0.63)  LDD1259  [4]
 LDCM0381  CL111 PaTu 8988t C100(1.04)  LDD1260  [4]
 LDCM0382  CL112 HEK-293T C90(0.91); C100(1.03); C29(1.11); C698(1.00)  LDD1586  [9]
 LDCM0383  CL113 HEK-293T C90(1.04); C100(1.04); C29(1.04); C698(1.12)  LDD1587  [9]
 LDCM0384  CL114 HEK-293T C90(1.04); C100(1.13); C29(0.96); C698(1.03)  LDD1588  [9]
 LDCM0385  CL115 HEK-293T C100(0.84); C29(1.01); C698(1.02); C640(1.05)  LDD1589  [9]
 LDCM0386  CL116 HEK-293T C90(1.00); C100(0.96); C29(1.06); C698(1.10)  LDD1590  [9]
 LDCM0387  CL117 HEK-293T C90(1.06); C100(0.96); C29(1.01); C698(1.06)  LDD1591  [9]
 LDCM0388  CL118 HEK-293T C90(1.11); C100(1.06); C29(1.02); C698(0.94)  LDD1592  [9]
 LDCM0389  CL119 HEK-293T C100(0.97); C29(0.92); C698(1.03); C640(1.07)  LDD1593  [9]
 LDCM0390  CL12 HEK-293T C100(1.36); C29(0.97); C640(1.08)  LDD1594  [9]
 LDCM0391  CL120 HEK-293T C90(1.07); C100(0.89); C29(1.04); C698(0.91)  LDD1595  [9]
 LDCM0392  CL121 HEK-293T C90(1.04); C100(0.96); C29(1.00); C698(0.92)  LDD1596  [9]
 LDCM0393  CL122 HEK-293T C90(1.03); C100(1.15); C29(0.91); C698(1.07)  LDD1597  [9]
 LDCM0394  CL123 HEK-293T C100(0.98); C29(0.88); C698(1.14); C640(1.46)  LDD1598  [9]
 LDCM0395  CL124 HEK-293T C90(1.02); C100(0.90); C29(1.01); C698(1.00)  LDD1599  [9]
 LDCM0396  CL125 PaTu 8988t C100(1.28)  LDD1275  [4]
 LDCM0397  CL126 PaTu 8988t C100(1.12)  LDD1276  [4]
 LDCM0398  CL127 PaTu 8988t C100(1.14)  LDD1277  [4]
 LDCM0399  CL128 PaTu 8988t C100(1.25)  LDD1278  [4]
 LDCM0400  CL13 HEK-293T C90(1.08); C100(0.98); C29(1.04); C698(1.10)  LDD1604  [9]
 LDCM0401  CL14 HEK-293T C90(1.00); C100(1.12); C29(0.98); C698(1.14)  LDD1605  [9]
 LDCM0402  CL15 HEK-293T C100(1.03); C29(0.89); C698(1.15); C640(1.22)  LDD1606  [9]
 LDCM0403  CL16 PaTu 8988t C100(1.17)  LDD1282  [4]
 LDCM0404  CL17 PaTu 8988t C100(1.11)  LDD1283  [4]
 LDCM0405  CL18 PaTu 8988t C100(1.19)  LDD1284  [4]
 LDCM0406  CL19 PaTu 8988t C100(1.19)  LDD1285  [4]
 LDCM0407  CL2 HEK-293T C90(1.09); C100(1.12); C29(1.05); C698(0.92)  LDD1611  [9]
 LDCM0408  CL20 PaTu 8988t C100(1.08)  LDD1287  [4]
 LDCM0409  CL21 PaTu 8988t C100(1.39)  LDD1288  [4]
 LDCM0410  CL22 PaTu 8988t C100(1.42)  LDD1289  [4]
 LDCM0411  CL23 PaTu 8988t C100(1.23)  LDD1290  [4]
 LDCM0412  CL24 PaTu 8988t C100(1.16)  LDD1291  [4]
 LDCM0413  CL25 PaTu 8988t C100(2.72)  LDD1292  [4]
 LDCM0414  CL26 PaTu 8988t C100(1.15)  LDD1293  [4]
 LDCM0415  CL27 PaTu 8988t C100(1.21)  LDD1294  [4]
 LDCM0416  CL28 PaTu 8988t C100(1.45)  LDD1295  [4]
 LDCM0417  CL29 PaTu 8988t C100(1.14)  LDD1296  [4]
 LDCM0418  CL3 HEK-293T C100(1.15); C29(0.96); C698(1.07); C640(1.14)  LDD1622  [9]
 LDCM0419  CL30 PaTu 8988t C100(1.22)  LDD1298  [4]
 LDCM0420  CL31 HEK-293T C100(0.99); C29(1.01); C698(1.04); C640(1.15)  LDD1624  [9]
 LDCM0421  CL32 HEK-293T C100(1.26); C29(0.94); C698(1.06); C640(1.18)  LDD1625  [9]
 LDCM0422  CL33 HEK-293T C90(0.92); C100(1.06); C29(0.84); C698(1.03)  LDD1626  [9]
 LDCM0423  CL34 HEK-293T C100(1.11); C29(1.06); C698(1.19); C640(1.16)  LDD1627  [9]
 LDCM0424  CL35 HEK-293T C100(1.35); C29(1.06); C698(1.05); C640(0.93)  LDD1628  [9]
 LDCM0425  CL36 HEK-293T C100(1.27); C29(1.00); C640(1.07)  LDD1629  [9]
 LDCM0426  CL37 HEK-293T C90(0.97); C100(0.96); C29(1.04); C698(1.18)  LDD1630  [9]
 LDCM0428  CL39 HEK-293T C100(1.04); C29(1.02); C698(1.12); C640(1.21)  LDD1632  [9]
 LDCM0429  CL4 HEK-293T C90(1.03); C100(1.15); C29(1.02); C698(0.99)  LDD1633  [9]
 LDCM0430  CL40 HEK-293T C90(0.95); C100(0.98); C29(0.97); C698(0.95)  LDD1634  [9]
 LDCM0431  CL41 HEK-293T C90(1.00); C100(1.13); C29(0.95); C698(1.12)  LDD1635  [9]
 LDCM0432  CL42 HEK-293T C100(1.27); C29(1.05); C698(1.04); C640(0.96)  LDD1636  [9]
 LDCM0433  CL43 HEK-293T C100(1.05); C29(0.95); C698(1.07); C640(1.19)  LDD1637  [9]
 LDCM0434  CL44 HEK-293T C100(1.29); C29(0.94); C698(1.18); C640(1.16)  LDD1638  [9]
 LDCM0435  CL45 HEK-293T C90(1.00); C100(1.10); C29(0.97); C698(1.02)  LDD1639  [9]
 LDCM0436  CL46 HEK-293T C100(1.22); C29(0.98); C698(1.41); C640(0.96)  LDD1640  [9]
 LDCM0437  CL47 HEK-293T C100(1.25); C29(1.03); C698(1.07); C640(1.08)  LDD1641  [9]
 LDCM0438  CL48 HEK-293T C100(1.30); C29(1.01); C640(1.05)  LDD1642  [9]
 LDCM0439  CL49 HEK-293T C90(1.01); C100(1.10); C29(1.04); C698(1.20)  LDD1643  [9]
 LDCM0440  CL5 HEK-293T C90(1.07); C100(1.13); C29(1.08); C698(0.88)  LDD1644  [9]
 LDCM0441  CL50 HEK-293T C90(0.97); C100(1.16); C29(1.02); C698(1.05)  LDD1645  [9]
 LDCM0443  CL52 HEK-293T C90(1.09); C100(1.09); C29(0.97); C698(0.94)  LDD1646  [9]
 LDCM0444  CL53 HEK-293T C90(0.90); C100(1.35); C29(1.07); C698(1.15)  LDD1647  [9]
 LDCM0445  CL54 HEK-293T C100(1.27); C29(0.92); C698(1.02); C640(0.98)  LDD1648  [9]
 LDCM0446  CL55 HEK-293T C100(1.04); C29(1.01); C698(1.04); C640(1.10)  LDD1649  [9]
 LDCM0447  CL56 HEK-293T C100(1.17); C29(1.00); C698(1.00); C640(1.08)  LDD1650  [9]
 LDCM0448  CL57 HEK-293T C90(1.02); C100(1.12); C29(1.05); C698(1.08)  LDD1651  [9]
 LDCM0449  CL58 HEK-293T C100(1.10); C29(0.92); C698(1.35); C640(1.01)  LDD1652  [9]
 LDCM0450  CL59 HEK-293T C100(1.39); C29(0.96); C698(1.03); C640(1.03)  LDD1653  [9]
 LDCM0451  CL6 HEK-293T C100(1.27); C29(0.99); C698(0.96); C640(1.13)  LDD1654  [9]
 LDCM0452  CL60 HEK-293T C100(1.13); C29(1.00); C640(1.08)  LDD1655  [9]
 LDCM0453  CL61 HEK-293T C90(1.07); C100(0.96); C29(1.06); C698(1.13)  LDD1656  [9]
 LDCM0454  CL62 HEK-293T C90(0.98); C100(1.04); C29(1.03); C698(1.03)  LDD1657  [9]
 LDCM0455  CL63 HEK-293T C100(1.01); C29(1.00); C698(1.13); C640(1.17)  LDD1658  [9]
 LDCM0456  CL64 HEK-293T C90(1.01); C100(0.94); C29(0.99); C698(1.06)  LDD1659  [9]
 LDCM0457  CL65 HEK-293T C90(0.99); C100(1.04); C29(1.10); C698(1.00)  LDD1660  [9]
 LDCM0458  CL66 HEK-293T C100(1.15); C29(1.10); C698(1.07); C640(1.06)  LDD1661  [9]
 LDCM0459  CL67 HEK-293T C100(1.00); C29(0.97); C698(1.05); C640(1.15)  LDD1662  [9]
 LDCM0460  CL68 HEK-293T C100(1.16); C29(0.88); C698(1.05); C640(1.05)  LDD1663  [9]
 LDCM0461  CL69 HEK-293T C90(1.02); C100(1.14); C29(0.99); C698(1.11)  LDD1664  [9]
 LDCM0462  CL7 HEK-293T C100(1.05); C29(1.00); C698(1.05); C640(1.10)  LDD1665  [9]
 LDCM0463  CL70 HEK-293T C100(1.16); C29(1.00); C698(1.24); C640(1.14)  LDD1666  [9]
 LDCM0464  CL71 HEK-293T C100(1.31); C29(1.02); C698(1.08); C640(1.11)  LDD1667  [9]
 LDCM0465  CL72 HEK-293T C100(1.21); C29(0.98); C640(1.08)  LDD1668  [9]
 LDCM0466  CL73 HEK-293T C90(0.98); C100(1.07); C29(1.01); C698(1.02)  LDD1669  [9]
 LDCM0467  CL74 HEK-293T C90(1.03); C100(1.04); C29(1.01); C698(1.04)  LDD1670  [9]
 LDCM0469  CL76 HEK-293T C90(1.12); C100(1.07); C29(0.99); C698(1.03)  LDD1672  [9]
 LDCM0470  CL77 HEK-293T C90(0.89); C100(1.11); C29(1.04); C698(1.37)  LDD1673  [9]
 LDCM0471  CL78 HEK-293T C100(1.13); C29(0.93); C698(1.02); C640(1.10)  LDD1674  [9]
 LDCM0472  CL79 HEK-293T C100(1.05); C29(0.98); C698(1.05); C640(1.07)  LDD1675  [9]
 LDCM0473  CL8 HEK-293T C100(1.29); C29(0.81); C698(1.45); C640(1.10)  LDD1676  [9]
 LDCM0474  CL80 HEK-293T C100(1.25); C29(0.95); C698(0.94); C640(1.10)  LDD1677  [9]
 LDCM0475  CL81 HEK-293T C90(1.07); C100(1.11); C29(1.03); C698(1.18)  LDD1678  [9]
 LDCM0476  CL82 HEK-293T C100(1.07); C29(1.05); C698(1.07); C640(1.08)  LDD1679  [9]
 LDCM0477  CL83 HEK-293T C100(1.20); C29(0.94); C698(1.15); C640(1.18)  LDD1680  [9]
 LDCM0478  CL84 HEK-293T C100(1.35); C29(0.97); C640(0.90)  LDD1681  [9]
 LDCM0479  CL85 HEK-293T C90(1.07); C100(1.05); C29(0.97); C698(1.14)  LDD1682  [9]
 LDCM0480  CL86 HEK-293T C90(1.03); C100(1.09); C29(0.95); C698(1.06)  LDD1683  [9]
 LDCM0481  CL87 HEK-293T C100(1.13); C29(0.99); C698(1.05); C640(1.12)  LDD1684  [9]
 LDCM0482  CL88 HEK-293T C90(1.08); C100(1.08); C29(1.07); C698(0.92)  LDD1685  [9]
 LDCM0483  CL89 HEK-293T C90(0.99); C100(1.13); C29(1.08); C698(1.15)  LDD1686  [9]
 LDCM0484  CL9 HEK-293T C90(1.25); C100(1.21); C29(1.01); C698(1.09)  LDD1687  [9]
 LDCM0485  CL90 HEK-293T C100(1.15); C29(0.83); C698(1.11); C640(1.11)  LDD1688  [9]
 LDCM0486  CL91 HEK-293T C100(1.15); C29(1.00); C698(1.04); C640(1.07)  LDD1689  [9]
 LDCM0487  CL92 HEK-293T C100(1.24); C29(0.89); C698(1.15); C640(1.11)  LDD1690  [9]
 LDCM0488  CL93 HEK-293T C90(0.95); C100(1.05); C29(0.98); C698(1.08)  LDD1691  [9]
 LDCM0489  CL94 HEK-293T C100(1.24); C29(1.08); C698(1.10); C640(0.92)  LDD1692  [9]
 LDCM0490  CL95 HEK-293T C100(1.17); C29(1.03); C698(1.13); C640(1.13)  LDD1693  [9]
 LDCM0491  CL96 HEK-293T C100(1.16); C29(0.89); C640(0.97)  LDD1694  [9]
 LDCM0492  CL97 HEK-293T C90(0.93); C100(1.08); C29(1.05); C698(1.06)  LDD1695  [9]
 LDCM0493  CL98 HEK-293T C90(1.09); C100(1.05); C29(0.89); C698(1.00)  LDD1696  [9]
 LDCM0494  CL99 HEK-293T C100(0.86); C29(0.98); C698(1.14); C640(1.18)  LDD1697  [9]
 LDCM0495  E2913 HEK-293T C100(0.93); C29(1.09); C698(1.18); C640(1.12)  LDD1698  [9]
 LDCM0625  F8 Ramos C29(0.97)  LDD2187  [3]
 LDCM0572  Fragment10 Ramos C29(1.14)  LDD2189  [3]
 LDCM0573  Fragment11 Ramos C29(0.16)  LDD2190  [3]
 LDCM0574  Fragment12 Ramos C29(0.75)  LDD2191  [3]
 LDCM0575  Fragment13 Ramos C29(0.89)  LDD2192  [3]
 LDCM0576  Fragment14 Ramos C29(0.95)  LDD2193  [3]
 LDCM0579  Fragment20 Ramos C29(0.78)  LDD2194  [3]
 LDCM0580  Fragment21 Ramos C29(0.80)  LDD2195  [3]
 LDCM0582  Fragment23 Ramos C29(1.13)  LDD2196  [3]
 LDCM0578  Fragment27 Ramos C29(0.81)  LDD2197  [3]
 LDCM0586  Fragment28 Ramos C29(0.78)  LDD2198  [3]
 LDCM0588  Fragment30 Ramos C29(0.88)  LDD2199  [3]
 LDCM0589  Fragment31 Ramos C29(0.88)  LDD2200  [3]
 LDCM0590  Fragment32 Ramos C29(1.06)  LDD2201  [3]
 LDCM0468  Fragment33 HEK-293T C100(0.95); C29(0.88); C698(1.05); C640(1.18)  LDD1671  [9]
 LDCM0596  Fragment38 Ramos C29(0.69)  LDD2203  [3]
 LDCM0566  Fragment4 Ramos C29(0.80)  LDD2184  [3]
 LDCM0427  Fragment51 HEK-293T C90(1.03); C100(1.06); C29(0.97); C698(1.07)  LDD1631  [9]
 LDCM0610  Fragment52 Ramos C29(0.87)  LDD2204  [3]
 LDCM0614  Fragment56 Ramos C29(0.99)  LDD2205  [3]
 LDCM0569  Fragment7 Ramos C29(0.71)  LDD2186  [3]
 LDCM0571  Fragment9 Ramos C29(0.88)  LDD2188  [3]
 LDCM0022  KB02 HEK-293T C204(0.99); C719(0.88); C698(0.93); C29(0.98)  LDD1492  [9]
 LDCM0023  KB03 HEK-293T C204(0.97); C719(1.01); C698(1.15); C29(1.10)  LDD1497  [9]
 LDCM0024  KB05 PaTu 8988t C204(1.55)  LDD3393  [10]
 LDCM0628  OTUB2-COV-1 HEK-293T C719(0.87)  LDD2207  [11]

The Interaction Atlas With This Target

The Protein(s) Related To This Target

Transporter and channel
Click To Hide/Show 1 Protein(s) Interacting with This Target
Protein name Family Uniprot ID
Vesicle-associated membrane protein 2 (VAMP2) Synaptobrevin family P63027

References

1 A Paal-Knorr agent for chemoproteomic profiling of targets of isoketals in cells. Chem Sci. 2021 Oct 15;12(43):14557-14563. doi: 10.1039/d1sc02230j. eCollection 2021 Nov 10.
Mass spectrometry data entry: PXD028270
2 Chemoproteomic capture of RNA binding activity in living cells. Nat Commun. 2023 Oct 7;14(1):6282. doi: 10.1038/s41467-023-41844-z.
Mass spectrometry data entry: PXD044625
3 Site-specific quantitative cysteine profiling with data-independent acquisition-based mass spectrometry. Methods Enzymol. 2023;679:295-322. doi: 10.1016/bs.mie.2022.07.037. Epub 2022 Sep 7.
Mass spectrometry data entry: PXD027578
4 Reimagining high-throughput profiling of reactive cysteines for cell-based screening of large electrophile libraries. Nat Biotechnol. 2021 May;39(5):630-641. doi: 10.1038/s41587-020-00778-3. Epub 2021 Jan 4.
5 N-Acryloylindole-alkyne (NAIA) enables imaging and profiling new ligandable cysteines and oxidized thiols by chemoproteomics. Nat Commun. 2023 Jun 15;14(1):3564. doi: 10.1038/s41467-023-39268-w.
Mass spectrometry data entry: PXD041264
6 Benchmarking Cleavable Biotin Tags for Peptide-Centric Chemoproteomics. J Proteome Res. 2022 May 6;21(5):1349-1358. doi: 10.1021/acs.jproteome.2c00174. Epub 2022 Apr 25.
Mass spectrometry data entry: PXD031019
7 A modification-centric assessment tool for the performance of chemoproteomic probes. Nat Chem Biol. 2022 Aug;18(8):904-912. doi: 10.1038/s41589-022-01074-8. Epub 2022 Jul 21.
Mass spectrometry data entry: PXD027758 , PXD027755 , PXD027760 , PXD027762 , PXD027756 , PXD027591 , PXD007149 , PXD030064 , PXD032392 , PXD027789 , PXD027767 , PXD027764
8 Chemoproteomic profiling of targets of lipid-derived electrophiles by bioorthogonal aminooxy probe. Redox Biol. 2017 Aug;12:712-718. doi: 10.1016/j.redox.2017.04.001. Epub 2017 Apr 5.
9 Accelerating multiplexed profiling of protein-ligand interactions: High-throughput plate-based reactive cysteine profiling with minimal input. Cell Chem Biol. 2024 Mar 21;31(3):565-576.e4. doi: 10.1016/j.chembiol.2023.11.015. Epub 2023 Dec 19.
Mass spectrometry data entry: PXD044402
10 DrugMap: A quantitative pan-cancer analysis of cysteine ligandability. Cell. 2024 May 9;187(10):2536-2556.e30. doi: 10.1016/j.cell.2024.03.027. Epub 2024 Apr 22.
Mass spectrometry data entry: PXD047840
11 Rapid Covalent-Probe Discovery by Electrophile-Fragment Screening. J Am Chem Soc. 2019 Jun 5;141(22):8951-8968. doi: 10.1021/jacs.9b02822. Epub 2019 May 22.