Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP00659
Target Name DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 (POLR2D)
Gene Name POLR2D
Gene ID 5433
Synonyms
DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4; RNA polymerase II subunit B4; DNA-directed RNA polymerase II subunit D; RNA polymerase II 16 kDa subunit; RPB16
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MAAGGSDPRAGDVEEDASQLIFPKEFETAETLLNSEVHMLLEHRKQQNESAEDEQELSEV
FMKTLNYTARFSRFKNRETIASVRSLLLQKKLHKFELACLANLCPETAEESKALIPSLEG
RFEDEELQQILDDIQTKRSFQY
Target Bioclass
Enzyme
Family
Eukaryotic RPB4 RNA polymerase subunit family
Subcellular location
Nucleus
Function
Core component of RNA polymerase II (Pol II), a DNA-dependent RNA polymerase which synthesizes mRNA precursors and many functional non-coding RNAs using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Pol II is the central component of the basal RNA polymerase II transcription machinery. It is composed of mobile elements that move relative to each other. POLR2D/RPB4 is part of a subcomplex with POLR2G/RPB7 that binds to a pocket formed by POLR2A/RPB1, POLR2B/RPB2 and POLR2F/RPABC2 at the base of the clamp element. The POLR2D/RPB4-POLR2G/RPB7 subcomplex seems to lock the clamp via POLR2G/RPB7 in the closed conformation thus preventing double-stranded DNA to enter the active site cleft. The POLR2D/RPB4-POLR2G/RPB7 subcomplex binds single-stranded DNA and RNA.
Uniprot ID
O15514
Ensemble ID
ENST00000272645.9
HGNC ID
HGNC:9191

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 4 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
DBIA
 Probe Info  		C104(0.71); C99(0.71)  LDD0532  [1]
m-APA
 Probe Info  		N.A.  LDD2231  [2]
IA-alkyne
 Probe Info  		N.A.  LDD0175  [3]
NAIA_5
 Probe Info  		C104(0.00); C99(0.00)  LDD2223  [4]
PAL-AfBPP Probe
Click To Hide/Show 1 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
C397
 Probe Info  		13.83  LDD2056  [5]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0214  AC1 PaTu 8988t C104(0.53); C99(0.53)  LDD1093  [1]
 LDCM0215  AC10 HCT 116 C104(0.71); C99(0.71)  LDD0532  [1]
 LDCM0226  AC11 HCT 116 C104(0.73); C99(0.73)  LDD0543  [1]
 LDCM0230  AC113 PaTu 8988t C104(0.98); C99(0.98)  LDD1109  [1]
 LDCM0231  AC114 PaTu 8988t C104(1.36); C99(1.36)  LDD1110  [1]
 LDCM0232  AC115 PaTu 8988t C104(0.99); C99(0.99)  LDD1111  [1]
 LDCM0233  AC116 PaTu 8988t C104(0.67); C99(0.67)  LDD1112  [1]
 LDCM0234  AC117 PaTu 8988t C104(0.98); C99(0.98)  LDD1113  [1]
 LDCM0235  AC118 PaTu 8988t C104(1.14); C99(1.14)  LDD1114  [1]
 LDCM0236  AC119 PaTu 8988t C104(0.74); C99(0.74)  LDD1115  [1]
 LDCM0237  AC12 HCT 116 C104(0.79); C99(0.79)  LDD0554  [1]
 LDCM0238  AC120 PaTu 8988t C104(0.97); C99(0.97)  LDD1117  [1]
 LDCM0239  AC121 PaTu 8988t C104(0.75); C99(0.75)  LDD1118  [1]
 LDCM0240  AC122 PaTu 8988t C104(0.93); C99(0.93)  LDD1119  [1]
 LDCM0241  AC123 PaTu 8988t C104(0.67); C99(0.67)  LDD1120  [1]
 LDCM0242  AC124 PaTu 8988t C104(0.78); C99(0.78)  LDD1121  [1]
 LDCM0243  AC125 PaTu 8988t C104(0.83); C99(0.83)  LDD1122  [1]
 LDCM0244  AC126 PaTu 8988t C104(0.85); C99(0.85)  LDD1123  [1]
 LDCM0245  AC127 PaTu 8988t C104(0.74); C99(0.74)  LDD1124  [1]
 LDCM0246  AC128 HCT 116 C104(0.97); C99(0.97)  LDD0563  [1]
 LDCM0247  AC129 HCT 116 C104(1.17); C99(1.17)  LDD0564  [1]
 LDCM0249  AC130 HCT 116 C104(1.01); C99(1.01)  LDD0566  [1]
 LDCM0250  AC131 HCT 116 C104(1.48); C99(1.48)  LDD0567  [1]
 LDCM0251  AC132 HCT 116 C104(0.95); C99(0.95)  LDD0568  [1]
 LDCM0252  AC133 HCT 116 C104(0.77); C99(0.77)  LDD0569  [1]
 LDCM0253  AC134 HCT 116 C104(1.11); C99(1.11)  LDD0570  [1]
 LDCM0254  AC135 HCT 116 C104(0.86); C99(0.86)  LDD0571  [1]
 LDCM0255  AC136 HCT 116 C104(0.75); C99(0.75)  LDD0572  [1]
 LDCM0256  AC137 HCT 116 C104(0.83); C99(0.83)  LDD0573  [1]
 LDCM0257  AC138 HCT 116 C104(0.75); C99(0.75)  LDD0574  [1]
 LDCM0258  AC139 HCT 116 C104(0.86); C99(0.86)  LDD0575  [1]
 LDCM0259  AC14 HCT 116 C104(0.66); C99(0.66)  LDD0576  [1]
 LDCM0260  AC140 HCT 116 C104(0.86); C99(0.86)  LDD0577  [1]
 LDCM0261  AC141 HCT 116 C104(0.87); C99(0.87)  LDD0578  [1]
 LDCM0262  AC142 HCT 116 C104(0.72); C99(0.72)  LDD0579  [1]
 LDCM0263  AC143 HCT 116 C104(0.73); C99(0.73)  LDD0580  [1]
 LDCM0264  AC144 HCT 116 C104(0.74); C99(0.74)  LDD0581  [1]
 LDCM0265  AC145 HCT 116 C104(0.48); C99(0.48)  LDD0582  [1]
 LDCM0266  AC146 HCT 116 C104(0.31); C99(0.31)  LDD0583  [1]
 LDCM0267  AC147 HCT 116 C104(0.57); C99(0.57)  LDD0584  [1]
 LDCM0268  AC148 HCT 116 C104(0.45); C99(0.45)  LDD0585  [1]
 LDCM0269  AC149 HCT 116 C104(0.43); C99(0.43)  LDD0586  [1]
 LDCM0270  AC15 HCT 116 C104(0.83); C99(0.83)  LDD0587  [1]
 LDCM0271  AC150 HCT 116 C104(0.56); C99(0.56)  LDD0588  [1]
 LDCM0272  AC151 HCT 116 C104(1.25); C99(1.25)  LDD0589  [1]
 LDCM0273  AC152 HCT 116 C104(0.47); C99(0.47)  LDD0590  [1]
 LDCM0274  AC153 HCT 116 C104(0.37); C99(0.37)  LDD0591  [1]
 LDCM0621  AC154 HCT 116 C104(0.80); C99(0.80)  LDD2158  [1]
 LDCM0622  AC155 HCT 116 C104(1.24); C99(1.24)  LDD2159  [1]
 LDCM0623  AC156 HCT 116 C104(0.81); C99(0.81)  LDD2160  [1]
 LDCM0624  AC157 HCT 116 C104(1.11); C99(1.11)  LDD2161  [1]
 LDCM0276  AC17 PaTu 8988t C104(0.84); C99(0.84)  LDD1155  [1]
 LDCM0277  AC18 PaTu 8988t C104(0.80); C99(0.80)  LDD1156  [1]
 LDCM0278  AC19 PaTu 8988t C104(0.83); C99(0.83)  LDD1157  [1]
 LDCM0279  AC2 PaTu 8988t C104(0.61); C99(0.61)  LDD1158  [1]
 LDCM0280  AC20 PaTu 8988t C104(1.01); C99(1.01)  LDD1159  [1]
 LDCM0281  AC21 PaTu 8988t C104(0.88); C99(0.88)  LDD1160  [1]
 LDCM0282  AC22 PaTu 8988t C104(0.93); C99(0.93)  LDD1161  [1]
 LDCM0283  AC23 PaTu 8988t C104(0.88); C99(0.88)  LDD1162  [1]
 LDCM0284  AC24 PaTu 8988t C104(0.85); C99(0.85)  LDD1163  [1]
 LDCM0285  AC25 PaTu 8988t C104(1.44); C99(1.44)  LDD1164  [1]
 LDCM0286  AC26 PaTu 8988t C104(0.90); C99(0.90)  LDD1165  [1]
 LDCM0287  AC27 PaTu 8988t C104(0.92); C99(0.92)  LDD1166  [1]
 LDCM0288  AC28 PaTu 8988t C104(1.00); C99(1.00)  LDD1167  [1]
 LDCM0289  AC29 PaTu 8988t C104(1.06); C99(1.06)  LDD1168  [1]
 LDCM0290  AC3 PaTu 8988t C104(0.48); C99(0.48)  LDD1169  [1]
 LDCM0291  AC30 PaTu 8988t C104(0.98); C99(0.98)  LDD1170  [1]
 LDCM0292  AC31 PaTu 8988t C104(0.98); C99(0.98)  LDD1171  [1]
 LDCM0293  AC32 PaTu 8988t C104(1.02); C99(1.02)  LDD1172  [1]
 LDCM0294  AC33 PaTu 8988t C104(0.99); C99(0.99)  LDD1173  [1]
 LDCM0295  AC34 PaTu 8988t C104(1.33); C99(1.33)  LDD1174  [1]
 LDCM0296  AC35 PaTu 8988t C104(1.45); C99(1.45)  LDD1175  [1]
 LDCM0297  AC36 PaTu 8988t C104(1.04); C99(1.04)  LDD1176  [1]
 LDCM0298  AC37 PaTu 8988t C104(0.92); C99(0.92)  LDD1177  [1]
 LDCM0299  AC38 PaTu 8988t C104(1.22); C99(1.22)  LDD1178  [1]
 LDCM0300  AC39 PaTu 8988t C104(1.17); C99(1.17)  LDD1179  [1]
 LDCM0301  AC4 PaTu 8988t C104(0.74); C99(0.74)  LDD1180  [1]
 LDCM0302  AC40 PaTu 8988t C104(1.22); C99(1.22)  LDD1181  [1]
 LDCM0303  AC41 PaTu 8988t C104(1.34); C99(1.34)  LDD1182  [1]
 LDCM0304  AC42 PaTu 8988t C104(1.06); C99(1.06)  LDD1183  [1]
 LDCM0305  AC43 PaTu 8988t C104(1.39); C99(1.39)  LDD1184  [1]
 LDCM0306  AC44 PaTu 8988t C104(1.13); C99(1.13)  LDD1185  [1]
 LDCM0307  AC45 PaTu 8988t C104(0.78); C99(0.78)  LDD1186  [1]
 LDCM0308  AC46 PaTu 8988t C104(0.79); C99(0.79)  LDD1187  [1]
 LDCM0309  AC47 PaTu 8988t C104(0.82); C99(0.82)  LDD1188  [1]
 LDCM0310  AC48 PaTu 8988t C104(0.77); C99(0.77)  LDD1189  [1]
 LDCM0311  AC49 PaTu 8988t C104(0.85); C99(0.85)  LDD1190  [1]
 LDCM0312  AC5 PaTu 8988t C104(0.52); C99(0.52)  LDD1191  [1]
 LDCM0313  AC50 PaTu 8988t C104(0.69); C99(0.69)  LDD1192  [1]
 LDCM0314  AC51 PaTu 8988t C104(0.55); C99(0.55)  LDD1193  [1]
 LDCM0315  AC52 PaTu 8988t C104(0.78); C99(0.78)  LDD1194  [1]
 LDCM0316  AC53 PaTu 8988t C104(0.82); C99(0.82)  LDD1195  [1]
 LDCM0317  AC54 PaTu 8988t C104(0.79); C99(0.79)  LDD1196  [1]
 LDCM0318  AC55 PaTu 8988t C104(0.78); C99(0.78)  LDD1197  [1]
 LDCM0319  AC56 PaTu 8988t C104(0.74); C99(0.74)  LDD1198  [1]
 LDCM0320  AC57 HCT 116 C104(0.81); C99(0.81)  LDD0637  [1]
 LDCM0321  AC58 HCT 116 C104(0.82); C99(0.82)  LDD0638  [1]
 LDCM0322  AC59 HCT 116 C104(0.79); C99(0.79)  LDD0639  [1]
 LDCM0323  AC6 HCT 116 C104(0.84); C99(0.84)  LDD0640  [1]
 LDCM0324  AC60 HCT 116 C104(0.73); C99(0.73)  LDD0641  [1]
 LDCM0325  AC61 HCT 116 C104(0.67); C99(0.67)  LDD0642  [1]
 LDCM0326  AC62 HCT 116 C104(0.81); C99(0.81)  LDD0643  [1]
 LDCM0327  AC63 HCT 116 C104(0.62); C99(0.62)  LDD0644  [1]
 LDCM0328  AC64 HCT 116 C104(0.70); C99(0.70)  LDD0645  [1]
 LDCM0329  AC65 HCT 116 C104(0.35); C99(0.35)  LDD0646  [1]
 LDCM0330  AC66 HCT 116 C104(0.34); C99(0.34)  LDD0647  [1]
 LDCM0331  AC67 HCT 116 C104(0.23); C99(0.23)  LDD0648  [1]
 LDCM0332  AC68 HCT 116 C104(0.48); C99(0.48)  LDD0649  [1]
 LDCM0333  AC69 HCT 116 C104(0.64); C99(0.64)  LDD0650  [1]
 LDCM0334  AC7 HCT 116 C104(0.78); C99(0.78)  LDD0651  [1]
 LDCM0335  AC70 HCT 116 C104(0.58); C99(0.58)  LDD0652  [1]
 LDCM0336  AC71 HCT 116 C104(0.56); C99(0.56)  LDD0653  [1]
 LDCM0337  AC72 HCT 116 C104(0.94); C99(0.94)  LDD0654  [1]
 LDCM0338  AC73 HCT 116 C104(0.67); C99(0.67)  LDD0655  [1]
 LDCM0339  AC74 HCT 116 C104(0.47); C99(0.47)  LDD0656  [1]
 LDCM0340  AC75 HCT 116 C104(0.67); C99(0.67)  LDD0657  [1]
 LDCM0341  AC76 HCT 116 C104(0.59); C99(0.59)  LDD0658  [1]
 LDCM0342  AC77 HCT 116 C104(0.70); C99(0.70)  LDD0659  [1]
 LDCM0343  AC78 HCT 116 C104(0.63); C99(0.63)  LDD0660  [1]
 LDCM0344  AC79 HCT 116 C104(0.88); C99(0.88)  LDD0661  [1]
 LDCM0345  AC8 HCT 116 C104(0.61); C99(0.61)  LDD0662  [1]
 LDCM0346  AC80 HCT 116 C104(0.70); C99(0.70)  LDD0663  [1]
 LDCM0347  AC81 HCT 116 C104(0.53); C99(0.53)  LDD0664  [1]
 LDCM0348  AC82 HCT 116 C104(0.39); C99(0.39)  LDD0665  [1]
 LDCM0349  AC83 PaTu 8988t C104(1.33); C99(1.33)  LDD1228  [1]
 LDCM0350  AC84 PaTu 8988t C104(1.53); C99(1.53)  LDD1229  [1]
 LDCM0351  AC85 PaTu 8988t C104(1.77); C99(1.77)  LDD1230  [1]
 LDCM0352  AC86 PaTu 8988t C104(1.35); C99(1.35)  LDD1231  [1]
 LDCM0353  AC87 PaTu 8988t C104(1.64); C99(1.64)  LDD1232  [1]
 LDCM0354  AC88 PaTu 8988t C104(1.16); C99(1.16)  LDD1233  [1]
 LDCM0355  AC89 PaTu 8988t C104(1.26); C99(1.26)  LDD1234  [1]
 LDCM0357  AC90 PaTu 8988t C104(1.06); C99(1.06)  LDD1236  [1]
 LDCM0358  AC91 PaTu 8988t C104(1.25); C99(1.25)  LDD1237  [1]
 LDCM0359  AC92 PaTu 8988t C104(1.25); C99(1.25)  LDD1238  [1]
 LDCM0360  AC93 PaTu 8988t C104(1.37); C99(1.37)  LDD1239  [1]
 LDCM0361  AC94 PaTu 8988t C104(1.42); C99(1.42)  LDD1240  [1]
 LDCM0362  AC95 PaTu 8988t C104(1.29); C99(1.29)  LDD1241  [1]
 LDCM0363  AC96 PaTu 8988t C104(1.05); C99(1.05)  LDD1242  [1]
 LDCM0364  AC97 PaTu 8988t C104(1.14); C99(1.14)  LDD1243  [1]
 LDCM0248  AKOS034007472 HCT 116 C104(1.02); C99(1.02)  LDD0565  [1]
 LDCM0356  AKOS034007680 HCT 116 C104(0.75); C99(0.75)  LDD0673  [1]
 LDCM0275  AKOS034007705 HCT 116 C104(0.69); C99(0.69)  LDD0592  [1]
 LDCM0367  CL1 HCT 116 C104(0.98); C99(0.98)  LDD0684  [1]
 LDCM0368  CL10 HCT 116 C104(0.59); C99(0.59)  LDD0685  [1]
 LDCM0369  CL100 PaTu 8988t C104(0.69); C99(0.69)  LDD1248  [1]
 LDCM0370  CL101 HCT 116 C104(0.75); C99(0.75)  LDD0687  [1]
 LDCM0371  CL102 HCT 116 C104(0.88); C99(0.88)  LDD0688  [1]
 LDCM0372  CL103 HCT 116 C104(1.01); C99(1.01)  LDD0689  [1]
 LDCM0373  CL104 HCT 116 C104(0.96); C99(0.96)  LDD0690  [1]
 LDCM0374  CL105 PaTu 8988t C104(0.98); C99(0.98)  LDD1253  [1]
 LDCM0375  CL106 PaTu 8988t C104(0.64); C99(0.64)  LDD1254  [1]
 LDCM0376  CL107 PaTu 8988t C104(0.80); C99(0.80)  LDD1255  [1]
 LDCM0377  CL108 PaTu 8988t C104(0.93); C99(0.93)  LDD1256  [1]
 LDCM0378  CL109 PaTu 8988t C104(0.88); C99(0.88)  LDD1257  [1]
 LDCM0379  CL11 HCT 116 C104(0.88); C99(0.88)  LDD0696  [1]
 LDCM0380  CL110 PaTu 8988t C104(0.90); C99(0.90)  LDD1259  [1]
 LDCM0381  CL111 PaTu 8988t C104(0.83); C99(0.83)  LDD1260  [1]
 LDCM0382  CL112 PaTu 8988t C104(1.23); C99(1.23)  LDD1261  [1]
 LDCM0383  CL113 PaTu 8988t C104(1.19); C99(1.19)  LDD1262  [1]
 LDCM0384  CL114 PaTu 8988t C104(0.84); C99(0.84)  LDD1263  [1]
 LDCM0385  CL115 PaTu 8988t C104(1.20); C99(1.20)  LDD1264  [1]
 LDCM0386  CL116 PaTu 8988t C104(0.89); C99(0.89)  LDD1265  [1]
 LDCM0387  CL117 PaTu 8988t C104(0.96); C99(0.96)  LDD1266  [1]
 LDCM0388  CL118 PaTu 8988t C104(0.91); C99(0.91)  LDD1267  [1]
 LDCM0389  CL119 PaTu 8988t C104(1.14); C99(1.14)  LDD1268  [1]
 LDCM0390  CL12 HCT 116 C104(0.83); C99(0.83)  LDD0707  [1]
 LDCM0391  CL120 PaTu 8988t C104(1.09); C99(1.09)  LDD1270  [1]
 LDCM0392  CL121 PaTu 8988t C104(0.86); C99(0.86)  LDD1271  [1]
 LDCM0393  CL122 PaTu 8988t C104(0.91); C99(0.91)  LDD1272  [1]
 LDCM0394  CL123 PaTu 8988t C104(0.67); C99(0.67)  LDD1273  [1]
 LDCM0395  CL124 PaTu 8988t C104(0.57); C99(0.57)  LDD1274  [1]
 LDCM0396  CL125 HCT 116 C104(0.85); C99(0.85)  LDD0713  [1]
 LDCM0397  CL126 HCT 116 C104(0.87); C99(0.87)  LDD0714  [1]
 LDCM0398  CL127 HCT 116 C104(0.87); C99(0.87)  LDD0715  [1]
 LDCM0399  CL128 HCT 116 C104(1.03); C99(1.03)  LDD0716  [1]
 LDCM0400  CL13 HCT 116 C104(0.89); C99(0.89)  LDD0717  [1]
 LDCM0401  CL14 HCT 116 C104(0.93); C99(0.93)  LDD0718  [1]
 LDCM0402  CL15 HCT 116 C104(0.70); C99(0.70)  LDD0719  [1]
 LDCM0403  CL16 HCT 116 C104(0.96); C99(0.96)  LDD0720  [1]
 LDCM0404  CL17 HCT 116 C104(0.47); C99(0.47)  LDD0721  [1]
 LDCM0405  CL18 HCT 116 C104(0.63); C99(0.63)  LDD0722  [1]
 LDCM0406  CL19 HCT 116 C104(0.81); C99(0.81)  LDD0723  [1]
 LDCM0407  CL2 HCT 116 C104(1.11); C99(1.11)  LDD0724  [1]
 LDCM0408  CL20 HCT 116 C104(1.05); C99(1.05)  LDD0725  [1]
 LDCM0409  CL21 HCT 116 C104(0.99); C99(0.99)  LDD0726  [1]
 LDCM0410  CL22 HCT 116 C104(0.99); C99(0.99)  LDD0727  [1]
 LDCM0411  CL23 HCT 116 C104(0.85); C99(0.85)  LDD0728  [1]
 LDCM0412  CL24 HCT 116 C104(1.14); C99(1.14)  LDD0729  [1]
 LDCM0413  CL25 HCT 116 C104(1.30); C99(1.30)  LDD0730  [1]
 LDCM0414  CL26 HCT 116 C104(1.20); C99(1.20)  LDD0731  [1]
 LDCM0415  CL27 HCT 116 C104(0.89); C99(0.89)  LDD0732  [1]
 LDCM0416  CL28 HCT 116 C104(0.77); C99(0.77)  LDD0733  [1]
 LDCM0417  CL29 HCT 116 C104(1.05); C99(1.05)  LDD0734  [1]
 LDCM0418  CL3 HCT 116 C104(0.91); C99(0.91)  LDD0735  [1]
 LDCM0419  CL30 HCT 116 C104(0.95); C99(0.95)  LDD0736  [1]
 LDCM0420  CL31 PaTu 8988t C104(0.71); C99(0.71)  LDD1299  [1]
 LDCM0421  CL32 PaTu 8988t C104(0.68); C99(0.68)  LDD1300  [1]
 LDCM0422  CL33 PaTu 8988t C104(0.49); C99(0.49)  LDD1301  [1]
 LDCM0423  CL34 PaTu 8988t C104(0.57); C99(0.57)  LDD1302  [1]
 LDCM0424  CL35 PaTu 8988t C104(0.71); C99(0.71)  LDD1303  [1]
 LDCM0425  CL36 PaTu 8988t C104(0.33); C99(0.33)  LDD1304  [1]
 LDCM0426  CL37 PaTu 8988t C104(0.66); C99(0.66)  LDD1305  [1]
 LDCM0428  CL39 PaTu 8988t C104(0.58); C99(0.58)  LDD1307  [1]
 LDCM0429  CL4 HCT 116 C104(1.08); C99(1.08)  LDD0746  [1]
 LDCM0430  CL40 PaTu 8988t C104(0.82); C99(0.82)  LDD1309  [1]
 LDCM0431  CL41 PaTu 8988t C104(0.69); C99(0.69)  LDD1310  [1]
 LDCM0432  CL42 PaTu 8988t C104(0.83); C99(0.83)  LDD1311  [1]
 LDCM0433  CL43 PaTu 8988t C104(0.73); C99(0.73)  LDD1312  [1]
 LDCM0434  CL44 PaTu 8988t C104(0.64); C99(0.64)  LDD1313  [1]
 LDCM0435  CL45 PaTu 8988t C104(0.49); C99(0.49)  LDD1314  [1]
 LDCM0436  CL46 PaTu 8988t C104(0.70); C99(0.70)  LDD1315  [1]
 LDCM0437  CL47 PaTu 8988t C104(0.81); C99(0.81)  LDD1316  [1]
 LDCM0438  CL48 PaTu 8988t C104(0.95); C99(0.95)  LDD1317  [1]
 LDCM0439  CL49 PaTu 8988t C104(1.00); C99(1.00)  LDD1318  [1]
 LDCM0440  CL5 HCT 116 C104(1.03); C99(1.03)  LDD0757  [1]
 LDCM0441  CL50 PaTu 8988t C104(0.80); C99(0.80)  LDD1320  [1]
 LDCM0442  CL51 PaTu 8988t C104(0.86); C99(0.86)  LDD1321  [1]
 LDCM0443  CL52 PaTu 8988t C104(0.87); C99(0.87)  LDD1322  [1]
 LDCM0444  CL53 PaTu 8988t C104(0.81); C99(0.81)  LDD1323  [1]
 LDCM0445  CL54 PaTu 8988t C104(0.60); C99(0.60)  LDD1324  [1]
 LDCM0446  CL55 PaTu 8988t C104(0.83); C99(0.83)  LDD1325  [1]
 LDCM0447  CL56 PaTu 8988t C104(0.32); C99(0.32)  LDD1326  [1]
 LDCM0448  CL57 PaTu 8988t C104(0.85); C99(0.85)  LDD1327  [1]
 LDCM0449  CL58 PaTu 8988t C104(0.79); C99(0.79)  LDD1328  [1]
 LDCM0450  CL59 PaTu 8988t C104(0.88); C99(0.88)  LDD1329  [1]
 LDCM0451  CL6 HCT 116 C104(0.88); C99(0.88)  LDD0768  [1]
 LDCM0452  CL60 PaTu 8988t C104(0.83); C99(0.83)  LDD1331  [1]
 LDCM0453  CL61 PaTu 8988t C104(0.75); C99(0.75)  LDD1332  [1]
 LDCM0454  CL62 PaTu 8988t C104(0.85); C99(0.85)  LDD1333  [1]
 LDCM0455  CL63 PaTu 8988t C104(1.00); C99(1.00)  LDD1334  [1]
 LDCM0456  CL64 PaTu 8988t C104(1.06); C99(1.06)  LDD1335  [1]
 LDCM0457  CL65 PaTu 8988t C104(0.94); C99(0.94)  LDD1336  [1]
 LDCM0458  CL66 PaTu 8988t C104(0.76); C99(0.76)  LDD1337  [1]
 LDCM0459  CL67 PaTu 8988t C104(0.99); C99(0.99)  LDD1338  [1]
 LDCM0460  CL68 PaTu 8988t C104(0.87); C99(0.87)  LDD1339  [1]
 LDCM0461  CL69 PaTu 8988t C104(0.87); C99(0.87)  LDD1340  [1]
 LDCM0462  CL7 HCT 116 C104(0.74); C99(0.74)  LDD0779  [1]
 LDCM0463  CL70 PaTu 8988t C104(0.93); C99(0.93)  LDD1342  [1]
 LDCM0464  CL71 PaTu 8988t C104(0.86); C99(0.86)  LDD1343  [1]
 LDCM0465  CL72 PaTu 8988t C104(1.09); C99(1.09)  LDD1344  [1]
 LDCM0466  CL73 PaTu 8988t C104(0.84); C99(0.84)  LDD1345  [1]
 LDCM0467  CL74 PaTu 8988t C104(0.79); C99(0.79)  LDD1346  [1]
 LDCM0469  CL76 HEK-293T C104(0.96)  LDD1672  [6]
 LDCM0470  CL77 HEK-293T C104(0.84)  LDD1673  [6]
 LDCM0471  CL78 HEK-293T C104(1.05)  LDD1674  [6]
 LDCM0472  CL79 HEK-293T C104(0.95)  LDD1675  [6]
 LDCM0473  CL8 HCT 116 C104(0.60); C99(0.60)  LDD0790  [1]
 LDCM0474  CL80 HEK-293T C104(1.08)  LDD1677  [6]
 LDCM0475  CL81 HEK-293T C104(1.24)  LDD1678  [6]
 LDCM0476  CL82 HEK-293T C104(1.04)  LDD1679  [6]
 LDCM0477  CL83 HEK-293T C104(1.23)  LDD1680  [6]
 LDCM0478  CL84 HEK-293T C104(1.12)  LDD1681  [6]
 LDCM0479  CL85 HEK-293T C104(1.14)  LDD1682  [6]
 LDCM0480  CL86 HEK-293T C104(1.14)  LDD1683  [6]
 LDCM0481  CL87 HEK-293T C104(1.10)  LDD1684  [6]
 LDCM0482  CL88 HEK-293T C104(1.09)  LDD1685  [6]
 LDCM0483  CL89 HEK-293T C104(1.14)  LDD1686  [6]
 LDCM0484  CL9 HCT 116 C104(1.01); C99(1.01)  LDD0801  [1]
 LDCM0485  CL90 HEK-293T C104(0.65)  LDD1688  [6]
 LDCM0486  CL91 PaTu 8988t C104(0.64); C99(0.64)  LDD1365  [1]
 LDCM0487  CL92 PaTu 8988t C104(0.57); C99(0.57)  LDD1366  [1]
 LDCM0488  CL93 PaTu 8988t C104(0.53); C99(0.53)  LDD1367  [1]
 LDCM0489  CL94 PaTu 8988t C104(0.61); C99(0.61)  LDD1368  [1]
 LDCM0490  CL95 PaTu 8988t C104(0.55); C99(0.55)  LDD1369  [1]
 LDCM0491  CL96 PaTu 8988t C104(0.53); C99(0.53)  LDD1370  [1]
 LDCM0492  CL97 PaTu 8988t C104(0.58); C99(0.58)  LDD1371  [1]
 LDCM0493  CL98 PaTu 8988t C104(0.58); C99(0.58)  LDD1372  [1]
 LDCM0494  CL99 PaTu 8988t C104(0.57); C99(0.57)  LDD1373  [1]
 LDCM0495  E2913 HEK-293T C104(1.18)  LDD1698  [6]
 LDCM0468  Fragment33 PaTu 8988t C104(0.92); C99(0.92)  LDD1347  [1]
 LDCM0427  Fragment51 PaTu 8988t C104(0.73); C99(0.73)  LDD1306  [1]
 LDCM0022  KB02 HEK-293T C104(0.98)  LDD1492  [6]
 LDCM0023  KB03 HEK-293T C104(1.09)  LDD1497  [6]
 LDCM0024  KB05 HEK-293T C104(0.88)  LDD1502  [6]

The Interaction Atlas With This Target

The Protein(s) Related To This Target

Enzyme
Click To Hide/Show 1 Protein(s) Interacting with This Target
Protein name Family Uniprot ID
DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 (POLR2L) Archaeal Rpo10/eukaryotic RPB10 RNA polymerase subunit family P62875

References

1 Reimagining high-throughput profiling of reactive cysteines for cell-based screening of large electrophile libraries. Nat Biotechnol. 2021 May;39(5):630-641. doi: 10.1038/s41587-020-00778-3. Epub 2021 Jan 4.
2 Global profiling of functional histidines in live cells using small-molecule photosensitizer and chemical probe relay labelling. Nat Chem. 2024 Jun 4. doi: 10.1038/s41557-024-01545-6. Online ahead of print.
Mass spectrometry data entry: PXD042377
3 SP3-FAIMS Chemoproteomics for High-Coverage Profiling of the Human Cysteinome*. Chembiochem. 2021 May 14;22(10):1841-1851. doi: 10.1002/cbic.202000870. Epub 2021 Feb 18.
Mass spectrometry data entry: PXD023056 , PXD023059 , PXD023058 , PXD023057 , PXD023060
4 N-Acryloylindole-alkyne (NAIA) enables imaging and profiling new ligandable cysteines and oxidized thiols by chemoproteomics. Nat Commun. 2023 Jun 15;14(1):3564. doi: 10.1038/s41467-023-39268-w.
Mass spectrometry data entry: PXD041264
5 Large-scale chemoproteomics expedites ligand discovery and predicts ligand behavior in cells. Science. 2024 Apr 26;384(6694):eadk5864. doi: 10.1126/science.adk5864. Epub 2024 Apr 26.
Mass spectrometry data entry: PXD041587
6 Accelerating multiplexed profiling of protein-ligand interactions: High-throughput plate-based reactive cysteine profiling with minimal input. Cell Chem Biol. 2024 Mar 21;31(3):565-576.e4. doi: 10.1016/j.chembiol.2023.11.015. Epub 2023 Dec 19.
Mass spectrometry data entry: PXD044402