Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP18338
Target Name Large ribosomal subunit protein uL1m (MRPL1)
Gene Name MRPL1
Gene ID 65008
Synonyms
Large ribosomal subunit protein uL1m; 39S ribosomal protein L1, mitochondrial; L1mt; MRP-L1
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MTAPCPPPPPDPQFVLRGTQSPVHALHFCEGAQAQGRPLLFSGSQSGLVHIWSLQTRRAV
TTLDGHGGQCVTWLQTLPQGRQLLSQGRDLKLCLWDLAEGRSAVVDSVCLESVGFCRSSI
LAGGQPRWTLAVPGRGSDEVQILEMPSKTSVCALKPKADAKLGMPMCLRLWQADCSSRPL
LLAGYEDGSVVLWDVSEQKVCSRIACHEEPVMDLDFDSQKARGISGSAGKALAVWSLDWQ
QALQVRGTHELTNPGIAEVTIRPDRKILATAGWDHRIRVFHWRTMQPLAVLAFHSAAVQC
VAFTADGLLAAGSKDQRISLWSLYPRA
Target Bioclass
Other
Family
Universal ribosomal protein uL1 family
Subcellular location
Mitochondrion
Uniprot ID
Q9BYD6
Ensemble ID
ENST00000315567.13
HGNC ID
HGNC:14275

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 9 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
STPyne
 Probe Info  		K108(10.00); K48(4.17)  LDD0277  [1]
Probe 1
 Probe Info  		Y87(8.41); Y97(21.74)  LDD3495  [2]
DBIA
 Probe Info  		C279(1.77)  LDD3310  [3]
AHL-Pu-1
 Probe Info  		C279(10.40)  LDD0170  [4]
4-Iodoacetamidophenylacetylene
 Probe Info  		N.A.  LDD0038  [5]
IA-alkyne
 Probe Info  		N.A.  LDD0036  [5]
Lodoacetamide azide
 Probe Info  		N.A.  LDD0037  [5]
NAIA_5
 Probe Info  		C30(0.00); C279(0.00)  LDD2223  [6]
HHS-465
 Probe Info  		Y148(0.00); K156(0.00)  LDD2240  [7]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0025  4SU-RNA DM93 C279(10.40)  LDD0170  [4]
 LDCM0026  4SU-RNA+native RNA DM93 C279(3.91)  LDD0171  [4]
 LDCM0214  AC1 HEK-293T C279(0.93)  LDD1507  [8]
 LDCM0215  AC10 PaTu 8988t C279(0.60)  LDD1094  [9]
 LDCM0226  AC11 PaTu 8988t C279(0.70)  LDD1105  [9]
 LDCM0237  AC12 PaTu 8988t C279(0.58)  LDD1116  [9]
 LDCM0259  AC14 PaTu 8988t C279(0.96)  LDD1138  [9]
 LDCM0263  AC143 PaTu 8988t C279(1.06)  LDD1142  [9]
 LDCM0264  AC144 PaTu 8988t C279(0.97)  LDD1143  [9]
 LDCM0265  AC145 PaTu 8988t C279(1.13)  LDD1144  [9]
 LDCM0266  AC146 PaTu 8988t C279(0.88)  LDD1145  [9]
 LDCM0267  AC147 PaTu 8988t C279(0.59)  LDD1146  [9]
 LDCM0268  AC148 PaTu 8988t C279(0.51)  LDD1147  [9]
 LDCM0269  AC149 PaTu 8988t C279(0.54)  LDD1148  [9]
 LDCM0270  AC15 PaTu 8988t C279(0.88)  LDD1149  [9]
 LDCM0271  AC150 PaTu 8988t C279(1.17)  LDD1150  [9]
 LDCM0272  AC151 PaTu 8988t C279(0.45)  LDD1151  [9]
 LDCM0273  AC152 PaTu 8988t C279(0.55)  LDD1152  [9]
 LDCM0274  AC153 PaTu 8988t C279(0.51)  LDD1153  [9]
 LDCM0621  AC154 PaTu 8988t C279(0.65)  LDD2166  [9]
 LDCM0622  AC155 PaTu 8988t C279(0.86)  LDD2167  [9]
 LDCM0623  AC156 PaTu 8988t C279(0.61)  LDD2168  [9]
 LDCM0624  AC157 PaTu 8988t C279(2.12)  LDD2169  [9]
 LDCM0276  AC17 HEK-293T C279(1.00)  LDD1515  [8]
 LDCM0277  AC18 HEK-293T C279(0.92)  LDD1516  [8]
 LDCM0278  AC19 HEK-293T C279(0.85)  LDD1517  [8]
 LDCM0279  AC2 HEK-293T C279(0.96)  LDD1518  [8]
 LDCM0280  AC20 HEK-293T C279(1.33)  LDD1519  [8]
 LDCM0281  AC21 HEK-293T C279(0.89)  LDD1520  [8]
 LDCM0282  AC22 HEK-293T C279(1.06)  LDD1521  [8]
 LDCM0283  AC23 HEK-293T C279(1.06)  LDD1522  [8]
 LDCM0284  AC24 HEK-293T C279(0.98)  LDD1523  [8]
 LDCM0285  AC25 HEK-293T C279(0.91)  LDD1524  [8]
 LDCM0286  AC26 HEK-293T C279(1.27)  LDD1525  [8]
 LDCM0287  AC27 HEK-293T C279(0.93)  LDD1526  [8]
 LDCM0288  AC28 HEK-293T C279(1.04)  LDD1527  [8]
 LDCM0289  AC29 HEK-293T C279(0.92)  LDD1528  [8]
 LDCM0290  AC3 HEK-293T C279(0.83)  LDD1529  [8]
 LDCM0291  AC30 HEK-293T C279(1.04)  LDD1530  [8]
 LDCM0292  AC31 HEK-293T C279(1.23)  LDD1531  [8]
 LDCM0293  AC32 HEK-293T C279(0.71)  LDD1532  [8]
 LDCM0294  AC33 HEK-293T C279(1.00)  LDD1533  [8]
 LDCM0295  AC34 HEK-293T C279(1.12)  LDD1534  [8]
 LDCM0296  AC35 HEK-293T C279(0.96)  LDD1535  [8]
 LDCM0297  AC36 HEK-293T C279(0.87)  LDD1536  [8]
 LDCM0298  AC37 HEK-293T C279(0.94)  LDD1537  [8]
 LDCM0299  AC38 HEK-293T C279(1.01)  LDD1538  [8]
 LDCM0300  AC39 HEK-293T C279(1.21)  LDD1539  [8]
 LDCM0301  AC4 HEK-293T C279(1.05)  LDD1540  [8]
 LDCM0302  AC40 HEK-293T C279(0.96)  LDD1541  [8]
 LDCM0303  AC41 HEK-293T C279(0.91)  LDD1542  [8]
 LDCM0304  AC42 HEK-293T C279(1.16)  LDD1543  [8]
 LDCM0305  AC43 HEK-293T C279(0.88)  LDD1544  [8]
 LDCM0306  AC44 HEK-293T C279(1.09)  LDD1545  [8]
 LDCM0307  AC45 HEK-293T C279(1.01)  LDD1546  [8]
 LDCM0308  AC46 PaTu 8988t C279(0.97)  LDD1187  [9]
 LDCM0309  AC47 PaTu 8988t C279(0.86)  LDD1188  [9]
 LDCM0310  AC48 PaTu 8988t C279(0.69)  LDD1189  [9]
 LDCM0311  AC49 PaTu 8988t C279(0.51)  LDD1190  [9]
 LDCM0312  AC5 HEK-293T C279(1.08)  LDD1551  [8]
 LDCM0313  AC50 PaTu 8988t C279(0.59)  LDD1192  [9]
 LDCM0314  AC51 PaTu 8988t C279(0.51)  LDD1193  [9]
 LDCM0315  AC52 PaTu 8988t C279(0.67)  LDD1194  [9]
 LDCM0316  AC53 PaTu 8988t C279(0.45)  LDD1195  [9]
 LDCM0317  AC54 PaTu 8988t C279(0.44)  LDD1196  [9]
 LDCM0318  AC55 PaTu 8988t C279(0.83)  LDD1197  [9]
 LDCM0319  AC56 PaTu 8988t C279(0.97)  LDD1198  [9]
 LDCM0320  AC57 HEK-293T C279(0.95)  LDD1559  [8]
 LDCM0321  AC58 HEK-293T C279(1.12)  LDD1560  [8]
 LDCM0322  AC59 HEK-293T C279(1.16)  LDD1561  [8]
 LDCM0323  AC6 PaTu 8988t C279(0.90)  LDD1202  [9]
 LDCM0324  AC60 HEK-293T C279(1.09)  LDD1563  [8]
 LDCM0325  AC61 HEK-293T C279(0.95)  LDD1564  [8]
 LDCM0326  AC62 HEK-293T C279(1.14)  LDD1565  [8]
 LDCM0327  AC63 HEK-293T C279(0.97)  LDD1566  [8]
 LDCM0328  AC64 HEK-293T C279(0.95)  LDD1567  [8]
 LDCM0334  AC7 PaTu 8988t C279(0.86)  LDD1213  [9]
 LDCM0345  AC8 PaTu 8988t C279(1.14)  LDD1224  [9]
 LDCM0248  AKOS034007472 PaTu 8988t C279(1.17)  LDD1127  [9]
 LDCM0356  AKOS034007680 PaTu 8988t C279(0.55)  LDD1235  [9]
 LDCM0275  AKOS034007705 PaTu 8988t C279(0.56)  LDD1154  [9]
 LDCM0367  CL1 HEK-293T C279(1.01)  LDD1571  [8]
 LDCM0368  CL10 HEK-293T C279(1.16)  LDD1572  [8]
 LDCM0369  CL100 HEK-293T C279(0.85)  LDD1573  [8]
 LDCM0370  CL101 PaTu 8988t C279(0.82)  LDD1249  [9]
 LDCM0371  CL102 PaTu 8988t C279(0.62)  LDD1250  [9]
 LDCM0372  CL103 PaTu 8988t C279(0.72)  LDD1251  [9]
 LDCM0373  CL104 PaTu 8988t C279(0.72)  LDD1252  [9]
 LDCM0374  CL105 HEK-293T C279(0.75)  LDD1578  [8]
 LDCM0375  CL106 HEK-293T C279(1.16)  LDD1579  [8]
 LDCM0376  CL107 HEK-293T C279(0.99)  LDD1580  [8]
 LDCM0377  CL108 HEK-293T C279(1.06)  LDD1581  [8]
 LDCM0378  CL109 HEK-293T C279(1.04)  LDD1582  [8]
 LDCM0379  CL11 HEK-293T C279(0.92)  LDD1583  [8]
 LDCM0380  CL110 HEK-293T C279(0.99)  LDD1584  [8]
 LDCM0381  CL111 HEK-293T C279(0.92)  LDD1585  [8]
 LDCM0382  CL112 HEK-293T C279(0.87)  LDD1586  [8]
 LDCM0383  CL113 HEK-293T C279(1.10)  LDD1587  [8]
 LDCM0384  CL114 HEK-293T C279(1.02)  LDD1588  [8]
 LDCM0385  CL115 HEK-293T C279(1.08)  LDD1589  [8]
 LDCM0386  CL116 HEK-293T C279(1.02)  LDD1590  [8]
 LDCM0387  CL117 HEK-293T C279(0.97)  LDD1591  [8]
 LDCM0388  CL118 HEK-293T C279(1.02)  LDD1592  [8]
 LDCM0389  CL119 HEK-293T C279(1.17)  LDD1593  [8]
 LDCM0390  CL12 HEK-293T C279(0.82)  LDD1594  [8]
 LDCM0391  CL120 HEK-293T C279(1.04)  LDD1595  [8]
 LDCM0392  CL121 PaTu 8988t C279(1.01)  LDD1271  [9]
 LDCM0393  CL122 PaTu 8988t C279(0.89)  LDD1272  [9]
 LDCM0394  CL123 PaTu 8988t C279(0.66)  LDD1273  [9]
 LDCM0395  CL124 PaTu 8988t C279(0.54)  LDD1274  [9]
 LDCM0396  CL125 HEK-293T C279(1.11)  LDD1600  [8]
 LDCM0397  CL126 HEK-293T C279(1.08)  LDD1601  [8]
 LDCM0398  CL127 HEK-293T C279(1.08)  LDD1602  [8]
 LDCM0399  CL128 HEK-293T C279(0.95)  LDD1603  [8]
 LDCM0400  CL13 HEK-293T C279(1.12)  LDD1604  [8]
 LDCM0401  CL14 HEK-293T C279(1.15)  LDD1605  [8]
 LDCM0402  CL15 HEK-293T C279(1.24)  LDD1606  [8]
 LDCM0403  CL16 HEK-293T C279(0.91)  LDD1607  [8]
 LDCM0404  CL17 HEK-293T C279(0.96)  LDD1608  [8]
 LDCM0405  CL18 HEK-293T C279(1.28)  LDD1609  [8]
 LDCM0406  CL19 HEK-293T C279(0.79)  LDD1610  [8]
 LDCM0407  CL2 HEK-293T C279(1.14)  LDD1611  [8]
 LDCM0408  CL20 HEK-293T C279(0.98)  LDD1612  [8]
 LDCM0409  CL21 HEK-293T C279(0.91)  LDD1613  [8]
 LDCM0410  CL22 HEK-293T C279(1.06)  LDD1614  [8]
 LDCM0411  CL23 HEK-293T C279(1.23)  LDD1615  [8]
 LDCM0412  CL24 HEK-293T C279(0.95)  LDD1616  [8]
 LDCM0413  CL25 HEK-293T C279(0.86)  LDD1617  [8]
 LDCM0414  CL26 HEK-293T C279(1.08)  LDD1618  [8]
 LDCM0415  CL27 HEK-293T C279(1.05)  LDD1619  [8]
 LDCM0416  CL28 HEK-293T C279(0.88)  LDD1620  [8]
 LDCM0417  CL29 HEK-293T C279(1.03)  LDD1621  [8]
 LDCM0418  CL3 HEK-293T C279(1.18)  LDD1622  [8]
 LDCM0419  CL30 HEK-293T C279(0.97)  LDD1623  [8]
 LDCM0420  CL31 PaTu 8988t C279(0.81)  LDD1299  [9]
 LDCM0421  CL32 PaTu 8988t C279(0.57)  LDD1300  [9]
 LDCM0422  CL33 PaTu 8988t C279(0.34)  LDD1301  [9]
 LDCM0423  CL34 PaTu 8988t C279(0.65)  LDD1302  [9]
 LDCM0424  CL35 PaTu 8988t C279(0.37)  LDD1303  [9]
 LDCM0425  CL36 PaTu 8988t C279(0.79)  LDD1304  [9]
 LDCM0426  CL37 PaTu 8988t C279(0.28)  LDD1305  [9]
 LDCM0428  CL39 PaTu 8988t C279(1.02)  LDD1307  [9]
 LDCM0429  CL4 HEK-293T C279(0.96)  LDD1633  [8]
 LDCM0430  CL40 PaTu 8988t C279(0.94)  LDD1309  [9]
 LDCM0431  CL41 PaTu 8988t C279(0.36)  LDD1310  [9]
 LDCM0432  CL42 PaTu 8988t C279(0.31)  LDD1311  [9]
 LDCM0433  CL43 PaTu 8988t C279(0.39)  LDD1312  [9]
 LDCM0434  CL44 PaTu 8988t C279(0.36)  LDD1313  [9]
 LDCM0435  CL45 PaTu 8988t C279(0.70)  LDD1314  [9]
 LDCM0436  CL46 HEK-293T C279(1.02)  LDD1640  [8]
 LDCM0437  CL47 HEK-293T C279(1.25)  LDD1641  [8]
 LDCM0438  CL48 HEK-293T C279(0.99)  LDD1642  [8]
 LDCM0439  CL49 HEK-293T C279(1.08)  LDD1643  [8]
 LDCM0440  CL5 HEK-293T C279(0.96)  LDD1644  [8]
 LDCM0441  CL50 HEK-293T C279(0.96)  LDD1645  [8]
 LDCM0443  CL52 HEK-293T C279(1.05)  LDD1646  [8]
 LDCM0444  CL53 HEK-293T C279(0.96)  LDD1647  [8]
 LDCM0445  CL54 HEK-293T C279(0.39)  LDD1648  [8]
 LDCM0446  CL55 HEK-293T C279(0.87)  LDD1649  [8]
 LDCM0447  CL56 HEK-293T C279(1.01)  LDD1650  [8]
 LDCM0448  CL57 HEK-293T C279(0.89)  LDD1651  [8]
 LDCM0449  CL58 HEK-293T C279(0.95)  LDD1652  [8]
 LDCM0450  CL59 HEK-293T C279(1.17)  LDD1653  [8]
 LDCM0451  CL6 HEK-293T C279(0.84)  LDD1654  [8]
 LDCM0452  CL60 HEK-293T C279(0.94)  LDD1655  [8]
 LDCM0453  CL61 HEK-293T C279(1.01)  LDD1656  [8]
 LDCM0454  CL62 HEK-293T C279(1.16)  LDD1657  [8]
 LDCM0455  CL63 HEK-293T C279(1.05)  LDD1658  [8]
 LDCM0456  CL64 HEK-293T C279(0.60)  LDD1659  [8]
 LDCM0457  CL65 HEK-293T C279(1.02)  LDD1660  [8]
 LDCM0458  CL66 HEK-293T C279(1.06)  LDD1661  [8]
 LDCM0459  CL67 HEK-293T C279(1.12)  LDD1662  [8]
 LDCM0460  CL68 HEK-293T C279(0.93)  LDD1663  [8]
 LDCM0461  CL69 HEK-293T C279(0.95)  LDD1664  [8]
 LDCM0462  CL7 HEK-293T C279(0.87)  LDD1665  [8]
 LDCM0463  CL70 HEK-293T C279(1.13)  LDD1666  [8]
 LDCM0464  CL71 HEK-293T C279(1.11)  LDD1667  [8]
 LDCM0465  CL72 HEK-293T C279(0.87)  LDD1668  [8]
 LDCM0466  CL73 HEK-293T C279(0.91)  LDD1669  [8]
 LDCM0467  CL74 HEK-293T C279(1.07)  LDD1670  [8]
 LDCM0469  CL76 HEK-293T C279(0.91)  LDD1672  [8]
 LDCM0470  CL77 HEK-293T C279(1.00)  LDD1673  [8]
 LDCM0471  CL78 HEK-293T C279(1.12)  LDD1674  [8]
 LDCM0472  CL79 HEK-293T C279(0.89)  LDD1675  [8]
 LDCM0473  CL8 HEK-293T C279(0.80)  LDD1676  [8]
 LDCM0474  CL80 HEK-293T C279(1.02)  LDD1677  [8]
 LDCM0475  CL81 HEK-293T C279(1.08)  LDD1678  [8]
 LDCM0476  CL82 HEK-293T C279(0.99)  LDD1679  [8]
 LDCM0477  CL83 HEK-293T C279(0.78)  LDD1680  [8]
 LDCM0478  CL84 HEK-293T C279(1.05)  LDD1681  [8]
 LDCM0479  CL85 HEK-293T C279(1.08)  LDD1682  [8]
 LDCM0480  CL86 HEK-293T C279(1.25)  LDD1683  [8]
 LDCM0481  CL87 HEK-293T C279(0.91)  LDD1684  [8]
 LDCM0482  CL88 HEK-293T C279(0.89)  LDD1685  [8]
 LDCM0483  CL89 HEK-293T C279(1.00)  LDD1686  [8]
 LDCM0484  CL9 HEK-293T C279(0.98)  LDD1687  [8]
 LDCM0485  CL90 HEK-293T C279(0.85)  LDD1688  [8]
 LDCM0486  CL91 HEK-293T C279(0.91)  LDD1689  [8]
 LDCM0487  CL92 HEK-293T C279(0.98)  LDD1690  [8]
 LDCM0488  CL93 HEK-293T C279(1.00)  LDD1691  [8]
 LDCM0489  CL94 HEK-293T C279(1.16)  LDD1692  [8]
 LDCM0490  CL95 HEK-293T C279(1.09)  LDD1693  [8]
 LDCM0491  CL96 HEK-293T C279(0.79)  LDD1694  [8]
 LDCM0492  CL97 HEK-293T C279(0.92)  LDD1695  [8]
 LDCM0493  CL98 HEK-293T C279(1.25)  LDD1696  [8]
 LDCM0494  CL99 HEK-293T C279(1.10)  LDD1697  [8]
 LDCM0495  E2913 HEK-293T C279(1.19)  LDD1698  [8]
 LDCM0468  Fragment33 HEK-293T C279(1.26)  LDD1671  [8]
 LDCM0427  Fragment51 PaTu 8988t C279(0.40)  LDD1306  [9]
 LDCM0022  KB02 HEK-293T C279(0.98)  LDD1492  [8]
 LDCM0023  KB03 HEK-293T C279(0.93)  LDD1497  [8]
 LDCM0024  KB05 COLO792 C279(1.77)  LDD3310  [3]

The Interaction Atlas With This Target

The Protein(s) Related To This Target

Transporter and channel
Click To Hide/Show 1 Protein(s) Interacting with This Target
Protein name Family Uniprot ID
Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein (GOPC) . Q9HD26
Other
Click To Hide/Show 1 Protein(s) Interacting with This Target
Protein name Family Uniprot ID
Vacuolar protein sorting-associated protein 52 homolog (VPS52) VPS52 family Q8N1B4

References

1 A Paal-Knorr agent for chemoproteomic profiling of targets of isoketals in cells. Chem Sci. 2021 Oct 15;12(43):14557-14563. doi: 10.1039/d1sc02230j. eCollection 2021 Nov 10.
Mass spectrometry data entry: PXD028270
2 An Azo Coupling-Based Chemoproteomic Approach to Systematically Profile the Tyrosine Reactivity in the Human Proteome. Anal Chem. 2021 Jul 27;93(29):10334-10342. doi: 10.1021/acs.analchem.1c01935. Epub 2021 Jul 12.
3 DrugMap: A quantitative pan-cancer analysis of cysteine ligandability. Cell. 2024 May 9;187(10):2536-2556.e30. doi: 10.1016/j.cell.2024.03.027. Epub 2024 Apr 22.
Mass spectrometry data entry: PXD047840
4 Chemoproteomic capture of RNA binding activity in living cells. Nat Commun. 2023 Oct 7;14(1):6282. doi: 10.1038/s41467-023-41844-z.
Mass spectrometry data entry: PXD044625
5 Enhancing Cysteine Chemoproteomic Coverage through Systematic Assessment of Click Chemistry Product Fragmentation. Anal Chem. 2022 Mar 8;94(9):3800-3810. doi: 10.1021/acs.analchem.1c04402. Epub 2022 Feb 23.
Mass spectrometry data entry: PXD028853
6 N-Acryloylindole-alkyne (NAIA) enables imaging and profiling new ligandable cysteines and oxidized thiols by chemoproteomics. Nat Commun. 2023 Jun 15;14(1):3564. doi: 10.1038/s41467-023-39268-w.
Mass spectrometry data entry: PXD041264
7 Global profiling identifies a stress-responsive tyrosine site on EDC3 regulating biomolecular condensate formation. Cell Chem Biol. 2022 Dec 15;29(12):1709-1720.e7. doi: 10.1016/j.chembiol.2022.11.008. Epub 2022 Dec 6.
Mass spectrometry data entry: PXD038010
8 Accelerating multiplexed profiling of protein-ligand interactions: High-throughput plate-based reactive cysteine profiling with minimal input. Cell Chem Biol. 2024 Mar 21;31(3):565-576.e4. doi: 10.1016/j.chembiol.2023.11.015. Epub 2023 Dec 19.
Mass spectrometry data entry: PXD044402
9 Reimagining high-throughput profiling of reactive cysteines for cell-based screening of large electrophile libraries. Nat Biotechnol. 2021 May;39(5):630-641. doi: 10.1038/s41587-020-00778-3. Epub 2021 Jan 4.