Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP15679
Target Name Sorting nexin-21 (SNX21)
Gene Name SNX21
Gene ID 90203
Synonyms
C20orf161; SNXL; Sorting nexin-21; Sorting nexin L; SNX-L
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MGSVNSRGHKAEAQVVMMGLDSAGKTTLLYKLKGHQLVETLPTVGFNVEPLKAPGHVSLT
LWDVGGQAPLRASWKDYLEGTDILVYVLDSTDEARLPESAAELTEVLNDPNMAGVPFLVL
ANKQEAPDALPLLKIRNRLSLERFQDHCWELRGCSALTGEGLPEALQSLWSLLKSRSCMC
LQARAHGAERGDSKRS
Target Bioclass
Transporter and channel
Family
Sorting nexin family
Subcellular location
Cytoplasmic vesicle membrane
Function Binds to membranes enriched in phosphatidylinositol 3-phosphate (PtdIns(P3)) and phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate. May be involved in several stages of intracellular trafficking.
Uniprot ID
Q969T3
Ensemble ID
ENST00000342644.9
HGNC ID
HGNC:16154

Target Site Mutations in Different Cell Lines

Cell line Mutation details Probe for labeling this protein in this cell
AGS SNV: p.W106Ter .
EFO27 Deletion: p.P101HfsTer35 .
NB1 SNV: p.P27L .
SNGM SNV: p.R130W .
SW756 SNV: p.D103H DBIA    Probe Info 

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 2 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
DBIA
 Probe Info  		C252(1.62); C163(1.84)  LDD3331  [1]
IPM
 Probe Info  		C252(0.90)  LDD1702  [2]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0214  AC1 PaTu 8988t C252(1.83)  LDD1093  [3]
 LDCM0215  AC10 PaTu 8988t C252(1.60)  LDD1094  [3]
 LDCM0226  AC11 PaTu 8988t C252(1.23)  LDD1105  [3]
 LDCM0230  AC113 PaTu 8988t C252(1.07)  LDD1109  [3]
 LDCM0231  AC114 PaTu 8988t C252(0.93)  LDD1110  [3]
 LDCM0232  AC115 PaTu 8988t C252(0.98)  LDD1111  [3]
 LDCM0233  AC116 PaTu 8988t C252(1.75)  LDD1112  [3]
 LDCM0234  AC117 PaTu 8988t C252(1.35)  LDD1113  [3]
 LDCM0235  AC118 PaTu 8988t C252(0.91)  LDD1114  [3]
 LDCM0236  AC119 PaTu 8988t C252(1.15)  LDD1115  [3]
 LDCM0237  AC12 PaTu 8988t C252(1.19)  LDD1116  [3]
 LDCM0238  AC120 PaTu 8988t C252(1.03)  LDD1117  [3]
 LDCM0239  AC121 PaTu 8988t C252(1.23)  LDD1118  [3]
 LDCM0240  AC122 PaTu 8988t C252(1.18)  LDD1119  [3]
 LDCM0241  AC123 PaTu 8988t C252(1.65)  LDD1120  [3]
 LDCM0242  AC124 PaTu 8988t C252(1.62)  LDD1121  [3]
 LDCM0243  AC125 PaTu 8988t C252(1.26)  LDD1122  [3]
 LDCM0244  AC126 PaTu 8988t C252(0.97)  LDD1123  [3]
 LDCM0245  AC127 PaTu 8988t C252(1.43)  LDD1124  [3]
 LDCM0259  AC14 PaTu 8988t C252(1.49)  LDD1138  [3]
 LDCM0270  AC15 PaTu 8988t C252(1.15)  LDD1149  [3]
 LDCM0277  AC18 HEK-293T C252(1.11)  LDD1516  [4]
 LDCM0279  AC2 PaTu 8988t C252(2.15)  LDD1158  [3]
 LDCM0280  AC20 HEK-293T C252(0.88)  LDD1519  [4]
 LDCM0281  AC21 HEK-293T C252(0.96)  LDD1520  [4]
 LDCM0283  AC23 HEK-293T C252(1.01)  LDD1522  [4]
 LDCM0284  AC24 HEK-293T C252(1.03)  LDD1523  [4]
 LDCM0285  AC25 PaTu 8988t C252(1.11)  LDD1164  [3]
 LDCM0286  AC26 PaTu 8988t C252(0.80)  LDD1165  [3]
 LDCM0287  AC27 PaTu 8988t C252(1.01)  LDD1166  [3]
 LDCM0288  AC28 PaTu 8988t C252(1.43)  LDD1167  [3]
 LDCM0289  AC29 PaTu 8988t C252(1.02)  LDD1168  [3]
 LDCM0290  AC3 PaTu 8988t C252(1.29)  LDD1169  [3]
 LDCM0291  AC30 PaTu 8988t C252(0.93)  LDD1170  [3]
 LDCM0292  AC31 PaTu 8988t C252(1.35)  LDD1171  [3]
 LDCM0293  AC32 PaTu 8988t C252(0.66)  LDD1172  [3]
 LDCM0294  AC33 PaTu 8988t C252(1.32)  LDD1173  [3]
 LDCM0295  AC34 PaTu 8988t C252(0.90)  LDD1174  [3]
 LDCM0296  AC35 PaTu 8988t C252(0.75)  LDD1175  [3]
 LDCM0297  AC36 PaTu 8988t C252(0.80)  LDD1176  [3]
 LDCM0298  AC37 PaTu 8988t C252(0.73)  LDD1177  [3]
 LDCM0299  AC38 PaTu 8988t C252(0.66)  LDD1178  [3]
 LDCM0300  AC39 PaTu 8988t C252(0.94)  LDD1179  [3]
 LDCM0301  AC4 PaTu 8988t C252(1.50)  LDD1180  [3]
 LDCM0302  AC40 PaTu 8988t C252(0.83)  LDD1181  [3]
 LDCM0303  AC41 PaTu 8988t C252(0.93)  LDD1182  [3]
 LDCM0304  AC42 PaTu 8988t C252(0.74)  LDD1183  [3]
 LDCM0305  AC43 PaTu 8988t C252(0.91)  LDD1184  [3]
 LDCM0306  AC44 PaTu 8988t C252(0.89)  LDD1185  [3]
 LDCM0307  AC45 PaTu 8988t C252(0.80)  LDD1186  [3]
 LDCM0309  AC47 HEK-293T C252(1.08)  LDD1548  [4]
 LDCM0310  AC48 HEK-293T C252(1.15)  LDD1549  [4]
 LDCM0312  AC5 PaTu 8988t C252(1.62)  LDD1191  [3]
 LDCM0313  AC50 HEK-293T C252(1.07)  LDD1552  [4]
 LDCM0315  AC52 HEK-293T C252(1.02)  LDD1554  [4]
 LDCM0316  AC53 HEK-293T C252(1.01)  LDD1555  [4]
 LDCM0318  AC55 HEK-293T C252(1.01)  LDD1557  [4]
 LDCM0319  AC56 HEK-293T C252(1.02)  LDD1558  [4]
 LDCM0321  AC58 HEK-293T C252(1.01)  LDD1560  [4]
 LDCM0323  AC6 PaTu 8988t C252(1.16)  LDD1202  [3]
 LDCM0324  AC60 HEK-293T C252(0.95)  LDD1563  [4]
 LDCM0325  AC61 HEK-293T C252(0.98)  LDD1564  [4]
 LDCM0327  AC63 HEK-293T C252(0.93)  LDD1566  [4]
 LDCM0328  AC64 HEK-293T C252(1.01)  LDD1567  [4]
 LDCM0334  AC7 PaTu 8988t C252(1.55)  LDD1213  [3]
 LDCM0345  AC8 PaTu 8988t C252(1.02)  LDD1224  [3]
 LDCM0248  AKOS034007472 PaTu 8988t C252(1.34)  LDD1127  [3]
 LDCM0356  AKOS034007680 PaTu 8988t C252(1.86)  LDD1235  [3]
 LDCM0275  AKOS034007705 PaTu 8988t C252(2.00)  LDD1154  [3]
 LDCM0369  CL100 PaTu 8988t C252(0.94)  LDD1248  [3]
 LDCM0370  CL101 PaTu 8988t C252(1.54)  LDD1249  [3]
 LDCM0371  CL102 PaTu 8988t C252(1.77)  LDD1250  [3]
 LDCM0372  CL103 PaTu 8988t C252(1.74)  LDD1251  [3]
 LDCM0373  CL104 PaTu 8988t C252(1.29)  LDD1252  [3]
 LDCM0375  CL106 HEK-293T C252(1.08)  LDD1579  [4]
 LDCM0376  CL107 HEK-293T C252(0.99)  LDD1580  [4]
 LDCM0377  CL108 HEK-293T C252(0.79)  LDD1581  [4]
 LDCM0379  CL11 HEK-293T C252(1.19)  LDD1583  [4]
 LDCM0380  CL110 HEK-293T C252(0.97)  LDD1584  [4]
 LDCM0381  CL111 HEK-293T C252(0.98)  LDD1585  [4]
 LDCM0382  CL112 PaTu 8988t C252(1.18)  LDD1261  [3]
 LDCM0383  CL113 PaTu 8988t C252(1.10)  LDD1262  [3]
 LDCM0384  CL114 PaTu 8988t C252(0.99)  LDD1263  [3]
 LDCM0385  CL115 PaTu 8988t C252(0.88)  LDD1264  [3]
 LDCM0386  CL116 PaTu 8988t C252(0.93)  LDD1265  [3]
 LDCM0387  CL117 PaTu 8988t C252(0.94)  LDD1266  [3]
 LDCM0388  CL118 PaTu 8988t C252(0.85)  LDD1267  [3]
 LDCM0389  CL119 PaTu 8988t C252(0.86)  LDD1268  [3]
 LDCM0390  CL12 HEK-293T C252(1.09)  LDD1594  [4]
 LDCM0391  CL120 PaTu 8988t C252(0.99)  LDD1270  [3]
 LDCM0393  CL122 HEK-293T C252(0.98)  LDD1597  [4]
 LDCM0394  CL123 HEK-293T C252(0.90)  LDD1598  [4]
 LDCM0395  CL124 HEK-293T C252(1.05)  LDD1599  [4]
 LDCM0397  CL126 HEK-293T C252(1.00)  LDD1601  [4]
 LDCM0398  CL127 HEK-293T C252(0.93)  LDD1602  [4]
 LDCM0399  CL128 HEK-293T C252(1.10)  LDD1603  [4]
 LDCM0401  CL14 HEK-293T C252(1.05)  LDD1605  [4]
 LDCM0402  CL15 HEK-293T C252(0.97)  LDD1606  [4]
 LDCM0403  CL16 HEK-293T C252(1.22)  LDD1607  [4]
 LDCM0405  CL18 HEK-293T C252(0.96)  LDD1609  [4]
 LDCM0407  CL2 HEK-293T C252(1.01)  LDD1611  [4]
 LDCM0408  CL20 HEK-293T C252(1.17)  LDD1612  [4]
 LDCM0409  CL21 HEK-293T C252(0.98)  LDD1613  [4]
 LDCM0411  CL23 HEK-293T C252(1.16)  LDD1615  [4]
 LDCM0412  CL24 HEK-293T C252(1.27)  LDD1616  [4]
 LDCM0414  CL26 HEK-293T C252(1.08)  LDD1618  [4]
 LDCM0415  CL27 HEK-293T C252(1.00)  LDD1619  [4]
 LDCM0416  CL28 HEK-293T C252(0.88)  LDD1620  [4]
 LDCM0418  CL3 HEK-293T C252(1.02)  LDD1622  [4]
 LDCM0419  CL30 HEK-293T C252(1.10)  LDD1623  [4]
 LDCM0421  CL32 HEK-293T C252(1.05)  LDD1625  [4]
 LDCM0422  CL33 HEK-293T C252(0.92)  LDD1626  [4]
 LDCM0424  CL35 HEK-293T C252(1.06)  LDD1628  [4]
 LDCM0425  CL36 HEK-293T C252(1.26)  LDD1629  [4]
 LDCM0428  CL39 HEK-293T C252(0.96)  LDD1632  [4]
 LDCM0429  CL4 HEK-293T C252(0.93)  LDD1633  [4]
 LDCM0430  CL40 HEK-293T C252(0.95)  LDD1634  [4]
 LDCM0432  CL42 HEK-293T C252(1.19)  LDD1636  [4]
 LDCM0434  CL44 HEK-293T C252(1.13)  LDD1638  [4]
 LDCM0435  CL45 HEK-293T C252(0.86)  LDD1639  [4]
 LDCM0436  CL46 PaTu 8988t C252(0.95)  LDD1315  [3]
 LDCM0437  CL47 PaTu 8988t C252(0.91)  LDD1316  [3]
 LDCM0438  CL48 PaTu 8988t C252(0.55)  LDD1317  [3]
 LDCM0439  CL49 PaTu 8988t C252(0.71)  LDD1318  [3]
 LDCM0441  CL50 PaTu 8988t C252(0.75)  LDD1320  [3]
 LDCM0442  CL51 PaTu 8988t C252(0.70)  LDD1321  [3]
 LDCM0443  CL52 PaTu 8988t C252(1.12)  LDD1322  [3]
 LDCM0444  CL53 PaTu 8988t C252(0.66)  LDD1323  [3]
 LDCM0445  CL54 PaTu 8988t C252(0.75)  LDD1324  [3]
 LDCM0446  CL55 PaTu 8988t C252(0.77)  LDD1325  [3]
 LDCM0447  CL56 PaTu 8988t C252(0.89)  LDD1326  [3]
 LDCM0448  CL57 PaTu 8988t C252(0.71)  LDD1327  [3]
 LDCM0449  CL58 PaTu 8988t C252(0.60)  LDD1328  [3]
 LDCM0450  CL59 PaTu 8988t C252(0.79)  LDD1329  [3]
 LDCM0451  CL6 HEK-293T C252(1.11)  LDD1654  [4]
 LDCM0452  CL60 PaTu 8988t C252(0.79)  LDD1331  [3]
 LDCM0454  CL62 HEK-293T C252(1.00)  LDD1657  [4]
 LDCM0455  CL63 HEK-293T C252(0.91)  LDD1658  [4]
 LDCM0456  CL64 HEK-293T C252(0.89)  LDD1659  [4]
 LDCM0458  CL66 HEK-293T C252(1.10)  LDD1661  [4]
 LDCM0460  CL68 HEK-293T C252(1.12)  LDD1663  [4]
 LDCM0461  CL69 HEK-293T C252(0.93)  LDD1664  [4]
 LDCM0464  CL71 HEK-293T C252(1.26)  LDD1667  [4]
 LDCM0465  CL72 HEK-293T C252(1.18)  LDD1668  [4]
 LDCM0467  CL74 HEK-293T C252(1.02)  LDD1670  [4]
 LDCM0469  CL76 HEK-293T C252(0.81)  LDD1672  [4]
 LDCM0471  CL78 HEK-293T C252(1.15)  LDD1674  [4]
 LDCM0473  CL8 HEK-293T C252(0.87)  LDD1676  [4]
 LDCM0474  CL80 HEK-293T C252(1.11)  LDD1677  [4]
 LDCM0475  CL81 HEK-293T C252(1.02)  LDD1678  [4]
 LDCM0477  CL83 HEK-293T C252(1.08)  LDD1680  [4]
 LDCM0478  CL84 HEK-293T C252(1.07)  LDD1681  [4]
 LDCM0480  CL86 HEK-293T C252(0.99)  LDD1683  [4]
 LDCM0481  CL87 HEK-293T C252(0.88)  LDD1684  [4]
 LDCM0482  CL88 HEK-293T C252(0.89)  LDD1685  [4]
 LDCM0484  CL9 HEK-293T C252(0.99)  LDD1687  [4]
 LDCM0485  CL90 HEK-293T C252(0.96)  LDD1688  [4]
 LDCM0486  CL91 PaTu 8988t C252(0.99)  LDD1365  [3]
 LDCM0487  CL92 PaTu 8988t C252(1.23)  LDD1366  [3]
 LDCM0488  CL93 PaTu 8988t C252(1.25)  LDD1367  [3]
 LDCM0489  CL94 PaTu 8988t C252(1.61)  LDD1368  [3]
 LDCM0490  CL95 PaTu 8988t C252(0.91)  LDD1369  [3]
 LDCM0491  CL96 PaTu 8988t C252(1.09)  LDD1370  [3]
 LDCM0492  CL97 PaTu 8988t C252(2.00)  LDD1371  [3]
 LDCM0493  CL98 PaTu 8988t C252(0.96)  LDD1372  [3]
 LDCM0494  CL99 PaTu 8988t C252(1.16)  LDD1373  [3]
 LDCM0495  E2913 HEK-293T C252(0.96)  LDD1698  [4]
 LDCM0213  Electrophilic fragment 2 MDA-MB-231 C252(0.90)  LDD1702  [2]
 LDCM0468  Fragment33 HEK-293T C252(0.95)  LDD1671  [4]
 LDCM0427  Fragment51 HEK-293T C252(0.99)  LDD1631  [4]
 LDCM0022  KB02 HEK-293T C252(1.02)  LDD1492  [4]
 LDCM0023  KB03 HEK-293T C252(1.05)  LDD1497  [4]
 LDCM0024  KB05 MKN-1 C252(1.62); C163(1.84)  LDD3331  [1]

The Interaction Atlas With This Target

The Protein(s) Related To This Target

Other
Click To Hide/Show 1 Protein(s) Interacting with This Target
Protein name Family Uniprot ID
Heat shock factor 2-binding protein (HSF2BP) . O75031

References

1 DrugMap: A quantitative pan-cancer analysis of cysteine ligandability. Cell. 2024 May 9;187(10):2536-2556.e30. doi: 10.1016/j.cell.2024.03.027. Epub 2024 Apr 22.
Mass spectrometry data entry: PXD047840
2 Nucleophilic covalent ligand discovery for the cysteine redoxome. Nat Chem Biol. 2023 Nov;19(11):1309-1319. doi: 10.1038/s41589-023-01330-5. Epub 2023 May 29.
Mass spectrometry data entry: PXD039908 , PXD029761
3 Reimagining high-throughput profiling of reactive cysteines for cell-based screening of large electrophile libraries. Nat Biotechnol. 2021 May;39(5):630-641. doi: 10.1038/s41587-020-00778-3. Epub 2021 Jan 4.
4 Accelerating multiplexed profiling of protein-ligand interactions: High-throughput plate-based reactive cysteine profiling with minimal input. Cell Chem Biol. 2024 Mar 21;31(3):565-576.e4. doi: 10.1016/j.chembiol.2023.11.015. Epub 2023 Dec 19.
Mass spectrometry data entry: PXD044402