Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP13725
Target Name Trafficking kinesin-binding protein 1 (TRAK1)
Gene Name TRAK1
Gene ID 22906
Synonyms
KIAA1042; OIP106; Trafficking kinesin-binding protein 1; 106 kDa O-GlcNAc transferase-interacting protein; Protein Milton
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MGVLMSKRQTVEQVQKVSLAVSAFKDGLRDRPSIRRTGELPGSRRGTVEGSVQEVQEEKE
AEAGTSVVQEESSAGRAAWERLRDGRGVEPEEFDRTSRFTPPAFIRPTRKLDDDKPPEIC
LEPREPVVNDEMCDVCEVWTAESLFPCRVCTRVFHDGCLRRMGYIQGDSAAEVTEMAHTE
TGWSCHYCDNINLLLTEEEMYSLTETFQRCKVIPDCSLTLEDFLRYRHQAAKRGDRDRAL
SEEQEEQAARQFAALDPEHRGHIEWPDFLSHESLLLLQQLRPQNSLLRLLTVKERERARA
AFLARGSGSTVSEAECRRAQHSWFCKRFPEAPSCSVSISHVGPIADSSPASSSSKSQDKT
LLPTEQESRFVDWPTFLQENVLYILAARPNSAAIHLKPPG
Target Bioclass
Other
Family
Milton family
Subcellular location
Cytoplasm
Function
Involved in the regulation of endosome-to-lysosome trafficking, including endocytic trafficking of EGF-EGFR complexes and GABA-A receptors. Involved in mitochondrial motility. When O-glycosylated, abolishes mitochondrial motility. Crucial for recruiting OGT to the mitochondrial surface of neuronal processes. TRAK1 and RHOT form an essential protein complex that links KIF5 to mitochondria for light chain-independent, anterograde transport of mitochondria.
Uniprot ID
Q9UPV9
Ensemble ID
ENST00000327628.10
HGNC ID
HGNC:29947

Target Site Mutations in Different Cell Lines

Cell line Mutation details Probe for labeling this protein in this cell
22RV1 Deletion: p.A314LfsTer34 .
769P SNV: p.M775V .
AN3CA SNV: p.A584T .
CCK81 SNV: p.Y771C .
CMK SNV: p.A643V .
HEC1 SNV: p.A472V .
HEC1B SNV: p.A472V .
IGROV1 SNV: p.L174P .
NCIN87 SNV: p.L347P .
P31FUJ SNV: p.I454M .
SKMEL30 SNV: p.S730C .
TOV21G SNV: p.R362C .
U2OS SNV: p.I466V .

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 4 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
DBIA
 Probe Info  		C713(0.93); C875(1.14); C98(0.89)  LDD1492  [1]
ATP probe
 Probe Info  		K272(0.00); K273(0.00)  LDD0199  [2]
NAIA_4
 Probe Info  		N.A.  LDD2226  [3]
IPM
 Probe Info  		N.A.  LDD2156  [4]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0215  AC10 HEK-293T C898(0.94); C713(1.02)  LDD1508  [1]
 LDCM0226  AC11 HEK-293T C801(1.16); C898(1.00); C98(1.11)  LDD1509  [1]
 LDCM0237  AC12 HEK-293T C898(1.35)  LDD1510  [1]
 LDCM0259  AC14 HEK-293T C898(1.04)  LDD1512  [1]
 LDCM0270  AC15 HEK-293T C898(0.76)  LDD1513  [1]
 LDCM0277  AC18 HEK-293T C898(1.65); C713(1.19)  LDD1516  [1]
 LDCM0278  AC19 HEK-293T C801(0.92); C898(0.95); C98(0.77)  LDD1517  [1]
 LDCM0279  AC2 HEK-293T C898(0.73); C713(1.25)  LDD1518  [1]
 LDCM0280  AC20 HEK-293T C898(1.07)  LDD1519  [1]
 LDCM0281  AC21 HEK-293T C898(1.00); C98(1.01)  LDD1520  [1]
 LDCM0282  AC22 HEK-293T C898(0.76)  LDD1521  [1]
 LDCM0283  AC23 HEK-293T C898(0.90)  LDD1522  [1]
 LDCM0284  AC24 HEK-293T C801(0.85); C98(0.86); C875(0.95)  LDD1523  [1]
 LDCM0286  AC26 HEK-293T C898(0.90); C713(1.19)  LDD1525  [1]
 LDCM0287  AC27 HEK-293T C801(0.98); C898(0.94); C98(1.01)  LDD1526  [1]
 LDCM0288  AC28 HEK-293T C898(1.13)  LDD1527  [1]
 LDCM0289  AC29 HEK-293T C898(0.97); C98(1.01)  LDD1528  [1]
 LDCM0290  AC3 HEK-293T C801(1.09); C898(0.90); C98(1.00)  LDD1529  [1]
 LDCM0291  AC30 HEK-293T C898(1.06)  LDD1530  [1]
 LDCM0292  AC31 HEK-293T C898(1.03)  LDD1531  [1]
 LDCM0293  AC32 HEK-293T C801(1.06); C98(0.86); C875(1.10)  LDD1532  [1]
 LDCM0295  AC34 HEK-293T C898(0.81); C713(1.34)  LDD1534  [1]
 LDCM0296  AC35 HEK-293T C801(0.96); C898(1.06); C98(0.96)  LDD1535  [1]
 LDCM0297  AC36 HEK-293T C898(1.20)  LDD1536  [1]
 LDCM0298  AC37 HEK-293T C898(1.07); C98(1.15)  LDD1537  [1]
 LDCM0299  AC38 HEK-293T C898(1.46)  LDD1538  [1]
 LDCM0300  AC39 HEK-293T C898(0.93)  LDD1539  [1]
 LDCM0301  AC4 HEK-293T C898(1.10)  LDD1540  [1]
 LDCM0302  AC40 HEK-293T C801(0.91); C98(0.82); C875(1.05)  LDD1541  [1]
 LDCM0304  AC42 HEK-293T C898(0.98); C713(1.28)  LDD1543  [1]
 LDCM0305  AC43 HEK-293T C801(1.00); C898(1.07); C98(1.12)  LDD1544  [1]
 LDCM0306  AC44 HEK-293T C898(0.94)  LDD1545  [1]
 LDCM0307  AC45 HEK-293T C898(1.02); C98(1.08)  LDD1546  [1]
 LDCM0308  AC46 HEK-293T C898(1.19)  LDD1547  [1]
 LDCM0309  AC47 HEK-293T C898(0.89)  LDD1548  [1]
 LDCM0310  AC48 HEK-293T C801(0.92); C98(0.78); C875(1.00)  LDD1549  [1]
 LDCM0312  AC5 HEK-293T C898(1.26); C98(0.95)  LDD1551  [1]
 LDCM0313  AC50 HEK-293T C898(1.16); C713(1.05)  LDD1552  [1]
 LDCM0314  AC51 HEK-293T C801(1.09); C898(0.94); C98(0.96)  LDD1553  [1]
 LDCM0315  AC52 HEK-293T C898(1.27)  LDD1554  [1]
 LDCM0316  AC53 HEK-293T C898(1.04); C98(1.08)  LDD1555  [1]
 LDCM0317  AC54 HEK-293T C898(1.07)  LDD1556  [1]
 LDCM0318  AC55 HEK-293T C898(0.93)  LDD1557  [1]
 LDCM0319  AC56 HEK-293T C801(0.98); C98(0.94); C875(1.20)  LDD1558  [1]
 LDCM0321  AC58 HEK-293T C898(1.40); C713(1.11)  LDD1560  [1]
 LDCM0322  AC59 HEK-293T C801(1.14); C898(1.07); C98(0.97)  LDD1561  [1]
 LDCM0323  AC6 HEK-293T C898(1.25)  LDD1562  [1]
 LDCM0324  AC60 HEK-293T C898(1.12)  LDD1563  [1]
 LDCM0325  AC61 HEK-293T C898(0.99); C98(1.15)  LDD1564  [1]
 LDCM0326  AC62 HEK-293T C898(1.51)  LDD1565  [1]
 LDCM0327  AC63 HEK-293T C898(0.98)  LDD1566  [1]
 LDCM0328  AC64 HEK-293T C801(1.03); C98(0.85); C875(1.12)  LDD1567  [1]
 LDCM0334  AC7 HEK-293T C898(1.20)  LDD1568  [1]
 LDCM0345  AC8 HEK-293T C801(0.83); C98(0.71); C875(0.98)  LDD1569  [1]
 LDCM0248  AKOS034007472 HEK-293T C898(0.97); C98(1.15)  LDD1511  [1]
 LDCM0275  AKOS034007705 HEK-293T C801(0.89); C98(0.94); C875(0.99)  LDD1514  [1]
 LDCM0367  CL1 HEK-293T C801(0.79); C898(1.10); C98(1.27)  LDD1571  [1]
 LDCM0368  CL10 HEK-293T C898(0.99)  LDD1572  [1]
 LDCM0369  CL100 HEK-293T C801(0.96); C898(1.18); C98(0.79); C875(0.94)  LDD1573  [1]
 LDCM0370  CL101 HEK-293T C801(1.20); C898(0.99); C98(1.12)  LDD1574  [1]
 LDCM0371  CL102 HEK-293T C898(0.90); C875(0.99)  LDD1575  [1]
 LDCM0372  CL103 HEK-293T C898(0.97)  LDD1576  [1]
 LDCM0373  CL104 HEK-293T C801(1.04); C898(1.29); C98(0.75); C875(1.09)  LDD1577  [1]
 LDCM0374  CL105 HEK-293T C801(1.16); C898(1.11); C98(1.12)  LDD1578  [1]
 LDCM0375  CL106 HEK-293T C898(1.18); C875(1.01)  LDD1579  [1]
 LDCM0376  CL107 HEK-293T C898(1.20)  LDD1580  [1]
 LDCM0377  CL108 HEK-293T C801(1.01); C898(0.98); C98(0.76); C875(1.11)  LDD1581  [1]
 LDCM0378  CL109 HEK-293T C801(1.08); C898(0.94); C98(1.13)  LDD1582  [1]
 LDCM0379  CL11 HEK-293T C898(0.94)  LDD1583  [1]
 LDCM0380  CL110 HEK-293T C898(0.98); C875(1.01)  LDD1584  [1]
 LDCM0381  CL111 HEK-293T C898(0.91)  LDD1585  [1]
 LDCM0382  CL112 HEK-293T C801(1.14); C898(1.00); C98(0.72); C875(0.96)  LDD1586  [1]
 LDCM0383  CL113 HEK-293T C801(1.13); C898(1.06); C98(1.01)  LDD1587  [1]
 LDCM0384  CL114 HEK-293T C898(0.88); C875(0.98)  LDD1588  [1]
 LDCM0385  CL115 HEK-293T C898(0.96)  LDD1589  [1]
 LDCM0386  CL116 HEK-293T C801(1.10); C898(1.24); C98(0.80); C875(0.97)  LDD1590  [1]
 LDCM0387  CL117 HEK-293T C801(1.04); C898(1.04); C98(1.02)  LDD1591  [1]
 LDCM0388  CL118 HEK-293T C898(0.95); C875(1.10)  LDD1592  [1]
 LDCM0389  CL119 HEK-293T C898(0.99)  LDD1593  [1]
 LDCM0390  CL12 HEK-293T C801(1.06); C98(1.00); C875(0.99)  LDD1594  [1]
 LDCM0391  CL120 HEK-293T C801(1.11); C898(1.31); C98(0.90); C875(1.14)  LDD1595  [1]
 LDCM0392  CL121 HEK-293T C801(1.20); C898(0.94); C98(1.05)  LDD1596  [1]
 LDCM0393  CL122 HEK-293T C898(1.01); C875(1.06)  LDD1597  [1]
 LDCM0394  CL123 HEK-293T C898(1.50)  LDD1598  [1]
 LDCM0395  CL124 HEK-293T C801(0.96); C898(1.04); C98(0.80); C875(1.03)  LDD1599  [1]
 LDCM0396  CL125 HEK-293T C801(1.22); C898(0.95); C98(1.12)  LDD1600  [1]
 LDCM0397  CL126 HEK-293T C898(0.86); C875(1.12)  LDD1601  [1]
 LDCM0398  CL127 HEK-293T C898(1.21)  LDD1602  [1]
 LDCM0399  CL128 HEK-293T C801(1.02); C898(1.05); C98(0.76); C875(1.16)  LDD1603  [1]
 LDCM0400  CL13 HEK-293T C801(1.18); C898(0.95); C98(1.25)  LDD1604  [1]
 LDCM0401  CL14 HEK-293T C898(0.92); C875(1.13)  LDD1605  [1]
 LDCM0402  CL15 HEK-293T C898(0.87)  LDD1606  [1]
 LDCM0403  CL16 HEK-293T C801(1.03); C898(1.06); C98(1.12); C875(1.09)  LDD1607  [1]
 LDCM0405  CL18 HEK-293T C898(0.92); C713(1.34)  LDD1609  [1]
 LDCM0406  CL19 HEK-293T C801(1.42); C898(0.86); C98(1.05)  LDD1610  [1]
 LDCM0407  CL2 HEK-293T C898(0.91); C875(1.21)  LDD1611  [1]
 LDCM0408  CL20 HEK-293T C898(1.18)  LDD1612  [1]
 LDCM0409  CL21 HEK-293T C898(1.03); C98(1.07)  LDD1613  [1]
 LDCM0410  CL22 HEK-293T C898(1.07)  LDD1614  [1]
 LDCM0411  CL23 HEK-293T C898(1.16)  LDD1615  [1]
 LDCM0412  CL24 HEK-293T C801(0.99); C98(1.45); C875(1.07)  LDD1616  [1]
 LDCM0413  CL25 HEK-293T C801(1.01); C898(0.99); C98(1.09)  LDD1617  [1]
 LDCM0414  CL26 HEK-293T C898(1.01); C875(1.05)  LDD1618  [1]
 LDCM0415  CL27 HEK-293T C898(1.34)  LDD1619  [1]
 LDCM0416  CL28 HEK-293T C801(1.23); C898(1.24); C98(0.77); C875(0.94)  LDD1620  [1]
 LDCM0418  CL3 HEK-293T C898(1.07)  LDD1622  [1]
 LDCM0419  CL30 HEK-293T C898(0.87); C713(1.34)  LDD1623  [1]
 LDCM0420  CL31 HEK-293T C801(1.01); C898(1.13); C98(1.02)  LDD1624  [1]
 LDCM0421  CL32 HEK-293T C898(1.07)  LDD1625  [1]
 LDCM0422  CL33 HEK-293T C898(0.83); C98(1.01)  LDD1626  [1]
 LDCM0423  CL34 HEK-293T C898(0.94)  LDD1627  [1]
 LDCM0424  CL35 HEK-293T C898(1.15)  LDD1628  [1]
 LDCM0425  CL36 HEK-293T C801(0.50); C98(1.15); C875(1.24)  LDD1629  [1]
 LDCM0426  CL37 HEK-293T C801(1.04); C898(0.99); C98(0.99)  LDD1630  [1]
 LDCM0428  CL39 HEK-293T C898(1.17)  LDD1632  [1]
 LDCM0429  CL4 HEK-293T C801(1.02); C898(1.11); C98(0.94); C875(1.10)  LDD1633  [1]
 LDCM0430  CL40 HEK-293T C801(1.15); C898(1.25); C98(0.70); C875(1.16)  LDD1634  [1]
 LDCM0432  CL42 HEK-293T C898(1.20); C713(1.26)  LDD1636  [1]
 LDCM0433  CL43 HEK-293T C801(1.03); C898(0.72); C98(0.99)  LDD1637  [1]
 LDCM0434  CL44 HEK-293T C898(1.72)  LDD1638  [1]
 LDCM0435  CL45 HEK-293T C898(0.97); C98(0.98)  LDD1639  [1]
 LDCM0436  CL46 HEK-293T C898(0.78)  LDD1640  [1]
 LDCM0437  CL47 HEK-293T C898(1.25)  LDD1641  [1]
 LDCM0438  CL48 HEK-293T C801(0.91); C98(1.14); C875(1.05)  LDD1642  [1]
 LDCM0439  CL49 HEK-293T C801(1.18); C898(1.12); C98(1.16)  LDD1643  [1]
 LDCM0441  CL50 HEK-293T C898(0.78); C875(1.09)  LDD1645  [1]
 LDCM0443  CL52 HEK-293T C801(1.20); C898(1.08); C98(0.86); C875(1.16)  LDD1646  [1]
 LDCM0445  CL54 HEK-293T C898(0.86); C713(1.33)  LDD1648  [1]
 LDCM0446  CL55 HEK-293T C801(1.01); C898(0.90); C98(1.04)  LDD1649  [1]
 LDCM0447  CL56 HEK-293T C898(1.34)  LDD1650  [1]
 LDCM0448  CL57 HEK-293T C898(1.24); C98(1.23)  LDD1651  [1]
 LDCM0449  CL58 HEK-293T C898(1.01)  LDD1652  [1]
 LDCM0450  CL59 HEK-293T C898(0.91)  LDD1653  [1]
 LDCM0451  CL6 HEK-293T C898(1.24); C713(1.42)  LDD1654  [1]
 LDCM0452  CL60 HEK-293T C801(0.95); C98(1.14); C875(1.10)  LDD1655  [1]
 LDCM0453  CL61 HEK-293T C801(1.04); C898(0.87); C98(1.03)  LDD1656  [1]
 LDCM0454  CL62 HEK-293T C898(1.04); C875(1.14)  LDD1657  [1]
 LDCM0455  CL63 HEK-293T C898(1.16)  LDD1658  [1]
 LDCM0456  CL64 HEK-293T C801(1.06); C898(1.09); C98(0.83); C875(1.08)  LDD1659  [1]
 LDCM0458  CL66 HEK-293T C898(0.85); C713(1.00)  LDD1661  [1]
 LDCM0459  CL67 HEK-293T C801(1.15); C898(0.73); C98(1.18)  LDD1662  [1]
 LDCM0460  CL68 HEK-293T C898(0.91)  LDD1663  [1]
 LDCM0461  CL69 HEK-293T C898(1.02); C98(1.08)  LDD1664  [1]
 LDCM0462  CL7 HEK-293T C801(1.00); C898(0.80); C98(1.08)  LDD1665  [1]
 LDCM0463  CL70 HEK-293T C898(1.12)  LDD1666  [1]
 LDCM0464  CL71 HEK-293T C898(0.90)  LDD1667  [1]
 LDCM0465  CL72 HEK-293T C801(1.05); C98(1.37); C875(1.11)  LDD1668  [1]
 LDCM0466  CL73 HEK-293T C801(1.16); C898(0.95); C98(1.08)  LDD1669  [1]
 LDCM0467  CL74 HEK-293T C898(1.13); C875(1.11)  LDD1670  [1]
 LDCM0469  CL76 HEK-293T C801(1.03); C898(1.34); C98(0.84); C875(0.94)  LDD1672  [1]
 LDCM0471  CL78 HEK-293T C898(1.21); C713(0.98)  LDD1674  [1]
 LDCM0472  CL79 HEK-293T C801(1.04); C898(0.69); C98(0.95)  LDD1675  [1]
 LDCM0473  CL8 HEK-293T C898(1.18)  LDD1676  [1]
 LDCM0474  CL80 HEK-293T C898(1.27)  LDD1677  [1]
 LDCM0475  CL81 HEK-293T C898(1.02); C98(0.99)  LDD1678  [1]
 LDCM0476  CL82 HEK-293T C898(1.16)  LDD1679  [1]
 LDCM0477  CL83 HEK-293T C898(0.98)  LDD1680  [1]
 LDCM0478  CL84 HEK-293T C801(1.04); C98(1.23); C875(1.13)  LDD1681  [1]
 LDCM0479  CL85 HEK-293T C801(1.18); C898(1.59); C98(1.18)  LDD1682  [1]
 LDCM0480  CL86 HEK-293T C898(1.06); C875(1.19)  LDD1683  [1]
 LDCM0481  CL87 HEK-293T C898(1.15)  LDD1684  [1]
 LDCM0482  CL88 HEK-293T C801(1.13); C898(1.28); C98(0.67); C875(1.08)  LDD1685  [1]
 LDCM0484  CL9 HEK-293T C898(1.08); C98(1.18)  LDD1687  [1]
 LDCM0485  CL90 HEK-293T C898(1.40); C713(1.15)  LDD1688  [1]
 LDCM0486  CL91 HEK-293T C801(0.95); C898(0.95); C98(1.23)  LDD1689  [1]
 LDCM0487  CL92 HEK-293T C898(1.61)  LDD1690  [1]
 LDCM0488  CL93 HEK-293T C898(1.09); C98(0.95)  LDD1691  [1]
 LDCM0489  CL94 HEK-293T C898(0.84)  LDD1692  [1]
 LDCM0490  CL95 HEK-293T C898(1.19)  LDD1693  [1]
 LDCM0491  CL96 HEK-293T C801(0.85); C98(0.95); C875(0.98)  LDD1694  [1]
 LDCM0492  CL97 HEK-293T C801(1.13); C898(1.06); C98(1.14)  LDD1695  [1]
 LDCM0493  CL98 HEK-293T C898(0.94); C875(0.86)  LDD1696  [1]
 LDCM0494  CL99 HEK-293T C898(1.24)  LDD1697  [1]
 LDCM0495  E2913 HEK-293T C898(1.37)  LDD1698  [1]
 LDCM0468  Fragment33 HEK-293T C898(1.12)  LDD1671  [1]
 LDCM0427  Fragment51 HEK-293T C898(0.87); C875(1.04)  LDD1631  [1]
 LDCM0022  KB02 HEK-293T C713(0.93); C875(1.14); C98(0.89)  LDD1492  [1]
 LDCM0023  KB03 HEK-293T C713(0.99); C875(1.11); C98(1.21)  LDD1497  [1]
 LDCM0024  KB05 HEK-293T C713(0.95); C875(1.06); C98(1.18)  LDD1502  [1]

The Interaction Atlas With This Target

The Protein(s) Related To This Target

Enzyme
Click To Hide/Show 3 Protein(s) Interacting with This Target
Protein name Family Uniprot ID
UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase 110 kDa subunit (OGT) Glycosyltransferase 41 family O15294
Mitochondrial Rho GTPase 1 (RHOT1) Mitochondrial Rho GTPase family Q8IXI2
Mitochondrial Rho GTPase 2 (RHOT2) Mitochondrial Rho GTPase family Q8IXI1

References

1 Accelerating multiplexed profiling of protein-ligand interactions: High-throughput plate-based reactive cysteine profiling with minimal input. Cell Chem Biol. 2024 Mar 21;31(3):565-576.e4. doi: 10.1016/j.chembiol.2023.11.015. Epub 2023 Dec 19.
Mass spectrometry data entry: PXD044402
2 Targeted Proteomic Approaches for Proteome-Wide Characterizations of the AMP-Binding Capacities of Kinases. J Proteome Res. 2022 Aug 5;21(8):2063-2070. doi: 10.1021/acs.jproteome.2c00225. Epub 2022 Jul 12.
3 N-Acryloylindole-alkyne (NAIA) enables imaging and profiling new ligandable cysteines and oxidized thiols by chemoproteomics. Nat Commun. 2023 Jun 15;14(1):3564. doi: 10.1038/s41467-023-39268-w.
Mass spectrometry data entry: PXD041264
4 Benchmarking Cleavable Biotin Tags for Peptide-Centric Chemoproteomics. J Proteome Res. 2022 May 6;21(5):1349-1358. doi: 10.1021/acs.jproteome.2c00174. Epub 2022 Apr 25.
Mass spectrometry data entry: PXD031019