Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP08403
Target Name E3 ubiquitin-protein ligase MARCHF9 (MARCHF9)
Gene Name MARCHF9
Gene ID 92979
Synonyms
MARCH9; RNF179; E3 ubiquitin-protein ligase MARCHF9; EC 2.3.2.27; Membrane-associated RING finger protein 9; Membrane-associated RING-CH protein IX; MARCH-IX; RING finger protein 179; RING-type E3 ubiquitin transferase MARCHF9
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MLKSRLRMFLNELKLLVLTGGGRPRAEPQPRGGRGGGCGWAPFAGCSTRDGDGDEEEYYG
SEPRARGLAGDKEPRAGPLPPPAPPLPPPGALDALSLSSSLDSGLRTPQCRICFQGPEQG
ELLSPCRCDGSVRCTHQPCLIRWISERGSWSCELCYFKYQVLAISTKNPLQWQAISLTVI
EKVQIAAIVLGSLFLVASISWLIWSSLSPSAKWQRQDLLFQICYGMYGFMDVVCIGLIIH
EGSSVYRIFKRWQAVNQQWKVLNYDKTKDIGGDAGGGTAGKSGPRNSRTGPTSGATSRPP
AAQRMRTLLPQRCGYTILHLLGQLRPPDARSSSHSGREVVMRVTTV
Target Bioclass
Enzyme
Subcellular location
Golgi apparatus membrane
Function
E3 ubiquitin-protein ligase that may mediate ubiquitination of MHC-I, CD4 and ICAM1, and promote their subsequent endocytosis and sorting to lysosomes via multivesicular bodies. E3 ubiquitin ligases accept ubiquitin from an E2 ubiquitin-conjugating enzyme in the form of a thioester and then directly transfer the ubiquitin to targeted substrates.
Uniprot ID
Q86YJ5
Ensemble ID
ENST00000266643.6
HGNC ID
HGNC:25139

Target Site Mutations in Different Cell Lines

Cell line Mutation details Probe for labeling this protein in this cell
MDAMB453 SNV: p.R23G; p.P24A .
MFE296 Insertion: p.R34PfsTer67 .
MOLT4 Insertion: p.R23AfsTer78
SNV: p.R23G		 .
NCIH446 SNV: p.T292P .

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 1 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
DBIA
 Probe Info  		C313(0.94)  LDD1508  [1]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0215  AC10 HEK-293T C313(0.94)  LDD1508  [1]
 LDCM0226  AC11 HEK-293T C313(1.06)  LDD1509  [1]
 LDCM0237  AC12 HEK-293T C313(1.06)  LDD1510  [1]
 LDCM0259  AC14 HEK-293T C313(1.22)  LDD1512  [1]
 LDCM0270  AC15 HEK-293T C113(1.28)  LDD1513  [1]
 LDCM0277  AC18 HEK-293T C313(1.02)  LDD1516  [1]
 LDCM0278  AC19 HEK-293T C313(1.05)  LDD1517  [1]
 LDCM0279  AC2 HEK-293T C313(1.23)  LDD1518  [1]
 LDCM0280  AC20 HEK-293T C313(1.04)  LDD1519  [1]
 LDCM0281  AC21 HEK-293T C313(1.17)  LDD1520  [1]
 LDCM0282  AC22 HEK-293T C313(0.83)  LDD1521  [1]
 LDCM0283  AC23 HEK-293T C113(1.02)  LDD1522  [1]
 LDCM0284  AC24 HEK-293T C313(0.75)  LDD1523  [1]
 LDCM0286  AC26 HEK-293T C313(0.99)  LDD1525  [1]
 LDCM0287  AC27 HEK-293T C313(1.01)  LDD1526  [1]
 LDCM0288  AC28 HEK-293T C313(1.04)  LDD1527  [1]
 LDCM0289  AC29 HEK-293T C313(1.06)  LDD1528  [1]
 LDCM0290  AC3 HEK-293T C313(0.90)  LDD1529  [1]
 LDCM0291  AC30 HEK-293T C313(1.05)  LDD1530  [1]
 LDCM0292  AC31 HEK-293T C113(0.89)  LDD1531  [1]
 LDCM0293  AC32 HEK-293T C313(0.82)  LDD1532  [1]
 LDCM0295  AC34 HEK-293T C313(1.23)  LDD1534  [1]
 LDCM0296  AC35 HEK-293T C313(1.13)  LDD1535  [1]
 LDCM0297  AC36 HEK-293T C313(1.00)  LDD1536  [1]
 LDCM0298  AC37 HEK-293T C313(0.89)  LDD1537  [1]
 LDCM0299  AC38 HEK-293T C313(1.03)  LDD1538  [1]
 LDCM0300  AC39 HEK-293T C113(0.95)  LDD1539  [1]
 LDCM0301  AC4 HEK-293T C313(1.11)  LDD1540  [1]
 LDCM0302  AC40 HEK-293T C313(0.86)  LDD1541  [1]
 LDCM0304  AC42 HEK-293T C313(1.14)  LDD1543  [1]
 LDCM0305  AC43 HEK-293T C313(1.09)  LDD1544  [1]
 LDCM0306  AC44 HEK-293T C313(1.10)  LDD1545  [1]
 LDCM0307  AC45 HEK-293T C313(0.97)  LDD1546  [1]
 LDCM0308  AC46 HEK-293T C313(1.08)  LDD1547  [1]
 LDCM0309  AC47 HEK-293T C113(1.14)  LDD1548  [1]
 LDCM0310  AC48 HEK-293T C313(0.96)  LDD1549  [1]
 LDCM0312  AC5 HEK-293T C313(1.00)  LDD1551  [1]
 LDCM0313  AC50 HEK-293T C313(1.03)  LDD1552  [1]
 LDCM0314  AC51 HEK-293T C313(1.09)  LDD1553  [1]
 LDCM0315  AC52 HEK-293T C313(1.08)  LDD1554  [1]
 LDCM0316  AC53 HEK-293T C313(1.02)  LDD1555  [1]
 LDCM0317  AC54 HEK-293T C313(1.05)  LDD1556  [1]
 LDCM0318  AC55 HEK-293T C113(1.04)  LDD1557  [1]
 LDCM0319  AC56 HEK-293T C313(0.91)  LDD1558  [1]
 LDCM0321  AC58 HEK-293T C313(1.08)  LDD1560  [1]
 LDCM0322  AC59 HEK-293T C313(1.12)  LDD1561  [1]
 LDCM0323  AC6 HEK-293T C313(1.16)  LDD1562  [1]
 LDCM0324  AC60 HEK-293T C313(1.09)  LDD1563  [1]
 LDCM0325  AC61 HEK-293T C313(1.31)  LDD1564  [1]
 LDCM0326  AC62 HEK-293T C313(1.08)  LDD1565  [1]
 LDCM0327  AC63 HEK-293T C113(1.13)  LDD1566  [1]
 LDCM0328  AC64 HEK-293T C313(0.94)  LDD1567  [1]
 LDCM0334  AC7 HEK-293T C113(0.88)  LDD1568  [1]
 LDCM0345  AC8 HEK-293T C313(0.87)  LDD1569  [1]
 LDCM0248  AKOS034007472 HEK-293T C313(1.06)  LDD1511  [1]
 LDCM0275  AKOS034007705 HEK-293T C313(0.95)  LDD1514  [1]
 LDCM0368  CL10 HEK-293T C313(1.15)  LDD1572  [1]
 LDCM0369  CL100 HEK-293T C313(0.87)  LDD1573  [1]
 LDCM0373  CL104 HEK-293T C313(0.92)  LDD1577  [1]
 LDCM0377  CL108 HEK-293T C313(0.94)  LDD1581  [1]
 LDCM0379  CL11 HEK-293T C113(1.14)  LDD1583  [1]
 LDCM0382  CL112 HEK-293T C313(0.86)  LDD1586  [1]
 LDCM0386  CL116 HEK-293T C313(0.90)  LDD1590  [1]
 LDCM0390  CL12 HEK-293T C313(0.92)  LDD1594  [1]
 LDCM0391  CL120 HEK-293T C313(0.89)  LDD1595  [1]
 LDCM0395  CL124 HEK-293T C313(1.13)  LDD1599  [1]
 LDCM0399  CL128 HEK-293T C313(0.96)  LDD1603  [1]
 LDCM0403  CL16 HEK-293T C313(0.89)  LDD1607  [1]
 LDCM0405  CL18 HEK-293T C313(1.02)  LDD1609  [1]
 LDCM0406  CL19 HEK-293T C313(1.04)  LDD1610  [1]
 LDCM0408  CL20 HEK-293T C313(1.05)  LDD1612  [1]
 LDCM0409  CL21 HEK-293T C313(0.98)  LDD1613  [1]
 LDCM0410  CL22 HEK-293T C313(1.09)  LDD1614  [1]
 LDCM0411  CL23 HEK-293T C113(0.91)  LDD1615  [1]
 LDCM0412  CL24 HEK-293T C313(0.96)  LDD1616  [1]
 LDCM0416  CL28 HEK-293T C313(1.10)  LDD1620  [1]
 LDCM0419  CL30 HEK-293T C313(0.96)  LDD1623  [1]
 LDCM0420  CL31 HEK-293T C313(0.96)  LDD1624  [1]
 LDCM0421  CL32 HEK-293T C313(1.09)  LDD1625  [1]
 LDCM0422  CL33 HEK-293T C313(0.84)  LDD1626  [1]
 LDCM0423  CL34 HEK-293T C313(0.90)  LDD1627  [1]
 LDCM0424  CL35 HEK-293T C113(1.09)  LDD1628  [1]
 LDCM0425  CL36 HEK-293T C313(0.80)  LDD1629  [1]
 LDCM0429  CL4 HEK-293T C313(0.79)  LDD1633  [1]
 LDCM0430  CL40 HEK-293T C313(1.02)  LDD1634  [1]
 LDCM0432  CL42 HEK-293T C313(0.92)  LDD1636  [1]
 LDCM0433  CL43 HEK-293T C313(0.97)  LDD1637  [1]
 LDCM0434  CL44 HEK-293T C313(1.07)  LDD1638  [1]
 LDCM0435  CL45 HEK-293T C313(0.95)  LDD1639  [1]
 LDCM0436  CL46 HEK-293T C313(1.14)  LDD1640  [1]
 LDCM0437  CL47 HEK-293T C113(0.99)  LDD1641  [1]
 LDCM0438  CL48 HEK-293T C313(0.83)  LDD1642  [1]
 LDCM0443  CL52 HEK-293T C313(0.73)  LDD1646  [1]
 LDCM0445  CL54 HEK-293T C313(1.02)  LDD1648  [1]
 LDCM0446  CL55 HEK-293T C313(0.84)  LDD1649  [1]
 LDCM0447  CL56 HEK-293T C313(1.03)  LDD1650  [1]
 LDCM0448  CL57 HEK-293T C313(0.88)  LDD1651  [1]
 LDCM0449  CL58 HEK-293T C313(0.98)  LDD1652  [1]
 LDCM0450  CL59 HEK-293T C113(1.11)  LDD1653  [1]
 LDCM0451  CL6 HEK-293T C313(0.97)  LDD1654  [1]
 LDCM0452  CL60 HEK-293T C313(0.84)  LDD1655  [1]
 LDCM0456  CL64 HEK-293T C313(0.88)  LDD1659  [1]
 LDCM0458  CL66 HEK-293T C313(1.13)  LDD1661  [1]
 LDCM0459  CL67 HEK-293T C313(0.95)  LDD1662  [1]
 LDCM0460  CL68 HEK-293T C313(1.03)  LDD1663  [1]
 LDCM0461  CL69 HEK-293T C313(0.96)  LDD1664  [1]
 LDCM0462  CL7 HEK-293T C313(1.01)  LDD1665  [1]
 LDCM0463  CL70 HEK-293T C313(1.03)  LDD1666  [1]
 LDCM0464  CL71 HEK-293T C113(1.08)  LDD1667  [1]
 LDCM0465  CL72 HEK-293T C313(0.78)  LDD1668  [1]
 LDCM0469  CL76 HEK-293T C313(1.05)  LDD1672  [1]
 LDCM0471  CL78 HEK-293T C313(0.84)  LDD1674  [1]
 LDCM0472  CL79 HEK-293T C313(0.95)  LDD1675  [1]
 LDCM0473  CL8 HEK-293T C313(1.29)  LDD1676  [1]
 LDCM0474  CL80 HEK-293T C313(1.13)  LDD1677  [1]
 LDCM0475  CL81 HEK-293T C313(1.03)  LDD1678  [1]
 LDCM0476  CL82 HEK-293T C313(1.10)  LDD1679  [1]
 LDCM0477  CL83 HEK-293T C113(1.02)  LDD1680  [1]
 LDCM0478  CL84 HEK-293T C313(0.83)  LDD1681  [1]
 LDCM0482  CL88 HEK-293T C313(0.84)  LDD1685  [1]
 LDCM0484  CL9 HEK-293T C313(1.06)  LDD1687  [1]
 LDCM0485  CL90 HEK-293T C313(1.32)  LDD1688  [1]
 LDCM0486  CL91 HEK-293T C313(0.90)  LDD1689  [1]
 LDCM0487  CL92 HEK-293T C313(0.99)  LDD1690  [1]
 LDCM0488  CL93 HEK-293T C313(1.12)  LDD1691  [1]
 LDCM0489  CL94 HEK-293T C313(1.08)  LDD1692  [1]
 LDCM0490  CL95 HEK-293T C113(1.62)  LDD1693  [1]
 LDCM0491  CL96 HEK-293T C313(1.16)  LDD1694  [1]

References

1 Accelerating multiplexed profiling of protein-ligand interactions: High-throughput plate-based reactive cysteine profiling with minimal input. Cell Chem Biol. 2024 Mar 21;31(3):565-576.e4. doi: 10.1016/j.chembiol.2023.11.015. Epub 2023 Dec 19.
Mass spectrometry data entry: PXD044402