Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP08373
Target Name E3 ubiquitin-protein ligase RNF130 (RNF130)
Gene Name RNF130
Gene ID 55819
Synonyms
E3 ubiquitin-protein ligase RNF130; EC 2.3.2.27; Goliath homolog; H-Goliath; RING finger protein 130; RING-type E3 ubiquitin transferase RNF130
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MSCAGRAGPARLAALALLTCSLWPARADNASQEYYTALINVTVQEPGRGAPLTFRIDRGR
YGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADHLGCDPQTRFFVPPNIKQWIALLQRGNCTFKEKIS
RAAFHNAVAVVIYNNKSKEEPVTMTHPGTGDIIAVMITELRGKDILSYLEKNISVQMTIA
VGTRMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKIRYTNARDRNQRRLGDAAKK
AISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCKHVFHKSCVDPWLSEHCT
CPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSALGDLAGDNSLGLEPLRTS
GISPLPQDGELTPRTGEINIAVTKEWFIIASFGLLSALTLCYMIIRATASLNANEVEWF
Target Bioclass
Enzyme
Subcellular location
Membrane
Function May have a role during the programmed cell death of hematopoietic cells. Acts as an E3 ubiquitin-protein ligase.
Uniprot ID
Q86XS8
Ensemble ID
ENST00000261947.4
HGNC ID
HGNC:18280

Target Site Mutations in Different Cell Lines

Cell line Mutation details Probe for labeling this protein in this cell
HCT116 SNV: p.S31N .
HCT15 SNV: p.A347V .
IGROV1 SNV: p.P9T .
OVCAR5 SNV: p.L80I .
SNU1 SNV: p.V324A .
WM2664 Insertion: p.F54VfsTer11 .

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 2 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
DBIA
 Probe Info  		C320(1.05)  LDD1507  [1]
IPM
 Probe Info  		N.A.  LDD2156  [2]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0214  AC1 HEK-293T C320(1.05)  LDD1507  [1]
 LDCM0226  AC11 HEK-293T C320(1.17)  LDD1509  [1]
 LDCM0237  AC12 HEK-293T C320(0.98)  LDD1510  [1]
 LDCM0259  AC14 HEK-293T C320(0.87)  LDD1512  [1]
 LDCM0270  AC15 HEK-293T C320(0.90)  LDD1513  [1]
 LDCM0276  AC17 HEK-293T C320(0.89)  LDD1515  [1]
 LDCM0278  AC19 HEK-293T C320(1.09)  LDD1517  [1]
 LDCM0280  AC20 HEK-293T C320(0.93)  LDD1519  [1]
 LDCM0282  AC22 HEK-293T C320(1.05)  LDD1521  [1]
 LDCM0283  AC23 HEK-293T C320(0.86)  LDD1522  [1]
 LDCM0284  AC24 HEK-293T C320(0.93)  LDD1523  [1]
 LDCM0285  AC25 HEK-293T C320(1.19)  LDD1524  [1]
 LDCM0287  AC27 HEK-293T C320(1.10)  LDD1526  [1]
 LDCM0288  AC28 HEK-293T C320(1.04)  LDD1527  [1]
 LDCM0290  AC3 HEK-293T C320(1.03)  LDD1529  [1]
 LDCM0291  AC30 HEK-293T C320(1.08)  LDD1530  [1]
 LDCM0292  AC31 HEK-293T C320(0.96)  LDD1531  [1]
 LDCM0293  AC32 HEK-293T C320(0.97)  LDD1532  [1]
 LDCM0294  AC33 HEK-293T C320(1.15)  LDD1533  [1]
 LDCM0296  AC35 HEK-293T C320(1.04)  LDD1535  [1]
 LDCM0297  AC36 HEK-293T C320(1.02)  LDD1536  [1]
 LDCM0299  AC38 HEK-293T C320(0.84)  LDD1538  [1]
 LDCM0300  AC39 HEK-293T C320(0.98)  LDD1539  [1]
 LDCM0301  AC4 HEK-293T C320(0.95)  LDD1540  [1]
 LDCM0302  AC40 HEK-293T C320(1.01)  LDD1541  [1]
 LDCM0303  AC41 HEK-293T C320(1.27)  LDD1542  [1]
 LDCM0305  AC43 HEK-293T C320(1.21)  LDD1544  [1]
 LDCM0306  AC44 HEK-293T C320(1.02)  LDD1545  [1]
 LDCM0308  AC46 HEK-293T C320(0.90)  LDD1547  [1]
 LDCM0309  AC47 HEK-293T C320(0.99)  LDD1548  [1]
 LDCM0310  AC48 HEK-293T C320(0.95)  LDD1549  [1]
 LDCM0311  AC49 HEK-293T C320(0.96)  LDD1550  [1]
 LDCM0314  AC51 HEK-293T C320(1.08)  LDD1553  [1]
 LDCM0315  AC52 HEK-293T C320(1.03)  LDD1554  [1]
 LDCM0317  AC54 HEK-293T C320(0.83)  LDD1556  [1]
 LDCM0318  AC55 HEK-293T C320(1.06)  LDD1557  [1]
 LDCM0319  AC56 HEK-293T C320(1.01)  LDD1558  [1]
 LDCM0320  AC57 HEK-293T C320(0.99)  LDD1559  [1]
 LDCM0322  AC59 HEK-293T C320(1.07)  LDD1561  [1]
 LDCM0323  AC6 HEK-293T C320(0.70)  LDD1562  [1]
 LDCM0324  AC60 HEK-293T C320(1.10)  LDD1563  [1]
 LDCM0326  AC62 HEK-293T C320(1.00)  LDD1565  [1]
 LDCM0327  AC63 HEK-293T C320(1.23)  LDD1566  [1]
 LDCM0328  AC64 HEK-293T C320(1.04)  LDD1567  [1]
 LDCM0334  AC7 HEK-293T C320(0.89)  LDD1568  [1]
 LDCM0345  AC8 HEK-293T C320(1.04)  LDD1569  [1]
 LDCM0356  AKOS034007680 HEK-293T C320(1.07)  LDD1570  [1]
 LDCM0275  AKOS034007705 HEK-293T C320(1.09)  LDD1514  [1]
 LDCM0367  CL1 HEK-293T C320(1.11)  LDD1571  [1]
 LDCM0368  CL10 HEK-293T C320(1.16)  LDD1572  [1]
 LDCM0369  CL100 HEK-293T C320(1.04)  LDD1573  [1]
 LDCM0370  CL101 HEK-293T C320(0.95)  LDD1574  [1]
 LDCM0373  CL104 HEK-293T C320(1.07)  LDD1577  [1]
 LDCM0374  CL105 HEK-293T C320(1.00)  LDD1578  [1]
 LDCM0377  CL108 HEK-293T C320(1.19)  LDD1581  [1]
 LDCM0378  CL109 HEK-293T C320(0.95)  LDD1582  [1]
 LDCM0379  CL11 HEK-293T C320(0.85)  LDD1583  [1]
 LDCM0382  CL112 HEK-293T C320(1.26)  LDD1586  [1]
 LDCM0383  CL113 HEK-293T C320(0.86)  LDD1587  [1]
 LDCM0386  CL116 HEK-293T C320(1.01)  LDD1590  [1]
 LDCM0387  CL117 HEK-293T C320(0.90)  LDD1591  [1]
 LDCM0390  CL12 HEK-293T C320(1.06)  LDD1594  [1]
 LDCM0391  CL120 HEK-293T C320(1.02)  LDD1595  [1]
 LDCM0392  CL121 HEK-293T C320(0.92)  LDD1596  [1]
 LDCM0395  CL124 HEK-293T C320(1.30)  LDD1599  [1]
 LDCM0396  CL125 HEK-293T C320(1.10)  LDD1600  [1]
 LDCM0399  CL128 HEK-293T C320(1.10)  LDD1603  [1]
 LDCM0400  CL13 HEK-293T C320(0.98)  LDD1604  [1]
 LDCM0403  CL16 HEK-293T C320(0.93)  LDD1607  [1]
 LDCM0404  CL17 HEK-293T C320(1.13)  LDD1608  [1]
 LDCM0406  CL19 HEK-293T C320(1.36)  LDD1610  [1]
 LDCM0408  CL20 HEK-293T C320(0.94)  LDD1612  [1]
 LDCM0410  CL22 HEK-293T C320(0.92)  LDD1614  [1]
 LDCM0411  CL23 HEK-293T C320(1.10)  LDD1615  [1]
 LDCM0412  CL24 HEK-293T C320(1.07)  LDD1616  [1]
 LDCM0413  CL25 HEK-293T C320(0.89)  LDD1617  [1]
 LDCM0416  CL28 HEK-293T C320(1.26)  LDD1620  [1]
 LDCM0417  CL29 HEK-293T C320(1.32)  LDD1621  [1]
 LDCM0420  CL31 HEK-293T C320(1.34)  LDD1624  [1]
 LDCM0421  CL32 HEK-293T C320(1.11)  LDD1625  [1]
 LDCM0423  CL34 HEK-293T C320(1.03)  LDD1627  [1]
 LDCM0424  CL35 HEK-293T C320(1.14)  LDD1628  [1]
 LDCM0425  CL36 HEK-293T C320(1.11)  LDD1629  [1]
 LDCM0426  CL37 HEK-293T C320(0.99)  LDD1630  [1]
 LDCM0429  CL4 HEK-293T C320(1.12)  LDD1633  [1]
 LDCM0430  CL40 HEK-293T C320(0.99)  LDD1634  [1]
 LDCM0431  CL41 HEK-293T C320(1.05)  LDD1635  [1]
 LDCM0433  CL43 HEK-293T C320(1.11)  LDD1637  [1]
 LDCM0434  CL44 HEK-293T C320(0.98)  LDD1638  [1]
 LDCM0436  CL46 HEK-293T C320(1.03)  LDD1640  [1]
 LDCM0437  CL47 HEK-293T C320(1.10)  LDD1641  [1]
 LDCM0438  CL48 HEK-293T C320(1.12)  LDD1642  [1]
 LDCM0439  CL49 HEK-293T C320(0.94)  LDD1643  [1]
 LDCM0440  CL5 HEK-293T C320(1.14)  LDD1644  [1]
 LDCM0443  CL52 HEK-293T C320(0.96)  LDD1646  [1]
 LDCM0444  CL53 HEK-293T C320(1.26)  LDD1647  [1]
 LDCM0446  CL55 HEK-293T C320(1.19)  LDD1649  [1]
 LDCM0447  CL56 HEK-293T C320(1.00)  LDD1650  [1]
 LDCM0449  CL58 HEK-293T C320(1.26)  LDD1652  [1]
 LDCM0450  CL59 HEK-293T C320(0.95)  LDD1653  [1]
 LDCM0452  CL60 HEK-293T C320(1.25)  LDD1655  [1]
 LDCM0453  CL61 HEK-293T C320(0.98)  LDD1656  [1]
 LDCM0456  CL64 HEK-293T C320(1.06)  LDD1659  [1]
 LDCM0457  CL65 HEK-293T C320(1.07)  LDD1660  [1]
 LDCM0459  CL67 HEK-293T C320(1.14)  LDD1662  [1]
 LDCM0460  CL68 HEK-293T C320(1.08)  LDD1663  [1]
 LDCM0462  CL7 HEK-293T C320(1.02)  LDD1665  [1]
 LDCM0463  CL70 HEK-293T C320(1.14)  LDD1666  [1]
 LDCM0464  CL71 HEK-293T C320(1.03)  LDD1667  [1]
 LDCM0465  CL72 HEK-293T C320(1.19)  LDD1668  [1]
 LDCM0466  CL73 HEK-293T C320(1.06)  LDD1669  [1]
 LDCM0469  CL76 HEK-293T C320(1.10)  LDD1672  [1]
 LDCM0470  CL77 HEK-293T C320(1.00)  LDD1673  [1]
 LDCM0472  CL79 HEK-293T C320(1.11)  LDD1675  [1]
 LDCM0473  CL8 HEK-293T C320(0.87)  LDD1676  [1]
 LDCM0474  CL80 HEK-293T C320(1.03)  LDD1677  [1]
 LDCM0476  CL82 HEK-293T C320(0.97)  LDD1679  [1]
 LDCM0477  CL83 HEK-293T C320(1.16)  LDD1680  [1]
 LDCM0478  CL84 HEK-293T C320(1.07)  LDD1681  [1]
 LDCM0479  CL85 HEK-293T C320(1.17)  LDD1682  [1]
 LDCM0482  CL88 HEK-293T C320(1.20)  LDD1685  [1]
 LDCM0483  CL89 HEK-293T C320(1.14)  LDD1686  [1]
 LDCM0486  CL91 HEK-293T C320(1.01)  LDD1689  [1]
 LDCM0487  CL92 HEK-293T C320(1.08)  LDD1690  [1]
 LDCM0489  CL94 HEK-293T C320(0.86)  LDD1692  [1]
 LDCM0490  CL95 HEK-293T C320(0.93)  LDD1693  [1]
 LDCM0491  CL96 HEK-293T C320(1.04)  LDD1694  [1]
 LDCM0492  CL97 HEK-293T C320(1.01)  LDD1695  [1]

References

1 Accelerating multiplexed profiling of protein-ligand interactions: High-throughput plate-based reactive cysteine profiling with minimal input. Cell Chem Biol. 2024 Mar 21;31(3):565-576.e4. doi: 10.1016/j.chembiol.2023.11.015. Epub 2023 Dec 19.
Mass spectrometry data entry: PXD044402
2 Benchmarking Cleavable Biotin Tags for Peptide-Centric Chemoproteomics. J Proteome Res. 2022 May 6;21(5):1349-1358. doi: 10.1021/acs.jproteome.2c00174. Epub 2022 Apr 25.
Mass spectrometry data entry: PXD031019