Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP06924
Target Name INO80 complex subunit D (INO80D)
Gene Name INO80D
Gene ID 54891
Synonyms
INO80 complex subunit D
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MYEGKHIHFSEVDNKPLCSYSPKLCKQRRLNGYAFCIRHVLEDKTAPFKQCEYVAKYNSQ
RCTNPIPKSEDRRYCNSHLQVLGFIPKKERKKKNDPIDEVKVRHQMDTMAFSLTVPTLAL
KMPNGLDGMSLSPPGARVPLHYLETELEDPFAFNEEDDDLKKGATVRKKLQSKLAQNRQR
QRETEILKVRQEHFSPPPAPSQQQPPQQHSHLSPLSTSLKPPAPPQGSVCKSPQPQNTSL
PMQGVAPTTHTIAQARQLSHKRPLPLLPSSRAPTVDPPRTDRILMKATAFSPHFSCISRL
QRLVKLCTQKHQLDTDLFPHLGLDWSEESGEEPEDSEQASPYQVAWSIRETLRYQRHASD
DDDAESRSSRVTQLCTYFQQKYKHLCRLERAESRQKKCRHTFRKALLQAASKEPECTGQL
IQELRRAACSRTSISRTKLREVEPAACSGTVKGEQCANKALPFTRHCFQHILLNHSQQLF
SSCTAKFADGQQCSVPVFDITHQTPLCEEHAKKMDNFLRGDNSRKVQHQQQRKPRKKTKP
PALTKKHKKKRRRGPRRPQKPIPPAVPQGNLSMPASVSLPVEASHIRSPSTPELSADELP
DDIANEITDIPHDLELNQEDFSDVLPRLPDDLQDFDFFEGKNGDLLPTTEEAEELERALQ
AVTSLECLSTIGVLAQSDGVPVQELSDRGIGVFSTGTGASGIQSLSREVNTDLGELLNGR
IVHDNFSSLELDENLLRSATLSNPPTPLAGQIQGQFSAPANVGLTSATLISQSALGERAF
PGQFHGLHDGSHASQRPHPAQLLSKADDLITSRQQYSSDHSHSSPHGSHYDSEHVPSPYS
DHITSPHTTSYSGDNMAATFSAEMPIMAQHLLPTQLEVPLGGVVNPRTHWGNLPVNLGDP
SPFSNLLGADGHLLSTSLSTPPTTSNSETTQPAFATVTPSSSSVLPGLPQTSFSGMGPSA
ELMASTSPKQQLPQFSAAFGHQLSSHSGIPKDLQPSHSSIAPPTGFTVTGATATSTNNAS
SPFPSPN
Target Bioclass
Other
Family
INO80D family
Subcellular location
Nucleus
Function Putative regulatory component of the chromatin remodeling INO80 complex which is involved in transcriptional regulation, DNA replication and probably DNA repair.
Uniprot ID
Q53TQ3
Ensemble ID
ENST00000403263.6
HGNC ID
HGNC:25997

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 3 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
IA-alkyne
 Probe Info  		C296(7.09); C416(5.13)  LDD1704  [1]
DBIA
 Probe Info  		C667(0.99); C416(0.96)  LDD1507  [2]
IPM
 Probe Info  		N.A.  LDD0147  [3]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0214  AC1 HEK-293T C667(0.99); C416(0.96)  LDD1507  [2]
 LDCM0215  AC10 HEK-293T C416(1.21)  LDD1508  [2]
 LDCM0226  AC11 HEK-293T C375(1.06)  LDD1509  [2]
 LDCM0237  AC12 HEK-293T C375(0.94)  LDD1510  [2]
 LDCM0259  AC14 HEK-293T C667(1.15); C416(0.82)  LDD1512  [2]
 LDCM0270  AC15 HEK-293T C667(0.92)  LDD1513  [2]
 LDCM0276  AC17 HEK-293T C667(1.13); C416(1.04)  LDD1515  [2]
 LDCM0277  AC18 HEK-293T C416(0.97)  LDD1516  [2]
 LDCM0278  AC19 HEK-293T C375(1.03)  LDD1517  [2]
 LDCM0279  AC2 HEK-293T C416(1.02)  LDD1518  [2]
 LDCM0280  AC20 HEK-293T C375(0.92)  LDD1519  [2]
 LDCM0281  AC21 HEK-293T C416(0.96)  LDD1520  [2]
 LDCM0282  AC22 HEK-293T C667(0.96); C416(1.19)  LDD1521  [2]
 LDCM0283  AC23 HEK-293T C667(0.84)  LDD1522  [2]
 LDCM0284  AC24 HEK-293T C667(1.23); C416(0.81)  LDD1523  [2]
 LDCM0285  AC25 HEK-293T C667(1.20); C416(0.90)  LDD1524  [2]
 LDCM0286  AC26 HEK-293T C416(1.06)  LDD1525  [2]
 LDCM0287  AC27 HEK-293T C375(1.03)  LDD1526  [2]
 LDCM0288  AC28 HEK-293T C375(1.01)  LDD1527  [2]
 LDCM0289  AC29 HEK-293T C416(1.01)  LDD1528  [2]
 LDCM0290  AC3 HEK-293T C375(1.19)  LDD1529  [2]
 LDCM0291  AC30 HEK-293T C667(1.05); C416(1.15)  LDD1530  [2]
 LDCM0292  AC31 HEK-293T C667(1.07)  LDD1531  [2]
 LDCM0293  AC32 HEK-293T C667(1.32); C416(0.78)  LDD1532  [2]
 LDCM0294  AC33 HEK-293T C667(1.14); C416(0.82)  LDD1533  [2]
 LDCM0295  AC34 HEK-293T C416(0.96)  LDD1534  [2]
 LDCM0296  AC35 HEK-293T C375(1.02)  LDD1535  [2]
 LDCM0297  AC36 HEK-293T C375(0.99)  LDD1536  [2]
 LDCM0298  AC37 HEK-293T C416(0.88)  LDD1537  [2]
 LDCM0299  AC38 HEK-293T C667(1.00); C416(1.12)  LDD1538  [2]
 LDCM0300  AC39 HEK-293T C667(0.99)  LDD1539  [2]
 LDCM0301  AC4 HEK-293T C375(0.97)  LDD1540  [2]
 LDCM0302  AC40 HEK-293T C667(1.37); C416(0.94)  LDD1541  [2]
 LDCM0303  AC41 HEK-293T C667(1.10); C416(0.85)  LDD1542  [2]
 LDCM0304  AC42 HEK-293T C416(0.98)  LDD1543  [2]
 LDCM0305  AC43 HEK-293T C375(0.91)  LDD1544  [2]
 LDCM0306  AC44 HEK-293T C375(0.94)  LDD1545  [2]
 LDCM0307  AC45 HEK-293T C416(0.98)  LDD1546  [2]
 LDCM0308  AC46 HEK-293T C667(1.04); C416(1.10)  LDD1547  [2]
 LDCM0309  AC47 HEK-293T C667(1.39)  LDD1548  [2]
 LDCM0310  AC48 HEK-293T C667(1.17); C416(1.00)  LDD1549  [2]
 LDCM0311  AC49 HEK-293T C667(1.34); C416(1.03)  LDD1550  [2]
 LDCM0312  AC5 HEK-293T C416(0.88)  LDD1551  [2]
 LDCM0313  AC50 HEK-293T C416(0.93)  LDD1552  [2]
 LDCM0314  AC51 HEK-293T C375(1.02)  LDD1553  [2]
 LDCM0315  AC52 HEK-293T C375(0.96)  LDD1554  [2]
 LDCM0316  AC53 HEK-293T C416(0.95)  LDD1555  [2]
 LDCM0317  AC54 HEK-293T C667(0.97); C416(1.26)  LDD1556  [2]
 LDCM0318  AC55 HEK-293T C667(1.12)  LDD1557  [2]
 LDCM0319  AC56 HEK-293T C667(1.18); C416(0.86)  LDD1558  [2]
 LDCM0320  AC57 HEK-293T C667(1.18); C416(0.99)  LDD1559  [2]
 LDCM0321  AC58 HEK-293T C416(0.81)  LDD1560  [2]
 LDCM0322  AC59 HEK-293T C375(1.05)  LDD1561  [2]
 LDCM0323  AC6 HEK-293T C667(1.15); C416(1.06)  LDD1562  [2]
 LDCM0324  AC60 HEK-293T C375(0.96)  LDD1563  [2]
 LDCM0325  AC61 HEK-293T C416(0.90)  LDD1564  [2]
 LDCM0326  AC62 HEK-293T C667(1.16); C416(0.98)  LDD1565  [2]
 LDCM0327  AC63 HEK-293T C667(0.93)  LDD1566  [2]
 LDCM0328  AC64 HEK-293T C667(1.15); C416(0.93)  LDD1567  [2]
 LDCM0334  AC7 HEK-293T C667(0.95)  LDD1568  [2]
 LDCM0345  AC8 HEK-293T C667(1.21); C416(0.95)  LDD1569  [2]
 LDCM0248  AKOS034007472 HEK-293T C416(0.92)  LDD1511  [2]
 LDCM0356  AKOS034007680 HEK-293T C667(1.19); C416(0.89)  LDD1570  [2]
 LDCM0275  AKOS034007705 HEK-293T C667(1.08); C416(0.74)  LDD1514  [2]
 LDCM0368  CL10 HEK-293T C667(0.97); C416(1.76)  LDD1572  [2]
 LDCM0369  CL100 HEK-293T C667(1.02)  LDD1573  [2]
 LDCM0371  CL102 HEK-293T C667(0.99); C375(1.18)  LDD1575  [2]
 LDCM0372  CL103 HEK-293T C667(1.13)  LDD1576  [2]
 LDCM0373  CL104 HEK-293T C667(1.00)  LDD1577  [2]
 LDCM0375  CL106 HEK-293T C667(1.02); C375(0.98)  LDD1579  [2]
 LDCM0376  CL107 HEK-293T C667(1.33)  LDD1580  [2]
 LDCM0377  CL108 HEK-293T C667(0.81)  LDD1581  [2]
 LDCM0379  CL11 HEK-293T C667(0.92)  LDD1583  [2]
 LDCM0380  CL110 HEK-293T C667(0.87); C375(1.09)  LDD1584  [2]
 LDCM0381  CL111 HEK-293T C667(1.21)  LDD1585  [2]
 LDCM0382  CL112 HEK-293T C667(0.98)  LDD1586  [2]
 LDCM0384  CL114 HEK-293T C667(0.84); C375(1.23)  LDD1588  [2]
 LDCM0385  CL115 HEK-293T C667(1.45)  LDD1589  [2]
 LDCM0386  CL116 HEK-293T C667(1.04)  LDD1590  [2]
 LDCM0388  CL118 HEK-293T C667(0.77); C375(1.01)  LDD1592  [2]
 LDCM0389  CL119 HEK-293T C667(1.62)  LDD1593  [2]
 LDCM0390  CL12 HEK-293T C667(1.58); C416(0.78)  LDD1594  [2]
 LDCM0391  CL120 HEK-293T C667(1.22)  LDD1595  [2]
 LDCM0393  CL122 HEK-293T C667(0.90); C375(1.16)  LDD1597  [2]
 LDCM0394  CL123 HEK-293T C667(1.49)  LDD1598  [2]
 LDCM0395  CL124 HEK-293T C667(0.95)  LDD1599  [2]
 LDCM0397  CL126 HEK-293T C667(0.80); C375(1.07)  LDD1601  [2]
 LDCM0398  CL127 HEK-293T C667(1.32)  LDD1602  [2]
 LDCM0399  CL128 HEK-293T C667(0.97)  LDD1603  [2]
 LDCM0401  CL14 HEK-293T C667(1.07); C375(1.02)  LDD1605  [2]
 LDCM0402  CL15 HEK-293T C667(1.25)  LDD1606  [2]
 LDCM0403  CL16 HEK-293T C667(0.96)  LDD1607  [2]
 LDCM0404  CL17 HEK-293T C667(1.64); C416(1.41)  LDD1608  [2]
 LDCM0405  CL18 HEK-293T C416(1.18)  LDD1609  [2]
 LDCM0406  CL19 HEK-293T C375(0.70)  LDD1610  [2]
 LDCM0407  CL2 HEK-293T C667(1.02); C375(1.13)  LDD1611  [2]
 LDCM0408  CL20 HEK-293T C375(0.73)  LDD1612  [2]
 LDCM0409  CL21 HEK-293T C416(1.22)  LDD1613  [2]
 LDCM0410  CL22 HEK-293T C667(1.05); C416(1.09)  LDD1614  [2]
 LDCM0411  CL23 HEK-293T C667(1.11)  LDD1615  [2]
 LDCM0412  CL24 HEK-293T C667(1.68); C416(0.95)  LDD1616  [2]
 LDCM0414  CL26 HEK-293T C667(0.89); C375(1.03)  LDD1618  [2]
 LDCM0415  CL27 HEK-293T C667(1.18)  LDD1619  [2]
 LDCM0416  CL28 HEK-293T C667(1.10)  LDD1620  [2]
 LDCM0417  CL29 HEK-293T C667(1.25); C416(1.00)  LDD1621  [2]
 LDCM0418  CL3 HEK-293T C667(1.76)  LDD1622  [2]
 LDCM0419  CL30 HEK-293T C416(1.10)  LDD1623  [2]
 LDCM0420  CL31 HEK-293T C375(0.84)  LDD1624  [2]
 LDCM0421  CL32 HEK-293T C375(0.65)  LDD1625  [2]
 LDCM0422  CL33 HEK-293T C416(1.29)  LDD1626  [2]
 LDCM0423  CL34 HEK-293T C667(1.07); C416(1.11)  LDD1627  [2]
 LDCM0424  CL35 HEK-293T C667(1.13)  LDD1628  [2]
 LDCM0425  CL36 HEK-293T C667(1.47); C416(0.90)  LDD1629  [2]
 LDCM0428  CL39 HEK-293T C667(1.31)  LDD1632  [2]
 LDCM0429  CL4 HEK-293T C667(1.07)  LDD1633  [2]
 LDCM0430  CL40 HEK-293T C667(0.90)  LDD1634  [2]
 LDCM0431  CL41 HEK-293T C667(1.49); C416(1.06)  LDD1635  [2]
 LDCM0432  CL42 HEK-293T C416(1.23)  LDD1636  [2]
 LDCM0433  CL43 HEK-293T C375(0.78)  LDD1637  [2]
 LDCM0434  CL44 HEK-293T C375(0.67)  LDD1638  [2]
 LDCM0435  CL45 HEK-293T C416(1.09)  LDD1639  [2]
 LDCM0436  CL46 HEK-293T C667(0.81); C416(1.10)  LDD1640  [2]
 LDCM0437  CL47 HEK-293T C667(0.95)  LDD1641  [2]
 LDCM0438  CL48 HEK-293T C667(1.54); C416(0.88)  LDD1642  [2]
 LDCM0440  CL5 HEK-293T C667(1.63); C416(1.22)  LDD1644  [2]
 LDCM0441  CL50 HEK-293T C667(1.08); C375(1.10)  LDD1645  [2]
 LDCM0443  CL52 HEK-293T C667(1.09)  LDD1646  [2]
 LDCM0444  CL53 HEK-293T C667(1.49); C416(1.13)  LDD1647  [2]
 LDCM0445  CL54 HEK-293T C416(1.49)  LDD1648  [2]
 LDCM0446  CL55 HEK-293T C375(0.71)  LDD1649  [2]
 LDCM0447  CL56 HEK-293T C375(0.68)  LDD1650  [2]
 LDCM0448  CL57 HEK-293T C416(1.17)  LDD1651  [2]
 LDCM0449  CL58 HEK-293T C667(0.95); C416(1.38)  LDD1652  [2]
 LDCM0450  CL59 HEK-293T C667(0.90)  LDD1653  [2]
 LDCM0451  CL6 HEK-293T C416(1.28)  LDD1654  [2]
 LDCM0452  CL60 HEK-293T C667(1.46); C416(1.17)  LDD1655  [2]
 LDCM0454  CL62 HEK-293T C667(0.91); C375(1.16)  LDD1657  [2]
 LDCM0455  CL63 HEK-293T C667(1.62)  LDD1658  [2]
 LDCM0456  CL64 HEK-293T C667(1.01)  LDD1659  [2]
 LDCM0457  CL65 HEK-293T C667(1.21); C416(0.95)  LDD1660  [2]
 LDCM0458  CL66 HEK-293T C416(1.11)  LDD1661  [2]
 LDCM0459  CL67 HEK-293T C375(0.81)  LDD1662  [2]
 LDCM0460  CL68 HEK-293T C375(0.76)  LDD1663  [2]
 LDCM0461  CL69 HEK-293T C416(1.01)  LDD1664  [2]
 LDCM0462  CL7 HEK-293T C375(0.89)  LDD1665  [2]
 LDCM0463  CL70 HEK-293T C667(1.07); C416(1.31)  LDD1666  [2]
 LDCM0464  CL71 HEK-293T C667(0.99)  LDD1667  [2]
 LDCM0465  CL72 HEK-293T C667(1.59); C416(1.08)  LDD1668  [2]
 LDCM0467  CL74 HEK-293T C667(1.13); C375(1.07)  LDD1670  [2]
 LDCM0469  CL76 HEK-293T C667(1.05)  LDD1672  [2]
 LDCM0470  CL77 HEK-293T C667(1.33); C416(1.30)  LDD1673  [2]
 LDCM0471  CL78 HEK-293T C416(0.91)  LDD1674  [2]
 LDCM0472  CL79 HEK-293T C375(0.89)  LDD1675  [2]
 LDCM0473  CL8 HEK-293T C375(0.72)  LDD1676  [2]
 LDCM0474  CL80 HEK-293T C375(0.75)  LDD1677  [2]
 LDCM0475  CL81 HEK-293T C416(1.05)  LDD1678  [2]
 LDCM0476  CL82 HEK-293T C667(0.98); C416(0.98)  LDD1679  [2]
 LDCM0477  CL83 HEK-293T C667(0.79)  LDD1680  [2]
 LDCM0478  CL84 HEK-293T C667(1.41); C416(1.37)  LDD1681  [2]
 LDCM0480  CL86 HEK-293T C667(0.94); C375(1.21)  LDD1683  [2]
 LDCM0481  CL87 HEK-293T C667(1.91)  LDD1684  [2]
 LDCM0482  CL88 HEK-293T C667(0.96)  LDD1685  [2]
 LDCM0483  CL89 HEK-293T C667(1.50); C416(0.85)  LDD1686  [2]
 LDCM0484  CL9 HEK-293T C416(1.03)  LDD1687  [2]
 LDCM0485  CL90 HEK-293T C416(1.78)  LDD1688  [2]
 LDCM0486  CL91 HEK-293T C375(1.20)  LDD1689  [2]
 LDCM0487  CL92 HEK-293T C375(0.84)  LDD1690  [2]
 LDCM0488  CL93 HEK-293T C416(1.20)  LDD1691  [2]
 LDCM0489  CL94 HEK-293T C667(1.09); C416(1.18)  LDD1692  [2]
 LDCM0490  CL95 HEK-293T C667(0.84)  LDD1693  [2]
 LDCM0491  CL96 HEK-293T C667(1.43); C416(0.99)  LDD1694  [2]
 LDCM0493  CL98 HEK-293T C667(1.00); C375(1.08)  LDD1696  [2]
 LDCM0494  CL99 HEK-293T C667(1.49)  LDD1697  [2]
 LDCM0495  E2913 HEK-293T C667(1.73)  LDD1698  [2]
 LDCM0468  Fragment33 HEK-293T C667(1.39)  LDD1671  [2]
 LDCM0427  Fragment51 HEK-293T C667(1.06); C375(1.05)  LDD1631  [2]
 LDCM0022  KB02 T cell-activated C296(7.09); C416(5.13)  LDD1704  [1]
 LDCM0023  KB03 22RV1 C667(0.74)  LDD2660  [4]
 LDCM0024  KB05 T cell-activated C375(5.64)  LDD1706  [1]

References

1 An Activity-Guided Map of Electrophile-Cysteine Interactions in Primary Human T Cells. Cell. 2020 Aug 20;182(4):1009-1026.e29. doi: 10.1016/j.cell.2020.07.001. Epub 2020 Jul 29.
2 Accelerating multiplexed profiling of protein-ligand interactions: High-throughput plate-based reactive cysteine profiling with minimal input. Cell Chem Biol. 2024 Mar 21;31(3):565-576.e4. doi: 10.1016/j.chembiol.2023.11.015. Epub 2023 Dec 19.
Mass spectrometry data entry: PXD044402
3 Chemoproteomic Profiling by Cysteine Fluoroalkylation Reveals Myrocin G as an Inhibitor of the Nonhomologous End Joining DNA Repair Pathway. J Am Chem Soc. 2021 Dec 8;143(48):20332-20342. doi: 10.1021/jacs.1c09724. Epub 2021 Nov 24.
Mass spectrometry data entry: PXD029255
4 DrugMap: A quantitative pan-cancer analysis of cysteine ligandability. Cell. 2024 May 9;187(10):2536-2556.e30. doi: 10.1016/j.cell.2024.03.027. Epub 2024 Apr 22.
Mass spectrometry data entry: PXD047840