Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP01925
Target Name Collagen alpha-1(II) chain (COL2A1)
Gene Name COL2A1
Gene ID 1280
Synonyms
Collagen alpha-1(II) chain; Alpha-1 type II collagen) [Cleaved into: Collagen alpha-1(II) chain; Chondrocalcin]
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MIRLGAPQTLVLLTLLVAAVLRCQGQDVQEAGSCVQDGQRYNDKDVWKPEPCRICVCDTG
TVLCDDIICEDVKDCLSPEIPFGECCPICPTDLATASGQPGPKGQKGEPGDIKDIVGPKG
PPGPQGPAGEQGPRGDRGDKGEKGAPGPRGRDGEPGTPGNPGPPGPPGPPGPPGLGGNFA
AQMAGGFDEKAGGAQLGVMQGPMGPMGPRGPPGPAGAPGPQGFQGNPGEPGEPGVSGPMG
PRGPPGPPGKPGDDGEAGKPGKAGERGPPGPQGARGFPGTPGLPGVKGHRGYPGLDGAKG
EAGAPGVKGESGSPGENGSPGPMGPRGLPGERGRTGPAGAAGARGNDGQPGPAGPPGPVG
PAGGPGFPGAPGAKGEAGPTGARGPEGAQGPRGEPGTPGSPGPAGASGNPGTDGIPGAKG
SAGAPGIAGAPGFPGPRGPPGPQGATGPLGPKGQTGEPGIAGFKGEQGPKGEPGPAGPQG
APGPAGEEGKRGARGEPGGVGPIGPPGERGAPGNRGFPGQDGLAGPKGAPGERGPSGLAG
PKGANGDPGRPGEPGLPGARGLTGRPGDAGPQGKVGPSGAPGEDGRPGPPGPQGARGQPG
VMGFPGPKGANGEPGKAGEKGLPGAPGLRGLPGKDGETGAAGPPGPAGPAGERGEQGAPG
PSGFQGLPGPPGPPGEGGKPGDQGVPGEAGAPGLVGPRGERGFPGERGSPGAQGLQGPRG
LPGTPGTDGPKGASGPAGPPGAQGPPGLQGMPGERGAAGIAGPKGDRGDVGEKGPEGAPG
KDGGRGLTGPIGPPGPAGANGEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPG
ADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPG
AAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPG
DDGPSGAEGPPGPQGLAGQRGIVGLPGQRGERGFPGLPGPSGEPGKQGAPGASGDRGPPG
PVGPPGLTGPAGEPGREGSPGADGPPGRDGAAGVKGDRGETGAVGAPGAPGPPGSPGPAG
PTGKQGDRGEAGAQGPMGPSGPAGARGIQGPQGPRGDKGEAGEPGERGLKGHRGFTGLQG
LPGPPGPSGDQGASGPAGPSGPRGPPGPVGPSGKDGANGIPGPIGPPGPRGRSGETGPAG
PPGNPGPPGPPGPPGPGIDMSAFAGLGPREKGPDPLQYMRADQAAGGLRQHDAEVDATLK
SLNNQIESIRSPEGSRKNPARTCRDLKLCHPEWKSGDYWIDPNQGCTLDAMKVFCNMETG
ETCVYPNPANVPKKNWWSSKSKEKKHIWFGETINGGFHFSYGDDNLAPNTANVQMTFLRL
LSTEGSQNITYHCKNSIAYLDEAAGNLKKALLIQGSNDVEIRAEGNSRFTYTALKDGCTK
HTGKWGKTVIEYRSQKTSRLPIIDIAPMDIGGPEQEFGVDIGPVCFL
Target Bioclass
Other
Family
Fibrillar collagen family
Subcellular location
Secreted, extracellular space, extracellular matrix
Function
Type II collagen is specific for cartilaginous tissues. It is essential for the normal embryonic development of the skeleton, for linear growth and for the ability of cartilage to resist compressive forces.
Uniprot ID
P02458
Ensemble ID
ENST00000337299.7
HGNC ID
HGNC:2200
ChEMBL ID
CHEMBL5169108

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 2 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
DBIA
 Probe Info  		C1289(1.04); C1306(0.90)  LDD1492  [1]
HHS-465
 Probe Info  		N.A.  LDD2240  [2]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0214  AC1 HEK-293T C1289(1.03)  LDD1507  [1]
 LDCM0215  AC10 HEK-293T C1289(1.01)  LDD1508  [1]
 LDCM0226  AC11 HEK-293T C1289(1.02)  LDD1509  [1]
 LDCM0237  AC12 HEK-293T C1289(0.94)  LDD1510  [1]
 LDCM0259  AC14 HEK-293T C1289(0.97); C1306(1.21)  LDD1512  [1]
 LDCM0276  AC17 HEK-293T C1289(1.09)  LDD1515  [1]
 LDCM0277  AC18 HEK-293T C1289(0.97)  LDD1516  [1]
 LDCM0278  AC19 HEK-293T C1289(1.00)  LDD1517  [1]
 LDCM0279  AC2 HEK-293T C1289(1.10)  LDD1518  [1]
 LDCM0280  AC20 HEK-293T C1289(0.96)  LDD1519  [1]
 LDCM0281  AC21 HEK-293T C1289(0.99); C1306(1.19)  LDD1520  [1]
 LDCM0282  AC22 HEK-293T C1289(0.98); C1306(1.46)  LDD1521  [1]
 LDCM0284  AC24 HEK-293T C1289(0.94)  LDD1523  [1]
 LDCM0285  AC25 HEK-293T C1289(1.08)  LDD1524  [1]
 LDCM0286  AC26 HEK-293T C1289(0.96)  LDD1525  [1]
 LDCM0287  AC27 HEK-293T C1289(0.98)  LDD1526  [1]
 LDCM0288  AC28 HEK-293T C1289(0.93)  LDD1527  [1]
 LDCM0289  AC29 HEK-293T C1289(1.01); C1306(1.03)  LDD1528  [1]
 LDCM0290  AC3 HEK-293T C1289(1.04)  LDD1529  [1]
 LDCM0291  AC30 HEK-293T C1289(0.99); C1306(1.36)  LDD1530  [1]
 LDCM0293  AC32 HEK-293T C1289(1.07)  LDD1532  [1]
 LDCM0294  AC33 HEK-293T C1289(1.04)  LDD1533  [1]
 LDCM0295  AC34 HEK-293T C1289(1.03)  LDD1534  [1]
 LDCM0296  AC35 HEK-293T C1289(0.97)  LDD1535  [1]
 LDCM0297  AC36 HEK-293T C1289(0.91)  LDD1536  [1]
 LDCM0298  AC37 HEK-293T C1289(1.00); C1306(1.12)  LDD1537  [1]
 LDCM0299  AC38 HEK-293T C1289(0.98); C1306(1.39)  LDD1538  [1]
 LDCM0301  AC4 HEK-293T C1289(1.00)  LDD1540  [1]
 LDCM0302  AC40 HEK-293T C1289(1.02)  LDD1541  [1]
 LDCM0303  AC41 HEK-293T C1289(0.99)  LDD1542  [1]
 LDCM0304  AC42 HEK-293T C1289(1.04)  LDD1543  [1]
 LDCM0305  AC43 HEK-293T C1289(1.10)  LDD1544  [1]
 LDCM0306  AC44 HEK-293T C1289(0.95)  LDD1545  [1]
 LDCM0307  AC45 HEK-293T C1289(1.02); C1306(1.10)  LDD1546  [1]
 LDCM0308  AC46 HEK-293T C1289(0.93); C1306(1.16)  LDD1547  [1]
 LDCM0310  AC48 HEK-293T C1289(1.07)  LDD1549  [1]
 LDCM0311  AC49 HEK-293T C1289(1.04)  LDD1550  [1]
 LDCM0312  AC5 HEK-293T C1289(0.97); C1306(0.88)  LDD1551  [1]
 LDCM0313  AC50 HEK-293T C1289(1.03)  LDD1552  [1]
 LDCM0314  AC51 HEK-293T C1289(1.05)  LDD1553  [1]
 LDCM0315  AC52 HEK-293T C1289(0.97)  LDD1554  [1]
 LDCM0316  AC53 HEK-293T C1289(1.02); C1306(1.36)  LDD1555  [1]
 LDCM0317  AC54 HEK-293T C1289(0.99); C1306(1.06)  LDD1556  [1]
 LDCM0319  AC56 HEK-293T C1289(1.04)  LDD1558  [1]
 LDCM0320  AC57 HEK-293T C1289(1.05)  LDD1559  [1]
 LDCM0321  AC58 HEK-293T C1289(1.04)  LDD1560  [1]
 LDCM0322  AC59 HEK-293T C1289(1.05)  LDD1561  [1]
 LDCM0323  AC6 HEK-293T C1289(0.92); C1306(1.70)  LDD1562  [1]
 LDCM0324  AC60 HEK-293T C1289(0.93)  LDD1563  [1]
 LDCM0325  AC61 HEK-293T C1289(1.04); C1306(0.91)  LDD1564  [1]
 LDCM0326  AC62 HEK-293T C1289(0.91); C1306(1.42)  LDD1565  [1]
 LDCM0328  AC64 HEK-293T C1289(1.05)  LDD1567  [1]
 LDCM0345  AC8 HEK-293T C1289(1.06)  LDD1569  [1]
 LDCM0248  AKOS034007472 HEK-293T C1289(1.00); C1306(1.13)  LDD1511  [1]
 LDCM0356  AKOS034007680 HEK-293T C1289(0.97)  LDD1570  [1]
 LDCM0275  AKOS034007705 HEK-293T C1289(1.03)  LDD1514  [1]
 LDCM0367  CL1 HEK-293T C1289(1.04)  LDD1571  [1]
 LDCM0368  CL10 HEK-293T C1289(0.98); C1306(1.60)  LDD1572  [1]
 LDCM0369  CL100 HEK-293T C1289(0.93)  LDD1573  [1]
 LDCM0370  CL101 HEK-293T C1289(1.00)  LDD1574  [1]
 LDCM0372  CL103 HEK-293T C1289(0.97)  LDD1576  [1]
 LDCM0373  CL104 HEK-293T C1289(1.03)  LDD1577  [1]
 LDCM0374  CL105 HEK-293T C1289(1.07)  LDD1578  [1]
 LDCM0376  CL107 HEK-293T C1289(1.02)  LDD1580  [1]
 LDCM0377  CL108 HEK-293T C1289(0.96)  LDD1581  [1]
 LDCM0378  CL109 HEK-293T C1289(1.01)  LDD1582  [1]
 LDCM0381  CL111 HEK-293T C1289(0.96)  LDD1585  [1]
 LDCM0382  CL112 HEK-293T C1289(0.97)  LDD1586  [1]
 LDCM0383  CL113 HEK-293T C1289(1.03)  LDD1587  [1]
 LDCM0385  CL115 HEK-293T C1289(1.04)  LDD1589  [1]
 LDCM0386  CL116 HEK-293T C1289(0.98)  LDD1590  [1]
 LDCM0387  CL117 HEK-293T C1289(1.02)  LDD1591  [1]
 LDCM0389  CL119 HEK-293T C1289(0.97)  LDD1593  [1]
 LDCM0390  CL12 HEK-293T C1289(1.06)  LDD1594  [1]
 LDCM0391  CL120 HEK-293T C1289(1.10)  LDD1595  [1]
 LDCM0392  CL121 HEK-293T C1289(1.03)  LDD1596  [1]
 LDCM0394  CL123 HEK-293T C1289(0.98)  LDD1598  [1]
 LDCM0395  CL124 HEK-293T C1289(0.99)  LDD1599  [1]
 LDCM0396  CL125 HEK-293T C1289(1.05)  LDD1600  [1]
 LDCM0398  CL127 HEK-293T C1289(1.02)  LDD1602  [1]
 LDCM0399  CL128 HEK-293T C1289(1.06)  LDD1603  [1]
 LDCM0400  CL13 HEK-293T C1289(1.02)  LDD1604  [1]
 LDCM0402  CL15 HEK-293T C1289(0.93)  LDD1606  [1]
 LDCM0403  CL16 HEK-293T C1289(1.20)  LDD1607  [1]
 LDCM0404  CL17 HEK-293T C1289(0.96)  LDD1608  [1]
 LDCM0405  CL18 HEK-293T C1289(1.06)  LDD1609  [1]
 LDCM0406  CL19 HEK-293T C1289(1.06)  LDD1610  [1]
 LDCM0408  CL20 HEK-293T C1289(1.03)  LDD1612  [1]
 LDCM0409  CL21 HEK-293T C1289(1.01); C1306(1.40)  LDD1613  [1]
 LDCM0410  CL22 HEK-293T C1289(1.11); C1306(1.60)  LDD1614  [1]
 LDCM0412  CL24 HEK-293T C1289(1.10)  LDD1616  [1]
 LDCM0413  CL25 HEK-293T C1289(0.91)  LDD1617  [1]
 LDCM0415  CL27 HEK-293T C1289(1.04)  LDD1619  [1]
 LDCM0416  CL28 HEK-293T C1289(1.00)  LDD1620  [1]
 LDCM0417  CL29 HEK-293T C1289(1.01)  LDD1621  [1]
 LDCM0418  CL3 HEK-293T C1289(0.99)  LDD1622  [1]
 LDCM0419  CL30 HEK-293T C1289(1.11)  LDD1623  [1]
 LDCM0420  CL31 HEK-293T C1289(1.00)  LDD1624  [1]
 LDCM0421  CL32 HEK-293T C1289(1.01)  LDD1625  [1]
 LDCM0422  CL33 HEK-293T C1289(1.00); C1306(0.81)  LDD1626  [1]
 LDCM0423  CL34 HEK-293T C1289(1.08); C1306(1.64)  LDD1627  [1]
 LDCM0425  CL36 HEK-293T C1289(1.22)  LDD1629  [1]
 LDCM0426  CL37 HEK-293T C1289(0.95)  LDD1630  [1]
 LDCM0428  CL39 HEK-293T C1289(0.99)  LDD1632  [1]
 LDCM0429  CL4 HEK-293T C1289(1.12)  LDD1633  [1]
 LDCM0430  CL40 HEK-293T C1289(1.05)  LDD1634  [1]
 LDCM0431  CL41 HEK-293T C1289(0.93)  LDD1635  [1]
 LDCM0432  CL42 HEK-293T C1289(1.09)  LDD1636  [1]
 LDCM0433  CL43 HEK-293T C1289(1.04)  LDD1637  [1]
 LDCM0434  CL44 HEK-293T C1289(0.99)  LDD1638  [1]
 LDCM0435  CL45 HEK-293T C1289(1.08); C1306(1.24)  LDD1639  [1]
 LDCM0436  CL46 HEK-293T C1289(1.08); C1306(1.13)  LDD1640  [1]
 LDCM0438  CL48 HEK-293T C1289(1.07)  LDD1642  [1]
 LDCM0439  CL49 HEK-293T C1289(1.01)  LDD1643  [1]
 LDCM0440  CL5 HEK-293T C1289(1.10)  LDD1644  [1]
 LDCM0443  CL52 HEK-293T C1289(1.08)  LDD1646  [1]
 LDCM0444  CL53 HEK-293T C1289(0.99)  LDD1647  [1]
 LDCM0445  CL54 HEK-293T C1289(0.92)  LDD1648  [1]
 LDCM0446  CL55 HEK-293T C1289(1.06)  LDD1649  [1]
 LDCM0447  CL56 HEK-293T C1289(0.94)  LDD1650  [1]
 LDCM0448  CL57 HEK-293T C1289(1.03); C1306(1.00)  LDD1651  [1]
 LDCM0449  CL58 HEK-293T C1289(1.10); C1306(1.48)  LDD1652  [1]
 LDCM0451  CL6 HEK-293T C1289(0.96)  LDD1654  [1]
 LDCM0452  CL60 HEK-293T C1289(1.09)  LDD1655  [1]
 LDCM0453  CL61 HEK-293T C1289(0.97)  LDD1656  [1]
 LDCM0455  CL63 HEK-293T C1289(0.97)  LDD1658  [1]
 LDCM0456  CL64 HEK-293T C1289(1.01)  LDD1659  [1]
 LDCM0457  CL65 HEK-293T C1289(0.94)  LDD1660  [1]
 LDCM0458  CL66 HEK-293T C1289(1.11)  LDD1661  [1]
 LDCM0459  CL67 HEK-293T C1289(1.06)  LDD1662  [1]
 LDCM0460  CL68 HEK-293T C1289(0.91)  LDD1663  [1]
 LDCM0461  CL69 HEK-293T C1289(1.08); C1306(1.01)  LDD1664  [1]
 LDCM0462  CL7 HEK-293T C1289(1.07)  LDD1665  [1]
 LDCM0463  CL70 HEK-293T C1289(1.10); C1306(1.00)  LDD1666  [1]
 LDCM0465  CL72 HEK-293T C1289(1.16)  LDD1668  [1]
 LDCM0466  CL73 HEK-293T C1289(0.97)  LDD1669  [1]
 LDCM0469  CL76 HEK-293T C1289(1.04)  LDD1672  [1]
 LDCM0470  CL77 HEK-293T C1289(1.02)  LDD1673  [1]
 LDCM0471  CL78 HEK-293T C1289(1.03)  LDD1674  [1]
 LDCM0472  CL79 HEK-293T C1289(1.00)  LDD1675  [1]
 LDCM0473  CL8 HEK-293T C1289(0.75)  LDD1676  [1]
 LDCM0474  CL80 HEK-293T C1289(0.98)  LDD1677  [1]
 LDCM0475  CL81 HEK-293T C1289(1.13); C1306(1.38)  LDD1678  [1]
 LDCM0476  CL82 HEK-293T C1289(1.04); C1306(0.92)  LDD1679  [1]
 LDCM0478  CL84 HEK-293T C1289(1.10)  LDD1681  [1]
 LDCM0479  CL85 HEK-293T C1289(1.03)  LDD1682  [1]
 LDCM0481  CL87 HEK-293T C1289(1.03)  LDD1684  [1]
 LDCM0482  CL88 HEK-293T C1289(1.09)  LDD1685  [1]
 LDCM0483  CL89 HEK-293T C1289(0.95)  LDD1686  [1]
 LDCM0484  CL9 HEK-293T C1289(1.04); C1306(1.17)  LDD1687  [1]
 LDCM0485  CL90 HEK-293T C1289(0.92)  LDD1688  [1]
 LDCM0486  CL91 HEK-293T C1289(1.09)  LDD1689  [1]
 LDCM0487  CL92 HEK-293T C1289(0.88)  LDD1690  [1]
 LDCM0488  CL93 HEK-293T C1289(1.08); C1306(1.16)  LDD1691  [1]
 LDCM0489  CL94 HEK-293T C1289(1.02); C1306(1.12)  LDD1692  [1]
 LDCM0491  CL96 HEK-293T C1289(1.07)  LDD1694  [1]
 LDCM0492  CL97 HEK-293T C1289(0.99)  LDD1695  [1]
 LDCM0494  CL99 HEK-293T C1289(1.03)  LDD1697  [1]
 LDCM0495  E2913 HEK-293T C1289(0.98)  LDD1698  [1]
 LDCM0468  Fragment33 HEK-293T C1289(1.03)  LDD1671  [1]
 LDCM0022  KB02 HEK-293T C1289(1.04); C1306(0.90)  LDD1492  [1]
 LDCM0023  KB03 HEK-293T C1289(1.06); C1306(0.94)  LDD1497  [1]
 LDCM0024  KB05 HEK-293T C1289(0.98); C1306(0.87)  LDD1502  [1]

References

1 Accelerating multiplexed profiling of protein-ligand interactions: High-throughput plate-based reactive cysteine profiling with minimal input. Cell Chem Biol. 2024 Mar 21;31(3):565-576.e4. doi: 10.1016/j.chembiol.2023.11.015. Epub 2023 Dec 19.
Mass spectrometry data entry: PXD044402
2 Global profiling identifies a stress-responsive tyrosine site on EDC3 regulating biomolecular condensate formation. Cell Chem Biol. 2022 Dec 15;29(12):1709-1720.e7. doi: 10.1016/j.chembiol.2022.11.008. Epub 2022 Dec 6.
Mass spectrometry data entry: PXD038010