Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP10233
Target Name Mitochondrial glycine transporter (SLC25A38)
Gene Name SLC25A38
Gene ID 54977
Synonyms
Mitochondrial glycine transporter; Appoptosin; Mitochondrial glycine transporter GlyC; Solute carrier family 25 member 38
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MAAPWWRAALCECRRWRGFSTSAVLGRRTPPLGPMPNSDIDLSNLERLEKYRSFDRYRRR
AEQEAQAPHWWRTYREYFGEKTDPKEKIDIGLPPPKVSRTQQLLERKQAIQELRANVEEE
RAARLRTASVPLDAVRAEWERTCGPYHKQRLAEYYGLYRDLFHGATFVPRVPLHVAYAVG
EDDLMPVYCGNEVTPTEAAQAPEVTYEAEEGSLWTLLLTSLDGHLLEPDAEYLHWLLTNI
PGNRVAEGQVTCPYLPPFPARGSGIHRLAFLLFKQDQPIDFSEDARPSPCYQLAQRTFRT
FDFYKKHQETMTPAGLSFFQCRWDDSVTYIFHQLLDMREPVFEFVRPPPYHPKQKRFPHR
QPLRYLDRYRDSHEPTYGIY
Target Bioclass
Transporter and channel
Family
Mitochondrial carrier (TC 2.A.29) family, SLC25A38 subfamily
Subcellular location
Mitochondrion inner membrane
Function
Mitochondrial glycine transporter that imports glycine into the mitochondrial matrix. Plays an important role in providing glycine for the first enzymatic step in heme biosynthesis, the condensation of glycine with succinyl-CoA to produce 5-aminolevulinate (ALA) in the mitochondrial matrix. Required during erythropoiesis. {|HAMAP-Rule:MF_03064}.; Plays a role as pro-apoptotic protein that induces caspase-dependent apoptosis.
Uniprot ID
Q96DW6
Ensemble ID
ENST00000650617.1
HGNC ID
HGNC:26054

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 4 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
DBIA
 Probe Info  		C140(0.89)  LDD1492  [1]
TFBX
 Probe Info  		N.A.  LDD0027  [2]
IPM
 Probe Info  		N.A.  LDD2156  [3]
AOyne
 Probe Info  		15.00  LDD0443  [4]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0214  AC1 HEK-293T C97(1.01)  LDD1507  [1]
 LDCM0215  AC10 HEK-293T C97(0.97)  LDD1508  [1]
 LDCM0226  AC11 HEK-293T C97(0.94)  LDD1509  [1]
 LDCM0237  AC12 HEK-293T C97(0.98)  LDD1510  [1]
 LDCM0259  AC14 HEK-293T C140(1.06)  LDD1512  [1]
 LDCM0270  AC15 HEK-293T C97(0.91)  LDD1513  [1]
 LDCM0276  AC17 HEK-293T C97(0.89)  LDD1515  [1]
 LDCM0277  AC18 HEK-293T C97(0.91)  LDD1516  [1]
 LDCM0278  AC19 HEK-293T C97(1.04)  LDD1517  [1]
 LDCM0279  AC2 HEK-293T C97(1.04)  LDD1518  [1]
 LDCM0280  AC20 HEK-293T C97(1.01)  LDD1519  [1]
 LDCM0281  AC21 HEK-293T C97(1.05)  LDD1520  [1]
 LDCM0282  AC22 HEK-293T C140(1.05)  LDD1521  [1]
 LDCM0283  AC23 HEK-293T C97(0.87)  LDD1522  [1]
 LDCM0285  AC25 HEK-293T C97(1.01)  LDD1524  [1]
 LDCM0286  AC26 HEK-293T C97(0.81)  LDD1525  [1]
 LDCM0287  AC27 HEK-293T C97(0.90)  LDD1526  [1]
 LDCM0288  AC28 HEK-293T C97(1.07)  LDD1527  [1]
 LDCM0289  AC29 HEK-293T C97(0.87)  LDD1528  [1]
 LDCM0290  AC3 HEK-293T C97(0.97)  LDD1529  [1]
 LDCM0291  AC30 HEK-293T C140(1.04)  LDD1530  [1]
 LDCM0292  AC31 HEK-293T C97(0.96)  LDD1531  [1]
 LDCM0294  AC33 HEK-293T C97(1.00)  LDD1533  [1]
 LDCM0295  AC34 HEK-293T C97(1.14)  LDD1534  [1]
 LDCM0296  AC35 HEK-293T C97(1.25)  LDD1535  [1]
 LDCM0297  AC36 HEK-293T C97(0.86)  LDD1536  [1]
 LDCM0298  AC37 HEK-293T C97(0.89)  LDD1537  [1]
 LDCM0299  AC38 HEK-293T C140(1.11)  LDD1538  [1]
 LDCM0300  AC39 HEK-293T C97(1.03)  LDD1539  [1]
 LDCM0301  AC4 HEK-293T C97(1.10)  LDD1540  [1]
 LDCM0303  AC41 HEK-293T C97(1.08)  LDD1542  [1]
 LDCM0304  AC42 HEK-293T C97(1.04)  LDD1543  [1]
 LDCM0305  AC43 HEK-293T C97(0.85)  LDD1544  [1]
 LDCM0306  AC44 HEK-293T C97(1.15)  LDD1545  [1]
 LDCM0307  AC45 HEK-293T C97(0.87)  LDD1546  [1]
 LDCM0308  AC46 HEK-293T C140(1.00)  LDD1547  [1]
 LDCM0309  AC47 HEK-293T C97(1.06)  LDD1548  [1]
 LDCM0311  AC49 HEK-293T C97(0.91)  LDD1550  [1]
 LDCM0312  AC5 HEK-293T C97(0.93)  LDD1551  [1]
 LDCM0313  AC50 HEK-293T C97(1.08)  LDD1552  [1]
 LDCM0314  AC51 HEK-293T C97(1.07)  LDD1553  [1]
 LDCM0315  AC52 HEK-293T C97(0.91)  LDD1554  [1]
 LDCM0316  AC53 HEK-293T C97(0.86)  LDD1555  [1]
 LDCM0317  AC54 HEK-293T C140(1.04)  LDD1556  [1]
 LDCM0318  AC55 HEK-293T C97(0.85)  LDD1557  [1]
 LDCM0320  AC57 HEK-293T C97(0.85)  LDD1559  [1]
 LDCM0321  AC58 HEK-293T C97(1.07)  LDD1560  [1]
 LDCM0322  AC59 HEK-293T C97(1.17)  LDD1561  [1]
 LDCM0323  AC6 HEK-293T C140(1.12)  LDD1562  [1]
 LDCM0324  AC60 HEK-293T C97(1.00)  LDD1563  [1]
 LDCM0325  AC61 HEK-293T C97(0.97)  LDD1564  [1]
 LDCM0326  AC62 HEK-293T C140(1.09)  LDD1565  [1]
 LDCM0327  AC63 HEK-293T C97(0.95)  LDD1566  [1]
 LDCM0334  AC7 HEK-293T C97(0.91)  LDD1568  [1]
 LDCM0248  AKOS034007472 HEK-293T C97(0.90)  LDD1511  [1]
 LDCM0356  AKOS034007680 HEK-293T C97(0.95)  LDD1570  [1]
 LDCM0367  CL1 HEK-293T C97(0.99)  LDD1571  [1]
 LDCM0368  CL10 HEK-293T C140(2.50)  LDD1572  [1]
 LDCM0369  CL100 HEK-293T C97(1.21); C140(0.87)  LDD1573  [1]
 LDCM0370  CL101 HEK-293T C97(0.88)  LDD1574  [1]
 LDCM0372  CL103 HEK-293T C97(1.03)  LDD1576  [1]
 LDCM0373  CL104 HEK-293T C97(1.12); C140(0.88)  LDD1577  [1]
 LDCM0374  CL105 HEK-293T C97(0.94)  LDD1578  [1]
 LDCM0376  CL107 HEK-293T C97(1.09)  LDD1580  [1]
 LDCM0377  CL108 HEK-293T C97(1.29); C140(0.83)  LDD1581  [1]
 LDCM0378  CL109 HEK-293T C97(1.11)  LDD1582  [1]
 LDCM0379  CL11 HEK-293T C97(0.98)  LDD1583  [1]
 LDCM0381  CL111 HEK-293T C97(1.00)  LDD1585  [1]
 LDCM0382  CL112 HEK-293T C97(1.17); C140(0.87)  LDD1586  [1]
 LDCM0383  CL113 HEK-293T C97(1.02)  LDD1587  [1]
 LDCM0385  CL115 HEK-293T C97(1.02)  LDD1589  [1]
 LDCM0386  CL116 HEK-293T C97(1.22); C140(0.83)  LDD1590  [1]
 LDCM0387  CL117 HEK-293T C97(1.01)  LDD1591  [1]
 LDCM0389  CL119 HEK-293T C97(1.03)  LDD1593  [1]
 LDCM0391  CL120 HEK-293T C97(1.11); C140(0.89)  LDD1595  [1]
 LDCM0392  CL121 HEK-293T C97(0.84)  LDD1596  [1]
 LDCM0394  CL123 HEK-293T C97(1.10)  LDD1598  [1]
 LDCM0395  CL124 HEK-293T C97(1.18); C140(0.82)  LDD1599  [1]
 LDCM0396  CL125 HEK-293T C97(1.04)  LDD1600  [1]
 LDCM0398  CL127 HEK-293T C97(1.07)  LDD1602  [1]
 LDCM0399  CL128 HEK-293T C97(1.21); C140(0.89)  LDD1603  [1]
 LDCM0400  CL13 HEK-293T C97(0.97)  LDD1604  [1]
 LDCM0402  CL15 HEK-293T C97(1.25)  LDD1606  [1]
 LDCM0403  CL16 HEK-293T C97(1.07); C140(0.87)  LDD1607  [1]
 LDCM0404  CL17 HEK-293T C97(1.14)  LDD1608  [1]
 LDCM0405  CL18 HEK-293T C97(1.06)  LDD1609  [1]
 LDCM0406  CL19 HEK-293T C97(1.22)  LDD1610  [1]
 LDCM0408  CL20 HEK-293T C97(1.03)  LDD1612  [1]
 LDCM0409  CL21 HEK-293T C97(1.36)  LDD1613  [1]
 LDCM0410  CL22 HEK-293T C140(1.18)  LDD1614  [1]
 LDCM0411  CL23 HEK-293T C97(0.91)  LDD1615  [1]
 LDCM0413  CL25 HEK-293T C97(1.75)  LDD1617  [1]
 LDCM0415  CL27 HEK-293T C97(1.00)  LDD1619  [1]
 LDCM0416  CL28 HEK-293T C97(1.37); C140(0.82)  LDD1620  [1]
 LDCM0417  CL29 HEK-293T C97(1.07)  LDD1621  [1]
 LDCM0418  CL3 HEK-293T C97(1.09)  LDD1622  [1]
 LDCM0419  CL30 HEK-293T C97(0.91)  LDD1623  [1]
 LDCM0420  CL31 HEK-293T C97(1.10)  LDD1624  [1]
 LDCM0421  CL32 HEK-293T C97(0.95)  LDD1625  [1]
 LDCM0422  CL33 HEK-293T C97(1.27)  LDD1626  [1]
 LDCM0423  CL34 HEK-293T C140(1.21)  LDD1627  [1]
 LDCM0424  CL35 HEK-293T C97(0.94)  LDD1628  [1]
 LDCM0426  CL37 HEK-293T C97(1.04)  LDD1630  [1]
 LDCM0428  CL39 HEK-293T C97(1.05)  LDD1632  [1]
 LDCM0429  CL4 HEK-293T C97(1.20); C140(0.93)  LDD1633  [1]
 LDCM0430  CL40 HEK-293T C97(1.11); C140(0.78)  LDD1634  [1]
 LDCM0431  CL41 HEK-293T C97(1.39)  LDD1635  [1]
 LDCM0432  CL42 HEK-293T C97(1.15)  LDD1636  [1]
 LDCM0433  CL43 HEK-293T C97(0.98)  LDD1637  [1]
 LDCM0434  CL44 HEK-293T C97(0.95)  LDD1638  [1]
 LDCM0435  CL45 HEK-293T C97(1.04)  LDD1639  [1]
 LDCM0436  CL46 HEK-293T C140(1.18)  LDD1640  [1]
 LDCM0437  CL47 HEK-293T C97(0.86)  LDD1641  [1]
 LDCM0439  CL49 HEK-293T C97(1.09)  LDD1643  [1]
 LDCM0440  CL5 HEK-293T C97(1.03)  LDD1644  [1]
 LDCM0443  CL52 HEK-293T C97(1.14); C140(0.83)  LDD1646  [1]
 LDCM0444  CL53 HEK-293T C97(1.03)  LDD1647  [1]
 LDCM0445  CL54 HEK-293T C97(1.57)  LDD1648  [1]
 LDCM0446  CL55 HEK-293T C97(1.22)  LDD1649  [1]
 LDCM0447  CL56 HEK-293T C97(1.01)  LDD1650  [1]
 LDCM0448  CL57 HEK-293T C97(1.13)  LDD1651  [1]
 LDCM0449  CL58 HEK-293T C140(1.38)  LDD1652  [1]
 LDCM0450  CL59 HEK-293T C97(0.94)  LDD1653  [1]
 LDCM0451  CL6 HEK-293T C97(1.05)  LDD1654  [1]
 LDCM0453  CL61 HEK-293T C97(1.09)  LDD1656  [1]
 LDCM0455  CL63 HEK-293T C97(1.01)  LDD1658  [1]
 LDCM0456  CL64 HEK-293T C97(0.74); C140(1.05)  LDD1659  [1]
 LDCM0457  CL65 HEK-293T C97(0.93)  LDD1660  [1]
 LDCM0458  CL66 HEK-293T C97(1.07)  LDD1661  [1]
 LDCM0459  CL67 HEK-293T C97(0.95)  LDD1662  [1]
 LDCM0460  CL68 HEK-293T C97(1.07)  LDD1663  [1]
 LDCM0461  CL69 HEK-293T C97(1.02)  LDD1664  [1]
 LDCM0462  CL7 HEK-293T C97(1.21)  LDD1665  [1]
 LDCM0463  CL70 HEK-293T C140(1.24)  LDD1666  [1]
 LDCM0464  CL71 HEK-293T C97(1.09)  LDD1667  [1]
 LDCM0466  CL73 HEK-293T C97(1.21)  LDD1669  [1]
 LDCM0469  CL76 HEK-293T C97(1.11); C140(0.86)  LDD1672  [1]
 LDCM0470  CL77 HEK-293T C97(1.08)  LDD1673  [1]
 LDCM0471  CL78 HEK-293T C97(0.97)  LDD1674  [1]
 LDCM0472  CL79 HEK-293T C97(0.87)  LDD1675  [1]
 LDCM0473  CL8 HEK-293T C97(1.79)  LDD1676  [1]
 LDCM0474  CL80 HEK-293T C97(0.95)  LDD1677  [1]
 LDCM0475  CL81 HEK-293T C97(1.04)  LDD1678  [1]
 LDCM0476  CL82 HEK-293T C140(1.16)  LDD1679  [1]
 LDCM0477  CL83 HEK-293T C97(0.99)  LDD1680  [1]
 LDCM0479  CL85 HEK-293T C97(1.22)  LDD1682  [1]
 LDCM0481  CL87 HEK-293T C97(1.06)  LDD1684  [1]
 LDCM0482  CL88 HEK-293T C97(1.20); C140(0.92)  LDD1685  [1]
 LDCM0483  CL89 HEK-293T C97(0.99)  LDD1686  [1]
 LDCM0484  CL9 HEK-293T C97(1.01)  LDD1687  [1]
 LDCM0485  CL90 HEK-293T C97(0.81)  LDD1688  [1]
 LDCM0486  CL91 HEK-293T C97(1.11)  LDD1689  [1]
 LDCM0487  CL92 HEK-293T C97(1.07)  LDD1690  [1]
 LDCM0488  CL93 HEK-293T C97(1.13)  LDD1691  [1]
 LDCM0489  CL94 HEK-293T C140(1.31)  LDD1692  [1]
 LDCM0490  CL95 HEK-293T C97(1.09)  LDD1693  [1]
 LDCM0492  CL97 HEK-293T C97(1.16)  LDD1695  [1]
 LDCM0494  CL99 HEK-293T C97(0.97)  LDD1697  [1]
 LDCM0495  E2913 HEK-293T C97(1.07)  LDD1698  [1]
 LDCM0468  Fragment33 HEK-293T C97(1.25)  LDD1671  [1]
 LDCM0022  KB02 HEK-293T C140(0.89)  LDD1492  [1]
 LDCM0023  KB03 HEK-293T C140(0.98)  LDD1497  [1]
 LDCM0024  KB05 HEK-293T C140(0.70)  LDD1502  [1]

References

1 Accelerating multiplexed profiling of protein-ligand interactions: High-throughput plate-based reactive cysteine profiling with minimal input. Cell Chem Biol. 2024 Mar 21;31(3):565-576.e4. doi: 10.1016/j.chembiol.2023.11.015. Epub 2023 Dec 19.
Mass spectrometry data entry: PXD044402
2 Chemoproteomic Profiling by Cysteine Fluoroalkylation Reveals Myrocin G as an Inhibitor of the Nonhomologous End Joining DNA Repair Pathway. J Am Chem Soc. 2021 Dec 8;143(48):20332-20342. doi: 10.1021/jacs.1c09724. Epub 2021 Nov 24.
Mass spectrometry data entry: PXD029255
3 Benchmarking Cleavable Biotin Tags for Peptide-Centric Chemoproteomics. J Proteome Res. 2022 May 6;21(5):1349-1358. doi: 10.1021/acs.jproteome.2c00174. Epub 2022 Apr 25.
Mass spectrometry data entry: PXD031019
4 Chemoproteomic profiling of targets of lipid-derived electrophiles by bioorthogonal aminooxy probe. Redox Biol. 2017 Aug;12:712-718. doi: 10.1016/j.redox.2017.04.001. Epub 2017 Apr 5.