Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP09411
Target Name Zinc finger protein 398 (ZNF398)
Gene Name ZNF398
Gene ID 57541
Synonyms
KIAA1339; ZER6; Zinc finger protein 398; Zinc finger DNA-binding protein p52/p71
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MAEAAPAPTSEWDSECLTSLQPLPLPTPPAANEAHLQTAAISLWTVVAAVQAIERKVEIH
SRRLLHLEGRTGTAEKKLASCEKTVTELGNQLEGKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENLENLL
RNRNFWILRLPPGIKGDIPKVPVAFDDVSIYFSTPEWEKLEEWQKELYKNIMKGNYESLI
SMDYAINQPDVLSQIQPEGEHNTEDQAGPEESEIPTDPSEEPGISTSDILSWIKQEEEPQ
VGAPPESKESDVYKSTYADEELVIKAEGLARSSLCPEVPVPFSSPPAAAKDAFSDVAFKS
QQSTSMTPFGRPATDLPEASEGQVTFTQLGSYPLPPPVGEQVFSCHHCGKNLSQDMLLTH
QCSHATEHPLPCAQCPKHFTPQADLSSTSQDHASETPPTCPHCARTFTHPSRLTYHLRVH
NSTERPFPCPDCPKRFADQARLTSHRRAHASERPFRCAQCGRSFSLKISLLLHQRGHAQE
RPFSCPQCGIDFNGHSALIRHQMIHTGERPYPCTDCSKSFMRKEHLLNHRRLHTGERPFS
CPHCGKSFIRKHHLMKHQRIHTGERPYPCSYCGRSFRYKQTLKDHLRSGHNGGCGGDSDP
SGQPPNPPGPLITGLETSGLGVNTEGLETNQWYGEGSGGGVL
Target Bioclass
Transcription factor
Family
Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family
Subcellular location
Nucleus
Function Functions as a transcriptional activator.
Uniprot ID
Q8TD17
Ensemble ID
ENST00000426851.6
HGNC ID
HGNC:18373

Target Site Mutations in Different Cell Lines

Cell line Mutation details Probe for labeling this protein in this cell
CAL148 SNV: p.G592A .
CASKI SNV: p.A383V .
CCFSTTG1 SNV: p.V278I .
G415 SNV: p.K248Ter .
GB2 SNV: p.K546N .
HEC1B SNV: p.S394N .
HT115 SNV: p.R435H .
NCIH1155 SNV: p.C572Y .
NCIH446 SNV: p.E82Ter .
OVCAR8 SNV: p.R530W .
SKNSH SNV: p.P6T .
SUPT1 SNV: p.R537Q .
TOV21G SNV: p.P8L .

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 2 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
DBIA
 Probe Info  		C275(1.05)  LDD1492  [1]
NAIA_5
 Probe Info  		N.A.  LDD2225  [2]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0214  AC1 HEK-293T C275(1.48)  LDD1507  [1]
 LDCM0215  AC10 HEK-293T C275(0.90)  LDD1508  [1]
 LDCM0237  AC12 HEK-293T C81(1.16)  LDD1510  [1]
 LDCM0259  AC14 HEK-293T C275(0.91)  LDD1512  [1]
 LDCM0276  AC17 HEK-293T C275(1.44)  LDD1515  [1]
 LDCM0277  AC18 HEK-293T C275(0.97)  LDD1516  [1]
 LDCM0279  AC2 HEK-293T C275(0.90)  LDD1518  [1]
 LDCM0280  AC20 HEK-293T C81(1.19)  LDD1519  [1]
 LDCM0281  AC21 HEK-293T C275(0.96)  LDD1520  [1]
 LDCM0282  AC22 HEK-293T C275(1.03)  LDD1521  [1]
 LDCM0284  AC24 HEK-293T C275(0.84)  LDD1523  [1]
 LDCM0285  AC25 HEK-293T C275(1.37)  LDD1524  [1]
 LDCM0286  AC26 HEK-293T C275(0.95)  LDD1525  [1]
 LDCM0288  AC28 HEK-293T C81(1.11)  LDD1527  [1]
 LDCM0289  AC29 HEK-293T C275(0.95)  LDD1528  [1]
 LDCM0291  AC30 HEK-293T C275(1.03)  LDD1530  [1]
 LDCM0293  AC32 HEK-293T C275(0.85)  LDD1532  [1]
 LDCM0294  AC33 HEK-293T C275(1.15)  LDD1533  [1]
 LDCM0295  AC34 HEK-293T C275(1.01)  LDD1534  [1]
 LDCM0297  AC36 HEK-293T C81(1.30)  LDD1536  [1]
 LDCM0298  AC37 HEK-293T C275(0.96)  LDD1537  [1]
 LDCM0299  AC38 HEK-293T C275(0.94)  LDD1538  [1]
 LDCM0301  AC4 HEK-293T C81(1.16)  LDD1540  [1]
 LDCM0302  AC40 HEK-293T C275(0.88)  LDD1541  [1]
 LDCM0303  AC41 HEK-293T C275(1.47)  LDD1542  [1]
 LDCM0304  AC42 HEK-293T C275(1.06)  LDD1543  [1]
 LDCM0306  AC44 HEK-293T C81(1.23)  LDD1545  [1]
 LDCM0307  AC45 HEK-293T C275(1.05)  LDD1546  [1]
 LDCM0308  AC46 HEK-293T C275(1.19)  LDD1547  [1]
 LDCM0310  AC48 HEK-293T C275(0.90)  LDD1549  [1]
 LDCM0311  AC49 HEK-293T C275(1.38)  LDD1550  [1]
 LDCM0312  AC5 HEK-293T C275(1.06)  LDD1551  [1]
 LDCM0313  AC50 HEK-293T C275(1.06)  LDD1552  [1]
 LDCM0315  AC52 HEK-293T C81(1.20)  LDD1554  [1]
 LDCM0316  AC53 HEK-293T C275(1.01)  LDD1555  [1]
 LDCM0317  AC54 HEK-293T C275(1.04)  LDD1556  [1]
 LDCM0319  AC56 HEK-293T C275(0.93)  LDD1558  [1]
 LDCM0320  AC57 HEK-293T C275(1.43)  LDD1559  [1]
 LDCM0321  AC58 HEK-293T C275(0.96)  LDD1560  [1]
 LDCM0323  AC6 HEK-293T C275(1.05)  LDD1562  [1]
 LDCM0324  AC60 HEK-293T C81(1.16)  LDD1563  [1]
 LDCM0325  AC61 HEK-293T C275(1.01)  LDD1564  [1]
 LDCM0326  AC62 HEK-293T C275(0.96)  LDD1565  [1]
 LDCM0328  AC64 HEK-293T C275(1.02)  LDD1567  [1]
 LDCM0345  AC8 HEK-293T C275(0.91)  LDD1569  [1]
 LDCM0248  AKOS034007472 HEK-293T C275(1.03)  LDD1511  [1]
 LDCM0356  AKOS034007680 HEK-293T C275(1.67)  LDD1570  [1]
 LDCM0275  AKOS034007705 HEK-293T C275(0.90)  LDD1514  [1]
 LDCM0367  CL1 HEK-293T C275(0.94)  LDD1571  [1]
 LDCM0368  CL10 HEK-293T C275(0.84)  LDD1572  [1]
 LDCM0370  CL101 HEK-293T C275(1.11)  LDD1574  [1]
 LDCM0372  CL103 HEK-293T C275(0.83)  LDD1576  [1]
 LDCM0374  CL105 HEK-293T C275(0.85)  LDD1578  [1]
 LDCM0376  CL107 HEK-293T C275(0.80)  LDD1580  [1]
 LDCM0378  CL109 HEK-293T C275(0.81)  LDD1582  [1]
 LDCM0381  CL111 HEK-293T C275(0.86)  LDD1585  [1]
 LDCM0383  CL113 HEK-293T C275(1.17)  LDD1587  [1]
 LDCM0385  CL115 HEK-293T C275(0.20)  LDD1589  [1]
 LDCM0387  CL117 HEK-293T C275(0.98)  LDD1591  [1]
 LDCM0389  CL119 HEK-293T C275(0.87)  LDD1593  [1]
 LDCM0390  CL12 HEK-293T C275(1.06)  LDD1594  [1]
 LDCM0392  CL121 HEK-293T C275(1.02)  LDD1596  [1]
 LDCM0394  CL123 HEK-293T C275(0.90)  LDD1598  [1]
 LDCM0396  CL125 HEK-293T C275(1.36)  LDD1600  [1]
 LDCM0398  CL127 HEK-293T C275(0.92)  LDD1602  [1]
 LDCM0400  CL13 HEK-293T C275(1.31)  LDD1604  [1]
 LDCM0402  CL15 HEK-293T C275(0.78)  LDD1606  [1]
 LDCM0404  CL17 HEK-293T C275(1.05)  LDD1608  [1]
 LDCM0405  CL18 HEK-293T C275(0.91)  LDD1609  [1]
 LDCM0408  CL20 HEK-293T C81(0.93)  LDD1612  [1]
 LDCM0409  CL21 HEK-293T C275(0.78)  LDD1613  [1]
 LDCM0410  CL22 HEK-293T C275(0.92)  LDD1614  [1]
 LDCM0412  CL24 HEK-293T C275(1.15)  LDD1616  [1]
 LDCM0413  CL25 HEK-293T C275(0.85)  LDD1617  [1]
 LDCM0415  CL27 HEK-293T C275(0.83)  LDD1619  [1]
 LDCM0417  CL29 HEK-293T C275(1.64)  LDD1621  [1]
 LDCM0418  CL3 HEK-293T C275(0.90)  LDD1622  [1]
 LDCM0419  CL30 HEK-293T C275(0.93)  LDD1623  [1]
 LDCM0421  CL32 HEK-293T C81(0.91)  LDD1625  [1]
 LDCM0422  CL33 HEK-293T C275(0.82)  LDD1626  [1]
 LDCM0423  CL34 HEK-293T C275(0.83)  LDD1627  [1]
 LDCM0425  CL36 HEK-293T C275(1.08)  LDD1629  [1]
 LDCM0426  CL37 HEK-293T C275(0.88)  LDD1630  [1]
 LDCM0428  CL39 HEK-293T C275(0.90)  LDD1632  [1]
 LDCM0431  CL41 HEK-293T C275(1.16)  LDD1635  [1]
 LDCM0432  CL42 HEK-293T C275(0.85)  LDD1636  [1]
 LDCM0434  CL44 HEK-293T C81(0.93)  LDD1638  [1]
 LDCM0435  CL45 HEK-293T C275(0.91)  LDD1639  [1]
 LDCM0436  CL46 HEK-293T C275(0.87)  LDD1640  [1]
 LDCM0438  CL48 HEK-293T C275(1.04)  LDD1642  [1]
 LDCM0439  CL49 HEK-293T C275(0.87)  LDD1643  [1]
 LDCM0440  CL5 HEK-293T C275(1.28)  LDD1644  [1]
 LDCM0444  CL53 HEK-293T C275(1.21)  LDD1647  [1]
 LDCM0445  CL54 HEK-293T C275(0.82)  LDD1648  [1]
 LDCM0447  CL56 HEK-293T C81(0.91)  LDD1650  [1]
 LDCM0448  CL57 HEK-293T C275(0.91)  LDD1651  [1]
 LDCM0449  CL58 HEK-293T C275(0.89)  LDD1652  [1]
 LDCM0451  CL6 HEK-293T C275(0.96)  LDD1654  [1]
 LDCM0452  CL60 HEK-293T C275(1.01)  LDD1655  [1]
 LDCM0453  CL61 HEK-293T C275(1.18)  LDD1656  [1]
 LDCM0455  CL63 HEK-293T C275(0.86)  LDD1658  [1]
 LDCM0457  CL65 HEK-293T C275(1.18)  LDD1660  [1]
 LDCM0458  CL66 HEK-293T C275(1.07)  LDD1661  [1]
 LDCM0460  CL68 HEK-293T C81(0.89)  LDD1663  [1]
 LDCM0461  CL69 HEK-293T C275(1.02)  LDD1664  [1]
 LDCM0463  CL70 HEK-293T C275(0.80)  LDD1666  [1]
 LDCM0465  CL72 HEK-293T C275(1.04)  LDD1668  [1]
 LDCM0466  CL73 HEK-293T C275(1.64)  LDD1669  [1]
 LDCM0470  CL77 HEK-293T C275(1.54)  LDD1673  [1]
 LDCM0471  CL78 HEK-293T C275(0.90)  LDD1674  [1]
 LDCM0473  CL8 HEK-293T C81(0.96)  LDD1676  [1]
 LDCM0474  CL80 HEK-293T C81(0.85)  LDD1677  [1]
 LDCM0475  CL81 HEK-293T C275(0.94)  LDD1678  [1]
 LDCM0476  CL82 HEK-293T C275(0.75)  LDD1679  [1]
 LDCM0478  CL84 HEK-293T C275(1.05)  LDD1681  [1]
 LDCM0479  CL85 HEK-293T C275(1.66)  LDD1682  [1]
 LDCM0481  CL87 HEK-293T C275(1.03)  LDD1684  [1]
 LDCM0483  CL89 HEK-293T C275(1.66)  LDD1686  [1]
 LDCM0484  CL9 HEK-293T C275(0.95)  LDD1687  [1]
 LDCM0485  CL90 HEK-293T C275(0.87)  LDD1688  [1]
 LDCM0487  CL92 HEK-293T C81(1.04)  LDD1690  [1]
 LDCM0488  CL93 HEK-293T C275(0.97)  LDD1691  [1]
 LDCM0489  CL94 HEK-293T C275(0.91)  LDD1692  [1]
 LDCM0491  CL96 HEK-293T C275(1.17)  LDD1694  [1]
 LDCM0492  CL97 HEK-293T C275(1.17)  LDD1695  [1]
 LDCM0494  CL99 HEK-293T C275(0.99)  LDD1697  [1]
 LDCM0495  E2913 HEK-293T C275(0.90)  LDD1698  [1]
 LDCM0468  Fragment33 HEK-293T C275(1.03)  LDD1671  [1]
 LDCM0022  KB02 HEK-293T C275(1.05)  LDD1492  [1]
 LDCM0023  KB03 HEK-293T C275(1.08)  LDD1497  [1]
 LDCM0024  KB05 HEK-293T C275(1.07)  LDD1502  [1]

References

1 Accelerating multiplexed profiling of protein-ligand interactions: High-throughput plate-based reactive cysteine profiling with minimal input. Cell Chem Biol. 2024 Mar 21;31(3):565-576.e4. doi: 10.1016/j.chembiol.2023.11.015. Epub 2023 Dec 19.
Mass spectrometry data entry: PXD044402
2 N-Acryloylindole-alkyne (NAIA) enables imaging and profiling new ligandable cysteines and oxidized thiols by chemoproteomics. Nat Commun. 2023 Jun 15;14(1):3564. doi: 10.1038/s41467-023-39268-w.
Mass spectrometry data entry: PXD041264