Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP07523
Target Name Transmembrane protein 53 (TMEM53)
Gene Name TMEM53
Gene ID 79639
Synonyms
NET4; Transmembrane protein 53; Nuclear envelope transmembrane protein 4
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MASAELDYTIEIPDQPCWSQKNSPSPGGKEAETRQPVVILLGWGGCKDKNLAKYSAIYHK
RGCIVIRYTAPWHMVFFSESLGIPSLRVLAQKLLELLFDYEIEKEPLLFHVFSNGGVMLY
RYVLELLQTRRFCRLRVVGTIFDSAPGDSNLVGALRALAAILERRAAMLRLLLLVAFALV
VVLFHVLLAPITALFHTHFYDRLQDAGSRWPELYLYSRADEVVLARDIERMVEARLARRV
LARSVDFVSSAHVSHLRDYPTYYTSLCVDFMRNCVRC
Target Bioclass
Other
Family
TMEM53 family
Subcellular location
Nucleus outer membrane
Function
Ensures normal bone formation, through the negative regulation of bone morphogenetic protein (BMP) signaling in osteoblast lineage cells by blocking cytoplasm-nucleus translocation of phosphorylated SMAD1/5/9 proteins.
Uniprot ID
Q6P2H8
Ensemble ID
ENST00000372237.8
HGNC ID
HGNC:26186

Target Site Mutations in Different Cell Lines

Cell line Mutation details Probe for labeling this protein in this cell
CCK81 SNV: p.L236M .
CORL88 SNV: p.E163K .
HCT116 SNV: p.C46Y .
HCT15 SNV: p.L158M .
KYSE180 SNV: p.G42S .
RKO SNV: p.S244Y .

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 1 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
DBIA
 Probe Info  		C46(0.95)  LDD1508  [1]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0215  AC10 HEK-293T C46(0.95)  LDD1508  [1]
 LDCM0226  AC11 HEK-293T C46(0.94)  LDD1509  [1]
 LDCM0259  AC14 HEK-293T C46(0.97)  LDD1512  [1]
 LDCM0277  AC18 HEK-293T C46(0.91)  LDD1516  [1]
 LDCM0278  AC19 HEK-293T C46(0.96)  LDD1517  [1]
 LDCM0279  AC2 HEK-293T C46(1.04)  LDD1518  [1]
 LDCM0282  AC22 HEK-293T C46(1.03)  LDD1521  [1]
 LDCM0284  AC24 HEK-293T C46(0.85)  LDD1523  [1]
 LDCM0286  AC26 HEK-293T C46(1.03)  LDD1525  [1]
 LDCM0287  AC27 HEK-293T C46(0.94)  LDD1526  [1]
 LDCM0290  AC3 HEK-293T C46(0.90)  LDD1529  [1]
 LDCM0291  AC30 HEK-293T C46(1.08)  LDD1530  [1]
 LDCM0293  AC32 HEK-293T C46(1.04)  LDD1532  [1]
 LDCM0295  AC34 HEK-293T C46(0.92)  LDD1534  [1]
 LDCM0296  AC35 HEK-293T C46(0.83)  LDD1535  [1]
 LDCM0299  AC38 HEK-293T C46(1.04)  LDD1538  [1]
 LDCM0302  AC40 HEK-293T C46(1.00)  LDD1541  [1]
 LDCM0304  AC42 HEK-293T C46(0.94)  LDD1543  [1]
 LDCM0305  AC43 HEK-293T C46(0.95)  LDD1544  [1]
 LDCM0308  AC46 HEK-293T C46(1.25)  LDD1547  [1]
 LDCM0310  AC48 HEK-293T C46(1.08)  LDD1549  [1]
 LDCM0313  AC50 HEK-293T C46(1.06)  LDD1552  [1]
 LDCM0314  AC51 HEK-293T C46(1.02)  LDD1553  [1]
 LDCM0317  AC54 HEK-293T C46(1.08)  LDD1556  [1]
 LDCM0319  AC56 HEK-293T C46(1.01)  LDD1558  [1]
 LDCM0321  AC58 HEK-293T C46(1.14)  LDD1560  [1]
 LDCM0322  AC59 HEK-293T C46(0.91)  LDD1561  [1]
 LDCM0323  AC6 HEK-293T C46(0.97)  LDD1562  [1]
 LDCM0326  AC62 HEK-293T C46(0.95)  LDD1565  [1]
 LDCM0328  AC64 HEK-293T C46(1.22)  LDD1567  [1]
 LDCM0345  AC8 HEK-293T C46(1.00)  LDD1569  [1]
 LDCM0275  AKOS034007705 HEK-293T C46(1.06)  LDD1514  [1]
 LDCM0368  CL10 HEK-293T C46(1.31)  LDD1572  [1]
 LDCM0369  CL100 HEK-293T C46(1.21)  LDD1573  [1]
 LDCM0371  CL102 HEK-293T C46(0.97)  LDD1575  [1]
 LDCM0373  CL104 HEK-293T C46(1.19)  LDD1577  [1]
 LDCM0375  CL106 HEK-293T C46(0.97)  LDD1579  [1]
 LDCM0377  CL108 HEK-293T C46(0.91)  LDD1581  [1]
 LDCM0380  CL110 HEK-293T C46(0.85)  LDD1584  [1]
 LDCM0382  CL112 HEK-293T C46(0.98)  LDD1586  [1]
 LDCM0384  CL114 HEK-293T C46(0.99)  LDD1588  [1]
 LDCM0386  CL116 HEK-293T C46(1.13)  LDD1590  [1]
 LDCM0388  CL118 HEK-293T C46(0.84)  LDD1592  [1]
 LDCM0390  CL12 HEK-293T C46(0.98)  LDD1594  [1]
 LDCM0391  CL120 HEK-293T C46(0.92)  LDD1595  [1]
 LDCM0393  CL122 HEK-293T C46(0.82)  LDD1597  [1]
 LDCM0395  CL124 HEK-293T C46(1.21)  LDD1599  [1]
 LDCM0397  CL126 HEK-293T C46(0.95)  LDD1601  [1]
 LDCM0399  CL128 HEK-293T C46(0.94)  LDD1603  [1]
 LDCM0401  CL14 HEK-293T C46(1.07)  LDD1605  [1]
 LDCM0403  CL16 HEK-293T C46(1.24)  LDD1607  [1]
 LDCM0405  CL18 HEK-293T C46(1.03)  LDD1609  [1]
 LDCM0406  CL19 HEK-293T C46(0.85)  LDD1610  [1]
 LDCM0407  CL2 HEK-293T C46(1.24)  LDD1611  [1]
 LDCM0410  CL22 HEK-293T C46(1.16)  LDD1614  [1]
 LDCM0412  CL24 HEK-293T C46(1.04)  LDD1616  [1]
 LDCM0414  CL26 HEK-293T C46(0.91)  LDD1618  [1]
 LDCM0416  CL28 HEK-293T C46(0.97)  LDD1620  [1]
 LDCM0419  CL30 HEK-293T C46(0.92)  LDD1623  [1]
 LDCM0420  CL31 HEK-293T C46(0.88)  LDD1624  [1]
 LDCM0423  CL34 HEK-293T C46(0.96)  LDD1627  [1]
 LDCM0425  CL36 HEK-293T C46(0.96)  LDD1629  [1]
 LDCM0429  CL4 HEK-293T C46(1.15)  LDD1633  [1]
 LDCM0430  CL40 HEK-293T C46(0.99)  LDD1634  [1]
 LDCM0432  CL42 HEK-293T C46(0.88)  LDD1636  [1]
 LDCM0433  CL43 HEK-293T C46(0.92)  LDD1637  [1]
 LDCM0436  CL46 HEK-293T C46(1.36)  LDD1640  [1]
 LDCM0438  CL48 HEK-293T C46(1.12)  LDD1642  [1]
 LDCM0441  CL50 HEK-293T C46(0.80)  LDD1645  [1]
 LDCM0443  CL52 HEK-293T C46(1.14)  LDD1646  [1]
 LDCM0445  CL54 HEK-293T C46(1.19)  LDD1648  [1]
 LDCM0446  CL55 HEK-293T C46(1.07)  LDD1649  [1]
 LDCM0449  CL58 HEK-293T C46(1.02)  LDD1652  [1]
 LDCM0451  CL6 HEK-293T C46(1.13)  LDD1654  [1]
 LDCM0452  CL60 HEK-293T C46(1.04)  LDD1655  [1]
 LDCM0454  CL62 HEK-293T C46(0.85)  LDD1657  [1]
 LDCM0456  CL64 HEK-293T C46(1.05)  LDD1659  [1]
 LDCM0458  CL66 HEK-293T C46(1.04)  LDD1661  [1]
 LDCM0459  CL67 HEK-293T C46(0.91)  LDD1662  [1]
 LDCM0462  CL7 HEK-293T C46(1.02)  LDD1665  [1]
 LDCM0463  CL70 HEK-293T C46(1.08)  LDD1666  [1]
 LDCM0465  CL72 HEK-293T C46(1.09)  LDD1668  [1]
 LDCM0467  CL74 HEK-293T C46(0.90)  LDD1670  [1]
 LDCM0469  CL76 HEK-293T C46(1.05)  LDD1672  [1]
 LDCM0471  CL78 HEK-293T C46(0.95)  LDD1674  [1]
 LDCM0472  CL79 HEK-293T C46(0.88)  LDD1675  [1]
 LDCM0476  CL82 HEK-293T C46(1.24)  LDD1679  [1]
 LDCM0478  CL84 HEK-293T C46(1.07)  LDD1681  [1]
 LDCM0480  CL86 HEK-293T C46(1.06)  LDD1683  [1]
 LDCM0482  CL88 HEK-293T C46(1.25)  LDD1685  [1]
 LDCM0485  CL90 HEK-293T C46(1.62)  LDD1688  [1]
 LDCM0486  CL91 HEK-293T C46(0.86)  LDD1689  [1]
 LDCM0489  CL94 HEK-293T C46(1.16)  LDD1692  [1]
 LDCM0491  CL96 HEK-293T C46(1.05)  LDD1694  [1]
 LDCM0493  CL98 HEK-293T C46(0.94)  LDD1696  [1]
 LDCM0427  Fragment51 HEK-293T C46(0.82)  LDD1631  [1]

References

1 Accelerating multiplexed profiling of protein-ligand interactions: High-throughput plate-based reactive cysteine profiling with minimal input. Cell Chem Biol. 2024 Mar 21;31(3):565-576.e4. doi: 10.1016/j.chembiol.2023.11.015. Epub 2023 Dec 19.
Mass spectrometry data entry: PXD044402