Details of the Target

General Information of Target

Target ID LDTP14090
Target Name Low-density lipoprotein receptor-related protein 12 (LRP12)
Gene Name LRP12
Gene ID 29967
Synonyms
ST7; Low-density lipoprotein receptor-related protein 12; LDLR-related protein 12; LRP-12; Suppressor of tumorigenicity 7 protein
3D Structure
Download
2D Sequence (FASTA)
Download
3D Structure (PDB)
Download
Sequence
MAAVDDLQFEEFGNAATSLTANPDATTVNIEDPGETPKHQPGSPRGSGREEDDELLGNDD
SDKTELLAGQKKSSPFWTFEYYQTFFDVDTYQVFDRIKGSLLPIPGKNFVRLYIRSNPDL
YGPFWICATLVFAIAISGNLSNFLIHLGEKTYHYVPEFRKVSIAATIIYAYAWLVPLALW
GFLMWRNSKVMNIVSYSFLEIVCVYGYSLFIYIPTAILWIIPQKAVRWILVMIALGISGS
LLAMTFWPAVREDNRRVALATIVTIVLLHMLLSVGCLAYFFDAPEMDHLPTTTATPNQTV
AAAKSS
Target Bioclass
Other
Family
LDLR family
Subcellular location
Membrane
Function Probable receptor, which may be involved in the internalization of lipophilic molecules and/or signal transduction. May act as a tumor suppressor.
Uniprot ID
Q9Y561
Ensemble ID
ENST00000276654.10
HGNC ID
HGNC:31708

Target Site Mutations in Different Cell Lines

Cell line Mutation details Probe for labeling this protein in this cell
CAL27 SNV: p.P129S .
CCK81 SNV: p.V509I .
DU145 SNV: p.C791F .
KASUMI2 SNV: p.D444G .
KYSE180 SNV: p.P809L .
LNCaP clone FGC Deletion: p.C451AfsTer37
SNV: p.N115K		 .
MELHO SNV: p.C3F .
MEWO SNV: p.P206L .
NB1 SNV: p.E562D .
NCIH1793 SNV: p.D196Y .
NCIH1993 SNV: p.C3F .
NCIH2172 SNV: p.G587V .
NCIH2291 SNV: p.P819S .
NCIH358 SNV: p.G587V .
RL SNV: p.D801Y .
SW1783 SNV: p.R583Ter .
SW756 SNV: p.E117K .
WM115 SNV: p.G320R .
WM2664 SNV: p.G320R .

Probe(s) Labeling This Target

ABPP Probe
Click To Hide/Show 2 Probe Related to This Target
Probe name Structure Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
DBIA
 Probe Info  		C232(2.85)  LDD3413  [1]
NAIA_4
 Probe Info  		N.A.  LDD2226  [2]

Competitor(s) Related to This Target

Competitor ID Name Cell line Binding Site(Ratio) Interaction ID Ref
 LDCM0214  AC1 HEK-293T C567(0.88); C232(0.95); C841(0.98)  LDD1507  [3]
 LDCM0215  AC10 HEK-293T C232(0.98)  LDD1508  [3]
 LDCM0226  AC11 HEK-293T C567(1.11)  LDD1509  [3]
 LDCM0259  AC14 HEK-293T C567(0.96); C841(0.92)  LDD1512  [3]
 LDCM0276  AC17 HEK-293T C567(1.12); C232(0.95); C841(0.93)  LDD1515  [3]
 LDCM0277  AC18 HEK-293T C232(1.14)  LDD1516  [3]
 LDCM0278  AC19 HEK-293T C567(1.10)  LDD1517  [3]
 LDCM0279  AC2 HEK-293T C232(1.00)  LDD1518  [3]
 LDCM0281  AC21 HEK-293T C567(1.11)  LDD1520  [3]
 LDCM0282  AC22 HEK-293T C567(1.28); C841(1.06)  LDD1521  [3]
 LDCM0285  AC25 HEK-293T C567(0.98); C232(1.01); C841(0.97)  LDD1524  [3]
 LDCM0286  AC26 HEK-293T C232(1.11)  LDD1525  [3]
 LDCM0287  AC27 HEK-293T C567(1.09)  LDD1526  [3]
 LDCM0289  AC29 HEK-293T C567(1.04)  LDD1528  [3]
 LDCM0290  AC3 HEK-293T C567(0.97)  LDD1529  [3]
 LDCM0291  AC30 HEK-293T C567(0.90); C841(1.01)  LDD1530  [3]
 LDCM0294  AC33 HEK-293T C567(1.14); C232(0.93); C841(1.11)  LDD1533  [3]
 LDCM0295  AC34 HEK-293T C232(1.08)  LDD1534  [3]
 LDCM0296  AC35 HEK-293T C567(1.09)  LDD1535  [3]
 LDCM0298  AC37 HEK-293T C567(1.00)  LDD1537  [3]
 LDCM0299  AC38 HEK-293T C567(1.06); C841(1.01)  LDD1538  [3]
 LDCM0303  AC41 HEK-293T C567(1.06); C232(1.05); C841(1.11)  LDD1542  [3]
 LDCM0304  AC42 HEK-293T C232(1.00)  LDD1543  [3]
 LDCM0305  AC43 HEK-293T C567(1.10)  LDD1544  [3]
 LDCM0307  AC45 HEK-293T C567(0.99)  LDD1546  [3]
 LDCM0308  AC46 HEK-293T C567(1.33); C841(1.06)  LDD1547  [3]
 LDCM0311  AC49 HEK-293T C567(1.16); C232(1.01); C841(1.00)  LDD1550  [3]
 LDCM0312  AC5 HEK-293T C567(0.79)  LDD1551  [3]
 LDCM0313  AC50 HEK-293T C232(0.98)  LDD1552  [3]
 LDCM0314  AC51 HEK-293T C567(1.08)  LDD1553  [3]
 LDCM0316  AC53 HEK-293T C567(1.20)  LDD1555  [3]
 LDCM0317  AC54 HEK-293T C567(1.18); C841(1.02)  LDD1556  [3]
 LDCM0320  AC57 HEK-293T C567(1.05); C232(1.04); C841(1.18)  LDD1559  [3]
 LDCM0321  AC58 HEK-293T C232(1.05)  LDD1560  [3]
 LDCM0322  AC59 HEK-293T C567(0.95)  LDD1561  [3]
 LDCM0323  AC6 HEK-293T C567(1.34); C841(1.11)  LDD1562  [3]
 LDCM0325  AC61 HEK-293T C567(0.84)  LDD1564  [3]
 LDCM0326  AC62 HEK-293T C567(1.05); C841(1.10)  LDD1565  [3]
 LDCM0248  AKOS034007472 HEK-293T C567(1.04)  LDD1511  [3]
 LDCM0356  AKOS034007680 HEK-293T C567(1.09); C232(0.98); C841(0.98)  LDD1570  [3]
 LDCM0020  ARS-1620 HCC44 C433(1.34); C439(1.34)  LDD2171  [4]
 LDCM0367  CL1 HEK-293T C567(0.88)  LDD1571  [3]
 LDCM0368  CL10 HEK-293T C567(1.18); C841(0.98)  LDD1572  [3]
 LDCM0369  CL100 HEK-293T C567(1.16)  LDD1573  [3]
 LDCM0370  CL101 HEK-293T C567(0.79)  LDD1574  [3]
 LDCM0372  CL103 HEK-293T C232(1.16)  LDD1576  [3]
 LDCM0373  CL104 HEK-293T C567(1.16)  LDD1577  [3]
 LDCM0374  CL105 HEK-293T C567(0.70)  LDD1578  [3]
 LDCM0376  CL107 HEK-293T C232(1.03)  LDD1580  [3]
 LDCM0377  CL108 HEK-293T C567(1.15)  LDD1581  [3]
 LDCM0378  CL109 HEK-293T C567(0.78)  LDD1582  [3]
 LDCM0381  CL111 HEK-293T C232(1.07)  LDD1585  [3]
 LDCM0382  CL112 HEK-293T C567(0.99)  LDD1586  [3]
 LDCM0383  CL113 HEK-293T C567(0.85)  LDD1587  [3]
 LDCM0385  CL115 HEK-293T C232(1.08)  LDD1589  [3]
 LDCM0386  CL116 HEK-293T C567(1.20)  LDD1590  [3]
 LDCM0387  CL117 HEK-293T C567(0.86)  LDD1591  [3]
 LDCM0389  CL119 HEK-293T C232(1.13)  LDD1593  [3]
 LDCM0391  CL120 HEK-293T C567(1.13)  LDD1595  [3]
 LDCM0392  CL121 HEK-293T C567(1.10)  LDD1596  [3]
 LDCM0394  CL123 HEK-293T C232(1.22)  LDD1598  [3]
 LDCM0395  CL124 HEK-293T C567(1.11)  LDD1599  [3]
 LDCM0396  CL125 HEK-293T C567(0.91)  LDD1600  [3]
 LDCM0398  CL127 HEK-293T C232(1.16)  LDD1602  [3]
 LDCM0399  CL128 HEK-293T C567(1.38)  LDD1603  [3]
 LDCM0400  CL13 HEK-293T C567(0.93)  LDD1604  [3]
 LDCM0402  CL15 HEK-293T C232(1.41)  LDD1606  [3]
 LDCM0403  CL16 HEK-293T C567(1.11)  LDD1607  [3]
 LDCM0404  CL17 HEK-293T C567(1.20); C232(1.16); C841(1.13)  LDD1608  [3]
 LDCM0405  CL18 HEK-293T C232(1.23)  LDD1609  [3]
 LDCM0406  CL19 HEK-293T C567(1.33)  LDD1610  [3]
 LDCM0409  CL21 HEK-293T C567(0.73)  LDD1613  [3]
 LDCM0410  CL22 HEK-293T C567(1.05); C841(0.96)  LDD1614  [3]
 LDCM0413  CL25 HEK-293T C567(0.87)  LDD1617  [3]
 LDCM0415  CL27 HEK-293T C232(1.12)  LDD1619  [3]
 LDCM0416  CL28 HEK-293T C567(1.65)  LDD1620  [3]
 LDCM0417  CL29 HEK-293T C567(1.18); C232(1.20); C841(1.06)  LDD1621  [3]
 LDCM0418  CL3 HEK-293T C232(1.11)  LDD1622  [3]
 LDCM0419  CL30 HEK-293T C232(1.13)  LDD1623  [3]
 LDCM0420  CL31 HEK-293T C567(1.04)  LDD1624  [3]
 LDCM0422  CL33 HEK-293T C567(1.02)  LDD1626  [3]
 LDCM0423  CL34 HEK-293T C567(1.23); C841(1.00)  LDD1627  [3]
 LDCM0426  CL37 HEK-293T C567(1.01)  LDD1630  [3]
 LDCM0428  CL39 HEK-293T C232(1.17)  LDD1632  [3]
 LDCM0429  CL4 HEK-293T C567(1.41)  LDD1633  [3]
 LDCM0430  CL40 HEK-293T C567(1.06)  LDD1634  [3]
 LDCM0431  CL41 HEK-293T C567(1.19); C232(1.09); C841(1.07)  LDD1635  [3]
 LDCM0432  CL42 HEK-293T C232(1.32)  LDD1636  [3]
 LDCM0433  CL43 HEK-293T C567(1.22)  LDD1637  [3]
 LDCM0435  CL45 HEK-293T C567(0.96)  LDD1639  [3]
 LDCM0436  CL46 HEK-293T C567(1.08); C841(0.97)  LDD1640  [3]
 LDCM0439  CL49 HEK-293T C567(0.80)  LDD1643  [3]
 LDCM0440  CL5 HEK-293T C567(1.11); C232(1.17); C841(1.14)  LDD1644  [3]
 LDCM0443  CL52 HEK-293T C567(1.90)  LDD1646  [3]
 LDCM0444  CL53 HEK-293T C567(1.07); C232(1.08); C841(0.96)  LDD1647  [3]
 LDCM0445  CL54 HEK-293T C232(1.20)  LDD1648  [3]
 LDCM0446  CL55 HEK-293T C567(1.21)  LDD1649  [3]
 LDCM0448  CL57 HEK-293T C567(0.76)  LDD1651  [3]
 LDCM0449  CL58 HEK-293T C567(1.00); C841(0.99)  LDD1652  [3]
 LDCM0451  CL6 HEK-293T C232(1.09)  LDD1654  [3]
 LDCM0453  CL61 HEK-293T C567(0.82)  LDD1656  [3]
 LDCM0455  CL63 HEK-293T C232(1.14)  LDD1658  [3]
 LDCM0456  CL64 HEK-293T C567(1.02)  LDD1659  [3]
 LDCM0457  CL65 HEK-293T C567(1.01); C232(1.12); C841(1.03)  LDD1660  [3]
 LDCM0458  CL66 HEK-293T C232(1.20)  LDD1661  [3]
 LDCM0459  CL67 HEK-293T C567(0.96)  LDD1662  [3]
 LDCM0461  CL69 HEK-293T C567(1.32)  LDD1664  [3]
 LDCM0462  CL7 HEK-293T C567(1.04)  LDD1665  [3]
 LDCM0463  CL70 HEK-293T C567(1.13); C841(1.05)  LDD1666  [3]
 LDCM0466  CL73 HEK-293T C567(1.16)  LDD1669  [3]
 LDCM0469  CL76 HEK-293T C567(1.58)  LDD1672  [3]
 LDCM0470  CL77 HEK-293T C567(1.08); C232(0.92); C841(1.31)  LDD1673  [3]
 LDCM0471  CL78 HEK-293T C232(1.08)  LDD1674  [3]
 LDCM0472  CL79 HEK-293T C567(1.32)  LDD1675  [3]
 LDCM0475  CL81 HEK-293T C567(1.08)  LDD1678  [3]
 LDCM0476  CL82 HEK-293T C567(1.21); C841(1.09)  LDD1679  [3]
 LDCM0479  CL85 HEK-293T C567(1.15)  LDD1682  [3]
 LDCM0481  CL87 HEK-293T C232(1.12)  LDD1684  [3]
 LDCM0482  CL88 HEK-293T C567(1.36)  LDD1685  [3]
 LDCM0483  CL89 HEK-293T C567(1.41); C232(1.08); C841(1.13)  LDD1686  [3]
 LDCM0484  CL9 HEK-293T C567(0.83)  LDD1687  [3]
 LDCM0485  CL90 HEK-293T C232(1.25)  LDD1688  [3]
 LDCM0486  CL91 HEK-293T C567(0.97)  LDD1689  [3]
 LDCM0488  CL93 HEK-293T C567(0.87)  LDD1691  [3]
 LDCM0489  CL94 HEK-293T C567(1.24); C841(1.00)  LDD1692  [3]
 LDCM0492  CL97 HEK-293T C567(0.86)  LDD1695  [3]
 LDCM0494  CL99 HEK-293T C232(1.02)  LDD1697  [3]
 LDCM0495  E2913 HEK-293T C232(1.09)  LDD1698  [3]
 LDCM0468  Fragment33 HEK-293T C232(1.19)  LDD1671  [3]
 LDCM0022  KB02 IPC-298 C232(2.07)  LDD2400  [1]
 LDCM0023  KB03 IPC-298 C232(3.49)  LDD2817  [1]
 LDCM0024  KB05 RVH-421 C232(2.85)  LDD3413  [1]
 LDCM0021  THZ1 HCT 116 C433(1.34); C439(1.34)  LDD2173  [4]

References

1 DrugMap: A quantitative pan-cancer analysis of cysteine ligandability. Cell. 2024 May 9;187(10):2536-2556.e30. doi: 10.1016/j.cell.2024.03.027. Epub 2024 Apr 22.
Mass spectrometry data entry: PXD047840
2 N-Acryloylindole-alkyne (NAIA) enables imaging and profiling new ligandable cysteines and oxidized thiols by chemoproteomics. Nat Commun. 2023 Jun 15;14(1):3564. doi: 10.1038/s41467-023-39268-w.
Mass spectrometry data entry: PXD041264
3 Accelerating multiplexed profiling of protein-ligand interactions: High-throughput plate-based reactive cysteine profiling with minimal input. Cell Chem Biol. 2024 Mar 21;31(3):565-576.e4. doi: 10.1016/j.chembiol.2023.11.015. Epub 2023 Dec 19.
Mass spectrometry data entry: PXD044402
4 Reimagining high-throughput profiling of reactive cysteines for cell-based screening of large electrophile libraries. Nat Biotechnol. 2021 May;39(5):630-641. doi: 10.1038/s41587-020-00778-3. Epub 2021 Jan 4.