Details of the Target
General Information of Target
| Target ID | LDTP18370 | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Target Name | DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b2 (POLR2J3) | |||||
| Gene Name | POLR2J3 | |||||
| Gene ID | 548644 | |||||
| Synonyms |
DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b2; RNA polymerase II subunit B11-b2; RPB11b2; DNA-directed RNA polymerase II subunit J3 |
|||||
| 3D Structure | ||||||
| Sequence |
MQLLGLLSILWMLKSSPGATGTLSTATSTSHVTFPRAEATRTALSNSPHSRYLAEWPQGV
PQLASPAPGHRENAPMTLTTSPHDTLISETLLSSLVSSNTSTTPTSKFAFKVETTPPTVL VYLATTECVYPTSFIITISHPTSICVTTTQVTFTSSYTPTPVTQKPVTTVTRTYPMTTTE KGTSAMISSPSTTTARETPIVTVTPSSSVSATDTTFHTTISSTTRTTERTPLPTGSIHTT MSPTPVFTTLKTAVTSTSPITSTITSTNTVTSMTTTTSRPTATNTLSSLMSNILSSTPVP STEMTTSHTTDTNPLSTLVTTLPTTITRSTPTSETTYPASPTSTVTDSTTEITYSTVLTG TLSPTTTLPPTSSSQQTTETPMTPTTKLVTTTTETTSQSSLNFSSSAIYSTVSTSTTAIS SLPPTSGTMVTSTNIVPTADLKPELILLEVHDQRIQAKNPRYSQTPFTSSTATSPETTTL TCTNDISTESLTTAMTSTTPVISAITPKTTVTSMTTTASGPTTTNTLSSLTSSILSSTPA PNTEVITSHTTTTTPPSTLVTTLPTAIARSTPTSETTYPISPTGTVTDSMTEITYSTSMT GTWSTATTLPLTSCSLPTIETATTPTTNLGNTTTETTSHSTPSFTSSAIYSTVNISTTTI SSFPPSSGTMVTFTTMNPSSLSTDISTTTLKNITQPSVGSTGFLTAATDLTSTFTVSSSS AMSTSVTPSAPSIQNKEISTLVSTTTTTSPTERMTLTSTENTPTSYILTTSPVTYSFSPS MSASSDWTTDTESISSAPAITSTLHTTAESTLAPTTTNSFTTSANMEPPSTAVATTGTGQ STFTSSTATFLETTTLTPTTDISTESFMTPMISTTPITSSMTLRNTMTSMTTAASRPTTT NTLSSLTSSILSSTPVPSTEVITSQTTNTTSPSTLVTTLPTTITTSTPTSETTYSTSPTS TVTDSTTETTYSTSITGTLSTEISLPATTSSLITKGISMTSTRNLVTTTNENTSHSTPTF 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|||||
| Target Bioclass |
Enzyme
|
|||||
| Family |
Archaeal Rpo11/eukaryotic RPB11/RPC19 RNA polymerase subunit family
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| Subcellular location |
Nucleus
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| Function |
DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Component of RNA polymerase II which synthesizes mRNA precursors and many functional non-coding RNAs. Pol II is the central component of the basal RNA polymerase II transcription machinery. It is composed of mobile elements that move relative to each other. RPB11 is part of the core element with the central large cleft.
|
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| Uniprot ID | ||||||
| Ensemble ID | ||||||
| HGNC ID | ||||||
Probe(s) Labeling This Target
ABPP Probe
| Probe name | Structure | Binding Site(Ratio) | Interaction ID | Ref | |
|---|---|---|---|---|---|
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STPyne Probe Info |
 |
K61(1.18) | LDD2217 | [1] | |
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DBIA Probe Info |
 |
C107(282.95) | LDD0209 | [2] | |
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IA-alkyne Probe Info |
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N.A. | LDD0166 | [3] | |
Competitor(s) Related to This Target
The Interaction Atlas With This Target
The Protein(s) Related To This Target
Enzyme
Transcription factor
| Protein name | Family | Uniprot ID | |||
|---|---|---|---|---|---|
| DNA-binding protein SATB2 (SATB2) | CUT homeobox family | Q9UPW6 | |||
Other
| Protein name | Family | Uniprot ID | |||
|---|---|---|---|---|---|
| ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2 (ATPAF2) | ATP12 family | Q8N5M1 | |||
| Vacuolar protein sorting-associated protein 37C (VPS37C) | VPS37 family | A5D8V6 | |||
References